MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_011959	CG	3	6	1652544	1652549	0 %	0 %	50 %	50 %	221633629
37003	NC_011959	CCG	2	6	1652594	1652599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633629
37004	NC_011959	CAGG	2	8	1652675	1652682	25 %	0 %	50 %	25 %	221633629
37005	NC_011959	GCGAC	2	10	1652781	1652790	20 %	0 %	40 %	40 %	221633629
37006	NC_011959	CGC	2	6	1652809	1652814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633629
37007	NC_011959	CAC	2	6	1652830	1652835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633629
37008	NC_011959	GC	3	6	1652856	1652861	0 %	0 %	50 %	50 %	221633629
37009	NC_011959	CGG	2	6	1652970	1652975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633629
37010	NC_011959	CA	3	6	1653001	1653006	50 %	0 %	0 %	50 %	221633629
37011	NC_011959	CGC	2	6	1653045	1653050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633629
37012	NC_011959	CGA	2	6	1653181	1653186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633629
37013	NC_011959	CCAC	2	8	1653299	1653306	25 %	0 %	0 %	75 %	221633629
37014	NC_011959	TGG	2	6	1653323	1653328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633629
37015	NC_011959	TCG	2	6	1653342	1653347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633629
37016	NC_011959	GC	3	6	1653348	1653353	0 %	0 %	50 %	50 %	221633629
37017	NC_011959	CGA	2	6	1653364	1653369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633629
37018	NC_011959	CGA	2	6	1653470	1653475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37019	NC_011959	CGC	2	6	1653476	1653481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37020	NC_011959	TCC	2	6	1653505	1653510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633630
37021	NC_011959	GAG	2	6	1653567	1653572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633630
37022	NC_011959	GCT	2	6	1653615	1653620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633630
37023	NC_011959	CCA	2	6	1653621	1653626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633630
37024	NC_011959	CG	3	6	1653640	1653645	0 %	0 %	50 %	50 %	221633630
37025	NC_011959	CGA	2	6	1653647	1653652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633630
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37028	NC_011959	CGC	2	6	1653749	1653754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633630
37029	NC_011959	ACCGA	2	10	1653762	1653771	40 %	0 %	20 %	40 %	221633630
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37033	NC_011959	GGC	2	6	1653959	1653964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633630
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37037	NC_011959	CGCT	2	8	1654060	1654067	0 %	25 %	25 %	50 %	221633630
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37055	NC_011959	CTGG	2	8	1654698	1654705	0 %	25 %	50 %	25 %	221633630
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37057	NC_011959	CTCG	2	8	1654818	1654825	0 %	25 %	25 %	50 %	221633630
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37086	NC_011959	GCCCAG	2	12	1655912	1655923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221633632
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37099	NC_011959	GC	3	6	1656601	1656606	0 %	0 %	50 %	50 %	221633632
37100	NC_011959	GCC	2	6	1656675	1656680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633632
37101	NC_011959	GTC	2	6	1656683	1656688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633632
37102	NC_011959	GC	3	6	1656701	1656706	0 %	0 %	50 %	50 %	221633632
37103	NC_011959	GTCGC	2	10	1656789	1656798	0 %	20 %	40 %	40 %	221633632
37104	NC_011959	GGTC	2	8	1656799	1656806	0 %	25 %	50 %	25 %	221633632
37105	NC_011959	TCG	2	6	1656908	1656913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633632
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37108	NC_011959	CGA	2	6	1656994	1656999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633632
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37115	NC_011959	CAG	2	6	1657302	1657307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633632
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37117	NC_011959	CG	3	6	1657380	1657385	0 %	0 %	50 %	50 %	221633633
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37232	NC_011959	CTC	2	6	1662305	1662310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633638
37233	NC_011959	CG	3	6	1662335	1662340	0 %	0 %	50 %	50 %	221633638
37234	NC_011959	CGG	2	6	1662357	1662362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633638
37235	NC_011959	GCGA	2	8	1662380	1662387	25 %	0 %	50 %	25 %	221633638
37236	NC_011959	CG	3	6	1662401	1662406	0 %	0 %	50 %	50 %	221633638
37237	NC_011959	CGG	2	6	1662466	1662471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633638
37238	NC_011959	CG	3	6	1662474	1662479	0 %	0 %	50 %	50 %	221633638
37239	NC_011959	CGA	2	6	1662523	1662528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633638
37240	NC_011959	CCG	2	6	1662579	1662584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633638
37241	NC_011959	ATC	2	6	1662617	1662622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633638
37242	NC_011959	G	6	6	1662641	1662646	0 %	0 %	100 %	0 %	221633638
37243	NC_011959	TCC	2	6	1662648	1662653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633638
37244	NC_011959	CCG	2	6	1662667	1662672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633638
37245	NC_011959	CTTC	2	8	1662696	1662703	0 %	50 %	0 %	50 %	221633638
37246	NC_011959	CCG	2	6	1662760	1662765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633638
37247	NC_011959	AGCGG	2	10	1662821	1662830	20 %	0 %	60 %	20 %	221633638
37248	NC_011959	AGC	2	6	1662836	1662841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633638
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37250	NC_011959	GCC	2	6	1662928	1662933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633639
37251	NC_011959	CG	3	6	1663156	1663161	0 %	0 %	50 %	50 %	221633639
37252	NC_011959	CGT	2	6	1663199	1663204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633639
37253	NC_011959	GAC	2	6	1663251	1663256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633639
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37255	NC_011959	GCTT	2	8	1663271	1663278	0 %	50 %	25 %	25 %	221633639
37256	NC_011959	CG	3	6	1663306	1663311	0 %	0 %	50 %	50 %	221633639
37257	NC_011959	TGG	2	6	1663355	1663360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633639
37258	NC_011959	CGG	2	6	1663382	1663387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633639
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37260	NC_011959	TGC	2	6	1663408	1663413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633639
37261	NC_011959	CGAG	2	8	1663513	1663520	25 %	0 %	50 %	25 %	221633639
37262	NC_011959	CGCA	2	8	1663524	1663531	25 %	0 %	25 %	50 %	221633639
37263	NC_011959	TGA	2	6	1663640	1663645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633639
37264	NC_011959	CAC	2	6	1663653	1663658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633639
37265	NC_011959	CGT	2	6	1663672	1663677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37266	NC_011959	GGA	2	6	1663773	1663778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633640
37267	NC_011959	AGT	2	6	1663842	1663847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633640
37268	NC_011959	AGC	2	6	1663904	1663909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633640
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37270	NC_011959	GAA	2	6	1664007	1664012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633640
37271	NC_011959	GAC	2	6	1664168	1664173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633640
37272	NC_011959	AGC	2	6	1664209	1664214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633640
37273	NC_011959	CGC	2	6	1664216	1664221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633640
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37278	NC_011959	TCT	2	6	1664468	1664473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633640
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37280	NC_011959	TGG	2	6	1664575	1664580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633640
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37283	NC_011959	ATG	2	6	1664641	1664646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37284	NC_011959	AG	3	6	1664721	1664726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37285	NC_011959	GAG	2	6	1664786	1664791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633641
37286	NC_011959	AGC	3	9	1664862	1664870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37287	NC_011959	TCG	2	6	1664904	1664909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37288	NC_011959	GCGG	2	8	1664912	1664919	0 %	0 %	75 %	25 %	221633641
37289	NC_011959	GGA	2	6	1664929	1664934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633641
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37292	NC_011959	CAGCGG	2	12	1665055	1665066	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221633641
37293	NC_011959	AAG	2	6	1665129	1665134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633641
37294	NC_011959	CGC	2	6	1665140	1665145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633641
37295	NC_011959	GC	3	6	1665152	1665157	0 %	0 %	50 %	50 %	221633641
37296	NC_011959	ACG	2	6	1665165	1665170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37297	NC_011959	GCCCA	2	10	1665171	1665180	20 %	0 %	20 %	60 %	221633641
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37300	NC_011959	CGA	2	6	1665339	1665344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37301	NC_011959	CAG	2	6	1665350	1665355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37302	NC_011959	TCG	3	9	1665420	1665428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37303	NC_011959	CGC	2	6	1665447	1665452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633641
37304	NC_011959	GCCA	2	8	1665527	1665534	25 %	0 %	25 %	50 %	221633641
37305	NC_011959	CTG	2	6	1665535	1665540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37306	NC_011959	TCCG	2	8	1665559	1665566	0 %	25 %	25 %	50 %	221633641
37307	NC_011959	GAC	2	6	1665587	1665592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37308	NC_011959	GC	3	6	1665664	1665669	0 %	0 %	50 %	50 %	221633641
37309	NC_011959	CGG	2	6	1665679	1665684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633641
37310	NC_011959	GCACG	2	10	1665712	1665721	20 %	0 %	40 %	40 %	221633641
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37312	NC_011959	CAG	2	6	1665783	1665788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633641
37313	NC_011959	TCG	2	6	1665920	1665925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633642
37314	NC_011959	CGA	2	6	1665963	1665968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633642
37315	NC_011959	ATC	2	6	1666069	1666074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633642
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37318	NC_011959	TCA	2	6	1666175	1666180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633642
37319	NC_011959	CG	4	8	1666188	1666195	0 %	0 %	50 %	50 %	221633642
37320	NC_011959	TCA	2	6	1666205	1666210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633642
37321	NC_011959	TC	4	8	1666221	1666228	0 %	50 %	0 %	50 %	221633642
37322	NC_011959	TCG	2	6	1666235	1666240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633642
37323	NC_011959	TC	3	6	1666304	1666309	0 %	50 %	0 %	50 %	221633642
37324	NC_011959	CG	3	6	1666319	1666324	0 %	0 %	50 %	50 %	221633642
37325	NC_011959	TG	3	6	1666342	1666347	0 %	50 %	50 %	0 %	221633642
37326	NC_011959	GGA	2	6	1666500	1666505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633642
37327	NC_011959	GCCCC	2	10	1666526	1666535	0 %	0 %	20 %	80 %	221633642
37328	NC_011959	GAC	2	6	1666556	1666561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633642
37329	NC_011959	ACC	2	6	1666609	1666614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633643
37330	NC_011959	GC	3	6	1666628	1666633	0 %	0 %	50 %	50 %	221633643
37331	NC_011959	CCCG	2	8	1666705	1666712	0 %	0 %	25 %	75 %	221633643
37332	NC_011959	GTC	2	6	1666785	1666790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633643
37333	NC_011959	TGC	2	6	1666817	1666822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633643
37334	NC_011959	TGC	2	6	1666975	1666980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633643
37335	NC_011959	CAG	2	6	1667019	1667024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633643
37336	NC_011959	GGC	2	6	1667037	1667042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633643
37337	NC_011959	GAT	2	6	1667082	1667087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633643
37338	NC_011959	CGAG	2	8	1667148	1667155	25 %	0 %	50 %	25 %	221633643
37339	NC_011959	TTC	2	6	1667178	1667183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633643
37340	NC_011959	GCT	3	9	1667199	1667207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633643
37341	NC_011959	GGC	2	6	1667284	1667289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633643
37342	NC_011959	GCG	2	6	1667319	1667324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633643
37343	NC_011959	CGCT	2	8	1667352	1667359	0 %	25 %	25 %	50 %	221633643
37344	NC_011959	CAA	2	6	1667463	1667468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633643
37345	NC_011959	CCA	2	6	1667495	1667500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633643
37346	NC_011959	CTC	2	6	1667616	1667621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633643
37347	NC_011959	GAG	2	6	1667676	1667681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633643
37348	NC_011959	CCG	2	6	1667692	1667697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633643
37349	NC_011959	CGTC	2	8	1667713	1667720	0 %	25 %	25 %	50 %	221633643
37350	NC_011959	AGCG	2	8	1667757	1667764	25 %	0 %	50 %	25 %	221633643
37351	NC_011959	AGCG	2	8	1667766	1667773	25 %	0 %	50 %	25 %	221633643
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37353	NC_011959	CCCG	2	8	1667894	1667901	0 %	0 %	25 %	75 %	221633643
37354	NC_011959	AACG	2	8	1667912	1667919	50 %	0 %	25 %	25 %	221633643
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37362	NC_011959	CCA	2	6	1668376	1668381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37363	NC_011959	GA	3	6	1668394	1668399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37364	NC_011959	GAG	2	6	1668459	1668464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37367	NC_011959	TGC	2	6	1668570	1668575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633644
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37369	NC_011959	GCTG	2	8	1668652	1668659	0 %	25 %	50 %	25 %	221633644
37370	NC_011959	GTGCG	2	10	1668678	1668687	0 %	20 %	60 %	20 %	221633644
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37373	NC_011959	GCG	2	6	1668763	1668768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633644
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37406	NC_011959	GCA	2	6	1670094	1670099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37407	NC_011959	CAT	2	6	1670118	1670123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37442	NC_011959	CCGTC	2	10	1671784	1671793	0 %	20 %	20 %	60 %	221633645
37443	NC_011959	CCGG	2	8	1671808	1671815	0 %	0 %	50 %	50 %	221633645
37444	NC_011959	CGA	2	6	1671870	1671875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633645
37445	NC_011959	GCTCC	2	10	1671880	1671889	0 %	20 %	20 %	60 %	221633645
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37447	NC_011959	GCGA	2	8	1671963	1671970	25 %	0 %	50 %	25 %	221633646
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37449	NC_011959	TCG	2	6	1672004	1672009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37450	NC_011959	TCG	2	6	1672052	1672057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37451	NC_011959	GA	3	6	1672067	1672072	50 %	0 %	50 %	0 %	221633646
37452	NC_011959	CG	3	6	1672089	1672094	0 %	0 %	50 %	50 %	221633646
37453	NC_011959	ATC	2	6	1672138	1672143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633646
37454	NC_011959	TGG	2	6	1672161	1672166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633646
37455	NC_011959	GGT	2	6	1672177	1672182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633646
37456	NC_011959	ACG	2	6	1672320	1672325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37457	NC_011959	TTC	2	6	1672360	1672365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633646
37458	NC_011959	CTC	2	6	1672399	1672404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633646
37459	NC_011959	GCA	2	6	1672488	1672493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37460	NC_011959	ATC	2	6	1672495	1672500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633646
37461	NC_011959	TCG	2	6	1672508	1672513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37462	NC_011959	CGA	2	6	1672667	1672672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37463	NC_011959	CGG	2	6	1672707	1672712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633646
37464	NC_011959	TCG	2	6	1672721	1672726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37465	NC_011959	GAC	2	6	1672728	1672733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633646
37466	NC_011959	CTT	2	6	1672758	1672763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633646
37467	NC_011959	GCG	2	6	1672779	1672784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633646
37468	NC_011959	TCA	3	9	1672835	1672843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633646
37469	NC_011959	GA	3	6	1672891	1672896	50 %	0 %	50 %	0 %	221633646
37470	NC_011959	GA	3	6	1672901	1672906	50 %	0 %	50 %	0 %	221633646
37471	NC_011959	CGC	2	6	1672920	1672925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633647
37472	NC_011959	CGC	2	6	1672957	1672962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633647
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37474	NC_011959	TCG	2	6	1673024	1673029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633647
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37476	NC_011959	CGA	2	6	1673060	1673065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633647
37477	NC_011959	GCG	2	6	1673068	1673073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633647
37478	NC_011959	CGA	2	6	1673115	1673120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633647
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37481	NC_011959	CGG	2	6	1673187	1673192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633647
37482	NC_011959	ATC	2	6	1673206	1673211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633647
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37484	NC_011959	ATC	2	6	1673284	1673289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633647
37485	NC_011959	GTC	2	6	1673308	1673313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633647
37486	NC_011959	TGC	2	6	1673409	1673414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633647
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37488	NC_011959	CG	3	6	1673455	1673460	0 %	0 %	50 %	50 %	221633647
37489	NC_011959	AGCC	2	8	1673466	1673473	25 %	0 %	25 %	50 %	221633647
37490	NC_011959	CTC	2	6	1673532	1673537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633647
37491	NC_011959	TCG	2	6	1673561	1673566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633647
37492	NC_011959	ACC	2	6	1673601	1673606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633647
37493	NC_011959	CCCT	2	8	1673611	1673618	0 %	25 %	0 %	75 %	221633647
37494	NC_011959	TGC	2	6	1673637	1673642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633647
37495	NC_011959	ACT	2	6	1673744	1673749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633647
37496	NC_011959	GCT	2	6	1673802	1673807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37497	NC_011959	CGC	2	6	1673845	1673850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37498	NC_011959	GACCA	2	10	1673910	1673919	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37499	NC_011959	CG	3	6	1673955	1673960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37500	NC_011959	ACC	2	6	1674000	1674005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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