MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_011959	CGAT	2	8	1695838	1695845	25 %	25 %	25 %	25 %	221633667
38003	NC_011959	CGC	2	6	1695856	1695861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633667
38004	NC_011959	CGA	2	6	1695866	1695871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633667
38005	NC_011959	CGGT	2	8	1695916	1695923	0 %	25 %	50 %	25 %	221633667
38006	NC_011959	ATC	2	6	1695937	1695942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633667
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38008	NC_011959	GCG	2	6	1696075	1696080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633667
38009	NC_011959	GAG	3	9	1696191	1696199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633667
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38011	NC_011959	TCG	2	6	1696210	1696215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633667
38012	NC_011959	CGC	2	6	1696245	1696250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633667
38013	NC_011959	CG	3	6	1696396	1696401	0 %	0 %	50 %	50 %	221633667
38014	NC_011959	CGA	2	6	1696448	1696453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633667
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38023	NC_011959	TGCA	2	8	1696908	1696915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38024	NC_011959	GGC	2	6	1696921	1696926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38025	NC_011959	CG	3	6	1696997	1697002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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38031	NC_011959	GA	3	6	1697189	1697194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38035	NC_011959	GGGA	2	8	1697340	1697347	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38036	NC_011959	GCC	2	6	1697380	1697385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38042	NC_011959	CCTC	2	8	1697600	1697607	0 %	25 %	0 %	75 %	221633668
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38112	NC_011959	ACG	2	6	1700360	1700365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633670
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38117	NC_011959	GTC	2	6	1700573	1700578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633670
38118	NC_011959	TC	3	6	1700587	1700592	0 %	50 %	0 %	50 %	221633670
38119	NC_011959	TCGG	2	8	1700623	1700630	0 %	25 %	50 %	25 %	221633670
38120	NC_011959	ATCT	2	8	1700696	1700703	25 %	50 %	0 %	25 %	221633670
38121	NC_011959	ACG	2	6	1700707	1700712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633670
38122	NC_011959	TCA	2	6	1700798	1700803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633671
38123	NC_011959	C	6	6	1700854	1700859	0 %	0 %	0 %	100 %	221633671
38124	NC_011959	TCG	2	6	1700903	1700908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633671
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38128	NC_011959	GC	3	6	1701138	1701143	0 %	0 %	50 %	50 %	221633671
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38133	NC_011959	CCCA	2	8	1701358	1701365	25 %	0 %	0 %	75 %	221633671
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38138	NC_011959	CTCG	2	8	1701615	1701622	0 %	25 %	25 %	50 %	221633671
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38142	NC_011959	GTC	2	6	1701766	1701771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633671
38143	NC_011959	GATC	2	8	1701813	1701820	25 %	25 %	25 %	25 %	221633671
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38145	NC_011959	CAG	2	6	1701913	1701918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38146	NC_011959	GAT	2	6	1701930	1701935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633672
38147	NC_011959	GCT	2	6	1701966	1701971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633672
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38149	NC_011959	CGA	3	9	1702079	1702087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633672
38150	NC_011959	CGAT	2	8	1702205	1702212	25 %	25 %	25 %	25 %	221633672
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38152	NC_011959	GTG	2	6	1702352	1702357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633672
38153	NC_011959	TGG	3	9	1702368	1702376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633672
38154	NC_011959	AT	3	6	1702470	1702475	50 %	50 %	0 %	0 %	221633672
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38158	NC_011959	GCA	2	6	1702656	1702661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633673
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38200	NC_011959	TTCG	2	8	1704549	1704556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38201	NC_011959	CCGA	2	8	1704600	1704607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38202	NC_011959	CTCG	2	8	1704609	1704616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38203	NC_011959	CTC	2	6	1704649	1704654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38204	NC_011959	CG	3	6	1704723	1704728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38205	NC_011959	GC	3	6	1704741	1704746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38206	NC_011959	CGG	2	6	1704813	1704818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38207	NC_011959	GCC	2	6	1704865	1704870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38208	NC_011959	GTG	2	6	1704873	1704878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38209	NC_011959	GT	3	6	1704928	1704933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38210	NC_011959	GCA	2	6	1705056	1705061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38211	NC_011959	CG	3	6	1705147	1705152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38212	NC_011959	CGCC	2	8	1705157	1705164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38213	NC_011959	GCACGG	2	12	1705237	1705248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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38215	NC_011959	CGCC	2	8	1705387	1705394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38216	NC_011959	CG	3	6	1705420	1705425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38217	NC_011959	CCGC	2	8	1705426	1705433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38218	NC_011959	GCG	2	6	1705449	1705454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38219	NC_011959	ACCGCG	2	12	1705483	1705494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38220	NC_011959	ACGA	2	8	1705544	1705551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38221	NC_011959	TCG	2	6	1705601	1705606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633676
38222	NC_011959	GAT	2	6	1705614	1705619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633676
38223	NC_011959	GAG	2	6	1705641	1705646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633676
38224	NC_011959	AGC	2	6	1705692	1705697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38225	NC_011959	CGA	2	6	1705760	1705765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38226	NC_011959	CCT	2	6	1705766	1705771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38227	NC_011959	GTC	2	6	1705828	1705833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633677
38228	NC_011959	GCT	2	6	1705891	1705896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633677
38229	NC_011959	TCG	2	6	1705922	1705927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633677
38230	NC_011959	CCG	2	6	1705971	1705976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633677
38231	NC_011959	CGAG	2	8	1705997	1706004	25 %	0 %	50 %	25 %	221633677
38232	NC_011959	TACGG	2	10	1706029	1706038	20 %	20 %	40 %	20 %	221633677
38233	NC_011959	CGC	2	6	1706106	1706111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633677
38234	NC_011959	CGA	2	6	1706214	1706219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633677
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38356	NC_011959	CGG	2	6	1711089	1711094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633682
38357	NC_011959	CGA	2	6	1711140	1711145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633682
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38392	NC_011959	CAC	2	6	1712436	1712441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38471	NC_011959	GGC	2	6	1715444	1715449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633685
38472	NC_011959	TCC	2	6	1715475	1715480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633685
38473	NC_011959	CCG	2	6	1715502	1715507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633685
38474	NC_011959	CAC	2	6	1715578	1715583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633685
38475	NC_011959	TCC	2	6	1715630	1715635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633685
38476	NC_011959	CAC	2	6	1715654	1715659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633685
38477	NC_011959	CGT	2	6	1715678	1715683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633685
38478	NC_011959	AGC	2	6	1715711	1715716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633685
38479	NC_011959	CAGC	2	8	1715801	1715808	25 %	0 %	25 %	50 %	221633685
38480	NC_011959	CTC	2	6	1715810	1715815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633685
38481	NC_011959	TCG	2	6	1715961	1715966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633685
38482	NC_011959	TTG	2	6	1716024	1716029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633685
38483	NC_011959	C	6	6	1716128	1716133	0 %	0 %	0 %	100 %	221633685
38484	NC_011959	CCA	2	6	1716138	1716143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633685
38485	NC_011959	CAC	2	6	1716160	1716165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633685
38486	NC_011959	TCG	2	6	1716240	1716245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633685
38487	NC_011959	AC	3	6	1716302	1716307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38488	NC_011959	CTCG	2	8	1716396	1716403	0 %	25 %	25 %	50 %	221633686
38489	NC_011959	CG	3	6	1716402	1716407	0 %	0 %	50 %	50 %	221633686
38490	NC_011959	CGAC	2	8	1716422	1716429	25 %	0 %	25 %	50 %	221633686
38491	NC_011959	TTC	2	6	1716430	1716435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633686
38492	NC_011959	GCT	2	6	1716548	1716553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633686
38493	NC_011959	CG	3	6	1716571	1716576	0 %	0 %	50 %	50 %	221633686
38494	NC_011959	CTC	2	6	1716607	1716612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633686
38495	NC_011959	GCC	2	6	1716653	1716658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633686
38496	NC_011959	GTC	2	6	1716716	1716721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633686
38497	NC_011959	CGA	2	6	1716783	1716788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633686
38498	NC_011959	CCA	2	6	1716853	1716858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633686
38499	NC_011959	CCGC	2	8	1716909	1716916	0 %	0 %	25 %	75 %	221633686
38500	NC_011959	CCT	2	6	1716933	1716938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633686

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