MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_011959	CTT	2	6	1977085	1977090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633930
44502	NC_011959	TGG	2	6	1977119	1977124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633930
44503	NC_011959	TGAA	2	8	1977180	1977187	50 %	25 %	25 %	0 %	221633930
44504	NC_011959	GCA	2	6	1977288	1977293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633930
44505	NC_011959	CGC	2	6	1977316	1977321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633930
44506	NC_011959	GCT	2	6	1977358	1977363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633930
44507	NC_011959	CG	3	6	1977430	1977435	0 %	0 %	50 %	50 %	221633930
44508	NC_011959	ATC	2	6	1977458	1977463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633930
44509	NC_011959	AG	3	6	1977487	1977492	50 %	0 %	50 %	0 %	221633930
44510	NC_011959	AAG	2	6	1977563	1977568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633930
44511	NC_011959	AAG	2	6	1977713	1977718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633930
44512	NC_011959	CCG	2	6	1977888	1977893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633930
44513	NC_011959	GCT	2	6	1977970	1977975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633930
44514	NC_011959	CGTG	2	8	1978017	1978024	0 %	25 %	50 %	25 %	221633930
44515	NC_011959	CGAC	2	8	1978066	1978073	25 %	0 %	25 %	50 %	221633930
44516	NC_011959	AGA	2	6	1978161	1978166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633930
44517	NC_011959	TC	4	8	1978353	1978360	0 %	50 %	0 %	50 %	221633931
44518	NC_011959	CAG	2	6	1978464	1978469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44519	NC_011959	TCGA	2	8	1978473	1978480	25 %	25 %	25 %	25 %	221633931
44520	NC_011959	TG	3	6	1978491	1978496	0 %	50 %	50 %	0 %	221633931
44521	NC_011959	CCAG	2	8	1978572	1978579	25 %	0 %	25 %	50 %	221633931
44522	NC_011959	GCCA	2	8	1978649	1978656	25 %	0 %	25 %	50 %	221633931
44523	NC_011959	CAGA	2	8	1978815	1978822	50 %	0 %	25 %	25 %	221633931
44524	NC_011959	GA	3	6	1978848	1978853	50 %	0 %	50 %	0 %	221633931
44525	NC_011959	CGA	2	6	1978903	1978908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44526	NC_011959	CTGC	2	8	1978927	1978934	0 %	25 %	25 %	50 %	221633931
44527	NC_011959	CGA	2	6	1978942	1978947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633931
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44529	NC_011959	CTG	2	6	1979008	1979013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44530	NC_011959	GCTG	2	8	1979074	1979081	0 %	25 %	50 %	25 %	221633931
44531	NC_011959	GC	3	6	1979083	1979088	0 %	0 %	50 %	50 %	221633931
44532	NC_011959	AGA	2	6	1979094	1979099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633931
44533	NC_011959	CGA	2	6	1979140	1979145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44534	NC_011959	ATC	2	6	1979184	1979189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633931
44535	NC_011959	CAG	2	6	1979207	1979212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44536	NC_011959	GTC	2	6	1979213	1979218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44537	NC_011959	TGC	2	6	1979234	1979239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44538	NC_011959	CACGCG	2	12	1979243	1979254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221633931
44539	NC_011959	GCT	2	6	1979320	1979325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633931
44540	NC_011959	CG	3	6	1979389	1979394	0 %	0 %	50 %	50 %	221633931
44541	NC_011959	GTG	2	6	1979421	1979426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633931
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44543	NC_011959	AGG	2	6	1979659	1979664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633931
44544	NC_011959	CTG	2	6	1979730	1979735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44545	NC_011959	ACG	2	6	1979757	1979762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44546	NC_011959	GCG	2	6	1979829	1979834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633932
44547	NC_011959	GTT	2	6	1979879	1979884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633932
44548	NC_011959	TAG	2	6	1979955	1979960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633932
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44551	NC_011959	TGG	2	6	1980161	1980166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633932
44552	NC_011959	TCG	2	6	1980300	1980305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633932
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44556	NC_011959	CGG	2	6	1980561	1980566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633932
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44559	NC_011959	CAG	2	6	1980803	1980808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633932
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44561	NC_011959	GGGAG	2	10	1980864	1980873	20 %	0 %	80 %	0 %	221633932
44562	NC_011959	TGC	2	6	1980916	1980921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44563	NC_011959	AGTC	2	8	1980937	1980944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44566	NC_011959	TGG	2	6	1981166	1981171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44567	NC_011959	CT	3	6	1981233	1981238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44568	NC_011959	CTG	2	6	1981248	1981253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633933
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44573	NC_011959	CGGT	2	8	1981529	1981536	0 %	25 %	50 %	25 %	221633933
44574	NC_011959	GGCA	2	8	1981552	1981559	25 %	0 %	50 %	25 %	221633933
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44585	NC_011959	GAC	2	6	1981900	1981905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633935
44586	NC_011959	TCG	2	6	1981951	1981956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633935
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44589	NC_011959	CGA	2	6	1982085	1982090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633935
44590	NC_011959	CG	3	6	1982121	1982126	0 %	0 %	50 %	50 %	221633935
44591	NC_011959	CTC	2	6	1982149	1982154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633935
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44598	NC_011959	GAT	2	6	1982524	1982529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633935
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44601	NC_011959	GGCA	2	8	1982678	1982685	25 %	0 %	50 %	25 %	221633935
44602	NC_011959	AAG	2	6	1982701	1982706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633935
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44604	NC_011959	CCAG	2	8	1982762	1982769	25 %	0 %	25 %	50 %	221633936
44605	NC_011959	GAT	2	6	1982859	1982864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633936
44606	NC_011959	CG	4	8	1982920	1982927	0 %	0 %	50 %	50 %	221633936
44607	NC_011959	CGA	2	6	1982951	1982956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633936
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44612	NC_011959	GAG	2	6	1983141	1983146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633936
44613	NC_011959	CTCC	2	8	1983173	1983180	0 %	25 %	0 %	75 %	221633936
44614	NC_011959	GCG	2	6	1983181	1983186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633936
44615	NC_011959	CGA	2	6	1983194	1983199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633936
44616	NC_011959	ATC	2	6	1983220	1983225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633936
44617	NC_011959	CGA	2	6	1983257	1983262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633936
44618	NC_011959	CCA	2	6	1983369	1983374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633937
44619	NC_011959	ATCG	2	8	1983375	1983382	25 %	25 %	25 %	25 %	221633937
44620	NC_011959	GTC	2	6	1983394	1983399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633937
44621	NC_011959	GTA	2	6	1983426	1983431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633937
44622	NC_011959	GCTCG	2	10	1983470	1983479	0 %	20 %	40 %	40 %	221633937
44623	NC_011959	TCGC	2	8	1983501	1983508	0 %	25 %	25 %	50 %	221633937
44624	NC_011959	TTC	2	6	1983562	1983567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633937
44625	NC_011959	CGA	2	6	1983572	1983577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633937
44626	NC_011959	CGC	2	6	1983686	1983691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633937
44627	NC_011959	GTA	2	6	1983726	1983731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633937
44628	NC_011959	CGA	2	6	1983779	1983784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633937
44629	NC_011959	CGA	2	6	1983833	1983838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633937
44630	NC_011959	GACG	2	8	1983866	1983873	25 %	0 %	50 %	25 %	221633937
44631	NC_011959	CGAC	2	8	1983925	1983932	25 %	0 %	25 %	50 %	221633937
44632	NC_011959	GTCG	2	8	1983943	1983950	0 %	25 %	50 %	25 %	221633937
44633	NC_011959	TAA	2	6	1984021	1984026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221633937
44634	NC_011959	GC	3	6	1984038	1984043	0 %	0 %	50 %	50 %	221633937
44635	NC_011959	GCT	2	6	1984057	1984062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633937
44636	NC_011959	AGG	2	6	1984099	1984104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633937
44637	NC_011959	GACC	2	8	1984173	1984180	25 %	0 %	25 %	50 %	221633937
44638	NC_011959	AGC	2	6	1984189	1984194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633937
44639	NC_011959	AACG	2	8	1984284	1984291	50 %	0 %	25 %	25 %	221633937
44640	NC_011959	TGG	2	6	1984414	1984419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633937
44641	NC_011959	CCA	2	6	1984468	1984473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633937
44642	NC_011959	GA	3	6	1984535	1984540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44643	NC_011959	TGG	2	6	1984587	1984592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633938
44644	NC_011959	CGA	2	6	1984600	1984605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633938
44645	NC_011959	CTG	2	6	1984614	1984619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633938
44646	NC_011959	CTGG	2	8	1984643	1984650	0 %	25 %	50 %	25 %	221633938
44647	NC_011959	GTC	2	6	1984665	1984670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633938
44648	NC_011959	GGTC	2	8	1984682	1984689	0 %	25 %	50 %	25 %	221633938
44649	NC_011959	CG	3	6	1984697	1984702	0 %	0 %	50 %	50 %	221633938
44650	NC_011959	GCT	2	6	1984732	1984737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633939
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44653	NC_011959	ACC	2	6	1984795	1984800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633939
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44655	NC_011959	GATC	2	8	1984826	1984833	25 %	25 %	25 %	25 %	221633939
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44665	NC_011959	GATC	2	8	1985162	1985169	25 %	25 %	25 %	25 %	221633939
44666	NC_011959	TCGC	2	8	1985193	1985200	0 %	25 %	25 %	50 %	221633939
44667	NC_011959	CAT	2	6	1985291	1985296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44668	NC_011959	GGC	2	6	1985391	1985396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633940
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44670	NC_011959	CG	3	6	1985412	1985417	0 %	0 %	50 %	50 %	221633940
44671	NC_011959	CG	3	6	1985456	1985461	0 %	0 %	50 %	50 %	221633940
44672	NC_011959	CCG	3	9	1985462	1985470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633940
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44674	NC_011959	ACG	2	6	1985493	1985498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
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44677	NC_011959	GTG	2	6	1985565	1985570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633940
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44680	NC_011959	CGA	2	6	1985704	1985709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44681	NC_011959	ATC	2	6	1985799	1985804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633940
44682	NC_011959	CGA	2	6	1985809	1985814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44683	NC_011959	CGC	2	6	1985816	1985821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633940
44684	NC_011959	GGA	2	6	1985822	1985827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633940
44685	NC_011959	CG	4	8	1985860	1985867	0 %	0 %	50 %	50 %	221633940
44686	NC_011959	CAG	2	6	1985931	1985936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44687	NC_011959	CAAG	2	8	1986038	1986045	50 %	0 %	25 %	25 %	221633940
44688	NC_011959	ATG	2	6	1986054	1986059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633940
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44690	NC_011959	CAA	2	6	1986125	1986130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633940
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44692	NC_011959	CGA	2	6	1986205	1986210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
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44708	NC_011959	GAC	2	6	1986623	1986628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44709	NC_011959	GCTG	2	8	1986690	1986697	0 %	25 %	50 %	25 %	221633940
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44711	NC_011959	GCA	2	6	1986782	1986787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
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44715	NC_011959	ATC	2	6	1987050	1987055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633940
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44719	NC_011959	TC	3	6	1987157	1987162	0 %	50 %	0 %	50 %	221633940
44720	NC_011959	ACA	2	6	1987165	1987170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633940
44721	NC_011959	TGC	2	6	1987210	1987215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44722	NC_011959	CG	3	6	1987265	1987270	0 %	0 %	50 %	50 %	221633940
44723	NC_011959	TCG	3	9	1987303	1987311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44724	NC_011959	ACA	2	6	1987333	1987338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633940
44725	NC_011959	CTC	2	6	1987434	1987439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633940
44726	NC_011959	CCGATC	2	12	1987455	1987466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221633940
44727	NC_011959	GCC	2	6	1987478	1987483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633940
44728	NC_011959	GCT	2	6	1987629	1987634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633940
44729	NC_011959	GCGA	2	8	1987749	1987756	25 %	0 %	50 %	25 %	221633940
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44733	NC_011959	AGC	2	6	1987821	1987826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633940
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44875	NC_011959	GC	3	6	1993926	1993931	0 %	0 %	50 %	50 %	221633946
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44903	NC_011959	GCTCG	2	10	1995071	1995080	0 %	20 %	40 %	40 %	221633947
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44908	NC_011959	TGC	2	6	1995194	1995199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633947
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44910	NC_011959	GAC	2	6	1995232	1995237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633947
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44913	NC_011959	CGCGC	2	10	1995343	1995352	0 %	0 %	40 %	60 %	221633948
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44919	NC_011959	TGGCG	2	10	1995582	1995591	0 %	20 %	60 %	20 %	221633948
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44923	NC_011959	CGA	2	6	1995681	1995686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633949
44924	NC_011959	GC	3	6	1995731	1995736	0 %	0 %	50 %	50 %	221633949
44925	NC_011959	CAGTG	2	10	1995817	1995826	20 %	20 %	40 %	20 %	221633949
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44932	NC_011959	CTG	2	6	1996022	1996027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633949
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44944	NC_011959	CGA	2	6	1996545	1996550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633949
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44946	NC_011959	CGA	2	6	1996743	1996748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633949
44947	NC_011959	CGA	2	6	1996764	1996769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633949
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44949	NC_011959	CGTTC	2	10	1996879	1996888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44950	NC_011959	AGA	2	6	1996910	1996915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44951	NC_011959	CGA	2	6	1996979	1996984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44952	NC_011959	CGG	2	6	1996989	1996994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44953	NC_011959	CTGG	2	8	1997216	1997223	0 %	25 %	50 %	25 %	221633950
44954	NC_011959	GCA	2	6	1997300	1997305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633950
44955	NC_011959	GCT	2	6	1997307	1997312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633950
44956	NC_011959	CGC	2	6	1997393	1997398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633950
44957	NC_011959	CGA	2	6	1997436	1997441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633950
44958	NC_011959	GC	3	6	1997463	1997468	0 %	0 %	50 %	50 %	221633950
44959	NC_011959	TAC	2	6	1997505	1997510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633950
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44961	NC_011959	TCG	2	6	1997554	1997559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633950
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