MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_011959	CGC	2	6	1427549	1427554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633414
31502	NC_011959	GATCT	2	10	1427598	1427607	20 %	40 %	20 %	20 %	221633414
31503	NC_011959	TC	3	6	1427660	1427665	0 %	50 %	0 %	50 %	221633414
31504	NC_011959	TCCG	2	8	1427749	1427756	0 %	25 %	25 %	50 %	221633414
31505	NC_011959	CGA	3	9	1427759	1427767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633414
31506	NC_011959	CGT	2	6	1427768	1427773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
31507	NC_011959	GCT	2	6	1427857	1427862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
31508	NC_011959	CTCG	2	8	1427863	1427870	0 %	25 %	25 %	50 %	221633414
31509	NC_011959	ACA	2	6	1427875	1427880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633414
31510	NC_011959	CGG	2	6	1427939	1427944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633414
31511	NC_011959	CG	4	8	1427984	1427991	0 %	0 %	50 %	50 %	221633414
31512	NC_011959	TCGA	2	8	1428027	1428034	25 %	25 %	25 %	25 %	221633414
31513	NC_011959	GAT	2	6	1428059	1428064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633414
31514	NC_011959	TCG	2	6	1428079	1428084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
31515	NC_011959	CCG	2	6	1428097	1428102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633414
31516	NC_011959	CGA	2	6	1428158	1428163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633414
31517	NC_011959	CTG	2	6	1428228	1428233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
31518	NC_011959	CG	3	6	1428296	1428301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31519	NC_011959	GGCGGG	2	12	1428302	1428313	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31520	NC_011959	ACC	3	9	1428366	1428374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633415
31521	NC_011959	CGC	2	6	1428386	1428391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633415
31522	NC_011959	AGC	2	6	1428456	1428461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633415
31523	NC_011959	GCTC	2	8	1428509	1428516	0 %	25 %	25 %	50 %	221633415
31524	NC_011959	CGT	3	9	1428533	1428541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633415
31525	NC_011959	GCCC	2	8	1428694	1428701	0 %	0 %	25 %	75 %	221633415
31526	NC_011959	TTG	2	6	1428711	1428716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633415
31527	NC_011959	TGG	2	6	1428730	1428735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633415
31528	NC_011959	ACG	2	6	1428804	1428809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633415
31529	NC_011959	GCG	2	6	1428824	1428829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633415
31530	NC_011959	CGC	2	6	1428838	1428843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633415
31531	NC_011959	GGT	2	6	1428902	1428907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633415
31532	NC_011959	AGG	2	6	1428910	1428915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633415
31533	NC_011959	GCG	2	6	1428917	1428922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633415
31534	NC_011959	CGT	2	6	1429018	1429023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633415
31535	NC_011959	CG	3	6	1429026	1429031	0 %	0 %	50 %	50 %	221633415
31536	NC_011959	CGT	2	6	1429198	1429203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31537	NC_011959	GGA	2	6	1429205	1429210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633416
31538	NC_011959	CGA	2	6	1429250	1429255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31539	NC_011959	CCG	2	6	1429270	1429275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633416
31540	NC_011959	AACC	2	8	1429310	1429317	50 %	0 %	0 %	50 %	221633416
31541	NC_011959	GC	3	6	1429380	1429385	0 %	0 %	50 %	50 %	221633416
31542	NC_011959	TCGA	2	8	1429440	1429447	25 %	25 %	25 %	25 %	221633416
31543	NC_011959	TCG	2	6	1429498	1429503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31544	NC_011959	CGA	2	6	1429589	1429594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31545	NC_011959	GGC	2	6	1429600	1429605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633416
31546	NC_011959	CTTCG	2	10	1429632	1429641	0 %	40 %	20 %	40 %	221633416
31547	NC_011959	GAC	2	6	1429644	1429649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31548	NC_011959	ACG	2	6	1429710	1429715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31549	NC_011959	CGA	2	6	1429718	1429723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31550	NC_011959	TCC	2	6	1429735	1429740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633416
31551	NC_011959	GTC	2	6	1429767	1429772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31552	NC_011959	GAC	2	6	1429861	1429866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31553	NC_011959	TGC	2	6	1429877	1429882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31554	NC_011959	GAGC	2	8	1429908	1429915	25 %	0 %	50 %	25 %	221633416
31555	NC_011959	GAA	2	6	1429929	1429934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633416
31556	NC_011959	GTC	2	6	1429950	1429955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31557	NC_011959	GCT	2	6	1430058	1430063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31558	NC_011959	CG	3	6	1430064	1430069	0 %	0 %	50 %	50 %	221633416
31559	NC_011959	CAC	2	6	1430126	1430131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633416
31560	NC_011959	TGGC	2	8	1430140	1430147	0 %	25 %	50 %	25 %	221633416
31561	NC_011959	CG	3	6	1430196	1430201	0 %	0 %	50 %	50 %	221633416
31562	NC_011959	GGAA	2	8	1430462	1430469	50 %	0 %	50 %	0 %	221633416
31563	NC_011959	CGT	2	6	1430507	1430512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31564	NC_011959	CGG	2	6	1430525	1430530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633416
31565	NC_011959	CGC	2	6	1430537	1430542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633416
31566	NC_011959	GCG	2	6	1430554	1430559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633416
31567	NC_011959	CACG	2	8	1430560	1430567	25 %	0 %	25 %	50 %	221633416
31568	NC_011959	GCA	2	6	1430579	1430584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31569	NC_011959	ACG	2	6	1430638	1430643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
31570	NC_011959	ATC	2	6	1430646	1430651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633416
31571	NC_011959	CACG	2	8	1430699	1430706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31572	NC_011959	GTC	2	6	1430720	1430725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31573	NC_011959	GAC	2	6	1430734	1430739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31574	NC_011959	CG	3	6	1430982	1430987	0 %	0 %	50 %	50 %	221633417
31575	NC_011959	GCCAGC	2	12	1430991	1431002	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221633417
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31577	NC_011959	GAC	2	6	1431094	1431099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31578	NC_011959	ACG	2	6	1431121	1431126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31579	NC_011959	GCCG	2	8	1431127	1431134	0 %	0 %	50 %	50 %	221633417
31580	NC_011959	CCAG	2	8	1431195	1431202	25 %	0 %	25 %	50 %	221633417
31581	NC_011959	CGC	2	6	1431203	1431208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633417
31582	NC_011959	TCG	3	9	1431209	1431217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31583	NC_011959	CTCG	2	8	1431280	1431287	0 %	25 %	25 %	50 %	221633417
31584	NC_011959	GAC	2	6	1431289	1431294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31585	NC_011959	TCGG	2	8	1431317	1431324	0 %	25 %	50 %	25 %	221633417
31586	NC_011959	GAA	2	6	1431433	1431438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633417
31587	NC_011959	CTG	3	9	1431484	1431492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31588	NC_011959	GTG	2	6	1431495	1431500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633417
31589	NC_011959	ACC	2	6	1431516	1431521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633417
31590	NC_011959	ACG	2	6	1431545	1431550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31591	NC_011959	TCG	2	6	1431584	1431589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31592	NC_011959	GAC	2	6	1431604	1431609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31593	NC_011959	CGGA	2	8	1431707	1431714	25 %	0 %	50 %	25 %	221633417
31594	NC_011959	GTC	2	6	1431836	1431841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633417
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31596	NC_011959	CCCGG	2	10	1431883	1431892	0 %	0 %	40 %	60 %	221633417
31597	NC_011959	AGC	2	6	1431942	1431947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31598	NC_011959	CCT	2	6	1431974	1431979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633417
31599	NC_011959	CAG	2	6	1432027	1432032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31600	NC_011959	GCA	2	6	1432047	1432052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31601	NC_011959	C	6	6	1432055	1432060	0 %	0 %	0 %	100 %	221633417
31602	NC_011959	ACC	2	6	1432074	1432079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633417
31603	NC_011959	CGG	2	6	1432089	1432094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633417
31604	NC_011959	CACTC	2	10	1432095	1432104	20 %	20 %	0 %	60 %	221633417
31605	NC_011959	TCG	2	6	1432160	1432165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633417
31606	NC_011959	CCCCGT	2	12	1432170	1432181	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221633417
31607	NC_011959	GCG	2	6	1432206	1432211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633417
31608	NC_011959	C	6	6	1432284	1432289	0 %	0 %	0 %	100 %	221633417
31609	NC_011959	GCG	2	6	1432328	1432333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633417
31610	NC_011959	GTCG	2	8	1432441	1432448	0 %	25 %	50 %	25 %	221633417
31611	NC_011959	GAG	2	6	1432468	1432473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633417
31612	NC_011959	GAG	2	6	1432489	1432494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633417
31613	NC_011959	GC	3	6	1432581	1432586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31614	NC_011959	C	6	6	1432612	1432617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31615	NC_011959	TAGCC	2	10	1432618	1432627	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31616	NC_011959	GGA	2	6	1432719	1432724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31617	NC_011959	GC	3	6	1432774	1432779	0 %	0 %	50 %	50 %	221633418
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31840	NC_011959	GGA	2	6	1442130	1442135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31842	NC_011959	CTGC	2	8	1442277	1442284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31843	NC_011959	CTTGC	2	10	1442296	1442305	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31844	NC_011959	AGTC	2	8	1442396	1442403	25 %	25 %	25 %	25 %	221633431
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31849	NC_011959	TGC	2	6	1442549	1442554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633431
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31969	NC_011959	CCG	2	6	1447306	1447311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633437
31970	NC_011959	CGG	2	6	1447325	1447330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633437
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31975	NC_011959	GTC	2	6	1447512	1447517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633437
31976	NC_011959	CG	3	6	1447519	1447524	0 %	0 %	50 %	50 %	221633437
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31998	NC_011959	CTC	2	6	1448613	1448618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633438
31999	NC_011959	GCCA	2	8	1448619	1448626	25 %	0 %	25 %	50 %	221633438
32000	NC_011959	CGA	2	6	1448666	1448671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633438

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