MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011959	GCTC	2	8	108614	108621	0 %	25 %	25 %	50 %	221632135
2502	NC_011959	TCGC	2	8	108644	108651	0 %	25 %	25 %	50 %	221632135
2503	NC_011959	GCTC	2	8	108679	108686	0 %	25 %	25 %	50 %	221632135
2504	NC_011959	TCG	2	6	108715	108720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632135
2505	NC_011959	TGA	2	6	108800	108805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632135
2506	NC_011959	CGA	2	6	108839	108844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632135
2507	NC_011959	GTT	2	6	108867	108872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632135
2508	NC_011959	TCC	2	6	108958	108963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632135
2509	NC_011959	GAG	2	6	108984	108989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632135
2510	NC_011959	GAA	2	6	109020	109025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632135
2511	NC_011959	GCT	2	6	109042	109047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632135
2512	NC_011959	AGG	2	6	109147	109152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632135
2513	NC_011959	GGA	2	6	109202	109207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011959	CGG	2	6	109236	109241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632136
2515	NC_011959	CTG	2	6	109281	109286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632136
2516	NC_011959	TCC	2	6	109430	109435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_011959	ATGC	2	8	109612	109619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_011959	CAT	2	6	109652	109657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_011959	GTC	2	6	109675	109680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_011959	TC	3	6	109739	109744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2521	NC_011959	CTGA	2	8	109830	109837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_011959	GAC	2	6	109860	109865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_011959	ACG	2	6	109866	109871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_011959	AAC	2	6	109896	109901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_011959	ACG	3	9	109914	109922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_011959	GGTG	2	8	109961	109968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011959	GGC	2	6	110039	110044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011959	GACGG	2	10	110174	110183	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2529	NC_011959	ATCC	2	8	110201	110208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_011959	TCGC	2	8	110247	110254	0 %	25 %	25 %	50 %	221632137
2531	NC_011959	CGC	2	6	110260	110265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632137
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2533	NC_011959	TCC	2	6	110399	110404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632137
2534	NC_011959	TCGC	2	8	110432	110439	0 %	25 %	25 %	50 %	221632137
2535	NC_011959	TCG	2	6	110471	110476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
2536	NC_011959	CGC	2	6	110529	110534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632137
2537	NC_011959	CGG	2	6	110553	110558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632137
2538	NC_011959	TAT	2	6	110566	110571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221632137
2539	NC_011959	CGG	2	6	110582	110587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632137
2540	NC_011959	GAC	2	6	110595	110600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632137
2541	NC_011959	TCCGC	2	10	110610	110619	0 %	20 %	20 %	60 %	221632137
2542	NC_011959	TGGG	2	8	110681	110688	0 %	25 %	75 %	0 %	221632137
2543	NC_011959	CG	3	6	110732	110737	0 %	0 %	50 %	50 %	221632137
2544	NC_011959	GCA	2	6	110743	110748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2547	NC_011959	TCG	2	6	110789	110794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2550	NC_011959	CCA	2	6	110935	110940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632137
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2555	NC_011959	CGA	2	6	111327	111332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632137
2556	NC_011959	CAT	2	6	111351	111356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632137
2557	NC_011959	TCG	2	6	111359	111364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
2558	NC_011959	GC	3	6	111370	111375	0 %	0 %	50 %	50 %	221632137
2559	NC_011959	GTC	2	6	111430	111435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
2560	NC_011959	GC	3	6	111500	111505	0 %	0 %	50 %	50 %	221632137
2561	NC_011959	CCGG	2	8	111529	111536	0 %	0 %	50 %	50 %	221632137
2562	NC_011959	ATC	2	6	111574	111579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632137
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2565	NC_011959	GC	3	6	111786	111791	0 %	0 %	50 %	50 %	221632137
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2568	NC_011959	CTG	2	6	111970	111975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632138
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2571	NC_011959	TGG	2	6	112231	112236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632138
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2581	NC_011959	TCG	2	6	112740	112745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632139
2582	NC_011959	AGCCG	2	10	112796	112805	20 %	0 %	40 %	40 %	221632139
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2587	NC_011959	GTC	2	6	113099	113104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632139
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2593	NC_011959	TCGT	2	8	113280	113287	0 %	50 %	25 %	25 %	221632139
2594	NC_011959	GGAG	2	8	113296	113303	25 %	0 %	75 %	0 %	221632139
2595	NC_011959	CG	3	6	113304	113309	0 %	0 %	50 %	50 %	221632139
2596	NC_011959	GCG	2	6	113357	113362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632139
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2607	NC_011959	CTGA	2	8	113767	113774	25 %	25 %	25 %	25 %	221632140
2608	NC_011959	TCC	2	6	113924	113929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632140
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2613	NC_011959	AGCG	2	8	114115	114122	25 %	0 %	50 %	25 %	221632140
2614	NC_011959	TGA	2	6	114242	114247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632140
2615	NC_011959	TCG	2	6	114258	114263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632140
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2620	NC_011959	TCG	2	6	114490	114495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632141
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2623	NC_011959	GC	3	6	114529	114534	0 %	0 %	50 %	50 %	221632141
2624	NC_011959	GCC	2	6	114569	114574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632141
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2629	NC_011959	ATC	2	6	114792	114797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632141
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2741	NC_011959	CCA	2	6	119352	119357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632147
2742	NC_011959	GTA	2	6	119383	119388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632147
2743	NC_011959	ACG	2	6	119435	119440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632147
2744	NC_011959	CGT	2	6	119467	119472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632147
2745	NC_011959	GGA	2	6	119487	119492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632147
2746	NC_011959	AGC	2	6	119522	119527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632147
2747	NC_011959	CTC	2	6	119542	119547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632147
2748	NC_011959	CGA	2	6	119637	119642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632147
2749	NC_011959	CCGA	2	8	119644	119651	25 %	0 %	25 %	50 %	221632147
2750	NC_011959	TGG	2	6	119686	119691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632147
2751	NC_011959	CGG	2	6	119752	119757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632148
2752	NC_011959	CG	3	6	119780	119785	0 %	0 %	50 %	50 %	221632148
2753	NC_011959	TTCC	2	8	119794	119801	0 %	50 %	0 %	50 %	221632148
2754	NC_011959	GA	3	6	119838	119843	50 %	0 %	50 %	0 %	221632148
2755	NC_011959	CG	3	6	119855	119860	0 %	0 %	50 %	50 %	221632148
2756	NC_011959	GC	3	6	119874	119879	0 %	0 %	50 %	50 %	221632148
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2759	NC_011959	GGT	2	6	120000	120005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632148
2760	NC_011959	CTC	2	6	120037	120042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632149
2761	NC_011959	CTG	2	6	120089	120094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632149
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2763	NC_011959	CCA	2	6	120167	120172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632149
2764	NC_011959	CGCT	2	8	120176	120183	0 %	25 %	25 %	50 %	221632149
2765	NC_011959	CGA	2	6	120280	120285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632149
2766	NC_011959	CTT	2	6	120305	120310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632149
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2768	NC_011959	ATC	2	6	120336	120341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632149
2769	NC_011959	GCTC	2	8	120346	120353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2770	NC_011959	ACAGCA	2	12	120383	120394	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2771	NC_011959	ACC	2	6	120409	120414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2772	NC_011959	GTCCT	2	10	120484	120493	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2773	NC_011959	TGC	2	6	120547	120552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2774	NC_011959	GCG	2	6	120556	120561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2775	NC_011959	AG	3	6	120646	120651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2776	NC_011959	CGC	2	6	120710	120715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2777	NC_011959	GC	3	6	120740	120745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2778	NC_011959	CGG	2	6	120782	120787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2779	NC_011959	TC	3	6	120795	120800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2780	NC_011959	CG	3	6	120961	120966	0 %	0 %	50 %	50 %	221632150
2781	NC_011959	ACC	2	6	121001	121006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632150
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2785	NC_011959	GGT	2	6	121121	121126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632150
2786	NC_011959	TAC	2	6	121189	121194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2787	NC_011959	CGG	2	6	121219	121224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2788	NC_011959	CT	3	6	121281	121286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2789	NC_011959	TCG	2	6	121369	121374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2794	NC_011959	GTC	2	6	121517	121522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151
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2800	NC_011959	CGA	2	6	121804	121809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632151
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2834	NC_011959	CCAG	2	8	122993	123000	25 %	0 %	25 %	50 %	221632152
2835	NC_011959	ATCCG	2	10	123029	123038	20 %	20 %	20 %	40 %	221632152
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2848	NC_011959	CG	3	6	123655	123660	0 %	0 %	50 %	50 %	221632152
2849	NC_011959	GGC	2	6	123838	123843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632152
2850	NC_011959	TCG	2	6	123863	123868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632152
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2852	NC_011959	CAC	2	6	124030	124035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632152
2853	NC_011959	TCG	2	6	124097	124102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632152
2854	NC_011959	CG	3	6	124195	124200	0 %	0 %	50 %	50 %	221632152
2855	NC_011959	CGAC	2	8	124214	124221	25 %	0 %	25 %	50 %	221632152
2856	NC_011959	CGA	2	6	124311	124316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632152
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2859	NC_011959	CTG	2	6	124603	124608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632152
2860	NC_011959	CTC	2	6	124671	124676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632152
2861	NC_011959	CAC	2	6	124797	124802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632152
2862	NC_011959	GCC	2	6	124875	124880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632152
2863	NC_011959	CGA	4	12	124893	124904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632152
2864	NC_011959	TGC	2	6	124905	124910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632152
2865	NC_011959	CAT	2	6	124963	124968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632153
2866	NC_011959	GAC	2	6	125057	125062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632153
2867	NC_011959	CG	3	6	125081	125086	0 %	0 %	50 %	50 %	221632153
2868	NC_011959	CGA	2	6	125093	125098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632153
2869	NC_011959	CAT	3	9	125397	125405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632153
2870	NC_011959	AGC	2	6	125424	125429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2871	NC_011959	GAT	2	6	125456	125461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2872	NC_011959	CGATC	2	10	125510	125519	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2873	NC_011959	GCT	3	9	125536	125544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2874	NC_011959	CGC	2	6	125584	125589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2875	NC_011959	AGG	2	6	125600	125605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2876	NC_011959	TC	3	6	125676	125681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2877	NC_011959	CCAG	2	8	125737	125744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2878	NC_011959	GGT	2	6	125768	125773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2879	NC_011959	AGCG	2	8	125808	125815	25 %	0 %	50 %	25 %	221632154
2880	NC_011959	CGA	2	6	125835	125840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632154
2881	NC_011959	TCG	2	6	125843	125848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632154
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2884	NC_011959	TGA	2	6	126024	126029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632154
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2886	NC_011959	GAG	2	6	126193	126198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632154
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2900	NC_011959	GGCA	2	8	126882	126889	25 %	0 %	50 %	25 %	221632154
2901	NC_011959	AGG	2	6	126908	126913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632154
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2904	NC_011959	GC	3	6	126949	126954	0 %	0 %	50 %	50 %	221632154
2905	NC_011959	CGATC	2	10	126975	126984	20 %	20 %	20 %	40 %	221632154
2906	NC_011959	CCT	3	9	126997	127005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2907	NC_011959	TCG	2	6	127105	127110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
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2927	NC_011959	GCT	2	6	127897	127902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
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2937	NC_011959	CTGC	2	8	128233	128240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2938	NC_011959	AGTC	2	8	128253	128260	25 %	25 %	25 %	25 %	221632156
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2952	NC_011959	GGC	2	6	129144	129149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632156
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2959	NC_011959	GATC	2	8	129399	129406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2960	NC_011959	AAG	2	6	129407	129412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2961	NC_011959	ATCC	2	8	129426	129433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2962	NC_011959	CTG	2	6	129489	129494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632157
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2968	NC_011959	C	6	6	129766	129771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2969	NC_011959	CGGT	2	8	129777	129784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2974	NC_011959	GT	3	6	130025	130030	0 %	50 %	50 %	0 %	221632158
2975	NC_011959	ATCG	2	8	130032	130039	25 %	25 %	25 %	25 %	221632158
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2978	NC_011959	ATC	2	6	130243	130248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632158
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2981	NC_011959	GCC	2	6	130365	130370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632158
2982	NC_011959	AGC	2	6	130468	130473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632158
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2987	NC_011959	CGA	2	6	130697	130702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632158
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2989	NC_011959	CG	3	6	130769	130774	0 %	0 %	50 %	50 %	221632158
2990	NC_011959	CGG	2	6	130793	130798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632158
2991	NC_011959	TGC	2	6	130813	130818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632158
2992	NC_011959	GGT	2	6	130907	130912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632158
2993	NC_011959	CCG	2	6	130939	130944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632158
2994	NC_011959	ACG	2	6	130951	130956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632158
2995	NC_011959	TCG	2	6	130957	130962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632158
2996	NC_011959	GCTC	2	8	130973	130980	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2997	NC_011959	CTG	2	6	130987	130992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2998	NC_011959	GAA	2	6	131063	131068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632159
2999	NC_011959	ATC	2	6	131076	131081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632159
3000	NC_011959	TCGC	2	8	131168	131175	0 %	25 %	25 %	50 %	221632159

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