MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_011959	GTG	2	6	1910075	1910080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633873
43002	NC_011959	TGG	2	6	1910099	1910104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633873
43003	NC_011959	GCGG	2	8	1910134	1910141	0 %	0 %	75 %	25 %	221633873
43004	NC_011959	TTCG	2	8	1910159	1910166	0 %	50 %	25 %	25 %	221633873
43005	NC_011959	GCG	2	6	1910252	1910257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633874
43006	NC_011959	TCG	2	6	1910403	1910408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633874
43007	NC_011959	CGT	2	6	1910477	1910482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633874
43008	NC_011959	ACTG	2	8	1910528	1910535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43009	NC_011959	ACG	2	6	1910544	1910549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43010	NC_011959	CAG	2	6	1910566	1910571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43011	NC_011959	TCGT	2	8	1910600	1910607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43012	NC_011959	TTC	2	6	1910647	1910652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43013	NC_011959	TCGC	2	8	1910654	1910661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43014	NC_011959	GCC	2	6	1910681	1910686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43015	NC_011959	CG	3	6	1910716	1910721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43016	NC_011959	TCC	2	6	1910792	1910797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43017	NC_011959	CG	3	6	1910823	1910828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43018	NC_011959	CTC	2	6	1910829	1910834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43019	NC_011959	AGGC	2	8	1910839	1910846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43020	NC_011959	ACG	2	6	1910849	1910854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43021	NC_011959	GCCG	2	8	1910901	1910908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43022	NC_011959	GCA	2	6	1910920	1910925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43023	NC_011959	GC	3	6	1910993	1910998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43024	NC_011959	TCG	2	6	1910999	1911004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43025	NC_011959	CGT	2	6	1911025	1911030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43026	NC_011959	CCG	2	6	1911038	1911043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633875
43027	NC_011959	GAAGGG	2	12	1911044	1911055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633875
43028	NC_011959	CGCGGA	2	12	1911058	1911069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221633875
43029	NC_011959	CTC	2	6	1911080	1911085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633875
43030	NC_011959	CGC	2	6	1911109	1911114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633875
43031	NC_011959	GGC	2	6	1911122	1911127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633875
43032	NC_011959	CAGC	2	8	1911134	1911141	25 %	0 %	25 %	50 %	221633875
43033	NC_011959	CGA	2	6	1911145	1911150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633875
43034	NC_011959	GCG	2	6	1911192	1911197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633875
43035	NC_011959	CGT	3	9	1911212	1911220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633875
43036	NC_011959	GTG	2	6	1911275	1911280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633875
43037	NC_011959	GAGC	2	8	1911283	1911290	25 %	0 %	50 %	25 %	221633875
43038	NC_011959	CTG	2	6	1911328	1911333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633875
43039	NC_011959	GGC	2	6	1911353	1911358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633875
43040	NC_011959	GAT	2	6	1911373	1911378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633875
43041	NC_011959	CGG	2	6	1911459	1911464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633875
43042	NC_011959	CGG	2	6	1911483	1911488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633875
43043	NC_011959	GCT	2	6	1911586	1911591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633875
43044	NC_011959	GTCG	2	8	1911623	1911630	0 %	25 %	50 %	25 %	221633875
43045	NC_011959	CGT	2	6	1911631	1911636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633875
43046	NC_011959	GCCC	2	8	1911640	1911647	0 %	0 %	25 %	75 %	221633875
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43050	NC_011959	GC	3	6	1911701	1911706	0 %	0 %	50 %	50 %	221633875
43051	NC_011959	CCA	2	6	1911714	1911719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633875
43052	NC_011959	GTC	2	6	1911734	1911739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633875
43053	NC_011959	CGA	2	6	1911839	1911844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43054	NC_011959	CAG	2	6	1911847	1911852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43055	NC_011959	GAGC	2	8	1911916	1911923	25 %	0 %	50 %	25 %	221633876
43056	NC_011959	GCG	2	6	1912056	1912061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633876
43057	NC_011959	AGAC	2	8	1912062	1912069	50 %	0 %	25 %	25 %	221633876
43058	NC_011959	GCG	2	6	1912097	1912102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633876
43059	NC_011959	GCA	2	6	1912145	1912150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633877
43060	NC_011959	CGGA	2	8	1912212	1912219	25 %	0 %	50 %	25 %	221633877
43061	NC_011959	GA	3	6	1912276	1912281	50 %	0 %	50 %	0 %	221633877
43062	NC_011959	GC	3	6	1912282	1912287	0 %	0 %	50 %	50 %	221633877
43063	NC_011959	CG	3	6	1912396	1912401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43064	NC_011959	CTC	2	6	1912442	1912447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43065	NC_011959	CTCG	2	8	1912554	1912561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43066	NC_011959	GAG	2	6	1912647	1912652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43067	NC_011959	CCA	2	6	1912854	1912859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633878
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43069	NC_011959	GCTC	2	8	1912889	1912896	0 %	25 %	25 %	50 %	221633878
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43072	NC_011959	TCG	2	6	1912996	1913001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633878
43073	NC_011959	GGGT	3	12	1913099	1913110	0 %	25 %	75 %	0 %	221633878
43074	NC_011959	CGCC	2	8	1913111	1913118	0 %	0 %	25 %	75 %	221633878
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43084	NC_011959	TCGC	2	8	1913548	1913555	0 %	25 %	25 %	50 %	221633878
43085	NC_011959	TCG	2	6	1913581	1913586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633878
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43089	NC_011959	TCCT	2	8	1913731	1913738	0 %	50 %	0 %	50 %	221633878
43090	NC_011959	GC	3	6	1913817	1913822	0 %	0 %	50 %	50 %	221633878
43091	NC_011959	CTGG	2	8	1913852	1913859	0 %	25 %	50 %	25 %	221633878
43092	NC_011959	GTG	2	6	1913934	1913939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633878
43093	NC_011959	GC	3	6	1914014	1914019	0 %	0 %	50 %	50 %	221633878
43094	NC_011959	GACG	2	8	1914063	1914070	25 %	0 %	50 %	25 %	221633878
43095	NC_011959	CCGC	2	8	1914110	1914117	0 %	0 %	25 %	75 %	221633878
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43099	NC_011959	CTC	2	6	1914273	1914278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633878
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43102	NC_011959	AGG	2	6	1914361	1914366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633878
43103	NC_011959	TGGGA	2	10	1914396	1914405	20 %	20 %	60 %	0 %	221633878
43104	NC_011959	CGC	2	6	1914406	1914411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633878
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43107	NC_011959	TCCT	2	8	1914497	1914504	0 %	50 %	0 %	50 %	221633879
43108	NC_011959	CGG	2	6	1914565	1914570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633879
43109	NC_011959	GGC	2	6	1914578	1914583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633879
43110	NC_011959	GGCG	2	8	1914590	1914597	0 %	0 %	75 %	25 %	221633879
43111	NC_011959	TCG	2	6	1914604	1914609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633879
43112	NC_011959	CG	4	8	1914652	1914659	0 %	0 %	50 %	50 %	221633879
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43119	NC_011959	GAC	2	6	1914916	1914921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633879
43120	NC_011959	GCA	2	6	1914936	1914941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633879
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43237	NC_011959	GC	4	8	1919606	1919613	0 %	0 %	50 %	50 %	221633881
43238	NC_011959	GCT	2	6	1919638	1919643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633881
43239	NC_011959	CTGC	2	8	1919667	1919674	0 %	25 %	25 %	50 %	221633881
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43241	NC_011959	CGG	2	6	1919765	1919770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43246	NC_011959	AGC	2	6	1919942	1919947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43272	NC_011959	AGGG	2	8	1921330	1921337	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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43354	NC_011959	CCGCT	2	10	1925030	1925039	0 %	20 %	20 %	60 %	221633888
43355	NC_011959	GCAG	2	8	1925103	1925110	25 %	0 %	50 %	25 %	221633888
43356	NC_011959	GCG	2	6	1925213	1925218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633888
43357	NC_011959	TCC	2	6	1925220	1925225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43358	NC_011959	CAG	2	6	1925227	1925232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43359	NC_011959	ACC	2	6	1925241	1925246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633889
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43362	NC_011959	CCG	2	6	1925426	1925431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633889
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43384	NC_011959	TCC	2	6	1926449	1926454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633889
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43388	NC_011959	TCG	2	6	1926590	1926595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633889
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43423	NC_011959	GA	3	6	1928242	1928247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43424	NC_011959	CGG	2	6	1928359	1928364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633891
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43453	NC_011959	CCGA	2	8	1929538	1929545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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43458	NC_011959	GCTCG	2	10	1929642	1929651	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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43460	NC_011959	GCTGG	2	10	1929683	1929692	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43461	NC_011959	CGG	2	6	1929708	1929713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43462	NC_011959	GTG	2	6	1929723	1929728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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43466	NC_011959	CTT	2	6	1929788	1929793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633893
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43471	NC_011959	TGA	2	6	1930016	1930021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633893
43472	NC_011959	CGC	2	6	1930043	1930048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633893
43473	NC_011959	CGC	2	6	1930055	1930060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633893
43474	NC_011959	TGG	2	6	1930119	1930124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633893
43475	NC_011959	GTA	2	6	1930133	1930138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633893
43476	NC_011959	TCG	2	6	1930140	1930145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633893
43477	NC_011959	CGC	2	6	1930149	1930154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633893
43478	NC_011959	GAA	2	6	1930196	1930201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633893
43479	NC_011959	TTC	2	6	1930245	1930250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633893
43480	NC_011959	GTC	2	6	1930358	1930363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633893
43481	NC_011959	CAGTC	2	10	1930444	1930453	20 %	20 %	20 %	40 %	221633893
43482	NC_011959	AGG	2	6	1930657	1930662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633893
43483	NC_011959	GAG	2	6	1930734	1930739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633893
43484	NC_011959	ACC	3	9	1930778	1930786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633893
43485	NC_011959	CGC	2	6	1930837	1930842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633893
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43487	NC_011959	CGT	2	6	1931036	1931041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633893
43488	NC_011959	CAG	2	6	1931129	1931134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633893
43489	NC_011959	TCC	2	6	1931153	1931158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43490	NC_011959	CGC	2	6	1931190	1931195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633894
43491	NC_011959	CCT	2	6	1931242	1931247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633894
43492	NC_011959	GTC	2	6	1931454	1931459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43493	NC_011959	TCGC	2	8	1931460	1931467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43494	NC_011959	CGGC	2	8	1931486	1931493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43495	NC_011959	CGC	2	6	1931530	1931535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43496	NC_011959	CCGG	2	8	1931621	1931628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43497	NC_011959	TCGA	2	8	1931711	1931718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43498	NC_011959	AGGGA	2	10	1931719	1931728	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43499	NC_011959	TCC	2	6	1931769	1931774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633895
43500	NC_011959	TCG	2	6	1931775	1931780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633895

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