MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_011978	GAA	2	6	362226	362231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099345
8003	NC_011978	CTT	2	6	362242	362247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099345
8004	NC_011978	AAC	2	6	362275	362280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099345
8005	NC_011978	GAAGC	2	10	362299	362308	40 %	0 %	40 %	20 %	222099345
8006	NC_011978	TTC	2	6	362410	362415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099345
8007	NC_011978	AGGG	2	8	362443	362450	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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8011	NC_011978	AAAG	2	8	362663	362670	75 %	0 %	25 %	0 %	222099346
8012	NC_011978	A	6	6	362688	362693	100 %	0 %	0 %	0 %	222099346
8013	NC_011978	GAA	2	6	362697	362702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099346
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8017	NC_011978	GGTG	2	8	362873	362880	0 %	25 %	75 %	0 %	222099346
8018	NC_011978	ACA	2	6	362949	362954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099346
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8021	NC_011978	AAG	2	6	363163	363168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099346
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8042	NC_011978	TCA	2	6	363842	363847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099346
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8054	NC_011978	ATTC	2	8	364468	364475	25 %	50 %	0 %	25 %	222099348
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8058	NC_011978	T	6	6	364687	364692	0 %	100 %	0 %	0 %	222099348
8059	NC_011978	CCTC	2	8	364704	364711	0 %	25 %	0 %	75 %	222099348
8060	NC_011978	GTT	2	6	364769	364774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099348
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8065	NC_011978	TGT	2	6	364885	364890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099348
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8095	NC_011978	CTT	2	6	366426	366431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_011978	TTTCA	2	10	366469	366478	20 %	60 %	0 %	20 %	222099350
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8111	NC_011978	T	7	7	367108	367114	0 %	100 %	0 %	0 %	222099351
8112	NC_011978	TTCC	2	8	367148	367155	0 %	50 %	0 %	50 %	222099351
8113	NC_011978	TCT	2	6	367208	367213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099351
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8115	NC_011978	TC	4	8	367279	367286	0 %	50 %	0 %	50 %	222099351
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8122	NC_011978	C	6	6	367537	367542	0 %	0 %	0 %	100 %	222099351
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8250	NC_011978	TTC	2	6	373577	373582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099354
8251	NC_011978	AGA	2	6	373621	373626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099354
8252	NC_011978	TCA	2	6	373708	373713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099355
8253	NC_011978	AGA	2	6	373741	373746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099355
8254	NC_011978	GGA	2	6	373793	373798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099355
8255	NC_011978	GTT	2	6	373856	373861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099355
8256	NC_011978	TTC	2	6	373887	373892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099355
8257	NC_011978	AAC	2	6	373922	373927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099355
8258	NC_011978	ACC	2	6	373943	373948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099355
8259	NC_011978	GCT	2	6	373986	373991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099355
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8262	NC_011978	TTCC	2	8	374260	374267	0 %	50 %	0 %	50 %	222099355
8263	NC_011978	GAT	2	6	374375	374380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099355
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8265	NC_011978	CGCTTT	2	12	374456	374467	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222099355
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8267	NC_011978	CTG	2	6	374513	374518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099355
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8270	NC_011978	CTT	2	6	374657	374662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099355
8271	NC_011978	CCCTG	2	10	374672	374681	0 %	20 %	20 %	60 %	222099355
8272	NC_011978	TCT	2	6	374715	374720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099355
8273	NC_011978	CTG	2	6	374770	374775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099355
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8277	NC_011978	CTT	2	6	374971	374976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099355
8278	NC_011978	TGA	2	6	374983	374988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099355
8279	NC_011978	GTAC	2	8	375067	375074	25 %	25 %	25 %	25 %	222099355
8280	NC_011978	TC	3	6	375075	375080	0 %	50 %	0 %	50 %	222099355
8281	NC_011978	TGA	2	6	375094	375099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099355
8282	NC_011978	TTC	2	6	375124	375129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099355
8283	NC_011978	CAC	2	6	375130	375135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099356
8284	NC_011978	CTGT	2	8	375155	375162	0 %	50 %	25 %	25 %	222099356
8285	NC_011978	GAG	2	6	375166	375171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099356
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8287	NC_011978	CTT	2	6	375198	375203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099356
8288	NC_011978	TGT	2	6	375207	375212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099356
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8290	NC_011978	TGA	2	6	375312	375317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099356
8291	NC_011978	TGT	2	6	375324	375329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099356
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8307	NC_011978	ATG	2	6	376081	376086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099356
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8309	NC_011978	TGAG	2	8	376251	376258	25 %	25 %	50 %	0 %	222099356
8310	NC_011978	A	6	6	376288	376293	100 %	0 %	0 %	0 %	222099356
8311	NC_011978	CA	3	6	376295	376300	50 %	0 %	0 %	50 %	222099356
8312	NC_011978	GGTG	2	8	376327	376334	0 %	25 %	75 %	0 %	222099356
8313	NC_011978	TCA	2	6	376462	376467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8316	NC_011978	ATG	2	6	376525	376530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099357
8317	NC_011978	TCC	2	6	376552	376557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099357
8318	NC_011978	TTC	2	6	376580	376585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099357
8319	NC_011978	GTC	2	6	376650	376655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099357
8320	NC_011978	TCT	2	6	376720	376725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099357
8321	NC_011978	GCA	2	6	376777	376782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099357
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8323	NC_011978	GAA	2	6	376813	376818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099357
8324	NC_011978	ACT	2	6	376843	376848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099357
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8333	NC_011978	CTGG	2	8	377386	377393	0 %	25 %	50 %	25 %	222099358
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8357	NC_011978	T	7	7	378406	378412	0 %	100 %	0 %	0 %	222099358
8358	NC_011978	T	7	7	378434	378440	0 %	100 %	0 %	0 %	222099358
8359	NC_011978	TTC	2	6	378455	378460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099358
8360	NC_011978	TTG	2	6	378471	378476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099358
8361	NC_011978	CAT	2	6	378482	378487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099358
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8363	NC_011978	TATCT	2	10	378563	378572	20 %	60 %	0 %	20 %	222099358
8364	NC_011978	CT	3	6	378579	378584	0 %	50 %	0 %	50 %	222099358
8365	NC_011978	GA	3	6	378596	378601	50 %	0 %	50 %	0 %	222099358
8366	NC_011978	T	6	6	378624	378629	0 %	100 %	0 %	0 %	222099358
8367	NC_011978	T	6	6	378677	378682	0 %	100 %	0 %	0 %	222099358
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8496	NC_011978	GAG	2	6	384225	384230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099364
8497	NC_011978	GGAT	2	8	384257	384264	25 %	25 %	50 %	0 %	222099364
8498	NC_011978	GAT	2	6	384297	384302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099364
8499	NC_011978	TCT	2	6	384349	384354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099364
8500	NC_011978	ATC	2	6	384421	384426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099364

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