MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011961	AGC	2	6	546385	546390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635960
13002	NC_011961	GCA	2	6	546430	546435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635960
13003	NC_011961	CGC	2	6	546480	546485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635960
13004	NC_011961	AGG	2	6	546509	546514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635960
13005	NC_011961	TGG	2	6	546521	546526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635960
13006	NC_011961	ACG	2	6	546566	546571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635960
13007	NC_011961	GC	3	6	546596	546601	0 %	0 %	50 %	50 %	221635960
13008	NC_011961	GGC	2	6	546611	546616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635960
13009	NC_011961	TGA	2	6	546625	546630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635960
13010	NC_011961	GTCA	2	8	546713	546720	25 %	25 %	25 %	25 %	221635960
13011	NC_011961	TCG	2	6	546819	546824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635960
13012	NC_011961	TGC	2	6	546830	546835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635960
13013	NC_011961	AACC	2	8	546858	546865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_011961	GCG	2	6	546946	546951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635961
13015	NC_011961	GCGA	2	8	546964	546971	25 %	0 %	50 %	25 %	221635961
13016	NC_011961	GCG	2	6	547010	547015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635961
13017	NC_011961	TCCT	2	8	547037	547044	0 %	50 %	0 %	50 %	221635961
13018	NC_011961	GCG	2	6	547071	547076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635961
13019	NC_011961	CTG	3	9	547144	547152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635961
13020	NC_011961	CGT	2	6	547162	547167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635961
13021	NC_011961	GAC	2	6	547179	547184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635961
13022	NC_011961	TCG	2	6	547202	547207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635961
13023	NC_011961	TGG	2	6	547250	547255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635961
13024	NC_011961	TCAC	2	8	547298	547305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_011961	ACG	2	6	547327	547332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_011961	CAC	2	6	547340	547345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_011961	CGGC	2	8	547356	547363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_011961	AGC	2	6	547369	547374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_011961	GA	3	6	547416	547421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_011961	GCT	2	6	547536	547541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_011961	GCGT	2	8	547621	547628	0 %	25 %	50 %	25 %	221635962
13032	NC_011961	GGCC	2	8	547636	547643	0 %	0 %	50 %	50 %	221635962
13033	NC_011961	GCC	2	6	547652	547657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635962
13034	NC_011961	GCTC	2	8	547671	547678	0 %	25 %	25 %	50 %	221635962
13035	NC_011961	GC	3	6	547736	547741	0 %	0 %	50 %	50 %	221635962
13036	NC_011961	CG	3	6	547754	547759	0 %	0 %	50 %	50 %	221635963
13037	NC_011961	TCGC	2	8	547792	547799	0 %	25 %	25 %	50 %	221635963
13038	NC_011961	CGA	2	6	547843	547848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635963
13039	NC_011961	ATCCGC	2	12	547856	547867	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221635963
13040	NC_011961	CCG	2	6	547887	547892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635963
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13042	NC_011961	TCCG	2	8	547950	547957	0 %	25 %	25 %	50 %	221635963
13043	NC_011961	GCGCT	2	10	548015	548024	0 %	20 %	40 %	40 %	221635964
13044	NC_011961	CGG	2	6	548087	548092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635964
13045	NC_011961	TCG	2	6	548096	548101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635964
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13050	NC_011961	CGGC	2	8	548187	548194	0 %	0 %	50 %	50 %	221635964
13051	NC_011961	TGC	3	9	548205	548213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635964
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13053	NC_011961	TGA	2	6	548297	548302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635965
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13057	NC_011961	GCT	2	6	548460	548465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635965
13058	NC_011961	GCT	2	6	548505	548510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635965
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13060	NC_011961	GCTG	2	8	548548	548555	0 %	25 %	50 %	25 %	221635965
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13072	NC_011961	CGCTC	2	10	549311	549320	0 %	20 %	20 %	60 %	221635966
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13081	NC_011961	GCCG	2	8	549673	549680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13103	NC_011961	TGC	2	6	550682	550687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635967
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13116	NC_011961	CCGT	2	8	551187	551194	0 %	25 %	25 %	50 %	221635967
13117	NC_011961	CAC	2	6	551227	551232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635967
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13121	NC_011961	CG	3	6	551320	551325	0 %	0 %	50 %	50 %	221635967
13122	NC_011961	CGG	2	6	551346	551351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635967
13123	NC_011961	CG	3	6	551420	551425	0 %	0 %	50 %	50 %	221635967
13124	NC_011961	GAT	2	6	551437	551442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635967
13125	NC_011961	GCT	2	6	551531	551536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635967
13126	NC_011961	GC	4	8	551575	551582	0 %	0 %	50 %	50 %	221635967
13127	NC_011961	CCG	2	6	551594	551599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635967
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13132	NC_011961	CGT	2	6	551813	551818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635967
13133	NC_011961	GTT	2	6	551875	551880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635967
13134	NC_011961	GTC	2	6	551914	551919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635967
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13142	NC_011961	GAC	2	6	552352	552357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635967
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13152	NC_011961	CAGG	2	8	552727	552734	25 %	0 %	50 %	25 %	221635968
13153	NC_011961	CGA	2	6	552760	552765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635968
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13230	NC_011961	GTGC	2	8	555869	555876	0 %	25 %	50 %	25 %	221635969
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13237	NC_011961	CGA	2	6	556149	556154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635969
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13240	NC_011961	GATC	2	8	556443	556450	25 %	25 %	25 %	25 %	221635969
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13242	NC_011961	GCC	2	6	556652	556657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635969
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13245	NC_011961	TCG	2	6	556727	556732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635969
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13325	NC_011961	GC	3	6	560782	560787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13326	NC_011961	CGT	2	6	560837	560842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635973
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13333	NC_011961	CGA	2	6	561328	561333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635973
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13344	NC_011961	CGC	2	6	561684	561689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635973
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13350	NC_011961	CAC	2	6	561905	561910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635973
13351	NC_011961	CGCCT	2	10	561983	561992	0 %	20 %	20 %	60 %	221635973
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13353	NC_011961	GCCA	2	8	562056	562063	25 %	0 %	25 %	50 %	221635973
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13355	NC_011961	CAG	2	6	562145	562150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635973
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13357	NC_011961	CGCGC	2	10	562275	562284	0 %	0 %	40 %	60 %	221635973
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13359	NC_011961	CCG	2	6	562310	562315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635973
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13361	NC_011961	TCG	2	6	562347	562352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635973
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13480	NC_011961	TCA	2	6	567663	567668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635979
13481	NC_011961	GGCGAT	2	12	567754	567765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635980
13482	NC_011961	CGC	2	6	567779	567784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635980
13483	NC_011961	GGC	2	6	567787	567792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635980
13484	NC_011961	GCT	2	6	567809	567814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13485	NC_011961	CAA	2	6	567817	567822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635980
13486	NC_011961	CGAG	2	8	567864	567871	25 %	0 %	50 %	25 %	221635980
13487	NC_011961	TCG	2	6	567890	567895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13488	NC_011961	CGC	2	6	567926	567931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635980
13489	NC_011961	ACC	2	6	567980	567985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635980
13490	NC_011961	CCG	2	6	567998	568003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635980
13491	NC_011961	TCGG	2	8	568023	568030	0 %	25 %	50 %	25 %	221635980
13492	NC_011961	AGCG	2	8	568031	568038	25 %	0 %	50 %	25 %	221635980
13493	NC_011961	CGG	2	6	568196	568201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635980
13494	NC_011961	GGTC	2	8	568221	568228	0 %	25 %	50 %	25 %	221635980
13495	NC_011961	AGGCG	2	10	568302	568311	20 %	0 %	60 %	20 %	221635980
13496	NC_011961	CGC	2	6	568382	568387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635980
13497	NC_011961	ACA	2	6	568463	568468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635980
13498	NC_011961	CGA	2	6	568566	568571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13499	NC_011961	CAG	2	6	568591	568596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980
13500	NC_011961	CGA	2	6	568605	568610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635980

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