MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011961	GTCCG	2	10	63665	63674	0 %	20 %	40 %	40 %	221635480
1502	NC_011961	GAGC	2	8	63736	63743	25 %	0 %	50 %	25 %	221635480
1503	NC_011961	GAG	2	6	63818	63823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635480
1504	NC_011961	GCT	2	6	63844	63849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011961	CTC	2	6	63853	63858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635481
1506	NC_011961	CGT	2	6	63866	63871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1507	NC_011961	CGC	2	6	63901	63906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635481
1508	NC_011961	AAG	2	6	63942	63947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635481
1509	NC_011961	CGA	2	6	63970	63975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1510	NC_011961	TGT	2	6	64014	64019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635481
1511	NC_011961	ACC	2	6	64046	64051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635481
1512	NC_011961	GCCCC	2	10	64058	64067	0 %	0 %	20 %	80 %	221635481
1513	NC_011961	AGG	2	6	64101	64106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635481
1514	NC_011961	CGA	2	6	64189	64194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1515	NC_011961	CAC	2	6	64256	64261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635481
1516	NC_011961	GCT	2	6	64264	64269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1517	NC_011961	ACG	2	6	64272	64277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1518	NC_011961	TCG	2	6	64293	64298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1519	NC_011961	AGA	2	6	64321	64326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635481
1520	NC_011961	GAA	2	6	64340	64345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635481
1521	NC_011961	CAG	2	6	64353	64358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1522	NC_011961	CG	3	6	64368	64373	0 %	0 %	50 %	50 %	221635481
1523	NC_011961	CGT	2	6	64378	64383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1524	NC_011961	TGC	2	6	64413	64418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1525	NC_011961	AGG	2	6	64426	64431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635481
1526	NC_011961	CTG	2	6	64433	64438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1527	NC_011961	TCC	2	6	64443	64448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635481
1528	NC_011961	TCGCC	2	10	64480	64489	0 %	20 %	20 %	60 %	221635481
1529	NC_011961	GCA	2	6	64521	64526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1530	NC_011961	TG	3	6	64548	64553	0 %	50 %	50 %	0 %	221635481
1531	NC_011961	AGC	2	6	64623	64628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1532	NC_011961	GC	3	6	64627	64632	0 %	0 %	50 %	50 %	221635481
1533	NC_011961	CAC	2	6	64688	64693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635481
1534	NC_011961	CGG	2	6	64700	64705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635481
1535	NC_011961	CAG	2	6	64717	64722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635481
1536	NC_011961	GGCG	2	8	64729	64736	0 %	0 %	75 %	25 %	221635481
1537	NC_011961	CCA	2	6	64752	64757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635481
1538	NC_011961	TGG	2	6	64761	64766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635481
1539	NC_011961	CGC	2	6	64814	64819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635481
1540	NC_011961	CTC	2	6	64837	64842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635482
1541	NC_011961	CG	3	6	64855	64860	0 %	0 %	50 %	50 %	221635482
1542	NC_011961	GCC	2	6	64868	64873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635482
1543	NC_011961	GTG	2	6	64874	64879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635482
1544	NC_011961	GGC	2	6	64900	64905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635482
1545	NC_011961	GAG	2	6	65275	65280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635482
1546	NC_011961	TG	3	6	65361	65366	0 %	50 %	50 %	0 %	221635482
1547	NC_011961	GCG	2	6	65429	65434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635482
1548	NC_011961	GGT	2	6	65483	65488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635482
1549	NC_011961	TCA	2	6	65505	65510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635482
1550	NC_011961	GATC	2	8	65535	65542	25 %	25 %	25 %	25 %	221635482
1551	NC_011961	CTG	2	6	65582	65587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1552	NC_011961	CTC	2	6	65636	65641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635483
1553	NC_011961	AGC	2	6	65657	65662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1554	NC_011961	CG	3	6	65680	65685	0 %	0 %	50 %	50 %	221635483
1555	NC_011961	CGG	2	6	65739	65744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635483
1556	NC_011961	GTC	2	6	65769	65774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1557	NC_011961	CGA	2	6	65827	65832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1558	NC_011961	TCG	2	6	65874	65879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1559	NC_011961	AGC	2	6	65928	65933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1560	NC_011961	GGT	2	6	65939	65944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635483
1561	NC_011961	GCA	2	6	65955	65960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1562	NC_011961	GCT	2	6	65985	65990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1563	NC_011961	CGGAT	2	10	65991	66000	20 %	20 %	40 %	20 %	221635483
1564	NC_011961	CG	3	6	66037	66042	0 %	0 %	50 %	50 %	221635483
1565	NC_011961	GAG	2	6	66074	66079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635483
1566	NC_011961	GAT	2	6	66149	66154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635483
1567	NC_011961	GCA	2	6	66220	66225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635483
1568	NC_011961	GACG	2	8	66229	66236	25 %	0 %	50 %	25 %	221635483
1569	NC_011961	GAGC	2	8	66248	66255	25 %	0 %	50 %	25 %	221635483
1570	NC_011961	GCC	2	6	66289	66294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_011961	GCTG	2	8	66366	66373	0 %	25 %	50 %	25 %	221635484
1572	NC_011961	CCA	2	6	66404	66409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635484
1573	NC_011961	TCGG	2	8	66418	66425	0 %	25 %	50 %	25 %	221635484
1574	NC_011961	GAA	2	6	66450	66455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635484
1575	NC_011961	CCACG	2	10	66461	66470	20 %	0 %	20 %	60 %	221635484
1576	NC_011961	TCC	2	6	66496	66501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635484
1577	NC_011961	CCG	2	6	66517	66522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635484
1578	NC_011961	CGC	2	6	66558	66563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635484
1579	NC_011961	TCG	2	6	66595	66600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635484
1580	NC_011961	TGG	2	6	66635	66640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635484
1581	NC_011961	GAT	2	6	66660	66665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635484
1582	NC_011961	GC	4	8	66688	66695	0 %	0 %	50 %	50 %	221635484
1583	NC_011961	ATC	2	6	66754	66759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635484
1584	NC_011961	CGA	2	6	66851	66856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635484
1585	NC_011961	AAG	2	6	66880	66885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635484
1586	NC_011961	GCC	2	6	66964	66969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635484
1587	NC_011961	CGA	3	9	66974	66982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635484
1588	NC_011961	CCAG	2	8	67012	67019	25 %	0 %	25 %	50 %	221635484
1589	NC_011961	GAT	3	9	67059	67067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635484
1590	NC_011961	GAT	2	6	67128	67133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635484
1591	NC_011961	CCT	2	6	67211	67216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_011961	CGC	2	6	67231	67236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635485
1593	NC_011961	GGCT	2	8	67240	67247	0 %	25 %	50 %	25 %	221635485
1594	NC_011961	GCA	2	6	67469	67474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635485
1595	NC_011961	GC	3	6	67483	67488	0 %	0 %	50 %	50 %	221635485
1596	NC_011961	GAT	2	6	67489	67494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635485
1597	NC_011961	CGT	2	6	67522	67527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635485
1598	NC_011961	ACC	2	6	67637	67642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635485
1599	NC_011961	GCC	2	6	67664	67669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635485
1600	NC_011961	CCG	2	6	67700	67705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635485
1601	NC_011961	TCG	2	6	67712	67717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635485
1602	NC_011961	GTG	2	6	67730	67735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635485
1603	NC_011961	ACC	2	6	67759	67764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635485
1604	NC_011961	ACC	2	6	67789	67794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635485
1605	NC_011961	GC	3	6	67849	67854	0 %	0 %	50 %	50 %	221635485
1606	NC_011961	CA	3	6	67861	67866	50 %	0 %	0 %	50 %	221635485
1607	NC_011961	CGT	2	6	67870	67875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635485
1608	NC_011961	TCG	2	6	67887	67892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635485
1609	NC_011961	CGCT	2	8	67985	67992	0 %	25 %	25 %	50 %	221635485
1610	NC_011961	TCGC	2	8	68042	68049	0 %	25 %	25 %	50 %	221635485
1611	NC_011961	GAG	2	6	68144	68149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635485
1612	NC_011961	CCG	2	6	68150	68155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635485
1613	NC_011961	GCC	2	6	68158	68163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635485
1614	NC_011961	CGGC	2	8	68186	68193	0 %	0 %	50 %	50 %	221635485
1615	NC_011961	TCG	2	6	68235	68240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635485
1616	NC_011961	CG	3	6	68262	68267	0 %	0 %	50 %	50 %	221635485
1617	NC_011961	GA	3	6	68316	68321	50 %	0 %	50 %	0 %	221635485
1618	NC_011961	GCC	2	6	68330	68335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635485
1619	NC_011961	GCG	2	6	68337	68342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635485
1620	NC_011961	ACTCC	2	10	68415	68424	20 %	20 %	0 %	60 %	221635485
1621	NC_011961	CCCT	2	8	68468	68475	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1622	NC_011961	AGC	2	6	68479	68484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635486
1623	NC_011961	ATG	2	6	68579	68584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635486
1624	NC_011961	CCG	2	6	68601	68606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635486
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1626	NC_011961	GTG	2	6	68672	68677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635486
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1633	NC_011961	GCGAG	2	10	68825	68834	20 %	0 %	60 %	20 %	221635486
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1655	NC_011961	TCG	2	6	69778	69783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635487
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1676	NC_011961	GATC	2	8	70489	70496	25 %	25 %	25 %	25 %	221635488
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1746	NC_011961	CGA	2	6	73372	73377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1747	NC_011961	GGC	2	6	73417	73422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1748	NC_011961	GTG	2	6	73455	73460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635491
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