MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011978	AATG	2	8	499335	499342	50 %	25 %	25 %	0 %	222099479
11002	NC_011978	CACATC	2	12	499345	499356	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222099479
11003	NC_011978	GAAG	2	8	499457	499464	50 %	0 %	50 %	0 %	222099479
11004	NC_011978	CT	3	6	499491	499496	0 %	50 %	0 %	50 %	222099479
11005	NC_011978	CTTTCT	2	12	499517	499528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099479
11006	NC_011978	TGCG	2	8	499618	499625	0 %	25 %	50 %	25 %	222099479
11007	NC_011978	T	6	6	499654	499659	0 %	100 %	0 %	0 %	222099479
11008	NC_011978	GGGA	2	8	499732	499739	25 %	0 %	75 %	0 %	222099479
11009	NC_011978	CTG	2	6	499790	499795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_011978	AGCAG	2	10	499808	499817	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11011	NC_011978	TTC	2	6	499835	499840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099480
11012	NC_011978	GAA	2	6	499892	499897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099480
11013	NC_011978	TCT	2	6	499908	499913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099480
11014	NC_011978	TGG	2	6	499969	499974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099480
11015	NC_011978	GTA	2	6	499979	499984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099480
11016	NC_011978	GGT	2	6	499990	499995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099480
11017	NC_011978	AT	3	6	500086	500091	50 %	50 %	0 %	0 %	222099480
11018	NC_011978	GTA	2	6	500102	500107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099480
11019	NC_011978	CAC	2	6	500177	500182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099480
11020	NC_011978	TTC	2	6	500193	500198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099480
11021	NC_011978	CTT	2	6	500229	500234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099480
11022	NC_011978	TCG	2	6	500262	500267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099480
11023	NC_011978	TCC	2	6	500298	500303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099480
11024	NC_011978	TC	3	6	500356	500361	0 %	50 %	0 %	50 %	222099480
11025	NC_011978	AGA	2	6	500398	500403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099480
11026	NC_011978	CT	4	8	500436	500443	0 %	50 %	0 %	50 %	222099480
11027	NC_011978	T	6	6	500565	500570	0 %	100 %	0 %	0 %	222099480
11028	NC_011978	AATCGA	2	12	500611	500622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222099480
11029	NC_011978	CCA	2	6	500629	500634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099480
11030	NC_011978	TGA	2	6	500665	500670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099480
11031	NC_011978	GGAT	2	8	500706	500713	25 %	25 %	50 %	0 %	222099480
11032	NC_011978	T	7	7	500747	500753	0 %	100 %	0 %	0 %	222099480
11033	NC_011978	A	6	6	500843	500848	100 %	0 %	0 %	0 %	222099481
11034	NC_011978	AAAG	2	8	500868	500875	75 %	0 %	25 %	0 %	222099481
11035	NC_011978	AG	3	6	500891	500896	50 %	0 %	50 %	0 %	222099481
11036	NC_011978	TGC	2	6	500933	500938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099481
11037	NC_011978	CCA	2	6	501029	501034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099481
11038	NC_011978	ATC	2	6	501061	501066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099481
11039	NC_011978	TC	3	6	501196	501201	0 %	50 %	0 %	50 %	222099481
11040	NC_011978	TGATAT	2	12	501231	501242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222099481
11041	NC_011978	CTC	2	6	501254	501259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099481
11042	NC_011978	AAG	2	6	501311	501316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099481
11043	NC_011978	AAC	2	6	501331	501336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099481
11044	NC_011978	A	6	6	501456	501461	100 %	0 %	0 %	0 %	222099481
11045	NC_011978	GTTT	2	8	501531	501538	0 %	75 %	25 %	0 %	222099482
11046	NC_011978	TGC	3	9	501560	501568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099482
11047	NC_011978	GTCTT	2	10	501642	501651	0 %	60 %	20 %	20 %	222099482
11048	NC_011978	A	6	6	501818	501823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_011978	CTAC	2	8	501838	501845	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_011978	TAC	2	6	501867	501872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_011978	GGC	2	6	501884	501889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_011978	GCG	2	6	502034	502039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_011978	GC	3	6	502118	502123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_011978	CTC	2	6	502215	502220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_011978	C	6	6	502245	502250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11056	NC_011978	CCT	2	6	502256	502261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_011978	GACC	2	8	502280	502287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_011978	ACG	2	6	502294	502299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_011978	GGATG	2	10	502369	502378	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_011978	CCG	2	6	502402	502407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_011978	CGGG	2	8	502422	502429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11062	NC_011978	GCC	2	6	502489	502494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_011978	C	6	6	502515	502520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11064	NC_011978	AGG	2	6	502625	502630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_011978	GGT	2	6	502714	502719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_011978	GGC	2	6	502728	502733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_011978	GGC	2	6	502751	502756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_011978	C	6	6	502887	502892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11069	NC_011978	TGA	2	6	503088	503093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_011978	CTT	2	6	503097	503102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_011978	CAT	2	6	503125	503130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_011978	T	6	6	503149	503154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_011978	TTC	2	6	503168	503173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_011978	GAA	2	6	503194	503199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_011978	TTC	2	6	503210	503215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_011978	ATCG	2	8	503247	503254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11077	NC_011978	TTC	2	6	503261	503266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_011978	GAA	2	6	503284	503289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_011978	CTG	2	6	503384	503389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_011978	AAC	2	6	503403	503408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_011978	CGA	2	6	503418	503423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_011978	C	6	6	503509	503514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11083	NC_011978	GCAG	2	8	503645	503652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11084	NC_011978	GCC	2	6	503684	503689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11085	NC_011978	CCCCT	2	10	503739	503748	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11086	NC_011978	GCCC	2	8	503990	503997	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11087	NC_011978	CCT	2	6	504192	504197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_011978	GAC	2	6	504304	504309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_011978	G	6	6	504336	504341	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_011978	CTC	2	6	504355	504360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_011978	G	6	6	504487	504492	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_011978	ATG	2	6	504560	504565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_011978	GCT	2	6	504566	504571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_011978	CGG	2	6	504645	504650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_011978	GTT	2	6	504656	504661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_011978	TG	3	6	504710	504715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_011978	GGA	2	6	504742	504747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_011978	C	6	6	504750	504755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11099	NC_011978	ACC	2	6	504787	504792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11100	NC_011978	GCC	2	6	504967	504972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_011978	GCTACG	2	12	505005	505016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_011978	CTT	2	6	505104	505109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_011978	GCG	2	6	505193	505198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_011978	GTA	2	6	505200	505205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_011978	C	6	6	505225	505230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11106	NC_011978	TCCC	2	8	505286	505293	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11107	NC_011978	GGT	2	6	505337	505342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_011978	AGG	2	6	505351	505356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_011978	CAC	2	6	505438	505443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_011978	CTC	2	6	505455	505460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_011978	TCGC	2	8	505466	505473	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11112	NC_011978	CTA	2	6	505476	505481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_011978	CGG	2	6	505554	505559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_011978	CGC	2	6	505670	505675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_011978	CCT	2	6	505709	505714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11116	NC_011978	TGG	2	6	505751	505756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_011978	CCT	2	6	505781	505786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11118	NC_011978	TGG	2	6	505832	505837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_011978	ACC	2	6	505854	505859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11120	NC_011978	AGC	2	6	505930	505935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_011978	AGG	2	6	505955	505960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_011978	C	6	6	506006	506011	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11123	NC_011978	C	7	7	506033	506039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11124	NC_011978	GT	3	6	506100	506105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_011978	GGC	2	6	506205	506210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_011978	GT	3	6	506269	506274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_011978	TCCT	2	8	506316	506323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11128	NC_011978	TCG	2	6	506329	506334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11129	NC_011978	GAC	2	6	506433	506438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_011978	CAC	2	6	506446	506451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11131	NC_011978	ACC	2	6	506505	506510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_011978	GGC	2	6	506628	506633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11133	NC_011978	C	6	6	506670	506675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11134	NC_011978	AC	3	6	506911	506916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11138	NC_011978	TTC	2	6	507057	507062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11139	NC_011978	CTG	2	6	507152	507157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11147	NC_011978	CCG	2	6	507408	507413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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