MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011978	CCA	2	6	272198	272203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_011978	TCA	2	6	272296	272301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_011978	GTTT	2	8	272312	272319	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_011978	GAA	2	6	272420	272425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099253
6005	NC_011978	GAT	2	6	272456	272461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6006	NC_011978	AAC	2	6	272579	272584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099253
6007	NC_011978	CAA	2	6	272665	272670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099253
6008	NC_011978	ATG	2	6	272682	272687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6009	NC_011978	ATG	2	6	272691	272696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6010	NC_011978	CCA	2	6	272703	272708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099253
6011	NC_011978	CAA	2	6	272734	272739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099253
6012	NC_011978	TGA	2	6	272749	272754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6013	NC_011978	CTGA	2	8	272792	272799	25 %	25 %	25 %	25 %	222099253
6014	NC_011978	TGT	2	6	272803	272808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099253
6015	NC_011978	TCT	2	6	272817	272822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099253
6016	NC_011978	ATC	2	6	272904	272909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099253
6017	NC_011978	TGT	2	6	272971	272976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099253
6018	NC_011978	TAC	2	6	272995	273000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099253
6019	NC_011978	TC	3	6	273005	273010	0 %	50 %	0 %	50 %	222099253
6020	NC_011978	GAT	2	6	273020	273025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6021	NC_011978	TTTTCA	2	12	273081	273092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222099253
6022	NC_011978	GAT	2	6	273119	273124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6023	NC_011978	GCA	2	6	273135	273140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099253
6024	NC_011978	GA	3	6	273335	273340	50 %	0 %	50 %	0 %	222099253
6025	NC_011978	TCC	2	6	273362	273367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099253
6026	NC_011978	TCC	2	6	273371	273376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099253
6027	NC_011978	ATG	3	9	273396	273404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6028	NC_011978	TC	3	6	273441	273446	0 %	50 %	0 %	50 %	222099253
6029	NC_011978	ATG	2	6	273471	273476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099253
6030	NC_011978	CGG	2	6	273478	273483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099253
6031	NC_011978	GAAA	2	8	273510	273517	75 %	0 %	25 %	0 %	222099253
6032	NC_011978	TTG	2	6	273528	273533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099253
6033	NC_011978	AGC	2	6	273537	273542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099253
6034	NC_011978	ACA	2	6	273574	273579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099253
6035	NC_011978	TCT	2	6	273595	273600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099254
6036	NC_011978	TTC	2	6	273602	273607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099254
6037	NC_011978	ACA	2	6	273664	273669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099254
6038	NC_011978	TGC	2	6	273811	273816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099254
6039	NC_011978	ACC	2	6	273819	273824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099254
6040	NC_011978	GAA	2	6	273968	273973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099254
6041	NC_011978	TCG	2	6	274079	274084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099254
6042	NC_011978	TCGA	2	8	274086	274093	25 %	25 %	25 %	25 %	222099254
6043	NC_011978	TAT	2	6	274143	274148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099254
6044	NC_011978	GAAA	2	8	274176	274183	75 %	0 %	25 %	0 %	222099254
6045	NC_011978	CGA	2	6	274238	274243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099254
6046	NC_011978	CTT	2	6	274254	274259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099254
6047	NC_011978	CCT	2	6	274272	274277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099255
6048	NC_011978	CTTGT	2	10	274300	274309	0 %	60 %	20 %	20 %	222099255
6049	NC_011978	TCC	2	6	274326	274331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099255
6050	NC_011978	AAG	2	6	274343	274348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099255
6051	NC_011978	T	6	6	274373	274378	0 %	100 %	0 %	0 %	222099255
6052	NC_011978	T	6	6	274387	274392	0 %	100 %	0 %	0 %	222099255
6053	NC_011978	TGTT	2	8	274442	274449	0 %	75 %	25 %	0 %	222099255
6054	NC_011978	TCA	2	6	274450	274455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099255
6055	NC_011978	GTA	2	6	274457	274462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099255
6056	NC_011978	CTT	2	6	274486	274491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099255
6057	NC_011978	AAAG	2	8	274499	274506	75 %	0 %	25 %	0 %	222099255
6058	NC_011978	TGG	2	6	274510	274515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099255
6059	NC_011978	ATG	2	6	274524	274529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099255
6060	NC_011978	GGT	2	6	274569	274574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099255
6061	NC_011978	GAAA	2	8	274583	274590	75 %	0 %	25 %	0 %	222099255
6062	NC_011978	ACC	2	6	274613	274618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099255
6063	NC_011978	GTT	2	6	274675	274680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099255
6064	NC_011978	CTT	2	6	274705	274710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099255
6065	NC_011978	TTC	2	6	274716	274721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099255
6066	NC_011978	T	6	6	274878	274883	0 %	100 %	0 %	0 %	222099255
6067	NC_011978	GTT	2	6	274931	274936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099255
6068	NC_011978	GTC	2	6	274970	274975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099255
6069	NC_011978	TCCT	2	8	275012	275019	0 %	50 %	0 %	50 %	222099255
6070	NC_011978	TG	3	6	275148	275153	0 %	50 %	50 %	0 %	222099255
6071	NC_011978	AGA	2	6	275217	275222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099255
6072	NC_011978	ACC	2	6	275223	275228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099255
6073	NC_011978	CCTT	2	8	275276	275283	0 %	50 %	0 %	50 %	222099256
6074	NC_011978	TTCC	2	8	275373	275380	0 %	50 %	0 %	50 %	222099256
6075	NC_011978	TCT	2	6	275408	275413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099256
6076	NC_011978	TTCGT	2	10	275447	275456	0 %	60 %	20 %	20 %	222099256
6077	NC_011978	CT	3	6	275461	275466	0 %	50 %	0 %	50 %	222099256
6078	NC_011978	T	6	6	275601	275606	0 %	100 %	0 %	0 %	222099256
6079	NC_011978	TTTC	2	8	275618	275625	0 %	75 %	0 %	25 %	222099256
6080	NC_011978	T	6	6	275676	275681	0 %	100 %	0 %	0 %	222099256
6081	NC_011978	T	8	8	275738	275745	0 %	100 %	0 %	0 %	222099256
6082	NC_011978	TCT	2	6	275750	275755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099256
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6084	NC_011978	TC	3	6	275844	275849	0 %	50 %	0 %	50 %	222099256
6085	NC_011978	TTCATC	2	12	275953	275964	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222099256
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6087	NC_011978	TCTT	2	8	276021	276028	0 %	75 %	0 %	25 %	222099256
6088	NC_011978	GTA	3	9	276031	276039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099256
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6090	NC_011978	TCT	2	6	276152	276157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099256
6091	NC_011978	GGAAA	2	10	276230	276239	60 %	0 %	40 %	0 %	222099256
6092	NC_011978	AT	3	6	276256	276261	50 %	50 %	0 %	0 %	222099256
6093	NC_011978	ATG	2	6	276317	276322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099256
6094	NC_011978	GA	3	6	276386	276391	50 %	0 %	50 %	0 %	222099256
6095	NC_011978	CGG	2	6	276414	276419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099256
6096	NC_011978	AGT	2	6	276423	276428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099256
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6099	NC_011978	ACA	2	6	276501	276506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099256
6100	NC_011978	TC	3	6	276525	276530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_011978	GAG	2	6	276568	276573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099257
6102	NC_011978	GTA	2	6	276589	276594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099257
6103	NC_011978	T	6	6	276617	276622	0 %	100 %	0 %	0 %	222099257
6104	NC_011978	TTCT	2	8	276658	276665	0 %	75 %	0 %	25 %	222099257
6105	NC_011978	AG	3	6	276770	276775	50 %	0 %	50 %	0 %	222099257
6106	NC_011978	TTC	2	6	276861	276866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099257
6107	NC_011978	GCG	3	9	276881	276889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099257
6108	NC_011978	GTT	2	6	276895	276900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099257
6109	NC_011978	AGAA	2	8	276946	276953	75 %	0 %	25 %	0 %	222099257
6110	NC_011978	TCG	2	6	277061	277066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099257
6111	NC_011978	AGAA	2	8	277081	277088	75 %	0 %	25 %	0 %	222099257
6112	NC_011978	GTT	2	6	277090	277095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099257
6113	NC_011978	GTTC	2	8	277171	277178	0 %	50 %	25 %	25 %	222099257
6114	NC_011978	AGA	2	6	277241	277246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099257
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6117	NC_011978	GTA	2	6	277315	277320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099257
6118	NC_011978	TTG	2	6	277353	277358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099257
6119	NC_011978	TTG	2	6	277386	277391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099257
6120	NC_011978	GATC	2	8	277401	277408	25 %	25 %	25 %	25 %	222099257
6121	NC_011978	GAA	2	6	277449	277454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099257
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6497	NC_011978	CTC	2	6	294576	294581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099277
6498	NC_011978	TTC	2	6	294599	294604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099277
6499	NC_011978	ATC	2	6	294607	294612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099277
6500	NC_011978	GACAGA	2	12	294634	294645	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222099277

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