MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_011959	CA	3	6	1846805	1846810	50 %	0 %	0 %	50 %	221633811
41502	NC_011959	GCT	2	6	1846881	1846886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633811
41503	NC_011959	AGT	2	6	1846930	1846935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633811
41504	NC_011959	GGA	2	6	1847010	1847015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633811
41505	NC_011959	AGCG	2	8	1847024	1847031	25 %	0 %	50 %	25 %	221633811
41506	NC_011959	CAG	2	6	1847089	1847094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633811
41507	NC_011959	CGG	2	6	1847096	1847101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633811
41508	NC_011959	GAA	2	6	1847116	1847121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633811
41509	NC_011959	GCGA	2	8	1847122	1847129	25 %	0 %	50 %	25 %	221633811
41510	NC_011959	GGA	2	6	1847148	1847153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633811
41511	NC_011959	CGAG	2	8	1847368	1847375	25 %	0 %	50 %	25 %	221633811
41512	NC_011959	GCTG	2	8	1847434	1847441	0 %	25 %	50 %	25 %	221633811
41513	NC_011959	CG	3	6	1847462	1847467	0 %	0 %	50 %	50 %	221633811
41514	NC_011959	GAG	2	6	1847470	1847475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633811
41515	NC_011959	GCG	2	6	1847484	1847489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633811
41516	NC_011959	CCG	2	6	1847515	1847520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633811
41517	NC_011959	GCC	2	6	1847675	1847680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633811
41518	NC_011959	CTG	2	6	1847802	1847807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633811
41519	NC_011959	CAA	2	6	1847829	1847834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633812
41520	NC_011959	CCT	3	9	1847942	1847950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633812
41521	NC_011959	CTG	2	6	1847991	1847996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41522	NC_011959	GTT	2	6	1848011	1848016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633812
41523	NC_011959	CCA	2	6	1848054	1848059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633812
41524	NC_011959	CTCC	2	8	1848104	1848111	0 %	25 %	0 %	75 %	221633812
41525	NC_011959	AGT	2	6	1848122	1848127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633812
41526	NC_011959	CGA	2	6	1848227	1848232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41527	NC_011959	GCT	2	6	1848241	1848246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41528	NC_011959	TAG	2	6	1848262	1848267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633812
41529	NC_011959	TGT	3	9	1848275	1848283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633812
41530	NC_011959	TGC	2	6	1848293	1848298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41531	NC_011959	CGT	2	6	1848299	1848304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41532	NC_011959	GACG	2	8	1848314	1848321	25 %	0 %	50 %	25 %	221633812
41533	NC_011959	GCA	2	6	1848524	1848529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41534	NC_011959	TGC	2	6	1848551	1848556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41535	NC_011959	CGG	2	6	1848600	1848605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633812
41536	NC_011959	TGA	2	6	1848614	1848619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633812
41537	NC_011959	GCG	2	6	1848643	1848648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633812
41538	NC_011959	TCG	2	6	1848745	1848750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41539	NC_011959	GC	3	6	1848791	1848796	0 %	0 %	50 %	50 %	221633812
41540	NC_011959	CCAT	2	8	1848805	1848812	25 %	25 %	0 %	50 %	221633812
41541	NC_011959	CAGC	2	8	1848843	1848850	25 %	0 %	25 %	50 %	221633812
41542	NC_011959	GAG	2	6	1848859	1848864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633812
41543	NC_011959	TTC	2	6	1848988	1848993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633812
41544	NC_011959	AAC	2	6	1848994	1848999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633812
41545	NC_011959	CGT	2	6	1849043	1849048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41546	NC_011959	ACGTC	2	10	1849052	1849061	20 %	20 %	20 %	40 %	221633812
41547	NC_011959	ATC	2	6	1849089	1849094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633812
41548	NC_011959	AGCC	2	8	1849136	1849143	25 %	0 %	25 %	50 %	221633812
41549	NC_011959	CG	3	6	1849205	1849210	0 %	0 %	50 %	50 %	221633812
41550	NC_011959	CGCGG	2	10	1849280	1849289	0 %	0 %	60 %	40 %	221633812
41551	NC_011959	TGC	2	6	1849320	1849325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41552	NC_011959	GCT	2	6	1849357	1849362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41553	NC_011959	CGT	2	6	1849380	1849385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41554	NC_011959	CTCG	2	8	1849410	1849417	0 %	25 %	25 %	50 %	221633812
41555	NC_011959	GAG	2	6	1849428	1849433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633812
41556	NC_011959	AGC	3	9	1849484	1849492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633812
41557	NC_011959	TGGG	2	8	1849501	1849508	0 %	25 %	75 %	0 %	221633812
41558	NC_011959	ACT	2	6	1849524	1849529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41559	NC_011959	CCTT	2	8	1849530	1849537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41560	NC_011959	CTG	2	6	1849551	1849556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41561	NC_011959	GAC	2	6	1849577	1849582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41562	NC_011959	GAA	2	6	1849588	1849593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41563	NC_011959	GCT	2	6	1849607	1849612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41564	NC_011959	CCT	2	6	1849616	1849621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41565	NC_011959	TCG	2	6	1849649	1849654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633813
41566	NC_011959	CCA	2	6	1849743	1849748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633813
41567	NC_011959	CAA	2	6	1849845	1849850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633813
41568	NC_011959	TCA	2	6	1849874	1849879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633813
41569	NC_011959	GAG	2	6	1849884	1849889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633813
41570	NC_011959	TTCG	2	8	1849899	1849906	0 %	50 %	25 %	25 %	221633813
41571	NC_011959	GC	3	6	1849917	1849922	0 %	0 %	50 %	50 %	221633813
41572	NC_011959	GCGG	2	8	1849929	1849936	0 %	0 %	75 %	25 %	221633813
41573	NC_011959	GCTC	2	8	1849938	1849945	0 %	25 %	25 %	50 %	221633813
41574	NC_011959	CAG	2	6	1849946	1849951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633813
41575	NC_011959	GTTC	2	8	1849973	1849980	0 %	50 %	25 %	25 %	221633813
41576	NC_011959	GC	3	6	1850010	1850015	0 %	0 %	50 %	50 %	221633813
41577	NC_011959	ATG	2	6	1850047	1850052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633813
41578	NC_011959	CAGC	2	8	1850114	1850121	25 %	0 %	25 %	50 %	221633813
41579	NC_011959	TCGA	2	8	1850128	1850135	25 %	25 %	25 %	25 %	221633813
41580	NC_011959	GAT	2	6	1850178	1850183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633813
41581	NC_011959	ACG	2	6	1850200	1850205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633813
41582	NC_011959	TGA	3	9	1850210	1850218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633813
41583	NC_011959	CCA	2	6	1850222	1850227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633813
41584	NC_011959	CAAGGA	2	12	1850232	1850243	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	221633813
41585	NC_011959	CGA	2	6	1850420	1850425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633813
41586	NC_011959	CAG	2	6	1850439	1850444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633813
41587	NC_011959	CGG	2	6	1850479	1850484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633813
41588	NC_011959	ACG	2	6	1850488	1850493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633813
41589	NC_011959	GAG	2	6	1850525	1850530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633813
41590	NC_011959	AGCC	2	8	1850575	1850582	25 %	0 %	25 %	50 %	221633814
41591	NC_011959	AGG	2	6	1850599	1850604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633814
41592	NC_011959	ACC	2	6	1850614	1850619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633814
41593	NC_011959	GAC	2	6	1850649	1850654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41594	NC_011959	CGG	2	6	1850672	1850677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633814
41595	NC_011959	TGA	2	6	1850765	1850770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633814
41596	NC_011959	GCA	2	6	1850788	1850793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633814
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41598	NC_011959	GCA	2	6	1850945	1850950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41599	NC_011959	GCT	2	6	1850959	1850964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41600	NC_011959	TTG	2	6	1850967	1850972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633814
41601	NC_011959	ACC	2	6	1850987	1850992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633814
41602	NC_011959	CAG	3	9	1851018	1851026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41603	NC_011959	CGA	2	6	1851071	1851076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41604	NC_011959	TTCG	2	8	1851188	1851195	0 %	50 %	25 %	25 %	221633814
41605	NC_011959	ACG	2	6	1851199	1851204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41606	NC_011959	GAGC	2	8	1851228	1851235	25 %	0 %	50 %	25 %	221633814
41607	NC_011959	TCG	2	6	1851295	1851300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633814
41608	NC_011959	CTCG	2	8	1851333	1851340	0 %	25 %	25 %	50 %	221633814
41609	NC_011959	GC	4	8	1851431	1851438	0 %	0 %	50 %	50 %	221633814
41610	NC_011959	CG	3	6	1851468	1851473	0 %	0 %	50 %	50 %	221633814
41611	NC_011959	TCT	2	6	1851491	1851496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41612	NC_011959	TTG	2	6	1851547	1851552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41613	NC_011959	GTC	2	6	1851564	1851569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41614	NC_011959	CGAG	2	8	1851580	1851587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41615	NC_011959	TCCCGT	2	12	1851611	1851622	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221633815
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41851	NC_011959	CGA	2	6	1860573	1860578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633821
41852	NC_011959	GCA	2	6	1860611	1860616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633821
41853	NC_011959	ACG	2	6	1860653	1860658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633821
41854	NC_011959	TGC	2	6	1860707	1860712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633821
41855	NC_011959	GGCG	2	8	1860847	1860854	0 %	0 %	75 %	25 %	221633821
41856	NC_011959	TGA	2	6	1860870	1860875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633821
41857	NC_011959	CGC	2	6	1860904	1860909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633821
41858	NC_011959	C	6	6	1860919	1860924	0 %	0 %	0 %	100 %	221633821
41859	NC_011959	ATC	2	6	1860934	1860939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633821
41860	NC_011959	TGA	2	6	1860960	1860965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633821
41861	NC_011959	GAGT	2	8	1861008	1861015	25 %	25 %	50 %	0 %	221633821
41862	NC_011959	CTG	2	6	1861039	1861044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633821
41863	NC_011959	CGT	2	6	1861067	1861072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633821
41864	NC_011959	TC	4	8	1861153	1861160	0 %	50 %	0 %	50 %	221633822
41865	NC_011959	CGA	2	6	1861175	1861180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633822
41866	NC_011959	GATC	2	8	1861181	1861188	25 %	25 %	25 %	25 %	221633822
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41868	NC_011959	GTC	2	6	1861221	1861226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633822
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41872	NC_011959	TCGG	2	8	1861318	1861325	0 %	25 %	50 %	25 %	221633822
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41882	NC_011959	CGTG	2	8	1861723	1861730	0 %	25 %	50 %	25 %	221633822
41883	NC_011959	TCGAGG	2	12	1861747	1861758	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633822
41884	NC_011959	TGGT	2	8	1861928	1861935	0 %	50 %	50 %	0 %	221633822
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41886	NC_011959	CT	3	6	1861958	1861963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41887	NC_011959	GCT	2	6	1861982	1861987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41888	NC_011959	CGG	2	6	1861996	1862001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41889	NC_011959	CAT	2	6	1862002	1862007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41931	NC_011959	AGC	2	6	1863874	1863879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633824
41932	NC_011959	GC	3	6	1863899	1863904	0 %	0 %	50 %	50 %	221633824
41933	NC_011959	GCA	2	6	1863949	1863954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633824
41934	NC_011959	TCG	2	6	1863969	1863974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633824
41935	NC_011959	GCA	2	6	1863976	1863981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633824
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41937	NC_011959	GGT	2	6	1864033	1864038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633825
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41944	NC_011959	TGA	2	6	1864271	1864276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633825
41945	NC_011959	GCTC	2	8	1864306	1864313	0 %	25 %	25 %	50 %	221633825
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41947	NC_011959	CG	3	6	1864491	1864496	0 %	0 %	50 %	50 %	221633825
41948	NC_011959	CGA	3	9	1864676	1864684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633825
41949	NC_011959	TGT	2	6	1864715	1864720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633825
41950	NC_011959	CGC	2	6	1864730	1864735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633825
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41952	NC_011959	TCG	2	6	1864846	1864851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633825
41953	NC_011959	CGA	2	6	1864874	1864879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633825
41954	NC_011959	CG	3	6	1864906	1864911	0 %	0 %	50 %	50 %	221633825
41955	NC_011959	CG	3	6	1864919	1864924	0 %	0 %	50 %	50 %	221633825
41956	NC_011959	CAGAAC	2	12	1864944	1864955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	221633825
41957	NC_011959	GCT	2	6	1864973	1864978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633825
41958	NC_011959	GA	3	6	1865087	1865092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41959	NC_011959	GGA	2	6	1865096	1865101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41960	NC_011959	CTC	2	6	1865132	1865137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633826
41961	NC_011959	CT	3	6	1865144	1865149	0 %	50 %	0 %	50 %	221633826
41962	NC_011959	CAT	2	6	1865164	1865169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633826
41963	NC_011959	ATC	2	6	1865249	1865254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633826
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