MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011961	GT	3	6	417716	417721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_011961	GCT	2	6	417724	417729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_011961	TCG	2	6	417831	417836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10004	NC_011961	GCG	2	6	417852	417857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
10005	NC_011961	GCG	2	6	417862	417867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
10006	NC_011961	GGA	2	6	417869	417874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635838
10007	NC_011961	GGA	2	6	417890	417895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635838
10008	NC_011961	GCT	2	6	417935	417940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10009	NC_011961	CGT	3	9	417941	417949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10010	NC_011961	GCT	2	6	417957	417962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10011	NC_011961	CGA	2	6	418019	418024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10012	NC_011961	TAC	2	6	418029	418034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635838
10013	NC_011961	TGA	2	6	418036	418041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635838
10014	NC_011961	GCT	2	6	418052	418057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10015	NC_011961	GGA	2	6	418058	418063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635838
10016	NC_011961	GC	3	6	418097	418102	0 %	0 %	50 %	50 %	221635838
10017	NC_011961	TCC	2	6	418118	418123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635838
10018	NC_011961	GGC	2	6	418193	418198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
10019	NC_011961	AGCA	2	8	418215	418222	50 %	0 %	25 %	25 %	221635838
10020	NC_011961	GCCCT	2	10	418248	418257	0 %	20 %	20 %	60 %	221635838
10021	NC_011961	CTG	2	6	418311	418316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10022	NC_011961	CTGG	2	8	418331	418338	0 %	25 %	50 %	25 %	221635838
10023	NC_011961	GGCT	2	8	418363	418370	0 %	25 %	50 %	25 %	221635838
10024	NC_011961	GCT	2	6	418373	418378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10025	NC_011961	GCT	2	6	418421	418426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10026	NC_011961	GCCG	2	8	418442	418449	0 %	0 %	50 %	50 %	221635838
10027	NC_011961	GCG	2	6	418472	418477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
10028	NC_011961	AGCG	4	16	418478	418493	25 %	0 %	50 %	25 %	221635838
10029	NC_011961	TGG	2	6	418500	418505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635838
10030	NC_011961	TCA	2	6	418564	418569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635838
10031	NC_011961	CGGG	2	8	418598	418605	0 %	0 %	75 %	25 %	221635838
10032	NC_011961	GGC	2	6	418610	418615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
10033	NC_011961	CGG	2	6	418682	418687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
10034	NC_011961	TGC	2	6	418798	418803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10035	NC_011961	TGG	2	6	418869	418874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635838
10036	NC_011961	GTC	2	6	418914	418919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10037	NC_011961	TGG	2	6	418956	418961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635838
10038	NC_011961	CCG	2	6	418974	418979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635838
10039	NC_011961	TGGC	2	8	418999	419006	0 %	25 %	50 %	25 %	221635838
10040	NC_011961	CTG	2	6	419027	419032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10041	NC_011961	CTC	2	6	419094	419099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635838
10042	NC_011961	CGT	2	6	419102	419107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635838
10043	NC_011961	CAT	2	6	419136	419141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635838
10044	NC_011961	CAA	2	6	419153	419158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635838
10045	NC_011961	GCTG	2	8	419179	419186	0 %	25 %	50 %	25 %	221635838
10046	NC_011961	GTTCC	2	10	419211	419220	0 %	40 %	20 %	40 %	221635838
10047	NC_011961	CGG	2	6	419239	419244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635838
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10050	NC_011961	CGGTC	2	10	419481	419490	0 %	20 %	40 %	40 %	221635839
10051	NC_011961	ACG	2	6	419505	419510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635839
10052	NC_011961	TCG	2	6	419523	419528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635839
10053	NC_011961	CGG	2	6	419633	419638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635839
10054	NC_011961	TGG	2	6	419648	419653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635839
10055	NC_011961	CGAG	2	8	419788	419795	25 %	0 %	50 %	25 %	221635839
10056	NC_011961	GGT	2	6	419804	419809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_011961	GGA	2	6	419914	419919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635840
10058	NC_011961	GAA	2	6	419961	419966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635840
10059	NC_011961	CCGG	2	8	420018	420025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_011961	GAG	2	6	420062	420067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_011961	TGA	2	6	420120	420125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635841
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10063	NC_011961	CCGACC	2	12	420263	420274	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221635841
10064	NC_011961	AAG	2	6	420353	420358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635841
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10072	NC_011961	CGACGC	2	12	420681	420692	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221635841
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10084	NC_011961	CCG	2	6	420947	420952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635841
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10086	NC_011961	GCGA	2	8	420983	420990	25 %	0 %	50 %	25 %	221635841
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10095	NC_011961	GGA	2	6	421255	421260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10101	NC_011961	GC	3	6	421565	421570	0 %	0 %	50 %	50 %	221635842
10102	NC_011961	TGC	2	6	421574	421579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635842
10103	NC_011961	GGTG	2	8	421589	421596	0 %	25 %	75 %	0 %	221635842
10104	NC_011961	CGT	2	6	421662	421667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635842
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10110	NC_011961	GC	3	6	421942	421947	0 %	0 %	50 %	50 %	221635842
10111	NC_011961	CCG	2	6	422017	422022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635842
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10117	NC_011961	CTG	2	6	422242	422247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635842
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10119	NC_011961	GTC	2	6	422281	422286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635842
10120	NC_011961	GCACG	2	10	422321	422330	20 %	0 %	40 %	40 %	221635842
10121	NC_011961	CG	3	6	422329	422334	0 %	0 %	50 %	50 %	221635842
10122	NC_011961	CTG	2	6	422341	422346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635842
10123	NC_011961	GA	3	6	422419	422424	50 %	0 %	50 %	0 %	221635843
10124	NC_011961	CCG	2	6	422432	422437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635843
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10126	NC_011961	GCG	2	6	422485	422490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635843
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10130	NC_011961	TGC	2	6	422644	422649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635843
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10139	NC_011961	GCTC	2	8	423291	423298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10140	NC_011961	GA	3	6	423325	423330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_011961	GAGG	2	8	423334	423341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_011961	GGT	2	6	423409	423414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635844
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10145	NC_011961	GGT	2	6	423640	423645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635844
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10150	NC_011961	TCG	2	6	423831	423836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635844
10151	NC_011961	TCG	2	6	423904	423909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635845
10152	NC_011961	TGG	2	6	423941	423946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635845
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10232	NC_011961	TGA	2	6	427403	427408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635848
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10239	NC_011961	AGC	2	6	427625	427630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635848
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10242	NC_011961	GCTC	2	8	427686	427693	0 %	25 %	25 %	50 %	221635848
10243	NC_011961	TGGT	2	8	427700	427707	0 %	50 %	50 %	0 %	221635848
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10250	NC_011961	GCG	2	6	428087	428092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_011961	GCG	2	6	428100	428105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635849
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10481	NC_011961	GCGA	2	8	438174	438181	25 %	0 %	50 %	25 %	221635856
10482	NC_011961	CCAGG	2	10	438186	438195	20 %	0 %	40 %	40 %	221635856
10483	NC_011961	CGA	2	6	438224	438229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635856
10484	NC_011961	CGA	3	9	438290	438298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635856
10485	NC_011961	GA	3	6	438319	438324	50 %	0 %	50 %	0 %	221635856
10486	NC_011961	GAC	2	6	438330	438335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635856
10487	NC_011961	TCC	2	6	438369	438374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10488	NC_011961	GCG	2	6	438404	438409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635857
10489	NC_011961	AGG	2	6	438437	438442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635857
10490	NC_011961	CGC	2	6	438443	438448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635857
10491	NC_011961	CG	3	6	438494	438499	0 %	0 %	50 %	50 %	221635857
10492	NC_011961	CGGA	2	8	438603	438610	25 %	0 %	50 %	25 %	221635857
10493	NC_011961	CGA	2	6	438652	438657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635857
10494	NC_011961	GT	3	6	438673	438678	0 %	50 %	50 %	0 %	221635857
10495	NC_011961	CTCG	2	8	438684	438691	0 %	25 %	25 %	50 %	221635858
10496	NC_011961	GAT	2	6	438708	438713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635858
10497	NC_011961	GTG	2	6	438723	438728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635858
10498	NC_011961	GCGGA	2	10	438790	438799	20 %	0 %	60 %	20 %	221635858
10499	NC_011961	ATC	2	6	438874	438879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635858
10500	NC_011961	CGC	3	9	438911	438919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635858

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