MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_011959	GTC	2	6	1803317	1803322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40502	NC_011959	TCCGC	2	10	1803370	1803379	0 %	20 %	20 %	60 %	221633772
40503	NC_011959	CGA	2	6	1803387	1803392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40504	NC_011959	CTC	2	6	1803404	1803409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633772
40505	NC_011959	GCT	2	6	1803589	1803594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40506	NC_011959	CGGTTT	2	12	1803598	1803609	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	221633772
40507	NC_011959	GAG	2	6	1803650	1803655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633772
40508	NC_011959	GAA	2	6	1803671	1803676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633772
40509	NC_011959	GGC	2	6	1803682	1803687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633772
40510	NC_011959	GCCA	2	8	1803689	1803696	25 %	0 %	25 %	50 %	221633772
40511	NC_011959	AGG	2	6	1803774	1803779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633772
40512	NC_011959	GCT	2	6	1803782	1803787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40513	NC_011959	CGA	2	6	1803808	1803813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40514	NC_011959	GCT	2	6	1803850	1803855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40515	NC_011959	TTC	2	6	1803869	1803874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633772
40516	NC_011959	GTGC	2	8	1803893	1803900	0 %	25 %	50 %	25 %	221633772
40517	NC_011959	CAG	2	6	1803924	1803929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40518	NC_011959	GCT	2	6	1803935	1803940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633772
40519	NC_011959	GTGG	2	8	1804013	1804020	0 %	25 %	75 %	0 %	221633772
40520	NC_011959	GTG	2	6	1804073	1804078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633772
40521	NC_011959	CGC	2	6	1804154	1804159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633773
40522	NC_011959	CTGG	2	8	1804209	1804216	0 %	25 %	50 %	25 %	221633773
40523	NC_011959	GAC	2	6	1804221	1804226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40524	NC_011959	CGG	2	6	1804240	1804245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633773
40525	NC_011959	GCC	2	6	1804255	1804260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633773
40526	NC_011959	TCT	2	6	1804304	1804309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633773
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40528	NC_011959	TTC	3	9	1804366	1804374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633773
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40531	NC_011959	GTC	2	6	1804399	1804404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
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40533	NC_011959	CG	3	6	1804515	1804520	0 %	0 %	50 %	50 %	221633773
40534	NC_011959	CTC	2	6	1804546	1804551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633773
40535	NC_011959	GCTC	2	8	1804554	1804561	0 %	25 %	25 %	50 %	221633773
40536	NC_011959	TCG	2	6	1804568	1804573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40537	NC_011959	TCG	2	6	1804634	1804639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40538	NC_011959	ATT	2	6	1804688	1804693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221633773
40539	NC_011959	GCTG	2	8	1804698	1804705	0 %	25 %	50 %	25 %	221633773
40540	NC_011959	CTGGCT	2	12	1804722	1804733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40541	NC_011959	CGT	2	6	1804749	1804754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40542	NC_011959	TTG	2	6	1804777	1804782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633773
40543	NC_011959	CAG	2	6	1804822	1804827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40544	NC_011959	CT	3	6	1804856	1804861	0 %	50 %	0 %	50 %	221633773
40545	NC_011959	GGT	2	6	1804862	1804867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633773
40546	NC_011959	GC	3	6	1804887	1804892	0 %	0 %	50 %	50 %	221633773
40547	NC_011959	CGC	2	6	1804911	1804916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633773
40548	NC_011959	CTT	2	6	1804966	1804971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633773
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40550	NC_011959	CGG	2	6	1805056	1805061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633773
40551	NC_011959	AGCG	2	8	1805094	1805101	25 %	0 %	50 %	25 %	221633773
40552	NC_011959	CTT	3	9	1805133	1805141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633773
40553	NC_011959	TGG	2	6	1805173	1805178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633773
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40557	NC_011959	CCGCT	2	10	1805266	1805275	0 %	20 %	20 %	60 %	221633773
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40559	NC_011959	GC	3	6	1805389	1805394	0 %	0 %	50 %	50 %	221633773
40560	NC_011959	CTC	2	6	1805398	1805403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633773
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40562	NC_011959	GCG	2	6	1805449	1805454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633773
40563	NC_011959	GTGTC	2	10	1805465	1805474	0 %	40 %	40 %	20 %	221633773
40564	NC_011959	TCG	2	6	1805487	1805492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
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40571	NC_011959	GTC	2	6	1805716	1805721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40572	NC_011959	CGA	2	6	1805763	1805768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633773
40573	NC_011959	TCG	2	6	1805774	1805779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
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40588	NC_011959	GTC	2	6	1806382	1806387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
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40590	NC_011959	GCA	2	6	1806429	1806434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633773
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40593	NC_011959	GCT	2	6	1806522	1806527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
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40598	NC_011959	TCT	2	6	1806669	1806674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633774
40599	NC_011959	CGG	2	6	1806819	1806824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633775
40600	NC_011959	CCGAT	2	10	1806846	1806855	20 %	20 %	20 %	40 %	221633775
40601	NC_011959	TCCAG	2	10	1806861	1806870	20 %	20 %	20 %	40 %	221633775
40602	NC_011959	CAC	2	6	1806884	1806889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633775
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40604	NC_011959	TCGG	2	8	1807101	1807108	0 %	25 %	50 %	25 %	221633775
40605	NC_011959	CGA	2	6	1807129	1807134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633775
40606	NC_011959	CGT	2	6	1807136	1807141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633775
40607	NC_011959	CGG	2	6	1807229	1807234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633775
40608	NC_011959	CGAGT	2	10	1807277	1807286	20 %	20 %	40 %	20 %	221633775
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40610	NC_011959	CCGA	2	8	1807391	1807398	25 %	0 %	25 %	50 %	221633775
40611	NC_011959	CTGT	2	8	1807448	1807455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40612	NC_011959	GCG	2	6	1807543	1807548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633776
40613	NC_011959	TCT	2	6	1807550	1807555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633776
40614	NC_011959	CGCC	2	8	1807570	1807577	0 %	0 %	25 %	75 %	221633776
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40616	NC_011959	CGGG	2	8	1807613	1807620	0 %	0 %	75 %	25 %	221633776
40617	NC_011959	CGA	2	6	1807643	1807648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633776
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40938	NC_011959	GCCCA	2	10	1820865	1820874	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40939	NC_011959	GAA	2	6	1820888	1820893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40949	NC_011959	GC	3	6	1821349	1821354	0 %	0 %	50 %	50 %	221633788
40950	NC_011959	CTCGT	2	10	1821370	1821379	0 %	40 %	20 %	40 %	221633788
40951	NC_011959	TCGA	2	8	1821387	1821394	25 %	25 %	25 %	25 %	221633788
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40959	NC_011959	CGTCC	2	10	1821723	1821732	0 %	20 %	20 %	60 %	221633788
40960	NC_011959	CCG	2	6	1821766	1821771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633788
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40962	NC_011959	GCG	2	6	1821863	1821868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633788
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40964	NC_011959	GCT	2	6	1821915	1821920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
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40967	NC_011959	CGT	2	6	1822226	1822231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
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40992	NC_011959	CGA	2	6	1823567	1823572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633788
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