MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011961	TCG	2	6	523678	523683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635937
12502	NC_011961	GC	3	6	523697	523702	0 %	0 %	50 %	50 %	221635937
12503	NC_011961	AGCG	2	8	523725	523732	25 %	0 %	50 %	25 %	221635937
12504	NC_011961	CGCC	2	8	523757	523764	0 %	0 %	25 %	75 %	221635937
12505	NC_011961	CAGC	2	8	523775	523782	25 %	0 %	25 %	50 %	221635937
12506	NC_011961	CCG	2	6	523792	523797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_011961	AGT	2	6	523840	523845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_011961	AGC	2	6	523847	523852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_011961	CTC	2	6	523857	523862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_011961	GCT	2	6	523905	523910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_011961	GC	3	6	523955	523960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_011961	GC	3	6	523972	523977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12513	NC_011961	CG	3	6	523987	523992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_011961	GTC	2	6	524051	524056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_011961	CTG	2	6	524060	524065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_011961	GCA	2	6	524209	524214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_011961	CGA	2	6	524250	524255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_011961	CTC	2	6	524320	524325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_011961	GTC	2	6	524332	524337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12520	NC_011961	CCA	2	6	524361	524366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635938
12521	NC_011961	CAG	2	6	524414	524419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12522	NC_011961	TGC	2	6	524420	524425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12523	NC_011961	GCA	2	6	524551	524556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12524	NC_011961	CGA	2	6	524581	524586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12525	NC_011961	GTCG	2	8	524590	524597	0 %	25 %	50 %	25 %	221635938
12526	NC_011961	ACG	2	6	524598	524603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12527	NC_011961	ACG	2	6	524634	524639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12528	NC_011961	TCGG	2	8	524670	524677	0 %	25 %	50 %	25 %	221635938
12529	NC_011961	CTC	2	6	524678	524683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635938
12530	NC_011961	CCGA	2	8	524726	524733	25 %	0 %	25 %	50 %	221635938
12531	NC_011961	ACG	2	6	524829	524834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12532	NC_011961	GCGCAG	2	12	524954	524965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221635938
12533	NC_011961	AGG	2	6	524997	525002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635938
12534	NC_011961	CTG	2	6	525007	525012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12535	NC_011961	GCT	3	9	525046	525054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12536	NC_011961	C	6	6	525057	525062	0 %	0 %	0 %	100 %	221635938
12537	NC_011961	GC	3	6	525135	525140	0 %	0 %	50 %	50 %	221635938
12538	NC_011961	CG	3	6	525147	525152	0 %	0 %	50 %	50 %	221635938
12539	NC_011961	AAC	2	6	525201	525206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635938
12540	NC_011961	TTC	2	6	525239	525244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635938
12541	NC_011961	GCC	2	6	525260	525265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635938
12542	NC_011961	CGCC	2	8	525279	525286	0 %	0 %	25 %	75 %	221635938
12543	NC_011961	GTC	2	6	525339	525344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635938
12544	NC_011961	GC	3	6	525390	525395	0 %	0 %	50 %	50 %	221635938
12545	NC_011961	CCAG	2	8	525400	525407	25 %	0 %	25 %	50 %	221635938
12546	NC_011961	CTC	2	6	525494	525499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635939
12547	NC_011961	CCCGC	2	10	525500	525509	0 %	0 %	20 %	80 %	221635939
12548	NC_011961	CCA	2	6	525517	525522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635939
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12550	NC_011961	CGG	2	6	525600	525605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635939
12551	NC_011961	GTC	2	6	525683	525688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635939
12552	NC_011961	CG	3	6	525754	525759	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
12553	NC_011961	GCT	2	6	525785	525790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635939
12554	NC_011961	TGT	2	6	525809	525814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635939
12555	NC_011961	GC	3	6	525824	525829	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
12556	NC_011961	CGA	2	6	525870	525875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
12557	NC_011961	CCAACG	2	12	525930	525941	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	221635939
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12559	NC_011961	CAC	2	6	526018	526023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635939
12560	NC_011961	CG	4	8	526136	526143	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
12561	NC_011961	TGG	2	6	526252	526257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635939
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12565	NC_011961	GA	3	6	526382	526387	50 %	0 %	50 %	0 %	221635939
12566	NC_011961	ATCGCG	2	12	526433	526444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221635939
12567	NC_011961	CGT	2	6	526468	526473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635939
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12569	NC_011961	AACGG	2	10	526508	526517	40 %	0 %	40 %	20 %	221635939
12570	NC_011961	GC	3	6	526558	526563	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
12571	NC_011961	CGC	2	6	526597	526602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635939
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12573	NC_011961	GAA	2	6	526660	526665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635939
12574	NC_011961	GAGT	2	8	526686	526693	25 %	25 %	50 %	0 %	221635939
12575	NC_011961	AGC	2	6	526709	526714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
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12577	NC_011961	GCCA	2	8	526805	526812	25 %	0 %	25 %	50 %	221635939
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12581	NC_011961	CCTC	2	8	526964	526971	0 %	25 %	0 %	75 %	221635939
12582	NC_011961	GC	3	6	526976	526981	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
12583	NC_011961	CGACG	2	10	527014	527023	20 %	0 %	40 %	40 %	221635939
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12589	NC_011961	GCG	2	6	527207	527212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
12590	NC_011961	GAG	2	6	527241	527246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635940
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12593	NC_011961	TCG	2	6	527495	527500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
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12600	NC_011961	CCTT	2	8	527836	527843	0 %	50 %	0 %	50 %	221635940
12601	NC_011961	GAA	2	6	527877	527882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635940
12602	NC_011961	CTG	2	6	527888	527893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
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12604	NC_011961	CGG	2	6	527933	527938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
12605	NC_011961	AATA	2	8	528026	528033	75 %	25 %	0 %	0 %	221635940
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12607	NC_011961	CGGT	2	8	528065	528072	0 %	25 %	50 %	25 %	221635940
12608	NC_011961	GCCG	2	8	528078	528085	0 %	0 %	50 %	50 %	221635940
12609	NC_011961	GCA	2	6	528094	528099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635940
12610	NC_011961	TGCC	2	8	528131	528138	0 %	25 %	25 %	50 %	221635940
12611	NC_011961	GCT	2	6	528142	528147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
12612	NC_011961	GGC	2	6	528195	528200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
12613	NC_011961	TCCA	2	8	528209	528216	25 %	25 %	0 %	50 %	221635940
12614	NC_011961	GCG	2	6	528217	528222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
12615	NC_011961	CCG	2	6	528232	528237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635940
12616	NC_011961	TC	3	6	528266	528271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12617	NC_011961	TCG	2	6	528279	528284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_011961	TC	3	6	528287	528292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12619	NC_011961	ATTC	2	8	528372	528379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12620	NC_011961	CCT	2	6	528422	528427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635941
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12622	NC_011961	TGGA	2	8	528473	528480	25 %	25 %	50 %	0 %	221635941
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12742	NC_011961	CGT	2	6	533919	533924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12995	NC_011961	CGGT	2	8	546016	546023	0 %	25 %	50 %	25 %	221635960
12996	NC_011961	GC	3	6	546063	546068	0 %	0 %	50 %	50 %	221635960
12997	NC_011961	CCGG	2	8	546089	546096	0 %	0 %	50 %	50 %	221635960
12998	NC_011961	AGCG	2	8	546176	546183	25 %	0 %	50 %	25 %	221635960
12999	NC_011961	GACATG	2	12	546251	546262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221635960
13000	NC_011961	CGAA	2	8	546318	546325	50 %	0 %	25 %	25 %	221635960

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