MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_011959	GGC	2	6	1556422	1556427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633548
34503	NC_011959	GA	3	6	1556475	1556480	50 %	0 %	50 %	0 %	221633548
34504	NC_011959	CTC	2	6	1556501	1556506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633548
34505	NC_011959	GAG	2	6	1556543	1556548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633548
34506	NC_011959	CGC	2	6	1556627	1556632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633548
34507	NC_011959	GAC	2	6	1556644	1556649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633548
34508	NC_011959	TCA	2	6	1556712	1556717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633548
34509	NC_011959	GTC	2	6	1556786	1556791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633548
34510	NC_011959	GC	3	6	1556813	1556818	0 %	0 %	50 %	50 %	221633548
34511	NC_011959	GCC	2	6	1556860	1556865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633548
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34513	NC_011959	TGGG	2	8	1557024	1557031	0 %	25 %	75 %	0 %	221633548
34514	NC_011959	CAT	2	6	1557040	1557045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633548
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34517	NC_011959	CG	3	6	1557187	1557192	0 %	0 %	50 %	50 %	221633548
34518	NC_011959	CGAC	2	8	1557231	1557238	25 %	0 %	25 %	50 %	221633548
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34532	NC_011959	GC	3	6	1557829	1557834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34533	NC_011959	CGAC	2	8	1557874	1557881	25 %	0 %	25 %	50 %	221633549
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34536	NC_011959	CG	3	6	1558000	1558005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34537	NC_011959	GAGC	2	8	1558094	1558101	25 %	0 %	50 %	25 %	221633550
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34556	NC_011959	CG	3	6	1558972	1558977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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34603	NC_011959	GC	3	6	1561459	1561464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34604	NC_011959	CGATG	2	10	1561486	1561495	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34605	NC_011959	CTC	2	6	1561582	1561587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633553
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34608	NC_011959	CG	4	8	1561696	1561703	0 %	0 %	50 %	50 %	221633553
34609	NC_011959	CGC	2	6	1561707	1561712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633553
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34621	NC_011959	CTG	2	6	1562185	1562190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633553
34622	NC_011959	GGCGA	2	10	1562209	1562218	20 %	0 %	60 %	20 %	221633553
34623	NC_011959	CCA	2	6	1562230	1562235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633553
34624	NC_011959	CAGC	2	8	1562313	1562320	25 %	0 %	25 %	50 %	221633554
34625	NC_011959	TCC	2	6	1562328	1562333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633554
34626	NC_011959	CTC	2	6	1562348	1562353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633554
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34628	NC_011959	GCT	2	6	1562378	1562383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633554
34629	NC_011959	CTC	2	6	1562423	1562428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633554
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34632	NC_011959	GTC	2	6	1562582	1562587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633554
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34634	NC_011959	CATC	2	8	1562614	1562621	25 %	25 %	0 %	50 %	221633554
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34641	NC_011959	CG	3	6	1562755	1562760	0 %	0 %	50 %	50 %	221633554
34642	NC_011959	CG	3	6	1562790	1562795	0 %	0 %	50 %	50 %	221633554
34643	NC_011959	AGC	2	6	1562832	1562837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633554
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34657	NC_011959	GCGA	2	8	1563669	1563676	25 %	0 %	50 %	25 %	221633555
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34723	NC_011959	CGA	2	6	1566081	1566086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633557
34724	NC_011959	CGA	2	6	1566096	1566101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633557
34725	NC_011959	CCG	2	6	1566130	1566135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633557
34726	NC_011959	GC	3	6	1566160	1566165	0 %	0 %	50 %	50 %	221633557
34727	NC_011959	GCT	2	6	1566171	1566176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633557
34728	NC_011959	CGA	2	6	1566194	1566199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633557
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34730	NC_011959	GTC	2	6	1566242	1566247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633557
34731	NC_011959	CGC	2	6	1566262	1566267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633557
34732	NC_011959	CCA	2	6	1566285	1566290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633557
34733	NC_011959	GCC	2	6	1566383	1566388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633557
34734	NC_011959	GGAAG	2	10	1566405	1566414	40 %	0 %	60 %	0 %	221633557
34735	NC_011959	TCG	2	6	1566431	1566436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633557
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34979	NC_011959	GAAGG	2	10	1574123	1574132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34980	NC_011959	ACG	2	6	1574162	1574167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
34981	NC_011959	TGGCGC	2	12	1574169	1574180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221633563
34982	NC_011959	CGT	2	6	1574189	1574194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633563
34983	NC_011959	CTG	2	6	1574229	1574234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633563
34984	NC_011959	CAG	2	6	1574253	1574258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
34985	NC_011959	ACC	2	6	1574316	1574321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633563
34986	NC_011959	GGC	2	6	1574324	1574329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633563
34987	NC_011959	CCA	2	6	1574333	1574338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633563
34988	NC_011959	CTC	2	6	1574355	1574360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633563
34989	NC_011959	TCGACG	2	12	1574377	1574388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633563
34990	NC_011959	GAGC	2	8	1574408	1574415	25 %	0 %	50 %	25 %	221633563
34991	NC_011959	CGC	2	6	1574426	1574431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633563
34992	NC_011959	CGG	2	6	1574446	1574451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633563
34993	NC_011959	CCG	2	6	1574496	1574501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633563
34994	NC_011959	CAG	2	6	1574529	1574534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633563
34995	NC_011959	TCG	2	6	1574602	1574607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633563
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34998	NC_011959	GGCC	2	8	1574651	1574658	0 %	0 %	50 %	50 %	221633563
34999	NC_011959	TCC	2	6	1574662	1574667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633563
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