MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011961	GCA	2	6	105023	105028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2502	NC_011961	GAG	2	6	105044	105049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635515
2503	NC_011961	AAC	2	6	105077	105082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635515
2504	NC_011961	GTG	2	6	105135	105140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635515
2505	NC_011961	CT	3	6	105261	105266	0 %	50 %	0 %	50 %	221635515
2506	NC_011961	CGA	2	6	105284	105289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2507	NC_011961	CCT	2	6	105301	105306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635515
2508	NC_011961	GAG	2	6	105398	105403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635515
2509	NC_011961	CCT	2	6	105442	105447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635515
2510	NC_011961	CAG	2	6	105520	105525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2511	NC_011961	GAA	2	6	105659	105664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635515
2512	NC_011961	CGA	2	6	105672	105677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2513	NC_011961	GGATCG	2	12	105681	105692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635515
2514	NC_011961	ACG	2	6	105701	105706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2515	NC_011961	CG	3	6	105705	105710	0 %	0 %	50 %	50 %	221635515
2516	NC_011961	GC	3	6	105721	105726	0 %	0 %	50 %	50 %	221635515
2517	NC_011961	TCG	2	6	105759	105764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2518	NC_011961	GATC	2	8	105777	105784	25 %	25 %	25 %	25 %	221635515
2519	NC_011961	GCA	2	6	105841	105846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_011961	ACG	2	6	105973	105978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_011961	GGA	2	6	106037	106042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011961	AGCG	2	8	106072	106079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_011961	TCC	2	6	106093	106098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_011961	GGC	2	6	106099	106104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_011961	CT	3	6	106117	106122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_011961	GCACA	2	10	106139	106148	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2527	NC_011961	CCA	2	6	106149	106154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_011961	AGG	2	6	106197	106202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635516
2529	NC_011961	TGC	2	6	106224	106229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2530	NC_011961	GC	4	8	106231	106238	0 %	0 %	50 %	50 %	221635516
2531	NC_011961	GGC	2	6	106268	106273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635516
2532	NC_011961	CCTG	2	8	106290	106297	0 %	25 %	25 %	50 %	221635516
2533	NC_011961	GAG	2	6	106346	106351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635516
2534	NC_011961	TGC	2	6	106365	106370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2535	NC_011961	AGG	2	6	106380	106385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635516
2536	NC_011961	CGG	2	6	106396	106401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635516
2537	NC_011961	AGCC	2	8	106404	106411	25 %	0 %	25 %	50 %	221635516
2538	NC_011961	AGCG	2	8	106412	106419	25 %	0 %	50 %	25 %	221635516
2539	NC_011961	CGATG	2	10	106555	106564	20 %	20 %	40 %	20 %	221635516
2540	NC_011961	CCAG	2	8	106567	106574	25 %	0 %	25 %	50 %	221635516
2541	NC_011961	AGC	2	6	106590	106595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2542	NC_011961	GC	3	6	106600	106605	0 %	0 %	50 %	50 %	221635516
2543	NC_011961	TCG	2	6	106626	106631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2544	NC_011961	GCT	2	6	106702	106707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2545	NC_011961	GAC	2	6	106763	106768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2546	NC_011961	GCC	3	9	106956	106964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635516
2547	NC_011961	CGA	2	6	107005	107010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2548	NC_011961	CGC	2	6	107035	107040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635516
2549	NC_011961	CT	3	6	107055	107060	0 %	50 %	0 %	50 %	221635516
2550	NC_011961	CG	3	6	107089	107094	0 %	0 %	50 %	50 %	221635516
2551	NC_011961	ACG	2	6	107219	107224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2552	NC_011961	TCG	2	6	107274	107279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2553	NC_011961	CGAG	2	8	107287	107294	25 %	0 %	50 %	25 %	221635516
2554	NC_011961	GCG	2	6	107331	107336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635516
2555	NC_011961	GTC	2	6	107339	107344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2556	NC_011961	CGG	2	6	107374	107379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635516
2557	NC_011961	CGA	2	6	107398	107403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635516
2558	NC_011961	CCGT	2	8	107457	107464	0 %	25 %	25 %	50 %	221635516
2559	NC_011961	GAGGAC	2	12	107480	107491	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221635516
2560	NC_011961	CTGG	2	8	107500	107507	0 %	25 %	50 %	25 %	221635516
2561	NC_011961	TCG	2	6	107548	107553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635517
2562	NC_011961	AGCC	2	8	107592	107599	25 %	0 %	25 %	50 %	221635517
2563	NC_011961	CGG	2	6	107726	107731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635517
2564	NC_011961	TCA	2	6	107767	107772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635517
2565	NC_011961	GCCA	2	8	107788	107795	25 %	0 %	25 %	50 %	221635517
2566	NC_011961	GAA	2	6	107813	107818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635517
2567	NC_011961	CGA	2	6	107917	107922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635517
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2569	NC_011961	AGCCG	2	10	107977	107986	20 %	0 %	40 %	40 %	221635517
2570	NC_011961	GC	3	6	108081	108086	0 %	0 %	50 %	50 %	221635517
2571	NC_011961	GCT	2	6	108147	108152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635517
2572	NC_011961	CGCGG	2	10	108175	108184	0 %	0 %	60 %	40 %	221635517
2573	NC_011961	GCT	2	6	108213	108218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635517
2574	NC_011961	GAG	2	6	108302	108307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635517
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2576	NC_011961	CTCG	2	8	108322	108329	0 %	25 %	25 %	50 %	221635517
2577	NC_011961	CGAT	2	8	108347	108354	25 %	25 %	25 %	25 %	221635517
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2579	NC_011961	C	6	6	108381	108386	0 %	0 %	0 %	100 %	221635517
2580	NC_011961	GAC	2	6	108418	108423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635517
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2582	NC_011961	GGTCG	2	10	108439	108448	0 %	20 %	60 %	20 %	221635517
2583	NC_011961	CTCC	2	8	108467	108474	0 %	25 %	0 %	75 %	221635518
2584	NC_011961	GCG	2	6	108540	108545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635518
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2586	NC_011961	CCCA	2	8	108619	108626	25 %	0 %	0 %	75 %	221635518
2587	NC_011961	CGAG	2	8	108640	108647	25 %	0 %	50 %	25 %	221635518
2588	NC_011961	CGAG	2	8	108734	108741	25 %	0 %	50 %	25 %	221635518
2589	NC_011961	GCA	2	6	108772	108777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635518
2590	NC_011961	GCT	2	6	108845	108850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635518
2591	NC_011961	CGT	2	6	108852	108857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635518
2592	NC_011961	GGCT	2	8	108868	108875	0 %	25 %	50 %	25 %	221635518
2593	NC_011961	CCCT	2	8	108885	108892	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2594	NC_011961	CG	3	6	108900	108905	0 %	0 %	50 %	50 %	221635519
2595	NC_011961	GAC	2	6	108914	108919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2596	NC_011961	GTC	2	6	108933	108938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2597	NC_011961	TCG	2	6	108939	108944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2598	NC_011961	GCCG	2	8	108961	108968	0 %	0 %	50 %	50 %	221635519
2599	NC_011961	AGC	2	6	108993	108998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635519
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2601	NC_011961	GACC	2	8	109051	109058	25 %	0 %	25 %	50 %	221635519
2602	NC_011961	AGC	2	6	109059	109064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2603	NC_011961	CGGC	2	8	109069	109076	0 %	0 %	50 %	50 %	221635519
2604	NC_011961	GTC	2	6	109086	109091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2605	NC_011961	TCG	3	9	109182	109190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2606	NC_011961	CCA	2	6	109226	109231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635519
2607	NC_011961	AGGGCG	2	12	109254	109265	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221635519
2608	NC_011961	CGAGA	2	10	109286	109295	40 %	0 %	40 %	20 %	221635519
2609	NC_011961	CTC	2	6	109328	109333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635519
2610	NC_011961	GAC	2	6	109337	109342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2611	NC_011961	CTG	2	6	109349	109354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2612	NC_011961	GAG	2	6	109367	109372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635519
2613	NC_011961	GTC	2	6	109497	109502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2614	NC_011961	GCCA	2	8	109514	109521	25 %	0 %	25 %	50 %	221635519
2615	NC_011961	GAC	2	6	109541	109546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635519
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2617	NC_011961	GTC	2	6	109653	109658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635519
2618	NC_011961	GGA	2	6	109663	109668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635519
2619	NC_011961	TCC	2	6	109824	109829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635520
2620	NC_011961	GCG	2	6	109899	109904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635520
2621	NC_011961	CGA	2	6	109925	109930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635520
2622	NC_011961	AGT	2	6	109931	109936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635520
2623	NC_011961	CGGC	2	8	109946	109953	0 %	0 %	50 %	50 %	221635520
2624	NC_011961	CG	3	6	109984	109989	0 %	0 %	50 %	50 %	221635520
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2745	NC_011961	CG	3	6	114173	114178	0 %	0 %	50 %	50 %	221635523
2746	NC_011961	AGC	2	6	114214	114219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2747	NC_011961	CGT	2	6	114224	114229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2748	NC_011961	ACG	2	6	114310	114315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2749	NC_011961	GAC	2	6	114327	114332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2750	NC_011961	GGA	2	6	114398	114403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635523
2751	NC_011961	GC	3	6	114413	114418	0 %	0 %	50 %	50 %	221635523
2752	NC_011961	TCG	2	6	114428	114433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2753	NC_011961	CAC	2	6	114537	114542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635523
2754	NC_011961	CCAGC	2	10	114593	114602	20 %	0 %	20 %	60 %	221635523
2755	NC_011961	AAC	2	6	114628	114633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635523
2756	NC_011961	CGA	2	6	114638	114643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2757	NC_011961	GCA	2	6	114644	114649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635523
2758	NC_011961	TGCC	2	8	114668	114675	0 %	25 %	25 %	50 %	221635523
2759	NC_011961	CAG	2	6	114696	114701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635524
2760	NC_011961	AAC	2	6	114718	114723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635524
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2763	NC_011961	ATGCG	2	10	114773	114782	20 %	20 %	40 %	20 %	221635524
2764	NC_011961	TGTC	2	8	114809	114816	0 %	50 %	25 %	25 %	221635524
2765	NC_011961	GAG	2	6	114861	114866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635524
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2767	NC_011961	GCT	3	9	114914	114922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635524
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2769	NC_011961	GCTCT	2	10	114960	114969	0 %	40 %	20 %	40 %	221635524
2770	NC_011961	TCG	2	6	115016	115021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635524
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2772	NC_011961	CGCT	2	8	115099	115106	0 %	25 %	25 %	50 %	221635524
2773	NC_011961	GCTC	2	8	115177	115184	0 %	25 %	25 %	50 %	221635524
2774	NC_011961	GGC	2	6	115193	115198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635524
2775	NC_011961	AGCG	2	8	115215	115222	25 %	0 %	50 %	25 %	221635524
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2777	NC_011961	CCGG	2	8	115290	115297	0 %	0 %	50 %	50 %	221635524
2778	NC_011961	GC	3	6	115304	115309	0 %	0 %	50 %	50 %	221635524
2779	NC_011961	GAG	2	6	115324	115329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635524
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2781	NC_011961	GAT	2	6	115361	115366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635525
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2783	NC_011961	GAGG	2	8	115375	115382	25 %	0 %	75 %	0 %	221635525
2784	NC_011961	GCTG	2	8	115384	115391	0 %	25 %	50 %	25 %	221635525
2785	NC_011961	GCT	2	6	115428	115433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635525
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2787	NC_011961	GCATC	2	10	115572	115581	20 %	20 %	20 %	40 %	221635526
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2789	NC_011961	GAC	2	6	115604	115609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635526
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2815	NC_011961	TCG	2	6	116712	116717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
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2819	NC_011961	AGC	2	6	116886	116891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635526
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2822	NC_011961	TGCGG	2	10	117024	117033	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2823	NC_011961	AGG	2	6	117036	117041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2824	NC_011961	GCGAT	2	10	117065	117074	20 %	20 %	40 %	20 %	221635527
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2849	NC_011961	TGA	2	6	118237	118242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635527
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2852	NC_011961	GC	4	8	118386	118393	0 %	0 %	50 %	50 %	221635527
2853	NC_011961	GCC	2	6	118508	118513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2854	NC_011961	CGAG	2	8	118517	118524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2855	NC_011961	AGCG	2	8	118566	118573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2856	NC_011961	GAC	2	6	118576	118581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2859	NC_011961	CGT	2	6	118739	118744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635528
2860	NC_011961	GCA	2	6	118756	118761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635528
2861	NC_011961	TCG	2	6	118770	118775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635528
2862	NC_011961	CGC	2	6	118783	118788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635528
2863	NC_011961	GGC	2	6	118847	118852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2864	NC_011961	CGA	2	6	118854	118859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2865	NC_011961	TGG	2	6	118872	118877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2866	NC_011961	TCA	2	6	118915	118920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635529
2867	NC_011961	GC	3	6	118950	118955	0 %	0 %	50 %	50 %	221635529
2868	NC_011961	AC	3	6	118974	118979	50 %	0 %	0 %	50 %	221635529
2869	NC_011961	CGG	2	6	118985	118990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
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2872	NC_011961	GAG	2	6	119081	119086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635529
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2884	NC_011961	CGAA	2	8	119634	119641	50 %	0 %	25 %	25 %	221635529
2885	NC_011961	ATCCG	2	10	119653	119662	20 %	20 %	20 %	40 %	221635529
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2933	NC_011961	GAG	2	6	121532	121537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2983	NC_011961	CCCG	2	8	123375	123382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2990	NC_011961	TGG	2	6	123582	123587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635534
2991	NC_011961	CCG	2	6	123607	123612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635534
2992	NC_011961	CAG	2	6	123635	123640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635534
2993	NC_011961	CG	3	6	123641	123646	0 %	0 %	50 %	50 %	221635534
2994	NC_011961	GC	3	6	123773	123778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2995	NC_011961	TGGA	2	8	123833	123840	25 %	25 %	50 %	0 %	221635535
2996	NC_011961	GTC	2	6	123851	123856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635535
2997	NC_011961	CAGC	2	8	123901	123908	25 %	0 %	25 %	50 %	221635535
2998	NC_011961	GCT	2	6	123916	123921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635535
2999	NC_011961	CAT	2	6	123931	123936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635535
3000	NC_011961	TGGT	2	8	123980	123987	0 %	50 %	50 %	0 %	221635535

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