MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011961	GA	3	6	264872	264877	50 %	0 %	50 %	0 %	221635684
6502	NC_011961	ACA	2	6	264954	264959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635684
6503	NC_011961	GCT	2	6	264960	264965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6504	NC_011961	TCG	2	6	264971	264976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6505	NC_011961	GGA	2	6	265002	265007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635684
6506	NC_011961	CAG	2	6	265012	265017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6507	NC_011961	CGA	2	6	265026	265031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6508	NC_011961	TCA	2	6	265070	265075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635685
6509	NC_011961	CGA	2	6	265088	265093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6510	NC_011961	TCG	2	6	265111	265116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6511	NC_011961	GCT	2	6	265160	265165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6512	NC_011961	CGA	2	6	265232	265237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6513	NC_011961	GCT	2	6	265295	265300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6514	NC_011961	CGCAC	2	10	265301	265310	20 %	0 %	20 %	60 %	221635685
6515	NC_011961	TTG	2	6	265329	265334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635685
6516	NC_011961	GGA	2	6	265406	265411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635685
6517	NC_011961	TGG	2	6	265416	265421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635685
6518	NC_011961	ACG	2	6	265428	265433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6519	NC_011961	CCGA	2	8	265515	265522	25 %	0 %	25 %	50 %	221635685
6520	NC_011961	GCT	2	6	265559	265564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
6521	NC_011961	GCG	3	9	265595	265603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635685
6522	NC_011961	GAG	2	6	265646	265651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_011961	GCT	2	6	265683	265688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6524	NC_011961	GGCT	2	8	265796	265803	0 %	25 %	50 %	25 %	221635686
6525	NC_011961	GTG	2	6	265832	265837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635686
6526	NC_011961	CGC	2	6	265931	265936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635686
6527	NC_011961	GAC	3	9	265947	265955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6528	NC_011961	CCG	2	6	265964	265969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635686
6529	NC_011961	CG	3	6	266017	266022	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6530	NC_011961	GC	3	6	266024	266029	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6531	NC_011961	AGCTG	2	10	266056	266065	20 %	20 %	40 %	20 %	221635686
6532	NC_011961	CGG	2	6	266080	266085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
6533	NC_011961	GCG	2	6	266105	266110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
6534	NC_011961	TCC	2	6	266116	266121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635686
6535	NC_011961	ACG	2	6	266131	266136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6536	NC_011961	CCGG	2	8	266156	266163	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6537	NC_011961	AGG	2	6	266164	266169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635686
6538	NC_011961	CG	3	6	266225	266230	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6539	NC_011961	ACG	2	6	266264	266269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6540	NC_011961	GGGT	2	8	266287	266294	0 %	25 %	75 %	0 %	221635686
6541	NC_011961	GGC	2	6	266310	266315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
6542	NC_011961	GGC	2	6	266330	266335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
6543	NC_011961	TGC	2	6	266383	266388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6544	NC_011961	GC	3	6	266398	266403	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6545	NC_011961	CGG	3	9	266414	266422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
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6550	NC_011961	GCG	2	6	266618	266623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
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6552	NC_011961	CCG	2	6	266705	266710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635686
6553	NC_011961	GCG	2	6	266737	266742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
6554	NC_011961	GCC	2	6	266777	266782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635686
6555	NC_011961	GAC	2	6	266871	266876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6556	NC_011961	GATC	2	8	266909	266916	25 %	25 %	25 %	25 %	221635686
6557	NC_011961	AGC	2	6	266971	266976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6558	NC_011961	GC	5	10	266993	267002	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6559	NC_011961	ACA	2	6	267058	267063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635686
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6561	NC_011961	TGC	2	6	267130	267135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635686
6562	NC_011961	GC	3	6	267152	267157	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6563	NC_011961	GGC	3	9	267179	267187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
6564	NC_011961	CTC	2	6	267189	267194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635686
6565	NC_011961	GCCG	2	8	267392	267399	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6566	NC_011961	GC	4	8	267402	267409	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6567	NC_011961	TTC	2	6	267486	267491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635686
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6569	NC_011961	GC	3	6	267621	267626	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6570	NC_011961	GAC	2	6	267636	267641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
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6572	NC_011961	CCA	2	6	267665	267670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635686
6573	NC_011961	GCC	2	6	267732	267737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635686
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6575	NC_011961	CCG	2	6	267830	267835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635686
6576	NC_011961	GAT	2	6	267918	267923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635686
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6580	NC_011961	CGAC	2	8	268096	268103	25 %	0 %	25 %	50 %	221635686
6581	NC_011961	GATCGA	2	12	268178	268189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221635686
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6585	NC_011961	GCGA	2	8	268401	268408	25 %	0 %	50 %	25 %	221635686
6586	NC_011961	GC	3	6	268431	268436	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
6587	NC_011961	ACT	2	6	268462	268467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635686
6588	NC_011961	ATC	2	6	268485	268490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635686
6589	NC_011961	GGC	2	6	268553	268558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
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6591	NC_011961	GATCG	2	10	268689	268698	20 %	20 %	40 %	20 %	221635687
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6593	NC_011961	GTC	2	6	268776	268781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635687
6594	NC_011961	GCG	2	6	268824	268829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635687
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6600	NC_011961	GCCG	2	8	269255	269262	0 %	0 %	50 %	50 %	221635687
6601	NC_011961	GGT	2	6	269267	269272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635687
6602	NC_011961	TCGC	2	8	269284	269291	0 %	25 %	25 %	50 %	221635687
6603	NC_011961	CTC	2	6	269370	269375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635687
6604	NC_011961	TGGGC	2	10	269390	269399	0 %	20 %	60 %	20 %	221635687
6605	NC_011961	CT	3	6	269437	269442	0 %	50 %	0 %	50 %	221635687
6606	NC_011961	GTG	2	6	269446	269451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635687
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6608	NC_011961	CGG	2	6	269530	269535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635687
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6611	NC_011961	GT	3	6	269696	269701	0 %	50 %	50 %	0 %	221635687
6612	NC_011961	CGA	2	6	269708	269713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635687
6613	NC_011961	CATCG	2	10	269746	269755	20 %	20 %	20 %	40 %	221635687
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6620	NC_011961	TCC	2	6	270064	270069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635687
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6622	NC_011961	CCA	2	6	270135	270140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635687
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6869	NC_011961	CGG	2	6	280468	280473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635700
6870	NC_011961	CG	4	8	280502	280509	0 %	0 %	50 %	50 %	221635700
6871	NC_011961	CGAG	2	8	280519	280526	25 %	0 %	50 %	25 %	221635700
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6989	NC_011961	GGTCT	2	10	285002	285011	0 %	40 %	40 %	20 %	221635705
6990	NC_011961	GGT	2	6	285013	285018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635705
6991	NC_011961	TCC	2	6	285033	285038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635705
6992	NC_011961	GTC	2	6	285059	285064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6993	NC_011961	CGGCAC	2	12	285087	285098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221635705
6994	NC_011961	TCG	3	9	285102	285110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6995	NC_011961	GAT	3	9	285115	285123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635705
6996	NC_011961	AGCCG	2	10	285134	285143	20 %	0 %	40 %	40 %	221635705
6997	NC_011961	AAGCCG	2	12	285144	285155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6998	NC_011961	G	6	6	285181	285186	0 %	0 %	100 %	0 %	221635705
6999	NC_011961	ACCATG	2	12	285224	285235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221635705
7000	NC_011961	TGA	2	6	285237	285242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635705

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