MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_011959	CGC	2	6	1336738	1336743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633324
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29504	NC_011959	CAG	2	6	1336799	1336804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29505	NC_011959	CGT	2	6	1336809	1336814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29506	NC_011959	CG	3	6	1336877	1336882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29507	NC_011959	GCT	2	6	1336972	1336977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633325
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29511	NC_011959	CGCT	2	8	1337221	1337228	0 %	25 %	25 %	50 %	221633325
29512	NC_011959	GTA	2	6	1337246	1337251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633325
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29517	NC_011959	GCA	2	6	1337353	1337358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633325
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29526	NC_011959	CGA	2	6	1338037	1338042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29615	NC_011959	TCG	4	12	1342365	1342376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633329
29616	NC_011959	GC	3	6	1342396	1342401	0 %	0 %	50 %	50 %	221633329
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29735	NC_011959	TCC	2	6	1347868	1347873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633335
29736	NC_011959	GCT	3	9	1347953	1347961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633335
29737	NC_011959	TCA	2	6	1348005	1348010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633335
29738	NC_011959	CCA	2	6	1348101	1348106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633335
29739	NC_011959	CGAT	2	8	1348160	1348167	25 %	25 %	25 %	25 %	221633335
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29741	NC_011959	TCGGA	2	10	1348356	1348365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29742	NC_011959	TC	3	6	1348414	1348419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29743	NC_011959	GC	3	6	1348428	1348433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29744	NC_011959	CAG	2	6	1348505	1348510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633336
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29747	NC_011959	GC	3	6	1348627	1348632	0 %	0 %	50 %	50 %	221633337
29748	NC_011959	CTG	2	6	1348671	1348676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633337
29749	NC_011959	GA	3	6	1348771	1348776	50 %	0 %	50 %	0 %	221633337
29750	NC_011959	CTCG	2	8	1348783	1348790	0 %	25 %	25 %	50 %	221633337
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29753	NC_011959	CGC	2	6	1348891	1348896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29754	NC_011959	TCC	2	6	1349100	1349105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29755	NC_011959	TCG	2	6	1349108	1349113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29756	NC_011959	CG	4	8	1349124	1349131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29757	NC_011959	CAGC	2	8	1349139	1349146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29758	NC_011959	GA	3	6	1349149	1349154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29759	NC_011959	GCC	2	6	1349293	1349298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29761	NC_011959	CGT	2	6	1349501	1349506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29762	NC_011959	AG	3	6	1349569	1349574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29763	NC_011959	GC	4	8	1349679	1349686	0 %	0 %	50 %	50 %	221633338
29764	NC_011959	GCG	2	6	1349707	1349712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633338
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29766	NC_011959	CTG	2	6	1349895	1349900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633338
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29772	NC_011959	GAG	2	6	1350302	1350307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633339
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29800	NC_011959	TCC	2	6	1351301	1351306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29801	NC_011959	TGC	2	6	1351434	1351439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633341
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29804	NC_011959	GAT	2	6	1351503	1351508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633341
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29834	NC_011959	CTG	2	6	1352865	1352870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633344
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29840	NC_011959	GCA	2	6	1353219	1353224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633344
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29842	NC_011959	GGAT	2	8	1353273	1353280	25 %	25 %	50 %	0 %	221633344
29843	NC_011959	CGC	2	6	1353324	1353329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633344
29844	NC_011959	TCG	2	6	1353337	1353342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633344
29845	NC_011959	GCG	2	6	1353427	1353432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633344
29846	NC_011959	CTC	2	6	1353507	1353512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633344
29847	NC_011959	CG	4	8	1353523	1353530	0 %	0 %	50 %	50 %	221633344
29848	NC_011959	CTG	2	6	1353650	1353655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633345
29849	NC_011959	G	6	6	1353729	1353734	0 %	0 %	100 %	0 %	221633345
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29851	NC_011959	TGC	2	6	1353837	1353842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633345
29852	NC_011959	GCA	2	6	1353900	1353905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
29853	NC_011959	CGG	2	6	1353925	1353930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633345
29854	NC_011959	CGA	2	6	1354129	1354134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
29855	NC_011959	GAG	2	6	1354202	1354207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633345
29856	NC_011959	CGA	2	6	1354282	1354287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
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29858	NC_011959	GAT	2	6	1354466	1354471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633345
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29860	NC_011959	CGA	3	9	1354543	1354551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
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29863	NC_011959	CGG	2	6	1354673	1354678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633345
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29868	NC_011959	CG	3	6	1354780	1354785	0 %	0 %	50 %	50 %	221633345
29869	NC_011959	CGA	2	6	1354792	1354797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
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29883	NC_011959	CCAT	2	8	1355406	1355413	25 %	25 %	0 %	50 %	221633346
29884	NC_011959	CAC	2	6	1355438	1355443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633346
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29894	NC_011959	GCC	2	6	1355799	1355804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633348
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29898	NC_011959	CGA	3	9	1355888	1355896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633348
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29900	NC_011959	CCA	2	6	1355972	1355977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633348
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29904	NC_011959	GCTA	2	8	1356174	1356181	25 %	25 %	25 %	25 %	221633348
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29912	NC_011959	CGA	2	6	1356311	1356316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633348
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29915	NC_011959	CCGC	2	8	1356416	1356423	0 %	0 %	25 %	75 %	221633348
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29919	NC_011959	CG	3	6	1356671	1356676	0 %	0 %	50 %	50 %	221633348
29920	NC_011959	TCC	2	6	1356679	1356684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633348
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29933	NC_011959	GGA	2	6	1357134	1357139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633348
29934	NC_011959	CGT	2	6	1357182	1357187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633348
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29949	NC_011959	CT	3	6	1357564	1357569	0 %	50 %	0 %	50 %	221633348
29950	NC_011959	CAGC	2	8	1357595	1357602	25 %	0 %	25 %	50 %	221633348
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29952	NC_011959	CGGT	2	8	1357628	1357635	0 %	25 %	50 %	25 %	221633348
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29954	NC_011959	CGCC	2	8	1357670	1357677	0 %	0 %	25 %	75 %	221633348
29955	NC_011959	GCTC	2	8	1357694	1357701	0 %	25 %	25 %	50 %	221633348
29956	NC_011959	GTCCA	2	10	1357771	1357780	20 %	20 %	20 %	40 %	221633348
29957	NC_011959	GCT	2	6	1357781	1357786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633348
29958	NC_011959	GCAC	2	8	1357795	1357802	25 %	0 %	25 %	50 %	221633348
29959	NC_011959	GC	3	6	1357875	1357880	0 %	0 %	50 %	50 %	221633348
29960	NC_011959	CGAG	2	8	1357984	1357991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29961	NC_011959	ATC	2	6	1357993	1357998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29962	NC_011959	GGC	2	6	1358030	1358035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29963	NC_011959	CGA	2	6	1358055	1358060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29964	NC_011959	CGA	2	6	1358173	1358178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633349
29965	NC_011959	TCG	2	6	1358185	1358190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633349
29966	NC_011959	TGC	2	6	1358195	1358200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633349
29967	NC_011959	CA	3	6	1358295	1358300	50 %	0 %	0 %	50 %	221633349
29968	NC_011959	GAT	2	6	1358329	1358334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633349
29969	NC_011959	CGGT	2	8	1358538	1358545	0 %	25 %	50 %	25 %	221633349
29970	NC_011959	GCTC	2	8	1358608	1358615	0 %	25 %	25 %	50 %	221633349
29971	NC_011959	TGC	2	6	1358624	1358629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633349
29972	NC_011959	CGAC	2	8	1358664	1358671	25 %	0 %	25 %	50 %	221633349
29973	NC_011959	GTCA	2	8	1358752	1358759	25 %	25 %	25 %	25 %	221633349
29974	NC_011959	ATGC	2	8	1358767	1358774	25 %	25 %	25 %	25 %	221633349
29975	NC_011959	GAG	2	6	1358840	1358845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633349
29976	NC_011959	ATC	2	6	1358885	1358890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633350
29977	NC_011959	CCT	2	6	1358905	1358910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633350
29978	NC_011959	AGG	2	6	1359075	1359080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633350
29979	NC_011959	GC	3	6	1359088	1359093	0 %	0 %	50 %	50 %	221633350
29980	NC_011959	TCGTC	2	10	1359094	1359103	0 %	40 %	20 %	40 %	221633350
29981	NC_011959	GCT	2	6	1359181	1359186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633350
29982	NC_011959	GATC	2	8	1359319	1359326	25 %	25 %	25 %	25 %	221633350
29983	NC_011959	CTCA	2	8	1359364	1359371	25 %	25 %	0 %	50 %	221633350
29984	NC_011959	CTC	2	6	1359372	1359377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633350
29985	NC_011959	CAG	2	6	1359399	1359404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633350
29986	NC_011959	G	6	6	1359414	1359419	0 %	0 %	100 %	0 %	221633350
29987	NC_011959	TGG	2	6	1359532	1359537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633350
29988	NC_011959	GCG	2	6	1359624	1359629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633350
29989	NC_011959	CCA	2	6	1359692	1359697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633350
29990	NC_011959	AGT	2	6	1359833	1359838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633350
29991	NC_011959	CGA	2	6	1359844	1359849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633350
29992	NC_011959	TCG	2	6	1359882	1359887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633350
29993	NC_011959	TCG	2	6	1359900	1359905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633350
29994	NC_011959	TGG	2	6	1360065	1360070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633350
29995	NC_011959	TC	3	6	1360102	1360107	0 %	50 %	0 %	50 %	221633350
29996	NC_011959	GGT	2	6	1360183	1360188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633350
29997	NC_011959	GCAGC	2	10	1360310	1360319	20 %	0 %	40 %	40 %	221633350
29998	NC_011959	CCT	2	6	1360338	1360343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633350
29999	NC_011959	GAG	2	6	1360387	1360392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30000	NC_011959	TCG	2	6	1360445	1360450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633351

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