MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_011959	CCTCGA	2	12	1382582	1382593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221633373
30503	NC_011959	GTTC	2	8	1382611	1382618	0 %	50 %	25 %	25 %	221633373
30504	NC_011959	GCC	2	6	1382633	1382638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633373
30505	NC_011959	TGC	2	6	1382683	1382688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633373
30506	NC_011959	CGAC	2	8	1382708	1382715	25 %	0 %	25 %	50 %	221633373
30507	NC_011959	CGC	2	6	1382724	1382729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633373
30508	NC_011959	CTC	2	6	1382739	1382744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633373
30509	NC_011959	ATG	2	6	1382776	1382781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633373
30510	NC_011959	CGG	2	6	1382784	1382789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633373
30511	NC_011959	ATG	2	6	1382806	1382811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633373
30512	NC_011959	CGTGAA	2	12	1382862	1382873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221633373
30513	NC_011959	TCG	2	6	1382875	1382880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633373
30514	NC_011959	CCG	2	6	1382903	1382908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633373
30515	NC_011959	ACG	2	6	1382953	1382958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633373
30516	NC_011959	CGC	2	6	1382996	1383001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633373
30517	NC_011959	TTGTCC	2	12	1383019	1383030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	221633373
30518	NC_011959	CGG	2	6	1383051	1383056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633373
30519	NC_011959	ACG	2	6	1383058	1383063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633373
30520	NC_011959	GATC	2	8	1383089	1383096	25 %	25 %	25 %	25 %	221633373
30521	NC_011959	GCA	2	6	1383116	1383121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633373
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30523	NC_011959	TCG	2	6	1383215	1383220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633373
30524	NC_011959	GATC	2	8	1383263	1383270	25 %	25 %	25 %	25 %	221633373
30525	NC_011959	TCC	2	6	1383393	1383398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633373
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30527	NC_011959	GCA	2	6	1383432	1383437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633373
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30530	NC_011959	GA	3	6	1383495	1383500	50 %	0 %	50 %	0 %	221633373
30531	NC_011959	CGC	2	6	1383506	1383511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633373
30532	NC_011959	TCG	2	6	1383528	1383533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633373
30533	NC_011959	CTG	2	6	1383596	1383601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633374
30534	NC_011959	TTC	2	6	1383617	1383622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633374
30535	NC_011959	GCT	2	6	1383628	1383633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633374
30536	NC_011959	CGAC	2	8	1383634	1383641	25 %	0 %	25 %	50 %	221633374
30537	NC_011959	CGA	2	6	1383682	1383687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633374
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30540	NC_011959	CGT	2	6	1383854	1383859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633374
30541	NC_011959	CCCA	2	8	1383865	1383872	25 %	0 %	0 %	75 %	221633374
30542	NC_011959	CG	3	6	1383902	1383907	0 %	0 %	50 %	50 %	221633374
30543	NC_011959	GAG	2	6	1383908	1383913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633374
30544	NC_011959	TCGAG	2	10	1383919	1383928	20 %	20 %	40 %	20 %	221633374
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30547	NC_011959	GCG	2	6	1384093	1384098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633374
30548	NC_011959	TGC	2	6	1384118	1384123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633374
30549	NC_011959	AGCA	2	8	1384187	1384194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30550	NC_011959	GCTC	2	8	1384232	1384239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30551	NC_011959	TGACG	2	10	1384285	1384294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30552	NC_011959	GTG	2	6	1384323	1384328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30553	NC_011959	GAG	2	6	1384401	1384406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633375
30554	NC_011959	CGC	2	6	1384493	1384498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633375
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30558	NC_011959	TCG	2	6	1384816	1384821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633375
30559	NC_011959	CGAT	2	8	1384828	1384835	25 %	25 %	25 %	25 %	221633375
30560	NC_011959	CGT	2	6	1384877	1384882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633375
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30564	NC_011959	CAAG	2	8	1384919	1384926	50 %	0 %	25 %	25 %	221633375
30565	NC_011959	TCG	2	6	1384960	1384965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633375
30566	NC_011959	GC	3	6	1384986	1384991	0 %	0 %	50 %	50 %	221633375
30567	NC_011959	TCT	2	6	1385026	1385031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633375
30568	NC_011959	CG	4	8	1385068	1385075	0 %	0 %	50 %	50 %	221633375
30569	NC_011959	ATC	2	6	1385107	1385112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633375
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30574	NC_011959	CGAGC	2	10	1385429	1385438	20 %	0 %	40 %	40 %	221633375
30575	NC_011959	TGGG	2	8	1385440	1385447	0 %	25 %	75 %	0 %	221633375
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30584	NC_011959	CTC	2	6	1386022	1386027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633376
30585	NC_011959	CGT	2	6	1386036	1386041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633376
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30589	NC_011959	GCC	2	6	1386178	1386183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633376
30590	NC_011959	GCTTGG	2	12	1386204	1386215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221633376
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30597	NC_011959	GCACG	2	10	1386678	1386687	20 %	0 %	40 %	40 %	221633376
30598	NC_011959	GTG	2	6	1386787	1386792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633376
30599	NC_011959	CGA	2	6	1386848	1386853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633376
30600	NC_011959	TGG	2	6	1386922	1386927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30601	NC_011959	CGA	2	6	1386960	1386965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633377
30602	NC_011959	GA	3	6	1386987	1386992	50 %	0 %	50 %	0 %	221633377
30603	NC_011959	GAG	3	9	1387011	1387019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633377
30604	NC_011959	GGAGC	2	10	1387026	1387035	20 %	0 %	60 %	20 %	221633377
30605	NC_011959	GCA	2	6	1387099	1387104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633377
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30607	NC_011959	CTGC	2	8	1387121	1387128	0 %	25 %	25 %	50 %	221633377
30608	NC_011959	GTG	4	12	1387130	1387141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633377
30609	NC_011959	ACC	2	6	1387156	1387161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633377
30610	NC_011959	GCA	2	6	1387183	1387188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633377
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30612	NC_011959	TCGA	2	8	1387366	1387373	25 %	25 %	25 %	25 %	221633377
30613	NC_011959	AAG	2	6	1387409	1387414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633377
30614	NC_011959	ACG	2	6	1387415	1387420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633377
30615	NC_011959	AGC	2	6	1387454	1387459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633377
30616	NC_011959	TCA	2	6	1387484	1387489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633377
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30714	NC_011959	TC	3	6	1392060	1392065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30715	NC_011959	CGA	2	6	1392071	1392076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30732	NC_011959	CTG	2	6	1392770	1392775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633382
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