MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_011961	CTC	2	6	694216	694221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636110
16502	NC_011961	CAGC	2	8	694247	694254	25 %	0 %	25 %	50 %	221636110
16503	NC_011961	CGA	2	6	694382	694387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636110
16504	NC_011961	CGC	2	6	694446	694451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636110
16505	NC_011961	GGC	2	6	694459	694464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636110
16506	NC_011961	AGC	2	6	694523	694528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636110
16507	NC_011961	CGGGCT	2	12	694542	694553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221636110
16508	NC_011961	CTC	2	6	694609	694614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636110
16509	NC_011961	AAC	2	6	694645	694650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636110
16510	NC_011961	ATCT	2	8	694702	694709	25 %	50 %	0 %	25 %	221636110
16511	NC_011961	ATG	2	6	694741	694746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636110
16512	NC_011961	GTC	2	6	694757	694762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636110
16513	NC_011961	ACC	2	6	694809	694814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16514	NC_011961	ACG	2	6	694999	695004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636111
16515	NC_011961	CGA	2	6	695194	695199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636111
16516	NC_011961	TCC	2	6	695269	695274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636111
16517	NC_011961	CTT	2	6	695285	695290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636111
16518	NC_011961	TC	3	6	695360	695365	0 %	50 %	0 %	50 %	221636111
16519	NC_011961	GAT	2	6	695429	695434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636111
16520	NC_011961	CCT	2	6	695503	695508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636111
16521	NC_011961	CCA	2	6	695544	695549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636111
16522	NC_011961	CGA	2	6	695588	695593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636111
16523	NC_011961	C	6	6	695608	695613	0 %	0 %	0 %	100 %	221636111
16524	NC_011961	TGG	2	6	695636	695641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636111
16525	NC_011961	ACA	2	6	695737	695742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636111
16526	NC_011961	ATC	2	6	695752	695757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636111
16527	NC_011961	GTC	2	6	695760	695765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636111
16528	NC_011961	CG	3	6	695854	695859	0 %	0 %	50 %	50 %	221636111
16529	NC_011961	TCG	3	9	695893	695901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636111
16530	NC_011961	CGG	2	6	695951	695956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636111
16531	NC_011961	GGT	2	6	695961	695966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636111
16532	NC_011961	GC	3	6	696034	696039	0 %	0 %	50 %	50 %	221636111
16533	NC_011961	GTC	2	6	696102	696107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636111
16534	NC_011961	AGCC	2	8	696172	696179	25 %	0 %	25 %	50 %	221636112
16535	NC_011961	TCC	2	6	696185	696190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636112
16536	NC_011961	CG	3	6	696207	696212	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
16537	NC_011961	AGC	2	6	696228	696233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16538	NC_011961	CGT	2	6	696264	696269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16539	NC_011961	CGC	2	6	696273	696278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
16540	NC_011961	ACC	2	6	696380	696385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636112
16541	NC_011961	ACC	2	6	696387	696392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636112
16542	NC_011961	TCAG	2	8	696422	696429	25 %	25 %	25 %	25 %	221636112
16543	NC_011961	TCG	2	6	696449	696454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16544	NC_011961	GAG	2	6	696463	696468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636112
16545	NC_011961	GGC	2	6	696531	696536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636112
16546	NC_011961	GAG	2	6	696565	696570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636112
16547	NC_011961	CG	3	6	696571	696576	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
16548	NC_011961	CGC	2	6	696579	696584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
16549	NC_011961	CTC	2	6	696607	696612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636112
16550	NC_011961	GAGC	2	8	696660	696667	25 %	0 %	50 %	25 %	221636112
16551	NC_011961	CG	3	6	696690	696695	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
16552	NC_011961	AGCC	2	8	696713	696720	25 %	0 %	25 %	50 %	221636112
16553	NC_011961	GCC	2	6	696727	696732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
16554	NC_011961	GCA	2	6	696733	696738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16555	NC_011961	AGC	2	6	696749	696754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16556	NC_011961	GTC	2	6	696760	696765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16557	NC_011961	TCG	2	6	696833	696838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16558	NC_011961	CCG	2	6	696854	696859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
16559	NC_011961	CGA	2	6	696936	696941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16560	NC_011961	CGA	2	6	696957	696962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16561	NC_011961	GCG	2	6	696969	696974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636112
16562	NC_011961	CTC	2	6	697012	697017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636112
16563	NC_011961	GC	4	8	697018	697025	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
16564	NC_011961	TCCG	2	8	697044	697051	0 %	25 %	25 %	50 %	221636112
16565	NC_011961	TCG	2	6	697076	697081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
16566	NC_011961	GC	3	6	697109	697114	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
16567	NC_011961	GC	3	6	697123	697128	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
16568	NC_011961	CGAC	2	8	697140	697147	25 %	0 %	25 %	50 %	221636112
16569	NC_011961	AGA	2	6	697160	697165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636112
16570	NC_011961	CGC	2	6	697187	697192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16571	NC_011961	CAG	2	6	697245	697250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636113
16572	NC_011961	TCG	3	9	697257	697265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636113
16573	NC_011961	CGG	2	6	697281	697286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636113
16574	NC_011961	TGGCGG	2	12	697372	697383	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221636113
16575	NC_011961	ACG	2	6	697397	697402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636113
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16578	NC_011961	TCA	2	6	697464	697469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636113
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16581	NC_011961	TCA	2	6	697609	697614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636113
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16584	NC_011961	TCC	2	6	697680	697685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636113
16585	NC_011961	GCC	2	6	697852	697857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636113
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16591	NC_011961	TCG	2	6	698163	698168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636113
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16593	NC_011961	GAC	2	6	698244	698249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636113
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16599	NC_011961	GC	3	6	698467	698472	0 %	0 %	50 %	50 %	221636114
16600	NC_011961	CGC	2	6	698509	698514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636114
16601	NC_011961	TCC	2	6	698522	698527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636114
16602	NC_011961	TGA	2	6	698570	698575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636114
16603	NC_011961	CCTCG	2	10	698595	698604	0 %	20 %	20 %	60 %	221636114
16604	NC_011961	CTC	2	6	698743	698748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636114
16605	NC_011961	GCG	2	6	698818	698823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636114
16606	NC_011961	TCG	2	6	698840	698845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636114
16607	NC_011961	CG	3	6	698844	698849	0 %	0 %	50 %	50 %	221636114
16608	NC_011961	CTG	2	6	698890	698895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636114
16609	NC_011961	CGCT	2	8	698908	698915	0 %	25 %	25 %	50 %	221636114
16610	NC_011961	CTCG	2	8	698938	698945	0 %	25 %	25 %	50 %	221636114
16611	NC_011961	CGC	2	6	698960	698965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636114
16612	NC_011961	CGCC	2	8	698989	698996	0 %	0 %	25 %	75 %	221636114
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16616	NC_011961	GC	3	6	699073	699078	0 %	0 %	50 %	50 %	221636114
16617	NC_011961	TGA	2	6	699183	699188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636114
16618	NC_011961	CTGG	2	8	699210	699217	0 %	25 %	50 %	25 %	221636114
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16620	NC_011961	TCC	2	6	699253	699258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636114
16621	NC_011961	GATG	2	8	699305	699312	25 %	25 %	50 %	0 %	221636114
16622	NC_011961	GCA	2	6	699334	699339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636114
16623	NC_011961	AC	3	6	699366	699371	50 %	0 %	0 %	50 %	221636114
16624	NC_011961	ATC	2	6	699421	699426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636114
16625	NC_011961	CGT	2	6	699450	699455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636114
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16629	NC_011961	GCCGG	2	10	699627	699636	0 %	0 %	60 %	40 %	221636115
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16643	NC_011961	TCG	2	6	700432	700437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636115
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16648	NC_011961	CGT	2	6	700583	700588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636115
16649	NC_011961	GCC	2	6	700617	700622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636115
16650	NC_011961	CTG	2	6	700644	700649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636115
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16657	NC_011961	GTG	2	6	701241	701246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636117
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16696	NC_011961	CCCAG	2	10	702853	702862	20 %	0 %	20 %	60 %	221636117
16697	NC_011961	GCGCA	2	10	702938	702947	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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16699	NC_011961	CG	3	6	703022	703027	0 %	0 %	50 %	50 %	221636118
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