MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_011959	CAG	2	6	1612688	1612693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633593
36003	NC_011959	CTT	2	6	1612717	1612722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633593
36004	NC_011959	GAA	2	6	1612796	1612801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633593
36005	NC_011959	CGA	2	6	1612819	1612824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633593
36006	NC_011959	ATG	2	6	1612827	1612832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633593
36007	NC_011959	TTCC	2	8	1612868	1612875	0 %	50 %	0 %	50 %	221633593
36008	NC_011959	ATC	2	6	1612917	1612922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633593
36009	NC_011959	TGA	2	6	1612969	1612974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633593
36010	NC_011959	TCGG	2	8	1612980	1612987	0 %	25 %	50 %	25 %	221633593
36011	NC_011959	GAT	2	6	1613024	1613029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633593
36012	NC_011959	TCG	2	6	1613038	1613043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633593
36013	NC_011959	GGTTCG	2	12	1613163	1613174	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221633593
36014	NC_011959	GCT	2	6	1613240	1613245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36015	NC_011959	GC	3	6	1613251	1613256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36016	NC_011959	ACAG	2	8	1613278	1613285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36017	NC_011959	ACG	2	6	1613294	1613299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36018	NC_011959	TTGC	2	8	1613338	1613345	0 %	50 %	25 %	25 %	221633594
36019	NC_011959	CTC	2	6	1613353	1613358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633594
36020	NC_011959	CACG	2	8	1613376	1613383	25 %	0 %	25 %	50 %	221633594
36021	NC_011959	CTT	2	6	1613430	1613435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633594
36022	NC_011959	CGA	2	6	1613454	1613459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633594
36023	NC_011959	CTCG	2	8	1613512	1613519	0 %	25 %	25 %	50 %	221633594
36024	NC_011959	GCT	2	6	1613532	1613537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633594
36025	NC_011959	ACG	2	6	1613543	1613548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633594
36026	NC_011959	CGA	3	9	1613569	1613577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633594
36027	NC_011959	ACC	2	6	1613585	1613590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36028	NC_011959	GTA	2	6	1613636	1613641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36029	NC_011959	ATC	2	6	1613690	1613695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36030	NC_011959	CTC	2	6	1613700	1613705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36031	NC_011959	GCCC	2	8	1613831	1613838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36032	NC_011959	CTG	2	6	1613876	1613881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36033	NC_011959	CGGTC	2	10	1613930	1613939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36034	NC_011959	GCA	2	6	1614014	1614019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36035	NC_011959	TGC	2	6	1614042	1614047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36036	NC_011959	CGG	2	6	1614100	1614105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36037	NC_011959	AGC	2	6	1614144	1614149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633595
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36039	NC_011959	GGA	2	6	1614284	1614289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633595
36040	NC_011959	CGG	2	6	1614303	1614308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633595
36041	NC_011959	TGC	2	6	1614333	1614338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633595
36042	NC_011959	ATC	2	6	1614346	1614351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633595
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36044	NC_011959	GCG	2	6	1614405	1614410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633595
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36046	NC_011959	TCG	2	6	1614567	1614572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633595
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36048	NC_011959	CTG	2	6	1614711	1614716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633596
36049	NC_011959	GTC	2	6	1614742	1614747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633596
36050	NC_011959	TGC	2	6	1614775	1614780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633596
36051	NC_011959	GAT	2	6	1614822	1614827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633596
36052	NC_011959	GCG	2	6	1614917	1614922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633596
36053	NC_011959	GAC	2	6	1614924	1614929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633596
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36055	NC_011959	GCCG	2	8	1615104	1615111	0 %	0 %	50 %	50 %	221633596
36056	NC_011959	ACCG	2	8	1615257	1615264	25 %	0 %	25 %	50 %	221633596
36057	NC_011959	CAC	2	6	1615271	1615276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633596
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36059	NC_011959	TGGA	2	8	1615363	1615370	25 %	25 %	50 %	0 %	221633596
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36062	NC_011959	CTG	2	6	1615500	1615505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633596
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36066	NC_011959	CTCG	2	8	1615629	1615636	0 %	25 %	25 %	50 %	221633596
36067	NC_011959	GC	3	6	1615681	1615686	0 %	0 %	50 %	50 %	221633596
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36089	NC_011959	GCC	2	6	1616655	1616660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633597
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36118	NC_011959	AAC	2	6	1617788	1617793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633598
36119	NC_011959	GAC	2	6	1617833	1617838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633599
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36123	NC_011959	GAT	2	6	1618073	1618078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633599
36124	NC_011959	CGGC	2	8	1618104	1618111	0 %	0 %	50 %	50 %	221633599
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36157	NC_011959	GCG	2	6	1619761	1619766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36158	NC_011959	TTCC	2	8	1619824	1619831	0 %	50 %	0 %	50 %	221633602
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36206	NC_011959	CG	4	8	1621655	1621662	0 %	0 %	50 %	50 %	221633604
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36217	NC_011959	GGCC	2	8	1622485	1622492	0 %	0 %	50 %	50 %	221633604
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36221	NC_011959	GTC	2	6	1622549	1622554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633604
36222	NC_011959	CGAG	2	8	1622596	1622603	25 %	0 %	50 %	25 %	221633604
36223	NC_011959	CGG	2	6	1622745	1622750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633604
36224	NC_011959	CTG	2	6	1622762	1622767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633604
36225	NC_011959	CTG	2	6	1622837	1622842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633604
36226	NC_011959	GCA	3	9	1622887	1622895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633604
36227	NC_011959	TGGAAC	2	12	1622919	1622930	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221633604
36228	NC_011959	CGA	2	6	1622951	1622956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633604
36229	NC_011959	CG	3	6	1622957	1622962	0 %	0 %	50 %	50 %	221633604
36230	NC_011959	TTC	2	6	1623050	1623055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633604
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36232	NC_011959	CCA	2	6	1623120	1623125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633604
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36336	NC_011959	ACG	2	6	1627600	1627605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36337	NC_011959	GCCGG	2	10	1627713	1627722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36338	NC_011959	G	6	6	1627755	1627760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36339	NC_011959	CCG	2	6	1627768	1627773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36340	NC_011959	TG	3	6	1627775	1627780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36341	NC_011959	GAC	2	6	1627806	1627811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36342	NC_011959	CGCC	2	8	1627838	1627845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36343	NC_011959	GCG	2	6	1627886	1627891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36344	NC_011959	CGAC	2	8	1627899	1627906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36345	NC_011959	GGT	3	9	1627921	1627929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36347	NC_011959	GGC	2	6	1627958	1627963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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36349	NC_011959	CGC	2	6	1628071	1628076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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36466	NC_011959	CGG	2	6	1632887	1632892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36467	NC_011959	CGACAG	2	12	1632937	1632948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633614
36468	NC_011959	CG	3	6	1632988	1632993	0 %	0 %	50 %	50 %	221633614
36469	NC_011959	GC	3	6	1633017	1633022	0 %	0 %	50 %	50 %	221633614
36470	NC_011959	CTA	2	6	1633140	1633145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633614
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36485	NC_011959	GCTG	2	8	1633481	1633488	0 %	25 %	50 %	25 %	221633614
36486	NC_011959	CG	3	6	1633492	1633497	0 %	0 %	50 %	50 %	221633614
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36491	NC_011959	GGCT	2	8	1633831	1633838	0 %	25 %	50 %	25 %	221633614
36492	NC_011959	CG	4	8	1633869	1633876	0 %	0 %	50 %	50 %	221633614
36493	NC_011959	CGG	2	6	1633883	1633888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633614
36494	NC_011959	TGA	2	6	1633919	1633924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633614
36495	NC_011959	GGGA	2	8	1633949	1633956	25 %	0 %	75 %	0 %	221633614
36496	NC_011959	AGCG	2	8	1634000	1634007	25 %	0 %	50 %	25 %	221633615
36497	NC_011959	GCCGGT	2	12	1634033	1634044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221633615
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36499	NC_011959	AGC	2	6	1634140	1634145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633615
36500	NC_011959	GAG	2	6	1634151	1634156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633615

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