MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_011961	CTG	2	6	499617	499622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635914
12003	NC_011961	CG	3	6	499697	499702	0 %	0 %	50 %	50 %	221635914
12004	NC_011961	GCG	2	6	499761	499766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635914
12005	NC_011961	CCG	2	6	499780	499785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635914
12006	NC_011961	CGG	2	6	499920	499925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635914
12007	NC_011961	GCC	2	6	499974	499979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635914
12008	NC_011961	GCG	2	6	499989	499994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635914
12009	NC_011961	GAC	2	6	499995	500000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635914
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12011	NC_011961	TCG	2	6	500146	500151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635914
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12013	NC_011961	TCC	2	6	500340	500345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635915
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12015	NC_011961	GGC	2	6	500403	500408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635915
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12049	NC_011961	CACGG	2	10	502322	502331	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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12051	NC_011961	CT	5	10	502451	502460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12052	NC_011961	TCG	2	6	502542	502547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635918
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12119	NC_011961	GC	3	6	505992	505997	0 %	0 %	50 %	50 %	221635920
12120	NC_011961	GC	3	6	506005	506010	0 %	0 %	50 %	50 %	221635920
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12122	NC_011961	TGG	2	6	506059	506064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635920
12123	NC_011961	TGG	2	6	506119	506124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635920
12124	NC_011961	TGG	2	6	506146	506151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635920
12125	NC_011961	CGC	2	6	506197	506202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635920
12126	NC_011961	CTG	2	6	506229	506234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12127	NC_011961	GAGC	2	8	506282	506289	25 %	0 %	50 %	25 %	221635920
12128	NC_011961	CTG	2	6	506290	506295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12129	NC_011961	CGC	2	6	506321	506326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635920
12130	NC_011961	TGC	2	6	506351	506356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12131	NC_011961	GCT	2	6	506381	506386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12132	NC_011961	GC	3	6	506471	506476	0 %	0 %	50 %	50 %	221635920
12133	NC_011961	GCTATG	2	12	506500	506511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221635920
12134	NC_011961	GC	3	6	506544	506549	0 %	0 %	50 %	50 %	221635920
12135	NC_011961	CCA	3	9	506583	506591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635920
12136	NC_011961	CGAT	2	8	506623	506630	25 %	25 %	25 %	25 %	221635920
12137	NC_011961	GTC	2	6	506637	506642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12138	NC_011961	CGA	2	6	506654	506659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12139	NC_011961	TCGCG	2	10	506660	506669	0 %	20 %	40 %	40 %	221635920
12140	NC_011961	GAA	2	6	506697	506702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635920
12141	NC_011961	GCT	2	6	506717	506722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635920
12142	NC_011961	CGG	2	6	506795	506800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635920
12143	NC_011961	TCC	2	6	506812	506817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635920
12144	NC_011961	GTG	2	6	506827	506832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635920
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12146	NC_011961	CGATC	2	10	506899	506908	20 %	20 %	20 %	40 %	221635921
12147	NC_011961	TCGC	2	8	506909	506916	0 %	25 %	25 %	50 %	221635921
12148	NC_011961	GAG	2	6	506948	506953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635921
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12150	NC_011961	GTGC	2	8	507098	507105	0 %	25 %	50 %	25 %	221635921
12151	NC_011961	CGT	3	9	507142	507150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635921
12152	NC_011961	GGGA	2	8	507169	507176	25 %	0 %	75 %	0 %	221635921
12153	NC_011961	ATC	2	6	507177	507182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635921
12154	NC_011961	CGA	2	6	507217	507222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635921
12155	NC_011961	CGG	2	6	507277	507282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635921
12156	NC_011961	AGG	2	6	507324	507329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635921
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12159	NC_011961	GCTC	2	8	507385	507392	0 %	25 %	25 %	50 %	221635921
12160	NC_011961	CGT	2	6	507425	507430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635921
12161	NC_011961	CGC	2	6	507451	507456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635921
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12164	NC_011961	CGG	2	6	507528	507533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635921
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12168	NC_011961	GAC	3	9	507617	507625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635921
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12186	NC_011961	TCCC	2	8	508519	508526	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12187	NC_011961	CAC	2	6	508536	508541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12188	NC_011961	CGT	2	6	508542	508547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12189	NC_011961	CGGG	2	8	508555	508562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12190	NC_011961	GCG	2	6	508612	508617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12191	NC_011961	CT	3	6	508648	508653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12192	NC_011961	GACCG	2	10	508657	508666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12193	NC_011961	GGGA	2	8	508754	508761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12194	NC_011961	GCC	2	6	508831	508836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635922
12195	NC_011961	TCG	2	6	508860	508865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635922
12196	NC_011961	CTCG	2	8	508885	508892	0 %	25 %	25 %	50 %	221635922
12197	NC_011961	AGC	2	6	508896	508901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635922
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12201	NC_011961	TGG	2	6	509130	509135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635922
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12206	NC_011961	CGGC	2	8	509345	509352	0 %	0 %	50 %	50 %	221635922
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12210	NC_011961	GTCA	2	8	509650	509657	25 %	25 %	25 %	25 %	221635922
12211	NC_011961	CCG	2	6	509660	509665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635922
12212	NC_011961	CCG	2	6	509741	509746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635922
12213	NC_011961	GCCGGT	2	12	509764	509775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221635922
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12215	NC_011961	GAT	2	6	510103	510108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635922
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12217	NC_011961	GTGG	2	8	510190	510197	0 %	25 %	75 %	0 %	221635922
12218	NC_011961	AGCG	3	12	510263	510274	25 %	0 %	50 %	25 %	221635923
12219	NC_011961	ATC	2	6	510361	510366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635923
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12223	NC_011961	AGG	2	6	510472	510477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635923
12224	NC_011961	TGA	2	6	510557	510562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635923
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12228	NC_011961	CCA	2	6	510673	510678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635923
12229	NC_011961	CGT	2	6	510685	510690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635923
12230	NC_011961	CTC	2	6	510720	510725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635923
12231	NC_011961	CCA	2	6	510732	510737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635923
12232	NC_011961	CGACTG	2	12	510932	510943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221635923
12233	NC_011961	ATT	2	6	511008	511013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221635924
12234	NC_011961	CTT	2	6	511034	511039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635924
12235	NC_011961	GCT	2	6	511097	511102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635924
12236	NC_011961	TCGC	2	8	511205	511212	0 %	25 %	25 %	50 %	221635925
12237	NC_011961	A	6	6	511218	511223	100 %	0 %	0 %	0 %	221635925
12238	NC_011961	GCC	2	6	511315	511320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635925
12239	NC_011961	GGA	3	9	511323	511331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635925
12240	NC_011961	AGC	2	6	511440	511445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635925
12241	NC_011961	TCC	2	6	511451	511456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635925
12242	NC_011961	GC	3	6	511552	511557	0 %	0 %	50 %	50 %	221635925
12243	NC_011961	GGA	2	6	511642	511647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635925
12244	NC_011961	GC	3	6	511656	511661	0 %	0 %	50 %	50 %	221635925
12245	NC_011961	ACG	2	6	511679	511684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635925
12246	NC_011961	CTG	2	6	511750	511755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635925
12247	NC_011961	TGGC	2	8	511775	511782	0 %	25 %	50 %	25 %	221635925
12248	NC_011961	CT	3	6	511810	511815	0 %	50 %	0 %	50 %	221635925
12249	NC_011961	GGA	2	6	511863	511868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635925
12250	NC_011961	GGA	2	6	511884	511889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635925
12251	NC_011961	GAACTC	2	12	511900	511911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221635925
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12255	NC_011961	GCA	2	6	512137	512142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635925
12256	NC_011961	AGCG	2	8	512145	512152	25 %	0 %	50 %	25 %	221635925
12257	NC_011961	TCA	2	6	512201	512206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635925
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12261	NC_011961	GTT	2	6	512400	512405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635926
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12264	NC_011961	GTTC	2	8	512471	512478	0 %	50 %	25 %	25 %	221635926
12265	NC_011961	ATC	2	6	512565	512570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635926
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12283	NC_011961	TCG	2	6	513631	513636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635926
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12285	NC_011961	CCT	2	6	513765	513770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12286	NC_011961	GGC	2	6	513823	513828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12287	NC_011961	GT	3	6	513883	513888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12324	NC_011961	CCG	2	6	515525	515530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12325	NC_011961	TGC	2	6	515534	515539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635929
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12330	NC_011961	GAG	2	6	515752	515757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635930
12331	NC_011961	ATGC	2	8	515788	515795	25 %	25 %	25 %	25 %	221635930
12332	NC_011961	GCA	2	6	515867	515872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12333	NC_011961	GCC	2	6	515957	515962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12334	NC_011961	ATC	2	6	515969	515974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12337	NC_011961	GGT	2	6	516037	516042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12338	NC_011961	GC	3	6	516077	516082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12339	NC_011961	CG	4	8	516154	516161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12340	NC_011961	GCT	2	6	516178	516183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12342	NC_011961	GC	3	6	516205	516210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12343	NC_011961	GC	3	6	516223	516228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12344	NC_011961	TGG	2	6	516279	516284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12345	NC_011961	TGG	2	6	516347	516352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12346	NC_011961	ACG	2	6	516368	516373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12347	NC_011961	CGT	2	6	516424	516429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12348	NC_011961	TGGC	2	8	516542	516549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12349	NC_011961	GCC	2	6	516628	516633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12350	NC_011961	GC	3	6	516688	516693	0 %	0 %	50 %	50 %	221635931
12351	NC_011961	CGGC	2	8	516698	516705	0 %	0 %	50 %	50 %	221635931
12352	NC_011961	CGA	2	6	516789	516794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635931
12353	NC_011961	G	6	6	516821	516826	0 %	0 %	100 %	0 %	221635931
12354	NC_011961	CGC	2	6	516880	516885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635931
12355	NC_011961	CGGT	2	8	516889	516896	0 %	25 %	50 %	25 %	221635931
12356	NC_011961	GAC	2	6	516911	516916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635931
12357	NC_011961	TGG	2	6	516944	516949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635931
12358	NC_011961	AAGG	2	8	517055	517062	50 %	0 %	50 %	0 %	221635931
12359	NC_011961	GAG	2	6	517115	517120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635931
12360	NC_011961	CGA	2	6	517213	517218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635931
12361	NC_011961	CGG	2	6	517257	517262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635931
12362	NC_011961	ACG	2	6	517263	517268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635931
12363	NC_011961	CG	3	6	517299	517304	0 %	0 %	50 %	50 %	221635931
12364	NC_011961	CGA	2	6	517306	517311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635931
12365	NC_011961	CGG	2	6	517318	517323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635931
12366	NC_011961	CGAC	2	8	517329	517336	25 %	0 %	25 %	50 %	221635931
12367	NC_011961	GGC	2	6	517616	517621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635931
12368	NC_011961	CGC	2	6	517690	517695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635931
12369	NC_011961	GC	3	6	517713	517718	0 %	0 %	50 %	50 %	221635931
12370	NC_011961	CGG	2	6	517740	517745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635931
12371	NC_011961	GAT	2	6	517940	517945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635931
12372	NC_011961	GCA	2	6	518053	518058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635931
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12400	NC_011961	GCGA	2	8	519227	519234	25 %	0 %	50 %	25 %	221635931
12401	NC_011961	CGC	2	6	519265	519270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635931
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12404	NC_011961	CGAG	2	8	519339	519346	25 %	0 %	50 %	25 %	221635931
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12442	NC_011961	CGATCC	2	12	520875	520886	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12443	NC_011961	GCA	2	6	520898	520903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12445	NC_011961	GAGCG	2	10	521023	521032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12446	NC_011961	CGGT	2	8	521047	521054	0 %	25 %	50 %	25 %	221635933
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12471	NC_011961	TC	3	6	522285	522290	0 %	50 %	0 %	50 %	221635934
12472	NC_011961	CG	3	6	522336	522341	0 %	0 %	50 %	50 %	221635934
12473	NC_011961	TGC	2	6	522411	522416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635934
12474	NC_011961	ATG	2	6	522455	522460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12475	NC_011961	TCG	2	6	522521	522526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12476	NC_011961	CCG	2	6	522549	522554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12477	NC_011961	GCA	2	6	522559	522564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12478	NC_011961	TC	3	6	522566	522571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12479	NC_011961	G	8	8	522648	522655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12480	NC_011961	CGG	2	6	522698	522703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635935
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12483	NC_011961	GCC	2	6	522854	522859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635935
12484	NC_011961	CTC	2	6	522923	522928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12485	NC_011961	CAT	2	6	522955	522960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12486	NC_011961	TCC	2	6	523034	523039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12487	NC_011961	TC	3	6	523040	523045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12488	NC_011961	TGC	2	6	523065	523070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12489	NC_011961	CTT	2	6	523273	523278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12490	NC_011961	GCG	2	6	523279	523284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12491	NC_011961	TCG	2	6	523290	523295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12492	NC_011961	GACC	2	8	523312	523319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12493	NC_011961	ACG	2	6	523373	523378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12494	NC_011961	TGG	2	6	523399	523404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635936
12495	NC_011961	TCG	2	6	523462	523467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635936
12496	NC_011961	CTC	2	6	523521	523526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635936
12497	NC_011961	GGC	2	6	523541	523546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635936
12498	NC_011961	TCG	2	6	523633	523638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635936
12499	NC_011961	CTC	2	6	523641	523646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635936
12500	NC_011961	TCA	2	6	523672	523677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635937

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