MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_011961	TGC	2	6	244620	244625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6003	NC_011961	GAA	2	6	244627	244632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635665
6004	NC_011961	TGA	2	6	244645	244650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635665
6005	NC_011961	GCC	2	6	244661	244666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635665
6006	NC_011961	ATG	2	6	244668	244673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635665
6007	NC_011961	CTC	2	6	244727	244732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635665
6008	NC_011961	GCC	2	6	244754	244759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635665
6009	NC_011961	GGC	2	6	244817	244822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635665
6010	NC_011961	CGA	2	6	244839	244844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6011	NC_011961	CAG	2	6	244926	244931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6012	NC_011961	CTC	3	9	244955	244963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635665
6013	NC_011961	CTC	2	6	244973	244978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635665
6014	NC_011961	GCGGTC	2	12	245012	245023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221635665
6015	NC_011961	GCCG	2	8	245042	245049	0 %	0 %	50 %	50 %	221635665
6016	NC_011961	CGTGG	2	10	245089	245098	0 %	20 %	60 %	20 %	221635665
6017	NC_011961	GTC	2	6	245099	245104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6018	NC_011961	TCG	2	6	245145	245150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6019	NC_011961	GACGG	2	10	245222	245231	20 %	0 %	60 %	20 %	221635665
6020	NC_011961	CGG	3	9	245256	245264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635665
6021	NC_011961	GC	3	6	245277	245282	0 %	0 %	50 %	50 %	221635665
6022	NC_011961	GTG	2	6	245294	245299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635665
6023	NC_011961	CGA	2	6	245320	245325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6024	NC_011961	GACG	2	8	245344	245351	25 %	0 %	50 %	25 %	221635665
6025	NC_011961	CTG	3	9	245359	245367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
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6028	NC_011961	GCT	2	6	245466	245471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635666
6029	NC_011961	TGCG	2	8	245526	245533	0 %	25 %	50 %	25 %	221635666
6030	NC_011961	TGC	2	6	245634	245639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635666
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6033	NC_011961	GCGCG	2	10	245706	245715	0 %	0 %	60 %	40 %	221635666
6034	NC_011961	GCT	2	6	245793	245798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635666
6035	NC_011961	TCG	2	6	245819	245824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635666
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6044	NC_011961	GCA	2	6	246159	246164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635666
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6108	NC_011961	TCG	2	6	248861	248866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635668
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6119	NC_011961	GC	3	6	249311	249316	0 %	0 %	50 %	50 %	221635668
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6122	NC_011961	GGC	2	6	249461	249466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635669
6123	NC_011961	CGGC	2	8	249478	249485	0 %	0 %	50 %	50 %	221635669
6124	NC_011961	ACA	2	6	249493	249498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635669
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6126	NC_011961	GCC	2	6	249543	249548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635669
6127	NC_011961	CG	3	6	249591	249596	0 %	0 %	50 %	50 %	221635669
6128	NC_011961	GCG	2	6	249615	249620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635669
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6132	NC_011961	CGA	2	6	249679	249684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635669
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6134	NC_011961	GCG	2	6	249741	249746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635669
6135	NC_011961	CGG	2	6	249757	249762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635669
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6138	NC_011961	GGAAGT	2	12	249856	249867	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	221635669
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6144	NC_011961	TGGT	2	8	250017	250024	0 %	50 %	50 %	0 %	221635669
6145	NC_011961	GGC	2	6	250037	250042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6146	NC_011961	CCGA	2	8	250052	250059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6147	NC_011961	TGC	2	6	250110	250115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_011961	GCG	2	6	250125	250130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_011961	GCT	2	6	250168	250173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_011961	CTCG	2	8	250202	250209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6151	NC_011961	GGC	2	6	250217	250222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635670
6152	NC_011961	GTGC	2	8	250262	250269	0 %	25 %	50 %	25 %	221635670
6153	NC_011961	TCG	2	6	250303	250308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635670
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6155	NC_011961	GGGA	2	8	250379	250386	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_011961	TGGGG	2	10	250468	250477	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6157	NC_011961	GGC	2	6	250501	250506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6158	NC_011961	GCGA	2	8	250510	250517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6159	NC_011961	CGCT	2	8	250574	250581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6161	NC_011961	GGC	2	6	250645	250650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6162	NC_011961	GGC	2	6	250683	250688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6163	NC_011961	TGG	2	6	250705	250710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6164	NC_011961	GC	3	6	250719	250724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6165	NC_011961	GCGG	2	8	250743	250750	0 %	0 %	75 %	25 %	221635671
6166	NC_011961	GGC	2	6	250764	250769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635671
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6186	NC_011961	TCCTT	2	10	251603	251612	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6187	NC_011961	AACCG	2	10	251716	251725	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6188	NC_011961	G	6	6	251735	251740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6189	NC_011961	GAGC	2	8	251787	251794	25 %	0 %	50 %	25 %	221635672
6190	NC_011961	CGAT	2	8	251875	251882	25 %	25 %	25 %	25 %	221635672
6191	NC_011961	GCT	2	6	251900	251905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635672
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6196	NC_011961	GCTGGC	2	12	252164	252175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221635672
6197	NC_011961	GC	3	6	252174	252179	0 %	0 %	50 %	50 %	221635672
6198	NC_011961	CGT	2	6	252182	252187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635672
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6202	NC_011961	GCTG	2	8	252280	252287	0 %	25 %	50 %	25 %	221635672
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6231	NC_011961	CTC	2	6	253510	253515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635673
6232	NC_011961	GTG	2	6	253522	253527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635673
6233	NC_011961	CG	3	6	253579	253584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6234	NC_011961	CGAT	2	8	253588	253595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6235	NC_011961	GGA	3	9	253623	253631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6236	NC_011961	GGC	2	6	253705	253710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635674
6237	NC_011961	GCG	2	6	253713	253718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635674
6238	NC_011961	CGACAC	2	12	253728	253739	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	221635674
6239	NC_011961	CGG	2	6	253746	253751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635674
6240	NC_011961	GCAGC	2	10	253755	253764	20 %	0 %	40 %	40 %	221635674
6241	NC_011961	CTG	2	6	253782	253787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635674
6242	NC_011961	CAGC	2	8	253794	253801	25 %	0 %	25 %	50 %	221635674
6243	NC_011961	GCG	3	9	253811	253819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635674
6244	NC_011961	CGG	2	6	253833	253838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635674
6245	NC_011961	GTC	2	6	253868	253873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635674
6246	NC_011961	GTC	2	6	253955	253960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635674
6247	NC_011961	TACCAG	2	12	253964	253975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221635674
6248	NC_011961	CTC	2	6	254045	254050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635674
6249	NC_011961	TG	3	6	254056	254061	0 %	50 %	50 %	0 %	221635674
6250	NC_011961	ACG	2	6	254082	254087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635674
6251	NC_011961	TGC	2	6	254088	254093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635674
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6257	NC_011961	TCT	2	6	254217	254222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635674
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6281	NC_011961	GTCG	2	8	255146	255153	0 %	25 %	50 %	25 %	221635675
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6283	NC_011961	GGT	2	6	255176	255181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635675
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6286	NC_011961	GA	3	6	255294	255299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6287	NC_011961	GC	3	6	255322	255327	0 %	0 %	50 %	50 %	221635676
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6318	NC_011961	GGA	2	6	256472	256477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6320	NC_011961	GCC	2	6	256589	256594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6351	NC_011961	GGA	2	6	258024	258029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6352	NC_011961	GTAC	2	8	258073	258080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6353	NC_011961	GC	3	6	258101	258106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6354	NC_011961	GTG	2	6	258118	258123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6355	NC_011961	GAG	2	6	258129	258134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6356	NC_011961	GCG	2	6	258137	258142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6357	NC_011961	CGA	2	6	258147	258152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635681
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6360	NC_011961	GCGCG	2	10	258347	258356	0 %	0 %	60 %	40 %	221635681
6361	NC_011961	GCT	2	6	258362	258367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
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6363	NC_011961	CTTCGT	2	12	258424	258435	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	221635681
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6368	NC_011961	GAGC	2	8	258596	258603	25 %	0 %	50 %	25 %	221635681
6369	NC_011961	CCG	2	6	258616	258621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635681
6370	NC_011961	CAGC	2	8	258688	258695	25 %	0 %	25 %	50 %	221635681
6371	NC_011961	CGG	2	6	258723	258728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635681
6372	NC_011961	AGG	2	6	258744	258749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
6373	NC_011961	GCT	2	6	258814	258819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
6374	NC_011961	CTA	2	6	258823	258828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635681
6375	NC_011961	CG	3	6	258855	258860	0 %	0 %	50 %	50 %	221635681
6376	NC_011961	CGT	2	6	258871	258876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
6377	NC_011961	GAG	2	6	258890	258895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
6378	NC_011961	TTC	2	6	259034	259039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635681
6379	NC_011961	GCTG	2	8	259111	259118	0 %	25 %	50 %	25 %	221635681
6380	NC_011961	CGA	3	9	259159	259167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635681
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6382	NC_011961	ACT	2	6	259206	259211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635681
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6384	NC_011961	CTG	2	6	259355	259360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
6385	NC_011961	GAG	2	6	259373	259378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
6386	NC_011961	GGA	2	6	259396	259401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
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6388	NC_011961	CGA	2	6	259440	259445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635681
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6394	NC_011961	GCG	2	6	259801	259806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635681
6395	NC_011961	GGC	2	6	259828	259833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6396	NC_011961	GC	3	6	259839	259844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6397	NC_011961	GCG	2	6	259959	259964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_011961	CCG	2	6	259966	259971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6399	NC_011961	AAT	2	6	260040	260045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_011961	TCA	2	6	260051	260056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6401	NC_011961	CGGTC	2	10	260086	260095	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6402	NC_011961	GTTCA	2	10	260101	260110	20 %	40 %	20 %	20 %	221635682
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6405	NC_011961	TC	3	6	260214	260219	0 %	50 %	0 %	50 %	221635682
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6408	NC_011961	TGGG	2	8	260349	260356	0 %	25 %	75 %	0 %	221635682
6409	NC_011961	GCT	2	6	260377	260382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635682
6410	NC_011961	AGTC	2	8	260401	260408	25 %	25 %	25 %	25 %	221635682
6411	NC_011961	GCCAG	2	10	260430	260439	20 %	0 %	40 %	40 %	221635682
6412	NC_011961	GCT	2	6	260539	260544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635682
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6425	NC_011961	CTG	2	6	261091	261096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635683
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6439	NC_011961	CTCC	2	8	261552	261559	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6440	NC_011961	GCT	2	6	261612	261617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6441	NC_011961	CTG	2	6	261621	261626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6442	NC_011961	TGC	2	6	261632	261637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6443	NC_011961	TCGA	2	8	261722	261729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6444	NC_011961	GGC	2	6	261741	261746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6445	NC_011961	CGA	2	6	261779	261784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6448	NC_011961	TGG	2	6	261927	261932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6449	NC_011961	CGCT	2	8	261956	261963	0 %	25 %	25 %	50 %	221635684
6450	NC_011961	CG	3	6	261977	261982	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
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6454	NC_011961	CTG	2	6	262195	262200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
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6461	NC_011961	GCGA	2	8	262488	262495	25 %	0 %	50 %	25 %	221635684
6462	NC_011961	ACG	2	6	262510	262515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
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6464	NC_011961	GTCGCC	2	12	262555	262566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221635684
6465	NC_011961	CTGGAG	2	12	262663	262674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635684
6466	NC_011961	GATC	2	8	262695	262702	25 %	25 %	25 %	25 %	221635684
6467	NC_011961	GC	3	6	262822	262827	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
6468	NC_011961	CAT	2	6	262968	262973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635684
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6470	NC_011961	CGG	2	6	263000	263005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
6471	NC_011961	CG	3	6	263010	263015	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
6472	NC_011961	TCCTC	2	10	263210	263219	0 %	40 %	0 %	60 %	221635684
6473	NC_011961	GATC	2	8	263254	263261	25 %	25 %	25 %	25 %	221635684
6474	NC_011961	CAG	2	6	263332	263337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
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6477	NC_011961	ACG	2	6	263607	263612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
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6479	NC_011961	GC	3	6	263691	263696	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
6480	NC_011961	AGC	2	6	263738	263743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6481	NC_011961	CGAG	2	8	263793	263800	25 %	0 %	50 %	25 %	221635684
6482	NC_011961	CTA	2	6	263847	263852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635684
6483	NC_011961	ACCGG	2	10	263858	263867	20 %	0 %	40 %	40 %	221635684
6484	NC_011961	CTC	2	6	264001	264006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635684
6485	NC_011961	GCC	2	6	264011	264016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635684
6486	NC_011961	GCG	2	6	264060	264065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
6487	NC_011961	ACC	2	6	264113	264118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635684
6488	NC_011961	G	6	6	264163	264168	0 %	0 %	100 %	0 %	221635684
6489	NC_011961	CTA	2	6	264288	264293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635684
6490	NC_011961	CAC	2	6	264312	264317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635684
6491	NC_011961	ACGA	2	8	264427	264434	50 %	0 %	25 %	25 %	221635684
6492	NC_011961	CAG	2	6	264460	264465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6493	NC_011961	AGC	2	6	264470	264475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6494	NC_011961	TCC	2	6	264638	264643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635684
6495	NC_011961	GACC	2	8	264671	264678	25 %	0 %	25 %	50 %	221635684
6496	NC_011961	GGC	2	6	264704	264709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
6497	NC_011961	GTC	2	6	264710	264715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6498	NC_011961	GAC	2	6	264724	264729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
6499	NC_011961	TCGA	2	8	264757	264764	25 %	25 %	25 %	25 %	221635684
6500	NC_011961	GC	3	6	264775	264780	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684

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