MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_011959	CAA	2	6	1574774	1574779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633563
35003	NC_011959	GAT	2	6	1574816	1574821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633563
35004	NC_011959	GAC	3	9	1574835	1574843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35005	NC_011959	ATG	2	6	1574851	1574856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633563
35006	NC_011959	CGC	2	6	1574891	1574896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633563
35007	NC_011959	ATC	2	6	1574913	1574918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633563
35008	NC_011959	GAC	2	6	1574951	1574956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35009	NC_011959	CG	3	6	1575001	1575006	0 %	0 %	50 %	50 %	221633563
35010	NC_011959	CAA	2	6	1575041	1575046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633563
35011	NC_011959	TCC	2	6	1575051	1575056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633563
35012	NC_011959	GAC	2	6	1575074	1575079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35013	NC_011959	TCG	2	6	1575106	1575111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35014	NC_011959	TCCC	2	8	1575176	1575183	0 %	25 %	0 %	75 %	221633563
35015	NC_011959	GTC	2	6	1575195	1575200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35016	NC_011959	GC	3	6	1575208	1575213	0 %	0 %	50 %	50 %	221633563
35017	NC_011959	CGGG	2	8	1575214	1575221	0 %	0 %	75 %	25 %	221633563
35018	NC_011959	CAA	2	6	1575227	1575232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633563
35019	NC_011959	ACA	2	6	1575268	1575273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633563
35020	NC_011959	CCT	2	6	1575301	1575306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633563
35021	NC_011959	GCCT	2	8	1575372	1575379	0 %	25 %	25 %	50 %	221633563
35022	NC_011959	AGC	2	6	1575382	1575387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35023	NC_011959	CGC	3	9	1575422	1575430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633563
35024	NC_011959	CG	3	6	1575462	1575467	0 %	0 %	50 %	50 %	221633563
35025	NC_011959	GCT	2	6	1575490	1575495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633563
35026	NC_011959	CTCC	2	8	1575498	1575505	0 %	25 %	0 %	75 %	221633563
35027	NC_011959	CGG	2	6	1575514	1575519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35028	NC_011959	TCC	2	6	1575527	1575532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35029	NC_011959	GCCCC	2	10	1575537	1575546	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
35030	NC_011959	CTC	2	6	1575548	1575553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35031	NC_011959	CAC	2	6	1575563	1575568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35032	NC_011959	GC	3	6	1575603	1575608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35033	NC_011959	GCC	2	6	1575645	1575650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35034	NC_011959	CGA	2	6	1575652	1575657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35035	NC_011959	CGCC	2	8	1575680	1575687	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35036	NC_011959	CGA	2	6	1575706	1575711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35037	NC_011959	CGC	2	6	1575791	1575796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35038	NC_011959	C	6	6	1575809	1575814	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35039	NC_011959	GCGTG	2	10	1575826	1575835	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35040	NC_011959	ACCCGG	2	12	1575840	1575851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35041	NC_011959	GCC	2	6	1575918	1575923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35042	NC_011959	GCC	2	6	1575925	1575930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35043	NC_011959	CACG	2	8	1575956	1575963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35044	NC_011959	GTGCG	2	10	1576019	1576028	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35045	NC_011959	GA	3	6	1576058	1576063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35046	NC_011959	CGG	2	6	1576128	1576133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35047	NC_011959	CAG	2	6	1576156	1576161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35048	NC_011959	ACC	2	6	1576168	1576173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35049	NC_011959	GGA	2	6	1576186	1576191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35050	NC_011959	CCGGG	2	10	1576212	1576221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35051	NC_011959	AGC	2	6	1576262	1576267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35052	NC_011959	AGC	2	6	1576270	1576275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35053	NC_011959	C	6	6	1576283	1576288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35054	NC_011959	CCG	2	6	1576297	1576302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35055	NC_011959	CCG	2	6	1576362	1576367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35056	NC_011959	GCC	2	6	1576382	1576387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35057	NC_011959	CTG	2	6	1576407	1576412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35058	NC_011959	AACG	2	8	1576413	1576420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35059	NC_011959	GCT	2	6	1576486	1576491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
35060	NC_011959	CGT	2	6	1576520	1576525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
35061	NC_011959	CGT	2	6	1576567	1576572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
35062	NC_011959	GACGGT	2	12	1576583	1576594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633564
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35064	NC_011959	CCGT	2	8	1576617	1576624	0 %	25 %	25 %	50 %	221633564
35065	NC_011959	CGT	2	6	1576664	1576669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
35066	NC_011959	TCG	2	6	1576719	1576724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
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35068	NC_011959	GCA	2	6	1576747	1576752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633564
35069	NC_011959	GC	3	6	1576759	1576764	0 %	0 %	50 %	50 %	221633564
35070	NC_011959	CAC	2	6	1576772	1576777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633564
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35072	NC_011959	GC	3	6	1576872	1576877	0 %	0 %	50 %	50 %	221633564
35073	NC_011959	TGT	2	6	1576882	1576887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633564
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35085	NC_011959	GTC	2	6	1577376	1577381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
35086	NC_011959	GTA	2	6	1577459	1577464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633564
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35088	NC_011959	CGC	2	6	1577660	1577665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633564
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35090	NC_011959	TGA	2	6	1577767	1577772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633564
35091	NC_011959	TGC	2	6	1577839	1577844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633564
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35102	NC_011959	CGA	2	6	1578404	1578409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633564
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35107	NC_011959	CGA	2	6	1578735	1578740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35109	NC_011959	CGGC	2	8	1578765	1578772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35110	NC_011959	CGC	2	6	1578773	1578778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35111	NC_011959	TCG	2	6	1578791	1578796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35112	NC_011959	GGC	2	6	1578807	1578812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35113	NC_011959	GCC	2	6	1578830	1578835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35114	NC_011959	CGG	2	6	1578840	1578845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35115	NC_011959	TC	3	6	1578850	1578855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35116	NC_011959	GC	3	6	1578865	1578870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35117	NC_011959	CCT	2	6	1578872	1578877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35118	NC_011959	TTCCC	2	10	1578890	1578899	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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35120	NC_011959	CCGG	2	8	1578952	1578959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35121	NC_011959	GCCC	2	8	1579018	1579025	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35122	NC_011959	GC	3	6	1579228	1579233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35123	NC_011959	CGGC	2	8	1579312	1579319	0 %	0 %	50 %	50 %	221633565
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35240	NC_011959	GTC	2	6	1583226	1583231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633569
35241	NC_011959	CGG	2	6	1583254	1583259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633569
35242	NC_011959	GC	3	6	1583283	1583288	0 %	0 %	50 %	50 %	221633569
35243	NC_011959	TGC	2	6	1583302	1583307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633569
35244	NC_011959	CG	3	6	1583320	1583325	0 %	0 %	50 %	50 %	221633569
35245	NC_011959	TCG	2	6	1583326	1583331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633569
35246	NC_011959	GGCC	2	8	1583387	1583394	0 %	0 %	50 %	50 %	221633569
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35299	NC_011959	CGC	2	6	1585005	1585010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633570
35300	NC_011959	GCG	2	6	1585036	1585041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633570
35301	NC_011959	CGA	2	6	1585042	1585047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633570
35302	NC_011959	GC	5	10	1585064	1585073	0 %	0 %	50 %	50 %	221633570
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35304	NC_011959	CG	3	6	1585169	1585174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35305	NC_011959	AGG	2	6	1585230	1585235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35318	NC_011959	GAC	2	6	1585582	1585587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633571
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35323	NC_011959	CGCT	2	8	1585710	1585717	0 %	25 %	25 %	50 %	221633572
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35329	NC_011959	GC	3	6	1585889	1585894	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
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35332	NC_011959	GC	3	6	1585935	1585940	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
35333	NC_011959	GAG	2	6	1585944	1585949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633572
35334	NC_011959	G	6	6	1585989	1585994	0 %	0 %	100 %	0 %	221633572
35335	NC_011959	GGC	2	6	1586021	1586026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633572
35336	NC_011959	CTCG	2	8	1586027	1586034	0 %	25 %	25 %	50 %	221633572
35337	NC_011959	CGC	2	6	1586111	1586116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633572
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35339	NC_011959	GC	3	6	1586223	1586228	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
35340	NC_011959	GAG	2	6	1586232	1586237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633572
35341	NC_011959	CGC	2	6	1586267	1586272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633572
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35343	NC_011959	GCC	2	6	1586292	1586297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633572
35344	NC_011959	CAT	2	6	1586325	1586330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633572
35345	NC_011959	GCC	2	6	1586340	1586345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633572
35346	NC_011959	CG	4	8	1586354	1586361	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
35347	NC_011959	CAG	2	6	1586364	1586369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633572
35348	NC_011959	CG	3	6	1586448	1586453	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
35349	NC_011959	TGC	2	6	1586494	1586499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633572
35350	NC_011959	GC	3	6	1586511	1586516	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
35351	NC_011959	CG	3	6	1586519	1586524	0 %	0 %	50 %	50 %	221633572
35352	NC_011959	GTC	2	6	1586526	1586531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633572
35353	NC_011959	GTGC	2	8	1586535	1586542	0 %	25 %	50 %	25 %	221633572
35354	NC_011959	GGA	2	6	1586555	1586560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633572
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35356	NC_011959	CGC	2	6	1586573	1586578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633572
35357	NC_011959	CTC	2	6	1586613	1586618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633572
35358	NC_011959	GCT	2	6	1586630	1586635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633572
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35466	NC_011959	GT	3	6	1591018	1591023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35467	NC_011959	CGA	2	6	1591069	1591074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633575
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35471	NC_011959	AGCCCG	2	12	1591149	1591160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221633575
35472	NC_011959	GCC	2	6	1591163	1591168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633575
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