MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_011959	GCG	2	6	1888816	1888821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42502	NC_011959	TCC	2	6	1888833	1888838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42503	NC_011959	TCCCT	2	10	1888910	1888919	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42504	NC_011959	CTTG	2	8	1888949	1888956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42505	NC_011959	TGAGC	2	10	1889001	1889010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42506	NC_011959	GTC	2	6	1889048	1889053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42507	NC_011959	GAC	2	6	1889067	1889072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42508	NC_011959	GAG	2	6	1889098	1889103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42509	NC_011959	TGG	2	6	1889127	1889132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633852
42510	NC_011959	GCG	2	6	1889138	1889143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633852
42511	NC_011959	GC	3	6	1889198	1889203	0 %	0 %	50 %	50 %	221633852
42512	NC_011959	GCGA	2	8	1889212	1889219	25 %	0 %	50 %	25 %	221633852
42513	NC_011959	GCG	2	6	1889233	1889238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633852
42514	NC_011959	CTC	2	6	1889240	1889245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633852
42515	NC_011959	GAG	2	6	1889246	1889251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633852
42516	NC_011959	CAG	2	6	1889333	1889338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42517	NC_011959	CAG	2	6	1889345	1889350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42518	NC_011959	GCG	2	6	1889365	1889370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633852
42519	NC_011959	AGC	2	6	1889388	1889393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42520	NC_011959	GAG	2	6	1889459	1889464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633852
42521	NC_011959	GCTCG	2	10	1889480	1889489	0 %	20 %	40 %	40 %	221633852
42522	NC_011959	GGA	2	6	1889536	1889541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633852
42523	NC_011959	GC	3	6	1889543	1889548	0 %	0 %	50 %	50 %	221633852
42524	NC_011959	GC	3	6	1889579	1889584	0 %	0 %	50 %	50 %	221633852
42525	NC_011959	AGC	2	6	1889616	1889621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42526	NC_011959	GAG	2	6	1889630	1889635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633852
42527	NC_011959	CGA	2	6	1889734	1889739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42528	NC_011959	CAT	2	6	1889752	1889757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633852
42529	NC_011959	TCG	2	6	1889814	1889819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42530	NC_011959	TCG	2	6	1889846	1889851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633852
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42533	NC_011959	GTC	2	6	1889939	1889944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42534	NC_011959	AAG	2	6	1889958	1889963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633852
42535	NC_011959	ATC	2	6	1889972	1889977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633852
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42537	NC_011959	GAA	2	6	1890305	1890310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633852
42538	NC_011959	CGG	2	6	1890345	1890350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633852
42539	NC_011959	CCT	2	6	1890438	1890443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633852
42540	NC_011959	CAGG	2	8	1890473	1890480	25 %	0 %	50 %	25 %	221633852
42541	NC_011959	GTC	2	6	1890551	1890556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633852
42542	NC_011959	AAG	2	6	1890557	1890562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633852
42543	NC_011959	CG	3	6	1890620	1890625	0 %	0 %	50 %	50 %	221633852
42544	NC_011959	CG	3	6	1890634	1890639	0 %	0 %	50 %	50 %	221633852
42545	NC_011959	CGG	2	6	1890729	1890734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42546	NC_011959	GT	3	6	1890792	1890797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42547	NC_011959	TG	3	6	1890828	1890833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42548	NC_011959	GT	3	6	1890876	1890881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42549	NC_011959	CG	4	8	1890909	1890916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42550	NC_011959	CGG	2	6	1890959	1890964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42551	NC_011959	GAGTC	2	10	1890985	1890994	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42552	NC_011959	AAG	2	6	1891026	1891031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42553	NC_011959	AGC	2	6	1891124	1891129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633853
42554	NC_011959	GCC	2	6	1891181	1891186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633853
42555	NC_011959	CGC	2	6	1891372	1891377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633853
42556	NC_011959	AG	3	6	1891416	1891421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42557	NC_011959	CCG	2	6	1891482	1891487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633854
42558	NC_011959	TGATC	2	10	1891549	1891558	20 %	40 %	20 %	20 %	221633854
42559	NC_011959	GATC	2	8	1891693	1891700	25 %	25 %	25 %	25 %	221633854
42560	NC_011959	GTT	2	6	1891709	1891714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633854
42561	NC_011959	GAG	2	6	1891748	1891753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633854
42562	NC_011959	CAG	2	6	1891843	1891848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633854
42563	NC_011959	GAG	2	6	1891874	1891879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633854
42564	NC_011959	TGC	2	6	1891889	1891894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633854
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42568	NC_011959	TCGT	2	8	1892041	1892048	0 %	50 %	25 %	25 %	221633854
42569	NC_011959	CTCC	2	8	1892088	1892095	0 %	25 %	0 %	75 %	221633855
42570	NC_011959	GTC	2	6	1892143	1892148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633855
42571	NC_011959	CGA	2	6	1892172	1892177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633855
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42575	NC_011959	TGC	3	9	1892404	1892412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633855
42576	NC_011959	GCG	2	6	1892552	1892557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633855
42577	NC_011959	TGC	2	6	1892559	1892564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633855
42578	NC_011959	CGG	2	6	1892592	1892597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633855
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42582	NC_011959	CGT	2	6	1892810	1892815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633856
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42585	NC_011959	CG	3	6	1892851	1892856	0 %	0 %	50 %	50 %	221633856
42586	NC_011959	TGA	2	6	1892875	1892880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633856
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42589	NC_011959	CTG	2	6	1892989	1892994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633856
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42591	NC_011959	CAGC	2	8	1893038	1893045	25 %	0 %	25 %	50 %	221633856
42592	NC_011959	GCAG	2	8	1893083	1893090	25 %	0 %	50 %	25 %	221633856
42593	NC_011959	CGAGC	2	10	1893095	1893104	20 %	0 %	40 %	40 %	221633856
42594	NC_011959	CCT	2	6	1893136	1893141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633856
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42600	NC_011959	GCG	2	6	1893224	1893229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633856
42601	NC_011959	GCA	2	6	1893312	1893317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633856
42602	NC_011959	CGA	2	6	1893337	1893342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633856
42603	NC_011959	CCAG	2	8	1893374	1893381	25 %	0 %	25 %	50 %	221633856
42604	NC_011959	CGG	2	6	1893382	1893387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633856
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42607	NC_011959	GCTC	2	8	1893458	1893465	0 %	25 %	25 %	50 %	221633856
42608	NC_011959	CCA	2	6	1893548	1893553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633856
42609	NC_011959	GCG	2	6	1893588	1893593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633856
42610	NC_011959	GC	3	6	1893597	1893602	0 %	0 %	50 %	50 %	221633856
42611	NC_011959	CCA	2	6	1893610	1893615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633856
42612	NC_011959	CGA	2	6	1893637	1893642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633856
42613	NC_011959	AG	3	6	1893739	1893744	50 %	0 %	50 %	0 %	221633856
42614	NC_011959	AGA	2	6	1893757	1893762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633856
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42618	NC_011959	GTC	2	6	1893845	1893850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633856
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42725	NC_011959	GAG	2	6	1898638	1898643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42726	NC_011959	GAC	2	6	1898653	1898658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633863
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42731	NC_011959	GC	3	6	1898798	1898803	0 %	0 %	50 %	50 %	221633863
42732	NC_011959	GGTC	2	8	1898806	1898813	0 %	25 %	50 %	25 %	221633863
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42853	NC_011959	AGCGGT	2	12	1904439	1904450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633867
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42856	NC_011959	AGT	2	6	1904586	1904591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633867
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42879	NC_011959	GC	3	6	1905533	1905538	0 %	0 %	50 %	50 %	221633868
42880	NC_011959	GC	3	6	1905548	1905553	0 %	0 %	50 %	50 %	221633868
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42882	NC_011959	GAG	2	6	1905628	1905633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42952	NC_011959	CTG	2	6	1908097	1908102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633870
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42959	NC_011959	GAT	2	6	1908390	1908395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633870
42960	NC_011959	GC	3	6	1908407	1908412	0 %	0 %	50 %	50 %	221633870
42961	NC_011959	CGA	2	6	1908495	1908500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633870
42962	NC_011959	GAT	2	6	1908550	1908555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633870
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42964	NC_011959	TC	3	6	1908597	1908602	0 %	50 %	0 %	50 %	221633870
42965	NC_011959	ACC	2	6	1908637	1908642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633870
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42971	NC_011959	TGGA	2	8	1908865	1908872	25 %	25 %	50 %	0 %	221633870
42972	NC_011959	CCG	2	6	1908929	1908934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633870
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