MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_011959	GC	3	6	1954278	1954283	0 %	0 %	50 %	50 %	221633910
44002	NC_011959	TGGA	2	8	1954289	1954296	25 %	25 %	50 %	0 %	221633910
44003	NC_011959	GGTC	2	8	1954299	1954306	0 %	25 %	50 %	25 %	221633910
44004	NC_011959	TCGA	2	8	1954411	1954418	25 %	25 %	25 %	25 %	221633910
44005	NC_011959	GAT	2	6	1954456	1954461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633910
44006	NC_011959	GC	3	6	1954514	1954519	0 %	0 %	50 %	50 %	221633910
44007	NC_011959	CTG	2	6	1954534	1954539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633910
44008	NC_011959	GGCG	2	8	1954551	1954558	0 %	0 %	75 %	25 %	221633910
44009	NC_011959	GAG	2	6	1954567	1954572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633910
44010	NC_011959	CG	3	6	1954585	1954590	0 %	0 %	50 %	50 %	221633910
44011	NC_011959	AGCGG	2	10	1954700	1954709	20 %	0 %	60 %	20 %	221633910
44012	NC_011959	GCT	2	6	1954725	1954730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633910
44013	NC_011959	AGG	3	9	1954763	1954771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633910
44014	NC_011959	CGT	2	6	1954786	1954791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633910
44015	NC_011959	TGAGCG	2	12	1954797	1954808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633910
44016	NC_011959	GTC	2	6	1954829	1954834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44017	NC_011959	AGC	2	6	1954843	1954848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44018	NC_011959	CGT	2	6	1954856	1954861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44019	NC_011959	GC	3	6	1954880	1954885	0 %	0 %	50 %	50 %	221633911
44020	NC_011959	GTC	2	6	1954945	1954950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44021	NC_011959	GAG	2	6	1955005	1955010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633911
44022	NC_011959	CGC	2	6	1955016	1955021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633911
44023	NC_011959	ATG	2	6	1955045	1955050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633911
44024	NC_011959	GAT	2	6	1955101	1955106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633911
44025	NC_011959	GAC	2	6	1955200	1955205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44026	NC_011959	CCG	2	6	1955206	1955211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633911
44027	NC_011959	TTC	3	9	1955212	1955220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633911
44028	NC_011959	CGG	2	6	1955238	1955243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633911
44029	NC_011959	CGG	2	6	1955259	1955264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633911
44030	NC_011959	GAT	2	6	1955275	1955280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633911
44031	NC_011959	CGT	2	6	1955294	1955299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44032	NC_011959	TCG	2	6	1955318	1955323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44033	NC_011959	GAC	2	6	1955356	1955361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44034	NC_011959	GTC	2	6	1955393	1955398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44035	NC_011959	CCG	2	6	1955402	1955407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633911
44036	NC_011959	CGA	2	6	1955412	1955417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44037	NC_011959	TGC	2	6	1955421	1955426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44038	NC_011959	GCC	2	6	1955465	1955470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633911
44039	NC_011959	CTC	2	6	1955476	1955481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633911
44040	NC_011959	GCA	2	6	1955528	1955533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44041	NC_011959	GAC	2	6	1955572	1955577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44042	NC_011959	TGC	2	6	1955600	1955605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44043	NC_011959	GCA	2	6	1955631	1955636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44044	NC_011959	CGGA	2	8	1955680	1955687	25 %	0 %	50 %	25 %	221633911
44045	NC_011959	CGA	2	6	1955691	1955696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633911
44046	NC_011959	CGC	2	6	1955753	1955758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633911
44047	NC_011959	TCT	2	6	1955760	1955765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633911
44048	NC_011959	AAC	2	6	1955867	1955872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633911
44049	NC_011959	ATG	3	9	1955970	1955978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633912
44050	NC_011959	TGG	3	9	1956065	1956073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633912
44051	NC_011959	GATC	2	8	1956115	1956122	25 %	25 %	25 %	25 %	221633912
44052	NC_011959	GTT	2	6	1956146	1956151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633912
44053	NC_011959	GCC	2	6	1956183	1956188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633912
44054	NC_011959	GT	3	6	1956196	1956201	0 %	50 %	50 %	0 %	221633912
44055	NC_011959	TGT	2	6	1956205	1956210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633912
44056	NC_011959	TGA	2	6	1956253	1956258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633912
44057	NC_011959	GTC	2	6	1956264	1956269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44058	NC_011959	GGC	2	6	1956345	1956350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633912
44059	NC_011959	GGT	2	6	1956351	1956356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633912
44060	NC_011959	GGC	2	6	1956357	1956362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633912
44061	NC_011959	ATC	2	6	1956390	1956395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633912
44062	NC_011959	CCTT	2	8	1956507	1956514	0 %	50 %	0 %	50 %	221633912
44063	NC_011959	TCGG	2	8	1956534	1956541	0 %	25 %	50 %	25 %	221633912
44064	NC_011959	GCT	2	6	1956553	1956558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44065	NC_011959	GCA	2	6	1956847	1956852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44066	NC_011959	TGG	2	6	1956863	1956868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633912
44067	NC_011959	CAGCC	2	10	1956881	1956890	20 %	0 %	20 %	60 %	221633912
44068	NC_011959	GAG	2	6	1956911	1956916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633912
44069	NC_011959	AGC	2	6	1956930	1956935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44070	NC_011959	TCGC	2	8	1956955	1956962	0 %	25 %	25 %	50 %	221633912
44071	NC_011959	GCCC	2	8	1957036	1957043	0 %	0 %	25 %	75 %	221633912
44072	NC_011959	GC	3	6	1957111	1957116	0 %	0 %	50 %	50 %	221633912
44073	NC_011959	TCC	2	6	1957193	1957198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633912
44074	NC_011959	GAC	3	9	1957223	1957231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633912
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44076	NC_011959	GCT	2	6	1957288	1957293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44077	NC_011959	CGTT	2	8	1957295	1957302	0 %	50 %	25 %	25 %	221633912
44078	NC_011959	TGCA	2	8	1957307	1957314	25 %	25 %	25 %	25 %	221633912
44079	NC_011959	AGG	2	6	1957334	1957339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633912
44080	NC_011959	CGA	2	6	1957342	1957347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44081	NC_011959	AC	3	6	1957372	1957377	50 %	0 %	0 %	50 %	221633912
44082	NC_011959	AGC	2	6	1957388	1957393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633912
44083	NC_011959	GTCG	2	8	1957412	1957419	0 %	25 %	50 %	25 %	221633912
44084	NC_011959	CG	4	8	1957462	1957469	0 %	0 %	50 %	50 %	221633912
44085	NC_011959	CTC	2	6	1957529	1957534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633912
44086	NC_011959	CGG	2	6	1957538	1957543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633912
44087	NC_011959	CTTCC	2	10	1957569	1957578	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44088	NC_011959	TCG	2	6	1957588	1957593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44089	NC_011959	TCG	2	6	1957600	1957605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44090	NC_011959	GGC	2	6	1957678	1957683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44091	NC_011959	CGG	2	6	1957689	1957694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44092	NC_011959	GTACG	2	10	1957747	1957756	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44093	NC_011959	AGA	2	6	1957762	1957767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44094	NC_011959	GAC	2	6	1957825	1957830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633913
44095	NC_011959	CCGA	2	8	1957835	1957842	25 %	0 %	25 %	50 %	221633913
44096	NC_011959	GTC	2	6	1957881	1957886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633913
44097	NC_011959	CGT	2	6	1957910	1957915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633913
44098	NC_011959	GGA	2	6	1957942	1957947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633913
44099	NC_011959	GTC	2	6	1958054	1958059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633913
44100	NC_011959	TG	3	6	1958066	1958071	0 %	50 %	50 %	0 %	221633913
44101	NC_011959	CGTGC	2	10	1958113	1958122	0 %	20 %	40 %	40 %	221633913
44102	NC_011959	CTC	2	6	1958248	1958253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633913
44103	NC_011959	GATCGA	2	12	1958407	1958418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221633913
44104	NC_011959	GACG	2	8	1958515	1958522	25 %	0 %	50 %	25 %	221633913
44105	NC_011959	CGG	2	6	1958586	1958591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633913
44106	NC_011959	TCG	2	6	1958641	1958646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633913
44107	NC_011959	GGT	2	6	1958695	1958700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633913
44108	NC_011959	GAC	2	6	1958704	1958709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633913
44109	NC_011959	CTC	2	6	1958797	1958802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44110	NC_011959	GAG	2	6	1958847	1958852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633914
44111	NC_011959	ACG	2	6	1958854	1958859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633914
44112	NC_011959	GAC	2	6	1958868	1958873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633914
44113	NC_011959	TCT	2	6	1958922	1958927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633914
44114	NC_011959	AGC	2	6	1959047	1959052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633914
44115	NC_011959	CGC	2	6	1959112	1959117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633914
44116	NC_011959	TCG	3	9	1959134	1959142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633914
44117	NC_011959	CGG	2	6	1959167	1959172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633914
44118	NC_011959	AAG	2	6	1959305	1959310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633914
44119	NC_011959	CGA	2	6	1959332	1959337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633914
44120	NC_011959	GGC	2	6	1959360	1959365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633914
44121	NC_011959	TCA	2	6	1959377	1959382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633914
44122	NC_011959	CGG	2	6	1959558	1959563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633914
44123	NC_011959	CTG	2	6	1959667	1959672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633914
44124	NC_011959	GAT	2	6	1959768	1959773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633914
44125	NC_011959	GTCCAT	2	12	1959805	1959816	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221633914
44126	NC_011959	TGGA	2	8	1959820	1959827	25 %	25 %	50 %	0 %	221633914
44127	NC_011959	AGCG	2	8	1960037	1960044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44128	NC_011959	GTC	2	6	1960060	1960065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44129	NC_011959	TCGGT	2	10	1960066	1960075	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44130	NC_011959	GCC	2	6	1960109	1960114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633915
44131	NC_011959	TGA	2	6	1960135	1960140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633915
44132	NC_011959	AGCC	2	8	1960215	1960222	25 %	0 %	25 %	50 %	221633915
44133	NC_011959	CGACG	2	10	1960228	1960237	20 %	0 %	40 %	40 %	221633915
44134	NC_011959	TTC	2	6	1960292	1960297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633915
44135	NC_011959	GTCCA	2	10	1960350	1960359	20 %	20 %	20 %	40 %	221633915
44136	NC_011959	CGA	2	6	1960384	1960389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633915
44137	NC_011959	CGCC	2	8	1960398	1960405	0 %	0 %	25 %	75 %	221633915
44138	NC_011959	CGTGAG	2	12	1960412	1960423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633915
44139	NC_011959	CGT	2	6	1960426	1960431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633915
44140	NC_011959	GGAC	2	8	1960432	1960439	25 %	0 %	50 %	25 %	221633915
44141	NC_011959	CA	3	6	1960451	1960456	50 %	0 %	0 %	50 %	221633915
44142	NC_011959	ACCA	2	8	1960485	1960492	50 %	0 %	0 %	50 %	221633915
44143	NC_011959	GC	3	6	1960532	1960537	0 %	0 %	50 %	50 %	221633915
44144	NC_011959	CGATC	2	10	1960652	1960661	20 %	20 %	20 %	40 %	221633915
44145	NC_011959	GCG	2	6	1960671	1960676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633915
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44147	NC_011959	GGGATC	2	12	1960812	1960823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633915
44148	NC_011959	CGA	2	6	1960840	1960845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633915
44149	NC_011959	CG	3	6	1960947	1960952	0 %	0 %	50 %	50 %	221633915
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44152	NC_011959	CTG	2	6	1961041	1961046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633915
44153	NC_011959	GCG	2	6	1961107	1961112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633915
44154	NC_011959	GGT	2	6	1961114	1961119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633915
44155	NC_011959	GTG	2	6	1961178	1961183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633915
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44157	NC_011959	CGAC	2	8	1961277	1961284	25 %	0 %	25 %	50 %	221633915
44158	NC_011959	TCC	2	6	1961342	1961347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44159	NC_011959	CGGGC	2	10	1961356	1961365	0 %	0 %	60 %	40 %	221633916
44160	NC_011959	CGAC	2	8	1961492	1961499	25 %	0 %	25 %	50 %	221633916
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44163	NC_011959	GC	3	6	1961671	1961676	0 %	0 %	50 %	50 %	221633916
44164	NC_011959	TCGTC	2	10	1961774	1961783	0 %	40 %	20 %	40 %	221633916
44165	NC_011959	TCGA	2	8	1961818	1961825	25 %	25 %	25 %	25 %	221633916
44166	NC_011959	GATC	2	8	1961831	1961838	25 %	25 %	25 %	25 %	221633916
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44173	NC_011959	CGTCG	2	10	1962140	1962149	0 %	20 %	40 %	40 %	221633916
44174	NC_011959	GC	3	6	1962151	1962156	0 %	0 %	50 %	50 %	221633916
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44192	NC_011959	GA	3	6	1962803	1962808	50 %	0 %	50 %	0 %	221633916
44193	NC_011959	CG	4	8	1962836	1962843	0 %	0 %	50 %	50 %	221633916
44194	NC_011959	GCGACG	2	12	1962871	1962882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221633916
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44199	NC_011959	CAG	2	6	1963136	1963141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633917
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44202	NC_011959	CGT	2	6	1963235	1963240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633917
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44210	NC_011959	ACG	2	6	1963504	1963509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633917
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44217	NC_011959	CGA	3	9	1963936	1963944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633918
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44219	NC_011959	GCA	2	6	1964052	1964057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633918
44220	NC_011959	GTG	2	6	1964086	1964091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633918
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44222	NC_011959	GCC	2	6	1964147	1964152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633918
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44224	NC_011959	GTC	2	6	1964256	1964261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633918
44225	NC_011959	TCG	2	6	1964424	1964429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633918
44226	NC_011959	CGA	2	6	1964641	1964646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633918
44227	NC_011959	TGGC	2	8	1964672	1964679	0 %	25 %	50 %	25 %	221633918
44228	NC_011959	CCG	2	6	1964685	1964690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633918
44229	NC_011959	GAG	2	6	1964726	1964731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633918
44230	NC_011959	AG	3	6	1964773	1964778	50 %	0 %	50 %	0 %	221633918
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44232	NC_011959	GGT	2	6	1964881	1964886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633918
44233	NC_011959	TCG	2	6	1964923	1964928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633918
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44237	NC_011959	ACTGT	2	10	1965161	1965170	20 %	40 %	20 %	20 %	221633919
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44307	NC_011959	CCGC	2	8	1967609	1967616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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44339	NC_011959	ACG	2	6	1968978	1968983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633923
44340	NC_011959	CCT	2	6	1969003	1969008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44341	NC_011959	AGA	2	6	1969052	1969057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633924
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44343	NC_011959	AGT	2	6	1969122	1969127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633924
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44345	NC_011959	CAAC	2	8	1969188	1969195	50 %	0 %	0 %	50 %	221633924
44346	NC_011959	GTC	2	6	1969238	1969243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633924
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44352	NC_011959	GGA	2	6	1969410	1969415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633924
44353	NC_011959	GGA	2	6	1969425	1969430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633924
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44358	NC_011959	AG	4	8	1969561	1969568	50 %	0 %	50 %	0 %	221633924
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44456	NC_011959	GAG	2	6	1974455	1974460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633928
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