MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011961	CGTGGC	2	12	589018	589029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221636004
14002	NC_011961	CACG	2	8	589030	589037	25 %	0 %	25 %	50 %	221636004
14003	NC_011961	GCC	2	6	589191	589196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636004
14004	NC_011961	CGC	2	6	589217	589222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636004
14005	NC_011961	CTG	2	6	589253	589258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636004
14006	NC_011961	C	6	6	589340	589345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14007	NC_011961	GCA	2	6	589429	589434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_011961	GGCA	2	8	589435	589442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14009	NC_011961	T	6	6	589443	589448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_011961	TGC	2	6	589455	589460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_011961	AGG	2	6	589473	589478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_011961	TGA	2	6	589484	589489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636005
14013	NC_011961	GCCCG	2	10	589499	589508	0 %	0 %	40 %	60 %	221636005
14014	NC_011961	TCG	2	6	589526	589531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14015	NC_011961	CGCT	2	8	589532	589539	0 %	25 %	25 %	50 %	221636005
14016	NC_011961	GA	3	6	589594	589599	50 %	0 %	50 %	0 %	221636005
14017	NC_011961	CGA	2	6	589682	589687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14018	NC_011961	C	6	6	589788	589793	0 %	0 %	0 %	100 %	221636005
14019	NC_011961	CAA	2	6	589847	589852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636005
14020	NC_011961	AGC	2	6	589888	589893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14021	NC_011961	GCA	2	6	589924	589929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14022	NC_011961	CGA	2	6	589934	589939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14023	NC_011961	TGA	2	6	589947	589952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636005
14024	NC_011961	GCA	3	9	589953	589961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14025	NC_011961	CGA	2	6	590004	590009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14026	NC_011961	GCG	2	6	590093	590098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636005
14027	NC_011961	CTGG	2	8	590123	590130	0 %	25 %	50 %	25 %	221636005
14028	NC_011961	TCG	2	6	590279	590284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14029	NC_011961	CCTT	2	8	590387	590394	0 %	50 %	0 %	50 %	221636005
14030	NC_011961	C	6	6	590406	590411	0 %	0 %	0 %	100 %	221636005
14031	NC_011961	CCT	2	6	590484	590489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636005
14032	NC_011961	CAG	2	6	590503	590508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14033	NC_011961	GGA	2	6	590532	590537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636005
14034	NC_011961	CGG	3	9	590544	590552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636005
14035	NC_011961	GCG	2	6	590582	590587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636005
14036	NC_011961	GCG	2	6	590630	590635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636005
14037	NC_011961	GCA	2	6	590636	590641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14038	NC_011961	GGA	2	6	590644	590649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636005
14039	NC_011961	AGCG	2	8	590682	590689	25 %	0 %	50 %	25 %	221636005
14040	NC_011961	GCC	2	6	590692	590697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636005
14041	NC_011961	CAGC	2	8	590716	590723	25 %	0 %	25 %	50 %	221636005
14042	NC_011961	CAG	2	6	590749	590754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14043	NC_011961	CCAG	2	8	590773	590780	25 %	0 %	25 %	50 %	221636005
14044	NC_011961	GCC	2	6	590799	590804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636005
14045	NC_011961	TCC	2	6	590816	590821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636005
14046	NC_011961	CTCAC	2	10	590845	590854	20 %	20 %	0 %	60 %	221636005
14047	NC_011961	TCG	2	6	590901	590906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636005
14048	NC_011961	ATGCC	2	10	590980	590989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14049	NC_011961	GCT	2	6	591108	591113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_011961	CGA	2	6	591159	591164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_011961	CTG	2	6	591183	591188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_011961	GCCA	2	8	591210	591217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14053	NC_011961	CAA	2	6	591240	591245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_011961	CG	3	6	591283	591288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14055	NC_011961	GA	3	6	591391	591396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_011961	AGCG	2	8	591414	591421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14057	NC_011961	GCC	2	6	591447	591452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_011961	GA	3	6	591476	591481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_011961	AGT	2	6	591604	591609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636006
14060	NC_011961	GTC	2	6	591613	591618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636006
14061	NC_011961	CGA	2	6	591705	591710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636006
14062	NC_011961	GTC	2	6	591736	591741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636006
14063	NC_011961	CGA	2	6	591743	591748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636006
14064	NC_011961	CGA	3	9	591752	591760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636006
14065	NC_011961	CGACCG	2	12	591767	591778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221636006
14066	NC_011961	GA	3	6	591780	591785	50 %	0 %	50 %	0 %	221636006
14067	NC_011961	GCTC	2	8	591811	591818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14068	NC_011961	GAC	2	6	591861	591866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_011961	TGGA	2	8	591892	591899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_011961	GTG	2	6	591927	591932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636007
14071	NC_011961	CTC	2	6	591999	592004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636007
14072	NC_011961	CGCTC	2	10	592088	592097	0 %	20 %	20 %	60 %	221636007
14073	NC_011961	ACCG	2	8	592121	592128	25 %	0 %	25 %	50 %	221636007
14074	NC_011961	CG	3	6	592177	592182	0 %	0 %	50 %	50 %	221636007
14075	NC_011961	CCT	2	6	592224	592229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636007
14076	NC_011961	CGA	2	6	592240	592245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636007
14077	NC_011961	GCC	2	6	592250	592255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636007
14078	NC_011961	ACCC	2	8	592256	592263	25 %	0 %	0 %	75 %	221636007
14079	NC_011961	GCA	2	6	592314	592319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636007
14080	NC_011961	TCG	2	6	592396	592401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636007
14081	NC_011961	CAC	2	6	592403	592408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636007
14082	NC_011961	CAG	2	6	592467	592472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636007
14083	NC_011961	CGA	2	6	592532	592537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636007
14084	NC_011961	TCC	2	6	592567	592572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636007
14085	NC_011961	TC	3	6	592618	592623	0 %	50 %	0 %	50 %	221636007
14086	NC_011961	CGG	2	6	592648	592653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636007
14087	NC_011961	ATC	2	6	592728	592733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636007
14088	NC_011961	ACGA	2	8	592740	592747	50 %	0 %	25 %	25 %	221636007
14089	NC_011961	ACC	2	6	592807	592812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636007
14090	NC_011961	GCT	2	6	592818	592823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_011961	GCC	2	6	592827	592832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14092	NC_011961	CGAT	2	8	592880	592887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14093	NC_011961	CGCC	2	8	592900	592907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14094	NC_011961	TCGC	2	8	592909	592916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14095	NC_011961	GC	3	6	592918	592923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14096	NC_011961	CAG	2	6	592924	592929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_011961	CGA	2	6	592965	592970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_011961	GA	3	6	593030	593035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_011961	CCTTC	2	10	593099	593108	0 %	40 %	0 %	60 %	221636008
14100	NC_011961	CGT	2	6	593133	593138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636008
14101	NC_011961	CTG	2	6	593139	593144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636008
14102	NC_011961	GTG	2	6	593193	593198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636008
14103	NC_011961	ATG	2	6	593199	593204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636008
14104	NC_011961	TGG	2	6	593222	593227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636008
14105	NC_011961	ACC	2	6	593229	593234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636008
14106	NC_011961	CGC	2	6	593258	593263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636008
14107	NC_011961	TCG	2	6	593290	593295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636008
14108	NC_011961	CGC	2	6	593462	593467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636008
14109	NC_011961	CGGC	2	8	593473	593480	0 %	0 %	50 %	50 %	221636008
14110	NC_011961	GGTC	2	8	593510	593517	0 %	25 %	50 %	25 %	221636008
14111	NC_011961	CCG	2	6	593653	593658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636008
14112	NC_011961	GCTC	2	8	593740	593747	0 %	25 %	25 %	50 %	221636008
14113	NC_011961	TCA	2	6	593755	593760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636008
14114	NC_011961	TGG	2	6	593794	593799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636008
14115	NC_011961	TGC	2	6	593807	593812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636008
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14117	NC_011961	GC	3	6	593874	593879	0 %	0 %	50 %	50 %	221636008
14118	NC_011961	TGG	2	6	593889	593894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636008
14119	NC_011961	CTC	2	6	593899	593904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636008
14120	NC_011961	ATC	2	6	593982	593987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636008
14121	NC_011961	TGC	2	6	594031	594036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636008
14122	NC_011961	GGA	2	6	594050	594055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636008
14123	NC_011961	CG	3	6	594071	594076	0 %	0 %	50 %	50 %	221636008
14124	NC_011961	CGC	2	6	594102	594107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636009
14125	NC_011961	A	6	6	594118	594123	100 %	0 %	0 %	0 %	221636009
14126	NC_011961	CGCT	2	8	594124	594131	0 %	25 %	25 %	50 %	221636009
14127	NC_011961	CCA	2	6	594139	594144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636009
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14154	NC_011961	TCG	2	6	594975	594980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636010
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14157	NC_011961	GCT	2	6	595127	595132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636010
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14200	NC_011961	CTG	3	9	596910	596918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636012
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14231	NC_011961	ACG	2	6	598468	598473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636013
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14234	NC_011961	ACG	3	9	598570	598578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636013
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14239	NC_011961	TCGC	2	8	598772	598779	0 %	25 %	25 %	50 %	221636013
14240	NC_011961	GGT	2	6	598836	598841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636013
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14242	NC_011961	GCC	2	6	598921	598926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636013
14243	NC_011961	GTC	2	6	598954	598959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636013
14244	NC_011961	TCG	2	6	598975	598980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636013
14245	NC_011961	CGT	2	6	598988	598993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636013
14246	NC_011961	TCG	2	6	599001	599006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636013
14247	NC_011961	TG	3	6	599044	599049	0 %	50 %	50 %	0 %	221636013
14248	NC_011961	GCCA	2	8	599076	599083	25 %	0 %	25 %	50 %	221636013
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14251	NC_011961	CTG	2	6	599323	599328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636013
14252	NC_011961	CG	3	6	599387	599392	0 %	0 %	50 %	50 %	221636013
14253	NC_011961	GCG	2	6	599429	599434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636013
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14260	NC_011961	CCGCG	2	10	599866	599875	0 %	0 %	40 %	60 %	221636014
14261	NC_011961	TCG	2	6	599926	599931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636014
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14265	NC_011961	GTC	2	6	600009	600014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636014
14266	NC_011961	CGC	2	6	600169	600174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636014
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14268	NC_011961	CGC	2	6	600247	600252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636014
14269	NC_011961	GTC	2	6	600273	600278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636014
14270	NC_011961	CCA	3	9	600281	600289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636014
14271	NC_011961	CGC	2	6	600303	600308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14272	NC_011961	TCG	2	6	600420	600425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14273	NC_011961	GCT	3	9	600431	600439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14274	NC_011961	ACG	2	6	600448	600453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
14275	NC_011961	GCA	2	6	600461	600466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
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14277	NC_011961	CGC	2	6	600512	600517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636015
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14279	NC_011961	GCT	2	6	600546	600551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636015
14280	NC_011961	CTCCC	2	10	600562	600571	0 %	20 %	0 %	80 %	221636015
14281	NC_011961	CACC	2	8	600592	600599	25 %	0 %	0 %	75 %	221636015
14282	NC_011961	CCCGAC	2	12	600662	600673	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221636015
14283	NC_011961	GC	3	6	600674	600679	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
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14289	NC_011961	GC	3	6	600871	600876	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
14290	NC_011961	CG	3	6	600880	600885	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
14291	NC_011961	ACG	2	6	600900	600905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
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14315	NC_011961	CG	3	6	601923	601928	0 %	0 %	50 %	50 %	221636016
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14333	NC_011961	GCT	2	6	602638	602643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636017
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14338	NC_011961	GCC	2	6	602769	602774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636017
14339	NC_011961	GGC	2	6	602830	602835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636017
14340	NC_011961	AGCG	2	8	602857	602864	25 %	0 %	50 %	25 %	221636017
14341	NC_011961	CGG	2	6	602967	602972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636017
14342	NC_011961	CAG	2	6	603032	603037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636017
14343	NC_011961	CAGC	2	8	603050	603057	25 %	0 %	25 %	50 %	221636017
14344	NC_011961	GAT	2	6	603106	603111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636018
14345	NC_011961	GAA	2	6	603148	603153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636018
14346	NC_011961	GGT	2	6	603159	603164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636018
14347	NC_011961	CAT	2	6	603169	603174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636018
14348	NC_011961	CTCG	2	8	603175	603182	0 %	25 %	25 %	50 %	221636018
14349	NC_011961	GC	4	8	603185	603192	0 %	0 %	50 %	50 %	221636018
14350	NC_011961	C	6	6	603251	603256	0 %	0 %	0 %	100 %	221636018
14351	NC_011961	CGCTCG	2	12	603267	603278	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221636018
14352	NC_011961	TCG	2	6	603326	603331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636018
14353	NC_011961	CCTG	2	8	603346	603353	0 %	25 %	25 %	50 %	221636018
14354	NC_011961	CCG	2	6	603365	603370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636018
14355	NC_011961	CTT	2	6	603387	603392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636018
14356	NC_011961	CAG	4	12	603409	603420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636018
14357	NC_011961	CAG	2	6	603427	603432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636018
14358	NC_011961	CTC	2	6	603484	603489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636018
14359	NC_011961	GCC	2	6	603532	603537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636018
14360	NC_011961	CCCG	2	8	603608	603615	0 %	0 %	25 %	75 %	221636018
14361	NC_011961	CGAT	2	8	603683	603690	25 %	25 %	25 %	25 %	221636018
14362	NC_011961	CGGTTG	2	12	603803	603814	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221636018
14363	NC_011961	ATTAG	2	10	603824	603833	40 %	40 %	20 %	0 %	221636018
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14366	NC_011961	TCG	2	6	603996	604001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636019
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14380	NC_011961	TCCG	2	8	604575	604582	0 %	25 %	25 %	50 %	221636019
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14391	NC_011961	GCT	2	6	605174	605179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14393	NC_011961	CTGG	2	8	605222	605229	0 %	25 %	50 %	25 %	221636021
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14472	NC_011961	ACTC	2	8	609244	609251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14473	NC_011961	CAC	2	6	609260	609265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14474	NC_011961	CTCG	2	8	609271	609278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14475	NC_011961	GTC	2	6	609374	609379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636025
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14479	NC_011961	CG	4	8	609484	609491	0 %	0 %	50 %	50 %	221636025
14480	NC_011961	CGA	2	6	609514	609519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636025
14481	NC_011961	CCT	2	6	609598	609603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636025
14482	NC_011961	CGT	2	6	609640	609645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636025
14483	NC_011961	GCT	2	6	609653	609658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636025
14484	NC_011961	TCC	2	6	609687	609692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14485	NC_011961	TTCA	2	8	609694	609701	25 %	50 %	0 %	25 %	221636026
14486	NC_011961	CCA	2	6	609716	609721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636026
14487	NC_011961	GCCGC	2	10	609802	609811	0 %	0 %	40 %	60 %	221636026
14488	NC_011961	GTA	2	6	609875	609880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636026
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14490	NC_011961	TCC	2	6	609999	610004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636026
14491	NC_011961	CCG	2	6	610062	610067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636026
14492	NC_011961	CATCG	2	10	610076	610085	20 %	20 %	20 %	40 %	221636026
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14500	NC_011961	CG	3	6	610493	610498	0 %	0 %	50 %	50 %	221636027

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