MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_011959	CTG	2	6	1674049	1674054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37502	NC_011959	AGA	2	6	1674081	1674086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37503	NC_011959	AGG	2	6	1674100	1674105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37504	NC_011959	CGC	2	6	1674116	1674121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37505	NC_011959	CTG	2	6	1674133	1674138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37506	NC_011959	CCT	2	6	1674142	1674147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37507	NC_011959	CG	3	6	1674254	1674259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37508	NC_011959	CG	3	6	1674263	1674268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37509	NC_011959	CGAGG	2	10	1674277	1674286	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37510	NC_011959	AG	3	6	1674287	1674292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37511	NC_011959	GCATTC	2	12	1674303	1674314	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37512	NC_011959	ACC	2	6	1674355	1674360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37513	NC_011959	TACC	2	8	1674401	1674408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37514	NC_011959	GAC	2	6	1674409	1674414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37515	NC_011959	CGT	2	6	1674422	1674427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37516	NC_011959	TACG	2	8	1674467	1674474	25 %	25 %	25 %	25 %	221633648
37517	NC_011959	GCA	2	6	1674496	1674501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633648
37518	NC_011959	TCG	2	6	1674563	1674568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633648
37519	NC_011959	TGG	2	6	1674569	1674574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633648
37520	NC_011959	ACGC	2	8	1674671	1674678	25 %	0 %	25 %	50 %	221633648
37521	NC_011959	TCA	2	6	1674773	1674778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633648
37522	NC_011959	TAT	2	6	1674795	1674800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221633648
37523	NC_011959	CT	3	6	1674839	1674844	0 %	50 %	0 %	50 %	221633648
37524	NC_011959	CAG	2	6	1674866	1674871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633648
37525	NC_011959	ATG	2	6	1674905	1674910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633648
37526	NC_011959	TCG	2	6	1674950	1674955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633648
37527	NC_011959	GCTC	2	8	1674987	1674994	0 %	25 %	25 %	50 %	221633648
37528	NC_011959	GTCC	2	8	1674999	1675006	0 %	25 %	25 %	50 %	221633648
37529	NC_011959	CGC	2	6	1675011	1675016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633648
37530	NC_011959	CG	3	6	1675076	1675081	0 %	0 %	50 %	50 %	221633648
37531	NC_011959	GCG	2	6	1675096	1675101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633648
37532	NC_011959	GCA	2	6	1675122	1675127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633648
37533	NC_011959	TCT	2	6	1675334	1675339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633648
37534	NC_011959	TGC	2	6	1675382	1675387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633648
37535	NC_011959	AGGA	2	8	1675391	1675398	50 %	0 %	50 %	0 %	221633648
37536	NC_011959	ATC	2	6	1675432	1675437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633649
37537	NC_011959	CTA	2	6	1675489	1675494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633649
37538	NC_011959	TCG	2	6	1675497	1675502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37539	NC_011959	TCT	2	6	1675507	1675512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633649
37540	NC_011959	GCT	2	6	1675513	1675518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37541	NC_011959	GC	3	6	1675573	1675578	0 %	0 %	50 %	50 %	221633649
37542	NC_011959	TCC	2	6	1675671	1675676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633649
37543	NC_011959	GTC	2	6	1675697	1675702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37544	NC_011959	CCA	2	6	1675710	1675715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633649
37545	NC_011959	GTC	2	6	1675718	1675723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37546	NC_011959	GCT	2	6	1675729	1675734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37547	NC_011959	ATG	2	6	1675856	1675861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633649
37548	NC_011959	TCGGC	2	10	1675864	1675873	0 %	20 %	40 %	40 %	221633649
37549	NC_011959	CAT	2	6	1676029	1676034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633649
37550	NC_011959	TCG	3	9	1676058	1676066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37551	NC_011959	TGC	2	6	1676121	1676126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633649
37552	NC_011959	CGC	2	6	1676161	1676166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633649
37553	NC_011959	TAC	2	6	1676186	1676191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633649
37554	NC_011959	GAT	2	6	1676200	1676205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633649
37555	NC_011959	CAT	2	6	1676218	1676223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633649
37556	NC_011959	TCCC	2	8	1676225	1676232	0 %	25 %	0 %	75 %	221633649
37557	NC_011959	GAG	3	9	1676314	1676322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37558	NC_011959	GGT	2	6	1676405	1676410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633650
37559	NC_011959	TGC	2	6	1676482	1676487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37560	NC_011959	TAC	2	6	1676488	1676493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633650
37561	NC_011959	GCC	2	6	1676507	1676512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633650
37562	NC_011959	CCGACC	2	12	1676513	1676524	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221633650
37563	NC_011959	CGC	2	6	1676530	1676535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633650
37564	NC_011959	GAC	2	6	1676608	1676613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37565	NC_011959	TCA	2	6	1676619	1676624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633650
37566	NC_011959	AGC	2	6	1676625	1676630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37567	NC_011959	GAG	2	6	1676636	1676641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633650
37568	NC_011959	AGA	2	6	1676649	1676654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633650
37569	NC_011959	CAA	2	6	1676686	1676691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633650
37570	NC_011959	CGC	2	6	1676736	1676741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633650
37571	NC_011959	TTCA	2	8	1676828	1676835	25 %	50 %	0 %	25 %	221633650
37572	NC_011959	TCT	2	6	1676944	1676949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633650
37573	NC_011959	GGCT	2	8	1676956	1676963	0 %	25 %	50 %	25 %	221633650
37574	NC_011959	CAG	2	6	1676996	1677001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37575	NC_011959	ACC	2	6	1677019	1677024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633650
37576	NC_011959	CTA	3	9	1677028	1677036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633650
37577	NC_011959	GCTC	2	8	1677126	1677133	0 %	25 %	25 %	50 %	221633650
37578	NC_011959	TGA	2	6	1677145	1677150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633650
37579	NC_011959	ATGT	2	8	1677188	1677195	25 %	50 %	25 %	0 %	221633650
37580	NC_011959	ATC	2	6	1677206	1677211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633650
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37584	NC_011959	CGA	2	6	1677291	1677296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37585	NC_011959	AGA	2	6	1677339	1677344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633650
37586	NC_011959	GTG	2	6	1677432	1677437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633650
37587	NC_011959	ACGC	2	8	1677441	1677448	25 %	0 %	25 %	50 %	221633650
37588	NC_011959	TCC	2	6	1677450	1677455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633650
37589	NC_011959	TCG	2	6	1677456	1677461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37590	NC_011959	AGC	2	6	1677501	1677506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633650
37591	NC_011959	CTG	2	6	1677526	1677531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633650
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37593	NC_011959	CGGA	2	8	1677604	1677611	25 %	0 %	50 %	25 %	221633650
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37595	NC_011959	ATG	2	6	1677680	1677685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633650
37596	NC_011959	CGC	2	6	1677711	1677716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633650
37597	NC_011959	CAT	2	6	1677840	1677845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37598	NC_011959	GAC	2	6	1677868	1677873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633651
37599	NC_011959	CTGG	2	8	1677914	1677921	0 %	25 %	50 %	25 %	221633651
37600	NC_011959	CG	3	6	1677934	1677939	0 %	0 %	50 %	50 %	221633651
37601	NC_011959	CTC	2	6	1677941	1677946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633651
37602	NC_011959	GTC	2	6	1677977	1677982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633651
37603	NC_011959	CTG	2	6	1678026	1678031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633651
37604	NC_011959	CG	3	6	1678039	1678044	0 %	0 %	50 %	50 %	221633651
37605	NC_011959	TGC	2	6	1678089	1678094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633651
37606	NC_011959	ACGGC	2	10	1678134	1678143	20 %	0 %	40 %	40 %	221633651
37607	NC_011959	ACC	2	6	1678145	1678150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633651
37608	NC_011959	CGC	2	6	1678159	1678164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633651
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37613	NC_011959	CGA	2	6	1678288	1678293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633651
37614	NC_011959	TCT	2	6	1678312	1678317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633651
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37616	NC_011959	GTC	2	6	1678461	1678466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633651
37617	NC_011959	CCAG	2	8	1678491	1678498	25 %	0 %	25 %	50 %	221633651
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37687	NC_011959	GAGAA	2	10	1681381	1681390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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37701	NC_011959	AG	3	6	1682168	1682173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37702	NC_011959	CGG	2	6	1682176	1682181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37703	NC_011959	GCA	2	6	1682198	1682203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633654
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37723	NC_011959	GCGT	2	8	1683322	1683329	0 %	25 %	50 %	25 %	221633655
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37730	NC_011959	GAT	2	6	1683546	1683551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633655
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37732	NC_011959	CACT	2	8	1683586	1683593	25 %	25 %	0 %	50 %	221633655
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