MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011961	CCA	2	6	568644	568649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13502	NC_011961	TCC	2	6	568676	568681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635980
13503	NC_011961	CG	3	6	568782	568787	0 %	0 %	50 %	50 %	221635980
13504	NC_011961	CGTG	2	8	568811	568818	0 %	25 %	50 %	25 %	221635980
13505	NC_011961	GAT	2	6	568825	568830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635980
13506	NC_011961	CAC	2	6	568901	568906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13507	NC_011961	TCC	2	6	568907	568912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635980
13508	NC_011961	AGC	2	6	569042	569047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13509	NC_011961	GTT	2	6	569058	569063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635980
13510	NC_011961	CCA	2	6	569067	569072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13511	NC_011961	CG	3	6	569074	569079	0 %	0 %	50 %	50 %	221635980
13512	NC_011961	CTG	3	9	569083	569091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13513	NC_011961	CCG	3	9	569148	569156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635980
13514	NC_011961	GCGAC	2	10	569225	569234	20 %	0 %	40 %	40 %	221635980
13515	NC_011961	CAC	2	6	569251	569256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13516	NC_011961	CTCG	2	8	569307	569314	0 %	25 %	25 %	50 %	221635980
13517	NC_011961	CAC	2	6	569347	569352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13518	NC_011961	CTC	2	6	569422	569427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635980
13519	NC_011961	CAA	2	6	569563	569568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635980
13520	NC_011961	GGC	2	6	569616	569621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635980
13521	NC_011961	GTGC	2	8	569651	569658	0 %	25 %	50 %	25 %	221635980
13522	NC_011961	GCACC	2	10	569706	569715	20 %	0 %	20 %	60 %	221635980
13523	NC_011961	CAG	2	6	569721	569726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13524	NC_011961	CAG	2	6	569728	569733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13525	NC_011961	TCCGC	2	10	569741	569750	0 %	20 %	20 %	60 %	221635980
13526	NC_011961	GCTC	2	8	569751	569758	0 %	25 %	25 %	50 %	221635980
13527	NC_011961	CGA	2	6	569769	569774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13528	NC_011961	CAC	2	6	569845	569850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13529	NC_011961	GGA	2	6	569882	569887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635980
13530	NC_011961	CTC	2	6	569893	569898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635980
13531	NC_011961	CGC	2	6	569912	569917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635980
13532	NC_011961	CTC	2	6	569949	569954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635980
13533	NC_011961	GAT	2	6	569974	569979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635980
13534	NC_011961	GAG	2	6	569980	569985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635980
13535	NC_011961	TCCC	2	8	570032	570039	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13536	NC_011961	TTC	2	6	570089	570094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_011961	CGAGGG	2	12	570122	570133	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221635981
13538	NC_011961	CCA	2	6	570212	570217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635981
13539	NC_011961	CCG	2	6	570252	570257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635981
13540	NC_011961	AGG	2	6	570453	570458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635981
13541	NC_011961	CGA	3	9	570514	570522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635981
13542	NC_011961	ACC	2	6	570531	570536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635981
13543	NC_011961	GCA	2	6	570559	570564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635981
13544	NC_011961	CGA	2	6	570583	570588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635981
13545	NC_011961	GAG	2	6	570681	570686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635981
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13547	NC_011961	GAG	2	6	570710	570715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635981
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13550	NC_011961	CCA	2	6	570835	570840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635981
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13552	NC_011961	GGCC	2	8	570914	570921	0 %	0 %	50 %	50 %	221635981
13553	NC_011961	GCC	2	6	570930	570935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635981
13554	NC_011961	CCAGG	2	10	570941	570950	20 %	0 %	40 %	40 %	221635981
13555	NC_011961	GCT	2	6	571038	571043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635981
13556	NC_011961	GAG	2	6	571058	571063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635981
13557	NC_011961	AAG	2	6	571151	571156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635981
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13559	NC_011961	TCGC	2	8	571219	571226	0 %	25 %	25 %	50 %	221635981
13560	NC_011961	CCG	2	6	571239	571244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635981
13561	NC_011961	ACCA	2	8	571275	571282	50 %	0 %	0 %	50 %	221635981
13562	NC_011961	C	6	6	571381	571386	0 %	0 %	0 %	100 %	221635981
13563	NC_011961	CCTG	2	8	571399	571406	0 %	25 %	25 %	50 %	221635981
13564	NC_011961	GC	3	6	571465	571470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13565	NC_011961	CGC	2	6	571666	571671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635982
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13567	NC_011961	GCT	2	6	571718	571723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635982
13568	NC_011961	CTT	2	6	571738	571743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635982
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13571	NC_011961	CTG	2	6	571856	571861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635982
13572	NC_011961	GCT	2	6	571888	571893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635982
13573	NC_011961	GC	3	6	571924	571929	0 %	0 %	50 %	50 %	221635982
13574	NC_011961	TGAC	2	8	571936	571943	25 %	25 %	25 %	25 %	221635982
13575	NC_011961	AGT	2	6	571965	571970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_011961	GAAC	2	8	572024	572031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13577	NC_011961	GCG	2	6	572037	572042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_011961	TC	3	6	572068	572073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_011961	CAGT	2	8	572083	572090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13580	NC_011961	GTC	2	6	572189	572194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_011961	CG	4	8	572216	572223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13587	NC_011961	CCG	2	6	572578	572583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635983
13588	NC_011961	CAGT	2	8	572593	572600	25 %	25 %	25 %	25 %	221635983
13589	NC_011961	TCG	2	6	572635	572640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635983
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13591	NC_011961	TCC	2	6	572657	572662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13592	NC_011961	GAA	2	6	572712	572717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_011961	CG	3	6	572779	572784	0 %	0 %	50 %	50 %	221635984
13594	NC_011961	TCG	2	6	572801	572806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635984
13595	NC_011961	CGGA	2	8	572817	572824	25 %	0 %	50 %	25 %	221635984
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13602	NC_011961	GCCA	2	8	573072	573079	25 %	0 %	25 %	50 %	221635985
13603	NC_011961	ACG	2	6	573089	573094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635985
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13605	NC_011961	GCC	2	6	573126	573131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635985
13606	NC_011961	TCT	2	6	573134	573139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635985
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13609	NC_011961	CGT	2	6	573291	573296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635985
13610	NC_011961	CGTGA	2	10	573343	573352	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13611	NC_011961	TAG	2	6	573414	573419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_011961	AC	3	6	573437	573442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13613	NC_011961	GCC	2	6	573447	573452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13614	NC_011961	GAGT	2	8	573454	573461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_011961	CAGG	2	8	573466	573473	25 %	0 %	50 %	25 %	221635986
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13622	NC_011961	GCA	2	6	573674	573679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635986
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13624	NC_011961	GCA	2	6	573764	573769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635986
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