MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_011959	GTG	2	6	1931831	1931836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633895
43502	NC_011959	TCG	2	6	1931856	1931861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43503	NC_011959	GCG	2	6	1931889	1931894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633895
43504	NC_011959	GGC	2	6	1931954	1931959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633895
43505	NC_011959	GCGA	2	8	1931966	1931973	25 %	0 %	50 %	25 %	221633895
43506	NC_011959	GAC	2	6	1932028	1932033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43507	NC_011959	CAG	2	6	1932101	1932106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43508	NC_011959	TCC	2	6	1932116	1932121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633895
43509	NC_011959	TCG	2	6	1932201	1932206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43510	NC_011959	GAC	3	9	1932379	1932387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43511	NC_011959	ACG	2	6	1932410	1932415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43512	NC_011959	GCGAC	2	10	1932474	1932483	20 %	0 %	40 %	40 %	221633895
43513	NC_011959	CCG	2	6	1932485	1932490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633895
43514	NC_011959	CGTGC	2	10	1932544	1932553	0 %	20 %	40 %	40 %	221633895
43515	NC_011959	GCGA	2	8	1932557	1932564	25 %	0 %	50 %	25 %	221633895
43516	NC_011959	ACC	2	6	1932566	1932571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633895
43517	NC_011959	CGG	2	6	1932771	1932776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633895
43518	NC_011959	GCGA	2	8	1932815	1932822	25 %	0 %	50 %	25 %	221633895
43519	NC_011959	GCTG	2	8	1932835	1932842	0 %	25 %	50 %	25 %	221633895
43520	NC_011959	ACG	2	6	1932852	1932857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43521	NC_011959	GAG	2	6	1932893	1932898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633895
43522	NC_011959	ACG	2	6	1932899	1932904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43523	NC_011959	TGC	2	6	1932907	1932912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43524	NC_011959	GAC	2	6	1932952	1932957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43525	NC_011959	GGTC	2	8	1932958	1932965	0 %	25 %	50 %	25 %	221633895
43526	NC_011959	TCC	2	6	1933029	1933034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633895
43527	NC_011959	CGT	2	6	1933048	1933053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43528	NC_011959	CGG	2	6	1933075	1933080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633895
43529	NC_011959	CTT	2	6	1933240	1933245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633895
43530	NC_011959	GGAT	2	8	1933332	1933339	25 %	25 %	50 %	0 %	221633895
43531	NC_011959	GGT	2	6	1933360	1933365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633895
43532	NC_011959	GACC	2	8	1933477	1933484	25 %	0 %	25 %	50 %	221633895
43533	NC_011959	TCG	2	6	1933512	1933517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633895
43534	NC_011959	CG	3	6	1933590	1933595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43535	NC_011959	GGCA	2	8	1933658	1933665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43536	NC_011959	GTCA	2	8	1933667	1933674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43537	NC_011959	GCTC	2	8	1933714	1933721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43538	NC_011959	GCG	2	6	1933756	1933761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43539	NC_011959	CTC	2	6	1933913	1933918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43540	NC_011959	CGGC	2	8	1933926	1933933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43541	NC_011959	GGGC	2	8	1933985	1933992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43542	NC_011959	CT	3	6	1933999	1934004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43543	NC_011959	GCTGC	2	10	1934012	1934021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43544	NC_011959	CGA	2	6	1934027	1934032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43545	NC_011959	TGC	2	6	1934049	1934054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633896
43546	NC_011959	CTT	2	6	1934055	1934060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633896
43547	NC_011959	GTG	2	6	1934104	1934109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633896
43548	NC_011959	CTC	2	6	1934176	1934181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633896
43549	NC_011959	CG	3	6	1934197	1934202	0 %	0 %	50 %	50 %	221633896
43550	NC_011959	GTG	2	6	1934227	1934232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633896
43551	NC_011959	CGC	2	6	1934243	1934248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633896
43552	NC_011959	GGA	2	6	1934250	1934255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633896
43553	NC_011959	CCA	2	6	1934312	1934317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633896
43554	NC_011959	CGA	3	9	1934412	1934420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633896
43555	NC_011959	GTG	2	6	1934428	1934433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633896
43556	NC_011959	CTCG	2	8	1934475	1934482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43557	NC_011959	CGG	2	6	1934577	1934582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633897
43558	NC_011959	CACG	2	8	1934620	1934627	25 %	0 %	25 %	50 %	221633897
43559	NC_011959	CGG	2	6	1934691	1934696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633897
43560	NC_011959	GC	3	6	1934773	1934778	0 %	0 %	50 %	50 %	221633897
43561	NC_011959	CG	3	6	1934782	1934787	0 %	0 %	50 %	50 %	221633897
43562	NC_011959	TGC	2	6	1934800	1934805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633897
43563	NC_011959	CTC	2	6	1934843	1934848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43564	NC_011959	GC	4	8	1934876	1934883	0 %	0 %	50 %	50 %	221633898
43565	NC_011959	GT	3	6	1934909	1934914	0 %	50 %	50 %	0 %	221633898
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43567	NC_011959	GC	3	6	1934949	1934954	0 %	0 %	50 %	50 %	221633898
43568	NC_011959	TCGTC	2	10	1935035	1935044	0 %	40 %	20 %	40 %	221633898
43569	NC_011959	CAC	2	6	1935051	1935056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633898
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43571	NC_011959	GATC	2	8	1935131	1935138	25 %	25 %	25 %	25 %	221633898
43572	NC_011959	CGA	2	6	1935188	1935193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633898
43573	NC_011959	GAC	2	6	1935234	1935239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633898
43574	NC_011959	TCG	2	6	1935247	1935252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633898
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43576	NC_011959	CTG	2	6	1935321	1935326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633898
43577	NC_011959	GC	3	6	1935346	1935351	0 %	0 %	50 %	50 %	221633898
43578	NC_011959	CCT	2	6	1935371	1935376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633898
43579	NC_011959	GGC	2	6	1935390	1935395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633898
43580	NC_011959	ACG	2	6	1935466	1935471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633898
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43582	NC_011959	GGC	2	6	1935570	1935575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633898
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43584	NC_011959	CGT	2	6	1935597	1935602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633898
43585	NC_011959	GTC	2	6	1935604	1935609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633898
43586	NC_011959	GGTGAT	2	12	1935633	1935644	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	221633898
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43588	NC_011959	TCC	2	6	1935670	1935675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633898
43589	NC_011959	CTC	2	6	1935685	1935690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43590	NC_011959	CGT	2	6	1935711	1935716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633899
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43593	NC_011959	CCA	2	6	1935811	1935816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633899
43594	NC_011959	GTC	2	6	1935883	1935888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633899
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43598	NC_011959	GC	3	6	1935949	1935954	0 %	0 %	50 %	50 %	221633899
43599	NC_011959	CGAC	2	8	1935997	1936004	25 %	0 %	25 %	50 %	221633899
43600	NC_011959	CGGAG	2	10	1936009	1936018	20 %	0 %	60 %	20 %	221633899
43601	NC_011959	CGG	2	6	1936023	1936028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633899
43602	NC_011959	GCG	2	6	1936085	1936090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633899
43603	NC_011959	CGG	2	6	1936099	1936104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633899
43604	NC_011959	TGG	2	6	1936150	1936155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633899
43605	NC_011959	GAG	2	6	1936193	1936198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633899
43606	NC_011959	CTG	2	6	1936199	1936204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633899
43607	NC_011959	GGC	2	6	1936259	1936264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633899
43608	NC_011959	GAA	2	6	1936271	1936276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633899
43609	NC_011959	GAG	2	6	1936292	1936297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633899
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43611	NC_011959	G	6	6	1936327	1936332	0 %	0 %	100 %	0 %	221633899
43612	NC_011959	GC	3	6	1936335	1936340	0 %	0 %	50 %	50 %	221633899
43613	NC_011959	AGG	2	6	1936347	1936352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633899
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43621	NC_011959	GTC	2	6	1936652	1936657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633900
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