MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 21729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011961	GCC	2	6	223565	223570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635641
5502	NC_011961	TGC	3	9	223572	223580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635641
5503	NC_011961	CTG	2	6	223589	223594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635641
5504	NC_011961	CTG	2	6	223601	223606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635641
5505	NC_011961	CGT	2	6	223650	223655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635642
5506	NC_011961	CGG	2	6	223703	223708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635642
5507	NC_011961	GGT	2	6	223809	223814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635642
5508	NC_011961	GAG	2	6	223858	223863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635642
5509	NC_011961	CTC	2	6	223922	223927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635642
5510	NC_011961	TGC	2	6	223959	223964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635642
5511	NC_011961	TCG	2	6	224021	224026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635642
5512	NC_011961	GAG	2	6	224065	224070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635642
5513	NC_011961	GGGA	2	8	224087	224094	25 %	0 %	75 %	0 %	221635642
5514	NC_011961	CGGA	2	8	224182	224189	25 %	0 %	50 %	25 %	221635642
5515	NC_011961	GC	3	6	224230	224235	0 %	0 %	50 %	50 %	221635642
5516	NC_011961	GATC	2	8	224346	224353	25 %	25 %	25 %	25 %	221635642
5517	NC_011961	GGGC	2	8	224364	224371	0 %	0 %	75 %	25 %	221635642
5518	NC_011961	GGT	2	6	224415	224420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635642
5519	NC_011961	GAG	2	6	224451	224456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635642
5520	NC_011961	CGA	2	6	224531	224536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_011961	CCA	2	6	224547	224552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_011961	TCG	2	6	224599	224604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_011961	GCC	2	6	224788	224793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_011961	CCG	2	6	224848	224853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_011961	CAGGG	2	10	224860	224869	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5526	NC_011961	GCCGC	2	10	224942	224951	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5527	NC_011961	GCG	2	6	224956	224961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_011961	GT	3	6	224998	225003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011961	CCTGT	2	10	225046	225055	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5530	NC_011961	CCG	2	6	225077	225082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_011961	CGC	2	6	225170	225175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_011961	GCG	2	6	225180	225185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_011961	ATG	2	6	225210	225215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_011961	CGGT	2	8	225252	225259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_011961	CCA	2	6	225278	225283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_011961	GAGC	2	8	225332	225339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_011961	CGC	2	6	225346	225351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_011961	CGG	2	6	225396	225401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_011961	TGC	2	6	225427	225432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011961	GGC	2	6	225449	225454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011961	AGC	2	6	225465	225470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011961	GAT	2	6	225506	225511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_011961	CGG	2	6	225528	225533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_011961	TGC	2	6	225565	225570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_011961	CGAG	2	8	225572	225579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_011961	GC	3	6	225597	225602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_011961	GCAC	2	8	225619	225626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_011961	TCG	2	6	225719	225724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011961	TGG	2	6	225853	225858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635643
5550	NC_011961	GCG	2	6	225885	225890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635643
5551	NC_011961	TCG	2	6	225892	225897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635643
5552	NC_011961	TGC	2	6	225910	225915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635643
5553	NC_011961	CCA	2	6	225917	225922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635643
5554	NC_011961	CGG	2	6	225936	225941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635643
5555	NC_011961	GGT	2	6	226019	226024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635643
5556	NC_011961	GCG	2	6	226025	226030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635643
5557	NC_011961	CGG	3	9	226042	226050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635643
5558	NC_011961	CGC	2	6	226105	226110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635643
5559	NC_011961	GGA	2	6	226121	226126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635643
5560	NC_011961	CGGGG	2	10	226154	226163	0 %	0 %	80 %	20 %	221635643
5561	NC_011961	GACGGT	2	12	226199	226210	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635643
5562	NC_011961	GGACG	2	10	226220	226229	20 %	0 %	60 %	20 %	221635643
5563	NC_011961	GC	3	6	226230	226235	0 %	0 %	50 %	50 %	221635643
5564	NC_011961	ACTG	2	8	226256	226263	25 %	25 %	25 %	25 %	221635643
5565	NC_011961	CTC	2	6	226363	226368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_011961	AGG	2	6	226372	226377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011961	GC	3	6	226406	226411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_011961	TGCC	2	8	226451	226458	0 %	25 %	25 %	50 %	221635644
5569	NC_011961	GAG	3	9	226468	226476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5570	NC_011961	GAG	2	6	226495	226500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5571	NC_011961	GCGG	2	8	226501	226508	0 %	0 %	75 %	25 %	221635644
5572	NC_011961	CAGC	3	12	226518	226529	25 %	0 %	25 %	50 %	221635644
5573	NC_011961	CGT	2	6	226552	226557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635644
5574	NC_011961	GCG	2	6	226589	226594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635644
5575	NC_011961	GAC	2	6	226621	226626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635644
5576	NC_011961	CGG	2	6	226644	226649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635644
5577	NC_011961	GAG	2	6	226705	226710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5578	NC_011961	CGG	2	6	226737	226742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635644
5579	NC_011961	ACG	2	6	226781	226786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635644
5580	NC_011961	GGA	2	6	226839	226844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5581	NC_011961	GCTC	2	8	226848	226855	0 %	25 %	25 %	50 %	221635644
5582	NC_011961	GAG	2	6	226879	226884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5583	NC_011961	GAG	2	6	226903	226908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5584	NC_011961	CGCA	2	8	226927	226934	25 %	0 %	25 %	50 %	221635644
5585	NC_011961	GGA	2	6	226962	226967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
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5588	NC_011961	CGT	2	6	227020	227025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635644
5589	NC_011961	CAG	2	6	227082	227087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635644
5590	NC_011961	GCT	2	6	227127	227132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635644
5591	NC_011961	CGGG	2	8	227214	227221	0 %	0 %	75 %	25 %	221635644
5592	NC_011961	GGA	2	6	227238	227243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5593	NC_011961	CGCA	2	8	227259	227266	25 %	0 %	25 %	50 %	221635644
5594	NC_011961	GCG	2	6	227279	227284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635644
5595	NC_011961	GGA	2	6	227289	227294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635644
5596	NC_011961	GTC	2	6	227377	227382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635645
5597	NC_011961	AGC	2	6	227386	227391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
5598	NC_011961	GAT	2	6	227406	227411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635645
5599	NC_011961	GAG	2	6	227412	227417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635645
5600	NC_011961	CCA	2	6	227432	227437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635645
5601	NC_011961	GTC	2	6	227440	227445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635645
5602	NC_011961	CGG	2	6	227483	227488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635645
5603	NC_011961	GAG	2	6	227505	227510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635645
5604	NC_011961	GAC	2	6	227535	227540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
5605	NC_011961	GCGT	2	8	227555	227562	0 %	25 %	50 %	25 %	221635645
5606	NC_011961	GCGATG	2	12	227581	227592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635645
5607	NC_011961	CGG	2	6	227617	227622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635645
5608	NC_011961	GAAG	2	8	227645	227652	50 %	0 %	50 %	0 %	221635645
5609	NC_011961	CAC	2	6	227661	227666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635645
5610	NC_011961	GGA	3	9	227691	227699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635645
5611	NC_011961	CCT	2	6	227777	227782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635645
5612	NC_011961	ATG	2	6	227833	227838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635645
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5614	NC_011961	ACG	2	6	227881	227886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
5615	NC_011961	CGGC	2	8	227921	227928	0 %	0 %	50 %	50 %	221635645
5616	NC_011961	ACGAT	2	10	227938	227947	40 %	20 %	20 %	20 %	221635645
5617	NC_011961	CAG	2	6	228015	228020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
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5619	NC_011961	AGC	2	6	228110	228115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
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5622	NC_011961	CAG	2	6	228225	228230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
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5624	NC_011961	CGA	2	6	228311	228316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635645
5625	NC_011961	ACGGG	2	10	228334	228343	20 %	0 %	60 %	20 %	221635645
5626	NC_011961	GGC	2	6	228435	228440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635645
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5628	NC_011961	CGG	2	6	228595	228600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635645
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5633	NC_011961	CGAG	2	8	228778	228785	25 %	0 %	50 %	25 %	221635646
5634	NC_011961	CG	3	6	228876	228881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5635	NC_011961	TGGT	2	8	228882	228889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_011961	TCC	2	6	228890	228895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5639	NC_011961	GAG	2	6	229010	229015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5642	NC_011961	TGGA	2	8	229072	229079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5643	NC_011961	CG	3	6	229132	229137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5644	NC_011961	CCG	2	6	229145	229150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5989	NC_011961	CGAG	2	8	244025	244032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5991	NC_011961	GCG	2	6	244097	244102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_011961	AGC	2	6	244119	244124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5993	NC_011961	AGCCG	2	10	244167	244176	20 %	0 %	40 %	40 %	221635665
5994	NC_011961	CTC	2	6	244256	244261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635665
5995	NC_011961	CGT	2	6	244298	244303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
5996	NC_011961	GAA	2	6	244307	244312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635665
5997	NC_011961	GTC	2	6	244322	244327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
5998	NC_011961	CTCGTG	2	12	244469	244480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665
5999	NC_011961	CGA	2	6	244482	244487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635665
6000	NC_011961	TCG	3	9	244506	244514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635665

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