MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_011959	TCG	2	6	1470543	1470548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633465
32503	NC_011959	GCCGG	2	10	1470581	1470590	0 %	0 %	60 %	40 %	221633465
32504	NC_011959	TCG	2	6	1470645	1470650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633465
32505	NC_011959	CGCCT	2	10	1470671	1470680	0 %	20 %	20 %	60 %	221633465
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32507	NC_011959	GCT	2	6	1470861	1470866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633465
32508	NC_011959	CCT	2	6	1470901	1470906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633465
32509	NC_011959	CGA	2	6	1470934	1470939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633465
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32512	NC_011959	GCT	2	6	1471006	1471011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633465
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32517	NC_011959	CGA	2	6	1471174	1471179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633466
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32519	NC_011959	CCG	2	6	1471225	1471230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633466
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32546	NC_011959	CAG	2	6	1472396	1472401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32559	NC_011959	GAG	2	6	1473079	1473084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633468
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32584	NC_011959	TGGC	2	8	1473900	1473907	0 %	25 %	50 %	25 %	221633468
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32602	NC_011959	CG	3	6	1474918	1474923	0 %	0 %	50 %	50 %	221633470
32603	NC_011959	CCTA	2	8	1474976	1474983	25 %	25 %	0 %	50 %	221633470
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32723	NC_011959	GCG	2	6	1479960	1479965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32735	NC_011959	CGA	2	6	1480361	1480366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633476
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32760	NC_011959	CA	3	6	1481394	1481399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32761	NC_011959	G	6	6	1481463	1481468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32762	NC_011959	CAG	2	6	1481483	1481488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32764	NC_011959	AGG	2	6	1481534	1481539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32770	NC_011959	GACACC	2	12	1481847	1481858	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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32844	NC_011959	CTG	2	6	1485175	1485180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633482
32845	NC_011959	GCA	2	6	1485197	1485202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633482
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32849	NC_011959	TCC	2	6	1485485	1485490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633482
32850	NC_011959	TGC	2	6	1485491	1485496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633482
32851	NC_011959	TGC	2	6	1485503	1485508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633482
32852	NC_011959	ACG	2	6	1485557	1485562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32853	NC_011959	CGG	2	6	1485571	1485576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32854	NC_011959	GCTGG	2	10	1485578	1485587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32855	NC_011959	GA	3	6	1485595	1485600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32856	NC_011959	AGC	2	6	1485676	1485681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633483
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32858	NC_011959	CGA	2	6	1485728	1485733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633483
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32861	NC_011959	TCG	2	6	1485838	1485843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633483
32862	NC_011959	CTC	2	6	1485885	1485890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633483
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32864	NC_011959	CAC	2	6	1485919	1485924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633483
32865	NC_011959	CTG	2	6	1485954	1485959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633483
32866	NC_011959	GGCT	2	8	1486038	1486045	0 %	25 %	50 %	25 %	221633483
32867	NC_011959	CGGG	2	8	1486069	1486076	0 %	0 %	75 %	25 %	221633483
32868	NC_011959	CTG	2	6	1486137	1486142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633483
32869	NC_011959	CGA	4	12	1486183	1486194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633483
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32874	NC_011959	TCGG	2	8	1486794	1486801	0 %	25 %	50 %	25 %	221633484
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32877	NC_011959	TGC	2	6	1486968	1486973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633484
32878	NC_011959	TCG	2	6	1486992	1486997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633484
32879	NC_011959	CG	3	6	1486996	1487001	0 %	0 %	50 %	50 %	221633484
32880	NC_011959	GAT	2	6	1487030	1487035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633484
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32883	NC_011959	GT	3	6	1487101	1487106	0 %	50 %	50 %	0 %	221633484
32884	NC_011959	CGA	2	6	1487128	1487133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633484
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32892	NC_011959	CGAT	2	8	1487532	1487539	25 %	25 %	25 %	25 %	221633485
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32919	NC_011959	CGA	2	6	1488608	1488613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633486
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32933	NC_011959	CGC	2	6	1489084	1489089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633486
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32939	NC_011959	TCCCC	2	10	1489326	1489335	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
32940	NC_011959	TTC	2	6	1489459	1489464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633487
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32952	NC_011959	CTG	2	6	1489809	1489814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633487
32953	NC_011959	TCC	2	6	1489835	1489840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633487
32954	NC_011959	G	6	6	1490011	1490016	0 %	0 %	100 %	0 %	221633487
32955	NC_011959	TCG	2	6	1490042	1490047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633487
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32959	NC_011959	CGGT	2	8	1490218	1490225	0 %	25 %	50 %	25 %	221633487
32960	NC_011959	CGC	2	6	1490258	1490263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633487
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32963	NC_011959	CCG	2	6	1490308	1490313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633488
32964	NC_011959	GC	3	6	1490316	1490321	0 %	0 %	50 %	50 %	221633488
32965	NC_011959	AG	3	6	1490332	1490337	50 %	0 %	50 %	0 %	221633488
32966	NC_011959	GGC	2	6	1490409	1490414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633488
32967	NC_011959	CTC	2	6	1490491	1490496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633488
32968	NC_011959	CCTC	2	8	1490519	1490526	0 %	25 %	0 %	75 %	221633488
32969	NC_011959	TCC	2	6	1490574	1490579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633488
32970	NC_011959	GCC	2	6	1490596	1490601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633488
32971	NC_011959	GCC	2	6	1490632	1490637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633488
32972	NC_011959	CCGA	2	8	1490642	1490649	25 %	0 %	25 %	50 %	221633488
32973	NC_011959	CCGG	2	8	1490847	1490854	0 %	0 %	50 %	50 %	221633488
32974	NC_011959	AGC	2	6	1490859	1490864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633488
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32976	NC_011959	CCGG	2	8	1490872	1490879	0 %	0 %	50 %	50 %	221633488
32977	NC_011959	CGA	2	6	1490911	1490916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633488
32978	NC_011959	AGG	2	6	1491012	1491017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633488
32979	NC_011959	ACCGCG	2	12	1491054	1491065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221633488
32980	NC_011959	GTT	2	6	1491136	1491141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633488
32981	NC_011959	GA	3	6	1491207	1491212	50 %	0 %	50 %	0 %	221633488
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32983	NC_011959	CGGTC	2	10	1491264	1491273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32984	NC_011959	CAG	2	6	1491274	1491279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32985	NC_011959	CT	3	6	1491295	1491300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32986	NC_011959	CG	3	6	1491386	1491391	0 %	0 %	50 %	50 %	221633489
32987	NC_011959	GCGTG	2	10	1491402	1491411	0 %	20 %	60 %	20 %	221633489
32988	NC_011959	GCG	2	6	1491425	1491430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633489
32989	NC_011959	CGG	2	6	1491453	1491458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633489
32990	NC_011959	TCGA	2	8	1491459	1491466	25 %	25 %	25 %	25 %	221633489
32991	NC_011959	TGA	2	6	1491478	1491483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633489
32992	NC_011959	GAGC	2	8	1491506	1491513	25 %	0 %	50 %	25 %	221633489
32993	NC_011959	GCCA	2	8	1491600	1491607	25 %	0 %	25 %	50 %	221633489
32994	NC_011959	GGC	2	6	1491615	1491620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633489
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32996	NC_011959	GGT	2	6	1491715	1491720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633489
32997	NC_011959	TCC	2	6	1491775	1491780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633489
32998	NC_011959	CCTCGA	2	12	1491794	1491805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221633489
32999	NC_011959	CGC	2	6	1491827	1491832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633489
33000	NC_011959	GAG	2	6	1491858	1491863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633489

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