MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011961	TCA	2	6	285285	285290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
7002	NC_011961	TCA	2	6	285300	285305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
7003	NC_011961	GCG	2	6	285359	285364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635705
7004	NC_011961	CTT	2	6	285376	285381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635705
7005	NC_011961	GTC	2	6	285401	285406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
7006	NC_011961	GGC	2	6	285439	285444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635706
7007	NC_011961	CAGC	2	8	285498	285505	25 %	0 %	25 %	50 %	221635706
7008	NC_011961	CGG	2	6	285534	285539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635706
7009	NC_011961	AGC	2	6	285572	285577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635706
7010	NC_011961	GAG	2	6	285589	285594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635706
7011	NC_011961	GC	3	6	285669	285674	0 %	0 %	50 %	50 %	221635707
7012	NC_011961	GAGC	2	8	285691	285698	25 %	0 %	50 %	25 %	221635707
7013	NC_011961	GAT	2	6	285701	285706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635707
7014	NC_011961	CGA	2	6	285721	285726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635707
7015	NC_011961	CAC	2	6	285745	285750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635707
7016	NC_011961	GCA	2	6	285796	285801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635707
7017	NC_011961	ATC	2	6	285898	285903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635708
7018	NC_011961	GGC	2	6	285947	285952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635708
7019	NC_011961	CGGAG	2	10	285958	285967	20 %	0 %	60 %	20 %	221635708
7020	NC_011961	CGG	2	6	286048	286053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635709
7021	NC_011961	GC	3	6	286079	286084	0 %	0 %	50 %	50 %	221635709
7022	NC_011961	CGC	3	9	286168	286176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
7023	NC_011961	TGT	2	6	286186	286191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635709
7024	NC_011961	GCG	2	6	286254	286259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635709
7025	NC_011961	CGA	2	6	286345	286350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635709
7026	NC_011961	CCA	2	6	286372	286377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635709
7027	NC_011961	GCGA	2	8	286392	286399	25 %	0 %	50 %	25 %	221635709
7028	NC_011961	CGCGCC	2	12	286459	286470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
7029	NC_011961	AGC	2	6	286503	286508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635709
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7031	NC_011961	CGGG	2	8	286678	286685	0 %	0 %	75 %	25 %	221635709
7032	NC_011961	CGC	2	6	286688	286693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
7033	NC_011961	CGA	2	6	286705	286710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635709
7034	NC_011961	GAGCAC	2	12	286823	286834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635709
7035	NC_011961	GCGT	2	8	286843	286850	0 %	25 %	50 %	25 %	221635709
7036	NC_011961	GATC	2	8	286853	286860	25 %	25 %	25 %	25 %	221635709
7037	NC_011961	CG	3	6	286904	286909	0 %	0 %	50 %	50 %	221635709
7038	NC_011961	CGC	2	6	287013	287018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
7039	NC_011961	CGG	2	6	287034	287039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635709
7040	NC_011961	CTG	2	6	287094	287099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635709
7041	NC_011961	GGCTC	2	10	287144	287153	0 %	20 %	40 %	40 %	221635709
7042	NC_011961	CG	4	8	287167	287174	0 %	0 %	50 %	50 %	221635709
7043	NC_011961	CGG	2	6	287232	287237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635709
7044	NC_011961	GA	3	6	287256	287261	50 %	0 %	50 %	0 %	221635709
7045	NC_011961	GAG	2	6	287453	287458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_011961	GAC	2	6	287481	287486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_011961	GGT	2	6	287494	287499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_011961	CGTGT	2	10	287564	287573	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7049	NC_011961	TGG	2	6	287763	287768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_011961	TGA	2	6	287783	287788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_011961	ACG	2	6	287815	287820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_011961	AGG	2	6	287825	287830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_011961	GAAT	2	8	287833	287840	50 %	25 %	25 %	0 %	221635710
7054	NC_011961	CCGG	2	8	287927	287934	0 %	0 %	50 %	50 %	221635710
7055	NC_011961	CCGC	2	8	287951	287958	0 %	0 %	25 %	75 %	221635710
7056	NC_011961	GAT	2	6	287972	287977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635710
7057	NC_011961	CGT	2	6	288017	288022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
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7059	NC_011961	CGG	2	6	288086	288091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635710
7060	NC_011961	GTC	2	6	288177	288182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
7061	NC_011961	GGGC	2	8	288200	288207	0 %	0 %	75 %	25 %	221635710
7062	NC_011961	GCT	2	6	288240	288245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
7063	NC_011961	TCG	2	6	288325	288330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
7064	NC_011961	AAG	2	6	288336	288341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635710
7065	NC_011961	GAG	2	6	288435	288440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635710
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7067	NC_011961	TGGCT	2	10	288527	288536	0 %	40 %	40 %	20 %	221635710
7068	NC_011961	GCTG	2	8	288548	288555	0 %	25 %	50 %	25 %	221635710
7069	NC_011961	CTC	2	6	288567	288572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635710
7070	NC_011961	TAC	2	6	288573	288578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635710
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7073	NC_011961	TCG	2	6	288788	288793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635711
7074	NC_011961	CAG	2	6	288797	288802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635711
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7077	NC_011961	TCGGG	2	10	288936	288945	0 %	20 %	60 %	20 %	221635711
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7091	NC_011961	GGGCC	2	10	289430	289439	0 %	0 %	60 %	40 %	221635711
7092	NC_011961	TGC	3	9	289445	289453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635711
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7105	NC_011961	GC	4	8	290034	290041	0 %	0 %	50 %	50 %	221635712
7106	NC_011961	CTCAAG	2	12	290067	290078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221635712
7107	NC_011961	GCGA	2	8	290091	290098	25 %	0 %	50 %	25 %	221635712
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7122	NC_011961	GCTG	2	8	290746	290753	0 %	25 %	50 %	25 %	221635713
7123	NC_011961	CTG	2	6	290807	290812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635713
7124	NC_011961	GCT	2	6	290827	290832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635713
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7126	NC_011961	CGG	2	6	290851	290856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635713
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7132	NC_011961	GCT	2	6	291194	291199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635714
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7136	NC_011961	CCGG	2	8	291271	291278	0 %	0 %	50 %	50 %	221635714
7137	NC_011961	CGA	2	6	291373	291378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635714
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7161	NC_011961	CGG	2	6	292074	292079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635714
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7174	NC_011961	GTGA	2	8	292481	292488	25 %	25 %	50 %	0 %	221635714
7175	NC_011961	CGGA	2	8	292496	292503	25 %	0 %	50 %	25 %	221635714
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7177	NC_011961	GGT	2	6	292641	292646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7178	NC_011961	GTTC	2	8	292844	292851	0 %	50 %	25 %	25 %	221635715
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7220	NC_011961	CGATC	2	10	294783	294792	20 %	20 %	20 %	40 %	221635715
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7222	NC_011961	CAA	2	6	294897	294902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635715
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7225	NC_011961	CGCCA	2	10	295010	295019	20 %	0 %	20 %	60 %	221635715
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7229	NC_011961	CG	3	6	295089	295094	0 %	0 %	50 %	50 %	221635715
7230	NC_011961	GC	3	6	295150	295155	0 %	0 %	50 %	50 %	221635715
7231	NC_011961	GCT	2	6	295164	295169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635715
7232	NC_011961	GCG	2	6	295182	295187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635715
7233	NC_011961	CGT	2	6	295231	295236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7234	NC_011961	GGTC	2	8	295304	295311	0 %	25 %	50 %	25 %	221635716
7235	NC_011961	CGCGG	2	10	295354	295363	0 %	0 %	60 %	40 %	221635716
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7237	NC_011961	CGA	2	6	295393	295398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635716
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7239	NC_011961	GAT	2	6	295511	295516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635716
7240	NC_011961	GGC	2	6	295517	295522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635716
7241	NC_011961	GCG	2	6	295530	295535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635716
7242	NC_011961	AGCG	2	8	295572	295579	25 %	0 %	50 %	25 %	221635716
7243	NC_011961	GC	3	6	295589	295594	0 %	0 %	50 %	50 %	221635716
7244	NC_011961	TCG	2	6	295627	295632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635716
7245	NC_011961	CGAG	2	8	295647	295654	25 %	0 %	50 %	25 %	221635716
7246	NC_011961	GAG	2	6	295727	295732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635716
7247	NC_011961	TCGCG	2	10	295767	295776	0 %	20 %	40 %	40 %	221635716
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7249	NC_011961	AAG	3	9	295953	295961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635716
7250	NC_011961	CTC	2	6	295997	296002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635716
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7257	NC_011961	GAC	2	6	296369	296374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635716
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7262	NC_011961	TGG	2	6	296562	296567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635716
7263	NC_011961	TGC	2	6	296626	296631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635716
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7265	NC_011961	CGT	2	6	296712	296717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635716
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7273	NC_011961	TGC	2	6	297085	297090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635716
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7285	NC_011961	CGCA	2	8	297737	297744	25 %	0 %	25 %	50 %	221635716
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7347	NC_011961	GAG	2	6	300509	300514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7348	NC_011961	TGC	2	6	300524	300529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635720
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7352	NC_011961	GCA	2	6	300640	300645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635720
7353	NC_011961	TCGT	2	8	300647	300654	0 %	50 %	25 %	25 %	221635720
7354	NC_011961	GTC	2	6	300655	300660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635720
7355	NC_011961	CGG	2	6	300674	300679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635720
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7357	NC_011961	GTC	2	6	300694	300699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635720
7358	NC_011961	CG	4	8	300796	300803	0 %	0 %	50 %	50 %	221635720
7359	NC_011961	GTC	2	6	300811	300816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635720
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7361	NC_011961	GGTC	2	8	300945	300952	0 %	25 %	50 %	25 %	221635720
7362	NC_011961	GTG	2	6	300997	301002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635720
7363	NC_011961	CGGT	2	8	301047	301054	0 %	25 %	50 %	25 %	221635720
7364	NC_011961	CG	3	6	301124	301129	0 %	0 %	50 %	50 %	221635720
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7366	NC_011961	ATC	2	6	301156	301161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635720
7367	NC_011961	GTC	2	6	301213	301218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635720
7368	NC_011961	ATC	2	6	301264	301269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635720
7369	NC_011961	GGC	2	6	301323	301328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635720
7370	NC_011961	TCG	2	6	301352	301357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635720
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7372	NC_011961	CCGA	2	8	301432	301439	25 %	0 %	25 %	50 %	221635720
7373	NC_011961	GCA	2	6	301472	301477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635720
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7391	NC_011961	GCA	2	6	302883	302888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635722
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7393	NC_011961	CTG	2	6	302966	302971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635722
7394	NC_011961	GA	3	6	302994	302999	50 %	0 %	50 %	0 %	221635722
7395	NC_011961	AGC	2	6	303027	303032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635722
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7397	NC_011961	GCG	2	6	303146	303151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7398	NC_011961	GC	3	6	303201	303206	0 %	0 %	50 %	50 %	221635723
7399	NC_011961	CG	3	6	303218	303223	0 %	0 %	50 %	50 %	221635723
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7457	NC_011961	GCTC	2	8	305212	305219	0 %	25 %	25 %	50 %	221635725
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7469	NC_011961	GCA	2	6	305707	305712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635725
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7473	NC_011961	CTGG	2	8	305898	305905	0 %	25 %	50 %	25 %	221635726
7474	NC_011961	TCG	2	6	305930	305935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635726
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7477	NC_011961	CGA	2	6	306024	306029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635726
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7480	NC_011961	TGC	2	6	306134	306139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635726
7481	NC_011961	TTG	2	6	306155	306160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635726
7482	NC_011961	CGACC	2	10	306219	306228	20 %	0 %	20 %	60 %	221635726
7483	NC_011961	CGA	2	6	306237	306242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635726
7484	NC_011961	GC	3	6	306339	306344	0 %	0 %	50 %	50 %	221635726
7485	NC_011961	CGA	2	6	306402	306407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635726
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