MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_011959	CGG	2	6	1360613	1360618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633351
30003	NC_011959	TGG	2	6	1360669	1360674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633351
30004	NC_011959	GC	3	6	1360692	1360697	0 %	0 %	50 %	50 %	221633351
30005	NC_011959	CTC	2	6	1360749	1360754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633351
30006	NC_011959	AGCC	2	8	1360786	1360793	25 %	0 %	25 %	50 %	221633351
30007	NC_011959	TCG	2	6	1360804	1360809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633351
30008	NC_011959	GAG	2	6	1360944	1360949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633351
30009	NC_011959	GCC	2	6	1361376	1361381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633351
30010	NC_011959	CCG	2	6	1361409	1361414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633351
30011	NC_011959	ACG	2	6	1361473	1361478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633351
30012	NC_011959	ATC	2	6	1361502	1361507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633351
30013	NC_011959	TCT	2	6	1361551	1361556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633351
30014	NC_011959	CCG	2	6	1361601	1361606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633351
30015	NC_011959	CCGC	2	8	1361697	1361704	0 %	0 %	25 %	75 %	221633351
30016	NC_011959	GGA	2	6	1361712	1361717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633351
30017	NC_011959	TGA	2	6	1361743	1361748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633351
30018	NC_011959	CCG	2	6	1361821	1361826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30019	NC_011959	GCT	2	6	1361842	1361847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30020	NC_011959	CG	3	6	1361874	1361879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30021	NC_011959	CAT	2	6	1361913	1361918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30022	NC_011959	CCCG	2	8	1361921	1361928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30023	NC_011959	ACGA	2	8	1361949	1361956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30024	NC_011959	ACCG	2	8	1361960	1361967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30025	NC_011959	CGC	2	6	1361968	1361973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30026	NC_011959	CACC	2	8	1361986	1361993	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30027	NC_011959	CA	3	6	1362006	1362011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30028	NC_011959	CGT	2	6	1362023	1362028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
30029	NC_011959	TGG	2	6	1362030	1362035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633352
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30032	NC_011959	CGCT	2	8	1362189	1362196	0 %	25 %	25 %	50 %	221633352
30033	NC_011959	CCG	3	9	1362209	1362217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633352
30034	NC_011959	GCCG	2	8	1362240	1362247	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
30035	NC_011959	CGT	2	6	1362269	1362274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
30036	NC_011959	GCGAC	2	10	1362332	1362341	20 %	0 %	40 %	40 %	221633352
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30038	NC_011959	CG	3	6	1362411	1362416	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
30039	NC_011959	CCG	2	6	1362452	1362457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633352
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30041	NC_011959	TGCCG	2	10	1362566	1362575	0 %	20 %	40 %	40 %	221633352
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30043	NC_011959	GCG	2	6	1362656	1362661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633352
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30045	NC_011959	GCA	2	6	1362744	1362749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633352
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30050	NC_011959	CG	3	6	1362857	1362862	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
30051	NC_011959	AGG	2	6	1362931	1362936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633352
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30053	NC_011959	TGC	2	6	1362962	1362967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
30054	NC_011959	CG	4	8	1363005	1363012	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
30055	NC_011959	GAT	2	6	1363013	1363018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633352
30056	NC_011959	TC	3	6	1363031	1363036	0 %	50 %	0 %	50 %	221633352
30057	NC_011959	TCG	2	6	1363048	1363053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
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30062	NC_011959	CGGGA	2	10	1363139	1363148	20 %	0 %	60 %	20 %	221633352
30063	NC_011959	GC	3	6	1363307	1363312	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
30064	NC_011959	TCG	2	6	1363348	1363353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
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30089	NC_011959	GC	3	6	1364304	1364309	0 %	0 %	50 %	50 %	221633353
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30102	NC_011959	TTG	2	6	1364996	1365001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633354
30103	NC_011959	CG	3	6	1365021	1365026	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
30104	NC_011959	CG	3	6	1365040	1365045	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
30105	NC_011959	CCG	2	6	1365054	1365059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633354
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30118	NC_011959	GGCC	2	8	1365514	1365521	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
30119	NC_011959	ACGC	2	8	1365565	1365572	25 %	0 %	25 %	50 %	221633354
30120	NC_011959	TCG	2	6	1365603	1365608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633354
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30122	NC_011959	CG	3	6	1365685	1365690	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
30123	NC_011959	ACA	2	6	1365708	1365713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633354
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30125	NC_011959	GC	3	6	1365762	1365767	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
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30131	NC_011959	ATCG	2	8	1366040	1366047	25 %	25 %	25 %	25 %	221633354
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30133	NC_011959	TCG	2	6	1366094	1366099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633354
30134	NC_011959	CT	3	6	1366100	1366105	0 %	50 %	0 %	50 %	221633354
30135	NC_011959	CGA	2	6	1366117	1366122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
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30141	NC_011959	GATC	2	8	1366363	1366370	25 %	25 %	25 %	25 %	221633354
30142	NC_011959	CCA	2	6	1366413	1366418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633354
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30144	NC_011959	TCG	2	6	1366488	1366493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633354
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30146	NC_011959	GAG	2	6	1366565	1366570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633354
30147	NC_011959	CGA	2	6	1366627	1366632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
30148	NC_011959	TCC	2	6	1366695	1366700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633354
30149	NC_011959	CG	3	6	1366714	1366719	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
30150	NC_011959	GAGC	2	8	1366787	1366794	25 %	0 %	50 %	25 %	221633354
30151	NC_011959	CGA	2	6	1366827	1366832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
30152	NC_011959	TCG	2	6	1366845	1366850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633354
30153	NC_011959	CGA	2	6	1366868	1366873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
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30165	NC_011959	GGA	2	6	1367386	1367391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633355
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30184	NC_011959	CCGC	2	8	1368249	1368256	0 %	0 %	25 %	75 %	221633356
30185	NC_011959	GC	3	6	1368269	1368274	0 %	0 %	50 %	50 %	221633356
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30199	NC_011959	ATCG	2	8	1369066	1369073	25 %	25 %	25 %	25 %	221633357
30200	NC_011959	GAT	2	6	1369075	1369080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633357
30201	NC_011959	CG	3	6	1369107	1369112	0 %	0 %	50 %	50 %	221633357
30202	NC_011959	CGA	2	6	1369137	1369142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633357
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30204	NC_011959	C	6	6	1369210	1369215	0 %	0 %	0 %	100 %	221633357
30205	NC_011959	CGCC	2	8	1369234	1369241	0 %	0 %	25 %	75 %	221633357
30206	NC_011959	GC	4	8	1369259	1369266	0 %	0 %	50 %	50 %	221633357
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30210	NC_011959	TG	3	6	1369447	1369452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30211	NC_011959	GAG	2	6	1369505	1369510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30212	NC_011959	TGG	3	9	1369562	1369570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633358
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30217	NC_011959	CGC	2	6	1369801	1369806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633358
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30220	NC_011959	GA	3	6	1370088	1370093	50 %	0 %	50 %	0 %	221633359
30221	NC_011959	GAC	3	9	1370150	1370158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633359
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30224	NC_011959	CGA	2	6	1370245	1370250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633359
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30227	NC_011959	CTG	2	6	1370439	1370444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633360
30228	NC_011959	CCT	2	6	1370465	1370470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633360
30229	NC_011959	TTCGCC	2	12	1370612	1370623	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30230	NC_011959	TCC	2	6	1370624	1370629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30231	NC_011959	CCG	2	6	1370819	1370824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30232	NC_011959	CGC	2	6	1370843	1370848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30233	NC_011959	GC	3	6	1370852	1370857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30234	NC_011959	CAC	2	6	1370900	1370905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30235	NC_011959	ACC	2	6	1370911	1370916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30236	NC_011959	CACG	2	8	1370935	1370942	25 %	0 %	25 %	50 %	221633361
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30469	NC_011959	GC	3	6	1381451	1381456	0 %	0 %	50 %	50 %	221633372
30470	NC_011959	GCG	2	6	1381459	1381464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633372
30471	NC_011959	TCC	2	6	1381496	1381501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633372
30472	NC_011959	CCGA	2	8	1381522	1381529	25 %	0 %	25 %	50 %	221633372
30473	NC_011959	CG	3	6	1381545	1381550	0 %	0 %	50 %	50 %	221633372
30474	NC_011959	GCA	2	6	1381685	1381690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30475	NC_011959	GGTG	2	8	1381759	1381766	0 %	25 %	75 %	0 %	221633372
30476	NC_011959	GCACCC	2	12	1381775	1381786	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221633372
30477	NC_011959	CTCC	2	8	1381818	1381825	0 %	25 %	0 %	75 %	221633372
30478	NC_011959	GCC	2	6	1381832	1381837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633372
30479	NC_011959	GTT	2	6	1381864	1381869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633372
30480	NC_011959	CGG	2	6	1381953	1381958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633372
30481	NC_011959	CGA	2	6	1381962	1381967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30482	NC_011959	TGC	2	6	1382002	1382007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30483	NC_011959	CAT	2	6	1382044	1382049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633372
30484	NC_011959	TGC	2	6	1382096	1382101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30485	NC_011959	GAC	2	6	1382140	1382145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633372
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30487	NC_011959	AG	3	6	1382205	1382210	50 %	0 %	50 %	0 %	221633372
30488	NC_011959	CGC	2	6	1382239	1382244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633372
30489	NC_011959	TTC	2	6	1382245	1382250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633372
30490	NC_011959	TCG	2	6	1382268	1382273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30491	NC_011959	GTCC	2	8	1382307	1382314	0 %	25 %	25 %	50 %	221633372
30492	NC_011959	TCG	2	6	1382348	1382353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30493	NC_011959	GCATG	2	10	1382400	1382409	20 %	20 %	40 %	20 %	221633372
30494	NC_011959	CGT	2	6	1382425	1382430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633372
30495	NC_011959	CG	3	6	1382439	1382444	0 %	0 %	50 %	50 %	221633372
30496	NC_011959	GCC	2	6	1382464	1382469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633373
30497	NC_011959	CCT	2	6	1382471	1382476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633373
30498	NC_011959	AAC	2	6	1382503	1382508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633373
30499	NC_011959	CACC	2	8	1382510	1382517	25 %	0 %	0 %	75 %	221633373
30500	NC_011959	ATG	2	6	1382536	1382541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633373

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