MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011959	TGG	2	6	155190	155195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632179
3502	NC_011959	AAC	2	6	155208	155213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632179
3503	NC_011959	TCG	2	6	155238	155243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632179
3504	NC_011959	CGCAC	2	10	155291	155300	20 %	0 %	20 %	60 %	221632179
3505	NC_011959	GTCG	2	8	155359	155366	0 %	25 %	50 %	25 %	221632179
3506	NC_011959	GT	3	6	155505	155510	0 %	50 %	50 %	0 %	221632180
3507	NC_011959	CCAG	2	8	155511	155518	25 %	0 %	25 %	50 %	221632180
3508	NC_011959	GCT	2	6	155552	155557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632180
3509	NC_011959	GCTCCA	2	12	155562	155573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221632180
3510	NC_011959	CGAC	2	8	155676	155683	25 %	0 %	25 %	50 %	221632180
3511	NC_011959	GCA	2	6	155691	155696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632180
3512	NC_011959	TCGC	2	8	155714	155721	0 %	25 %	25 %	50 %	221632180
3513	NC_011959	GTT	2	6	155775	155780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632180
3514	NC_011959	CCAA	2	8	155797	155804	50 %	0 %	0 %	50 %	221632180
3515	NC_011959	TCC	2	6	155920	155925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632181
3516	NC_011959	GCG	2	6	155929	155934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3517	NC_011959	GAC	2	6	155991	155996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3518	NC_011959	GCC	2	6	155999	156004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632181
3519	NC_011959	CGT	2	6	156015	156020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3520	NC_011959	CGA	3	9	156062	156070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3521	NC_011959	GCT	2	6	156113	156118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3522	NC_011959	CTC	2	6	156129	156134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632181
3523	NC_011959	ACC	3	9	156159	156167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632181
3524	NC_011959	CAG	2	6	156175	156180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3525	NC_011959	CGG	2	6	156241	156246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3526	NC_011959	TGC	2	6	156249	156254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3527	NC_011959	GCC	2	6	156304	156309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632181
3528	NC_011959	GGC	2	6	156399	156404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3529	NC_011959	GTG	2	6	156442	156447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632181
3530	NC_011959	CG	3	6	156477	156482	0 %	0 %	50 %	50 %	221632181
3531	NC_011959	CGA	2	6	156494	156499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3532	NC_011959	CTT	2	6	156515	156520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632181
3533	NC_011959	CGACG	2	10	156524	156533	20 %	0 %	40 %	40 %	221632181
3534	NC_011959	CGT	2	6	156536	156541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3535	NC_011959	AGG	2	6	156568	156573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632181
3536	NC_011959	GGCC	2	8	156584	156591	0 %	0 %	50 %	50 %	221632181
3537	NC_011959	GCCAC	2	10	156602	156611	20 %	0 %	20 %	60 %	221632181
3538	NC_011959	GAAG	2	8	156642	156649	50 %	0 %	50 %	0 %	221632181
3539	NC_011959	CGA	2	6	156659	156664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3540	NC_011959	GC	3	6	156690	156695	0 %	0 %	50 %	50 %	221632181
3541	NC_011959	AGCG	2	8	156728	156735	25 %	0 %	50 %	25 %	221632181
3542	NC_011959	TGC	2	6	156789	156794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3543	NC_011959	AC	3	6	156892	156897	50 %	0 %	0 %	50 %	221632181
3544	NC_011959	GCG	2	6	156956	156961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3545	NC_011959	ATA	2	6	157002	157007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632181
3546	NC_011959	TTG	2	6	157012	157017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632181
3547	NC_011959	GCG	2	6	157027	157032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3548	NC_011959	GC	3	6	157042	157047	0 %	0 %	50 %	50 %	221632181
3549	NC_011959	ATG	2	6	157090	157095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632181
3550	NC_011959	CTC	2	6	157200	157205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632181
3551	NC_011959	CCA	2	6	157299	157304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632181
3552	NC_011959	TGGC	2	8	157312	157319	0 %	25 %	50 %	25 %	221632181
3553	NC_011959	GGCT	2	8	157378	157385	0 %	25 %	50 %	25 %	221632181
3554	NC_011959	CCAC	2	8	157462	157469	25 %	0 %	0 %	75 %	221632181
3555	NC_011959	CG	4	8	157481	157488	0 %	0 %	50 %	50 %	221632181
3556	NC_011959	CGAAC	2	10	157493	157502	40 %	0 %	20 %	40 %	221632181
3557	NC_011959	GAG	2	6	157509	157514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632181
3558	NC_011959	GCG	2	6	157554	157559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3559	NC_011959	CGA	2	6	157580	157585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3560	NC_011959	CGA	2	6	157610	157615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3561	NC_011959	GCC	2	6	157635	157640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632181
3562	NC_011959	AGA	2	6	157703	157708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632181
3563	NC_011959	GAA	2	6	157716	157721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632181
3564	NC_011959	GCA	2	6	157733	157738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3565	NC_011959	GCA	2	6	157775	157780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3566	NC_011959	GAC	2	6	157800	157805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
3567	NC_011959	CGAGA	2	10	157896	157905	40 %	0 %	40 %	20 %	221632181
3568	NC_011959	CAG	2	6	157969	157974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632182
3569	NC_011959	TTG	2	6	158048	158053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632182
3570	NC_011959	CAGC	2	8	158179	158186	25 %	0 %	25 %	50 %	221632182
3571	NC_011959	GCGG	2	8	158199	158206	0 %	0 %	75 %	25 %	221632182
3572	NC_011959	GAGC	2	8	158235	158242	25 %	0 %	50 %	25 %	221632182
3573	NC_011959	GCT	2	6	158327	158332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632182
3574	NC_011959	GCG	2	6	158426	158431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632182
3575	NC_011959	GC	3	6	158454	158459	0 %	0 %	50 %	50 %	221632182
3576	NC_011959	GAT	2	6	158461	158466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632182
3577	NC_011959	TCG	2	6	158474	158479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632182
3578	NC_011959	GCC	2	6	158506	158511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632182
3579	NC_011959	GCC	2	6	158594	158599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632182
3580	NC_011959	GGT	2	6	158724	158729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632182
3581	NC_011959	GCG	2	6	158830	158835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632182
3582	NC_011959	CG	3	6	158834	158839	0 %	0 %	50 %	50 %	221632182
3583	NC_011959	TCGG	2	8	158864	158871	0 %	25 %	50 %	25 %	221632182
3584	NC_011959	CGA	2	6	158889	158894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632182
3585	NC_011959	TCC	3	9	158919	158927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_011959	CAG	2	6	158935	158940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3587	NC_011959	GC	3	6	158948	158953	0 %	0 %	50 %	50 %	221632183
3588	NC_011959	TGGC	2	8	159011	159018	0 %	25 %	50 %	25 %	221632183
3589	NC_011959	TGGG	2	8	159059	159066	0 %	25 %	75 %	0 %	221632183
3590	NC_011959	TCG	2	6	159090	159095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3591	NC_011959	G	6	6	159175	159180	0 %	0 %	100 %	0 %	221632183
3592	NC_011959	AGC	2	6	159191	159196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3593	NC_011959	CAC	2	6	159262	159267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632183
3594	NC_011959	AGCCG	2	10	159282	159291	20 %	0 %	40 %	40 %	221632183
3595	NC_011959	GCG	2	6	159293	159298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632183
3596	NC_011959	GGCGC	2	10	159357	159366	0 %	0 %	60 %	40 %	221632183
3597	NC_011959	CG	3	6	159451	159456	0 %	0 %	50 %	50 %	221632183
3598	NC_011959	TCG	2	6	159533	159538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3599	NC_011959	CAG	2	6	159553	159558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3600	NC_011959	GTC	2	6	159580	159585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3601	NC_011959	GTTC	2	8	159624	159631	0 %	50 %	25 %	25 %	221632183
3602	NC_011959	TCC	2	6	159653	159658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632183
3603	NC_011959	ATC	2	6	159715	159720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632184
3604	NC_011959	GCA	2	6	159822	159827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3605	NC_011959	CTC	2	6	159873	159878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632184
3606	NC_011959	CCG	3	9	159937	159945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632184
3607	NC_011959	CAG	2	6	159946	159951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3608	NC_011959	GCA	2	6	159971	159976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3609	NC_011959	CGA	2	6	159980	159985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3610	NC_011959	GTG	2	6	160019	160024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632184
3611	NC_011959	CGT	2	6	160025	160030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3612	NC_011959	GAG	2	6	160098	160103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632184
3613	NC_011959	GAG	2	6	160131	160136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632184
3614	NC_011959	CGT	2	6	160137	160142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3615	NC_011959	CGT	2	6	160154	160159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3616	NC_011959	CCG	2	6	160165	160170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632184
3617	NC_011959	ACG	2	6	160219	160224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3618	NC_011959	CCAG	2	8	160297	160304	25 %	0 %	25 %	50 %	221632184
3619	NC_011959	CG	3	6	160406	160411	0 %	0 %	50 %	50 %	221632184
3620	NC_011959	AGG	2	6	160418	160423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632184
3621	NC_011959	CAC	2	6	160438	160443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632184
3622	NC_011959	CCT	2	6	160571	160576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632184
3623	NC_011959	GTG	2	6	160687	160692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632184
3624	NC_011959	GAG	2	6	160716	160721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632184
3625	NC_011959	CCG	2	6	160740	160745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632184
3626	NC_011959	AGCG	2	8	160847	160854	25 %	0 %	50 %	25 %	221632184
3627	NC_011959	CGA	2	6	160940	160945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3628	NC_011959	CG	3	6	161053	161058	0 %	0 %	50 %	50 %	221632185
3629	NC_011959	GGC	2	6	161071	161076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632185
3630	NC_011959	CCA	2	6	161204	161209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632185
3631	NC_011959	CGA	2	6	161243	161248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632185
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3633	NC_011959	GAG	2	6	161313	161318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632185
3634	NC_011959	GGA	2	6	161321	161326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632185
3635	NC_011959	CAGC	2	8	161352	161359	25 %	0 %	25 %	50 %	221632185
3636	NC_011959	TCG	2	6	161461	161466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632185
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3640	NC_011959	CTG	2	6	161538	161543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632185
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3642	NC_011959	TGA	2	6	161777	161782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632185
3643	NC_011959	CCT	2	6	161816	161821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632186
3644	NC_011959	GCAG	2	8	161873	161880	25 %	0 %	50 %	25 %	221632186
3645	NC_011959	GCC	2	6	161896	161901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632186
3646	NC_011959	GAC	2	6	161949	161954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632186
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3648	NC_011959	CGA	3	9	161984	161992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632186
3649	NC_011959	TGGC	2	8	162047	162054	0 %	25 %	50 %	25 %	221632186
3650	NC_011959	GCT	2	6	162066	162071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3651	NC_011959	TCA	2	6	162113	162118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632187
3652	NC_011959	GC	3	6	162137	162142	0 %	0 %	50 %	50 %	221632187
3653	NC_011959	GCA	2	6	162213	162218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632187
3654	NC_011959	CGA	2	6	162220	162225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632187
3655	NC_011959	CCG	2	6	162273	162278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632187
3656	NC_011959	GCT	2	6	162341	162346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632187
3657	NC_011959	GAC	2	6	162368	162373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632187
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3661	NC_011959	GCA	2	6	162620	162625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632187
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3693	NC_011959	CTT	2	6	164367	164372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632188
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3701	NC_011959	GCCC	2	8	164794	164801	0 %	0 %	25 %	75 %	221632189
3702	NC_011959	TTG	2	6	164805	164810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632189
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3717	NC_011959	AGCCG	2	10	165737	165746	20 %	0 %	40 %	40 %	221632191
3718	NC_011959	TCCG	2	8	165753	165760	0 %	25 %	25 %	50 %	221632191
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3723	NC_011959	ATC	2	6	165915	165920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632192
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3726	NC_011959	GCC	3	9	166037	166045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632192
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3730	NC_011959	GGC	2	6	166139	166144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632192
3731	NC_011959	GCT	2	6	166152	166157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632192
3732	NC_011959	AAG	3	9	166158	166166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632192
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3734	NC_011959	TCC	2	6	166248	166253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3735	NC_011959	AAG	2	6	166302	166307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632193
3736	NC_011959	CAC	2	6	166315	166320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632193
3737	NC_011959	TCC	2	6	166344	166349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632193
3738	NC_011959	AGG	2	6	166435	166440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632193
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3740	NC_011959	GTC	2	6	166476	166481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632193
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3869	NC_011959	GTC	2	6	172460	172465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632200
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3986	NC_011959	GAT	2	6	177453	177458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632204
3987	NC_011959	TCC	2	6	177463	177468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632204
3988	NC_011959	TCG	2	6	177508	177513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3989	NC_011959	GTC	2	6	177580	177585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3990	NC_011959	CAC	2	6	177588	177593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632204
3991	NC_011959	TCGC	2	8	177656	177663	0 %	25 %	25 %	50 %	221632204
3992	NC_011959	CGT	2	6	177702	177707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3993	NC_011959	CGA	2	6	177758	177763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3994	NC_011959	AGC	2	6	177786	177791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3995	NC_011959	CG	3	6	178025	178030	0 %	0 %	50 %	50 %	221632205
3996	NC_011959	CCA	2	6	178188	178193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632205
3997	NC_011959	CCGA	2	8	178231	178238	25 %	0 %	25 %	50 %	221632205
3998	NC_011959	GGT	2	6	178245	178250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632205
3999	NC_011959	CG	3	6	178280	178285	0 %	0 %	50 %	50 %	221632205
4000	NC_011959	TGC	2	6	178286	178291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632205

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