MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_011959	GCG	2	6	1315837	1315842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633304
29002	NC_011959	TCGC	2	8	1315910	1315917	0 %	25 %	25 %	50 %	221633304
29003	NC_011959	TCG	2	6	1315925	1315930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633304
29004	NC_011959	AGG	2	6	1315983	1315988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633304
29005	NC_011959	GCA	2	6	1316101	1316106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633304
29006	NC_011959	TGC	2	6	1316128	1316133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633304
29007	NC_011959	CAC	2	6	1316153	1316158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633304
29008	NC_011959	CAC	2	6	1316167	1316172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633305
29009	NC_011959	CGC	2	6	1316203	1316208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633305
29010	NC_011959	TCGCGA	2	12	1316241	1316252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29011	NC_011959	CGC	2	6	1316263	1316268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633305
29012	NC_011959	TGG	2	6	1316290	1316295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633305
29013	NC_011959	GAC	2	6	1316376	1316381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29014	NC_011959	AGC	2	6	1316384	1316389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29015	NC_011959	GAT	3	9	1316434	1316442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633305
29016	NC_011959	CGAT	2	8	1316474	1316481	25 %	25 %	25 %	25 %	221633305
29017	NC_011959	GAC	2	6	1316526	1316531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29018	NC_011959	CATG	2	8	1316544	1316551	25 %	25 %	25 %	25 %	221633305
29019	NC_011959	GAC	2	6	1316554	1316559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29020	NC_011959	GCC	2	6	1316576	1316581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633305
29021	NC_011959	CGT	2	6	1316619	1316624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29022	NC_011959	ATC	2	6	1316627	1316632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633305
29023	NC_011959	GCC	2	6	1316651	1316656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633305
29024	NC_011959	ACC	2	6	1316663	1316668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633305
29025	NC_011959	TCGA	2	8	1316681	1316688	25 %	25 %	25 %	25 %	221633305
29026	NC_011959	GCAGC	2	10	1316703	1316712	20 %	0 %	40 %	40 %	221633305
29027	NC_011959	CGC	2	6	1316741	1316746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633305
29028	NC_011959	CAC	2	6	1316793	1316798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633305
29029	NC_011959	CCA	2	6	1316826	1316831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633305
29030	NC_011959	CG	3	6	1316833	1316838	0 %	0 %	50 %	50 %	221633305
29031	NC_011959	CGA	2	6	1316868	1316873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29032	NC_011959	CAC	2	6	1316880	1316885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633305
29033	NC_011959	TGA	2	6	1316907	1316912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633305
29034	NC_011959	GCG	2	6	1316929	1316934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633305
29035	NC_011959	GCA	2	6	1316987	1316992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633305
29036	NC_011959	CCT	2	6	1317008	1317013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29037	NC_011959	CGA	2	6	1317039	1317044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633306
29038	NC_011959	CTCG	2	8	1317058	1317065	0 %	25 %	25 %	50 %	221633306
29039	NC_011959	GGT	2	6	1317084	1317089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633306
29040	NC_011959	CGA	2	6	1317199	1317204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633306
29041	NC_011959	CTC	2	6	1317261	1317266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633306
29042	NC_011959	CCG	2	6	1317268	1317273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633306
29043	NC_011959	CGA	3	9	1317301	1317309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633306
29044	NC_011959	GGA	2	6	1317373	1317378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633306
29045	NC_011959	CTC	2	6	1317401	1317406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633307
29046	NC_011959	GAG	2	6	1317420	1317425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633307
29047	NC_011959	TCCGAG	2	12	1317569	1317580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29048	NC_011959	CCA	2	6	1317599	1317604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633307
29049	NC_011959	GCA	2	6	1317628	1317633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29050	NC_011959	CGT	2	6	1317653	1317658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29051	NC_011959	CGA	2	6	1317690	1317695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29052	NC_011959	CCA	2	6	1317742	1317747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633307
29053	NC_011959	CAGC	2	8	1317769	1317776	25 %	0 %	25 %	50 %	221633307
29054	NC_011959	GAT	2	6	1317812	1317817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633307
29055	NC_011959	CAC	2	6	1317848	1317853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633307
29056	NC_011959	CAGCG	2	10	1317857	1317866	20 %	0 %	40 %	40 %	221633307
29057	NC_011959	GCA	2	6	1317901	1317906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29058	NC_011959	CG	3	6	1317914	1317919	0 %	0 %	50 %	50 %	221633307
29059	NC_011959	CTG	2	6	1317926	1317931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29060	NC_011959	AGG	2	6	1317939	1317944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633307
29061	NC_011959	AGC	2	6	1317948	1317953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29062	NC_011959	CGA	2	6	1317961	1317966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29063	NC_011959	TCA	2	6	1317994	1317999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633307
29064	NC_011959	GCC	2	6	1318047	1318052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633307
29065	NC_011959	CG	3	6	1318086	1318091	0 %	0 %	50 %	50 %	221633307
29066	NC_011959	CGC	2	6	1318094	1318099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633307
29067	NC_011959	C	6	6	1318206	1318211	0 %	0 %	0 %	100 %	221633307
29068	NC_011959	CCGA	2	8	1318224	1318231	25 %	0 %	25 %	50 %	221633307
29069	NC_011959	CGACC	2	10	1318249	1318258	20 %	0 %	20 %	60 %	221633307
29070	NC_011959	GATCGT	2	12	1318262	1318273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221633307
29071	NC_011959	C	6	6	1318461	1318466	0 %	0 %	0 %	100 %	221633307
29072	NC_011959	CAC	2	6	1318478	1318483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633307
29073	NC_011959	GCT	2	6	1318494	1318499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633307
29074	NC_011959	TCACC	2	10	1318516	1318525	20 %	20 %	0 %	60 %	221633307
29075	NC_011959	CGC	2	6	1318547	1318552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633307
29076	NC_011959	TCG	3	9	1318560	1318568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633307
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29081	NC_011959	GAGC	2	8	1318663	1318670	25 %	0 %	50 %	25 %	221633307
29082	NC_011959	CGA	2	6	1318727	1318732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29083	NC_011959	GGA	2	6	1318750	1318755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29084	NC_011959	CGTG	2	8	1318761	1318768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29085	NC_011959	CTT	2	6	1318786	1318791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633308
29086	NC_011959	ACG	2	6	1318808	1318813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633308
29087	NC_011959	CCT	2	6	1318869	1318874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633308
29088	NC_011959	GCTC	2	8	1318882	1318889	0 %	25 %	25 %	50 %	221633308
29089	NC_011959	GGA	2	6	1318917	1318922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633308
29090	NC_011959	GTCGAG	2	12	1319020	1319031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221633309
29091	NC_011959	AAG	2	6	1319083	1319088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633309
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29094	NC_011959	GTC	2	6	1319251	1319256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29095	NC_011959	CTC	2	6	1319299	1319304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633309
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29097	NC_011959	CGA	2	6	1319513	1319518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29098	NC_011959	AGCG	2	8	1319521	1319528	25 %	0 %	50 %	25 %	221633309
29099	NC_011959	TCG	2	6	1319582	1319587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29100	NC_011959	TCG	2	6	1319621	1319626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29101	NC_011959	TCG	2	6	1319654	1319659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29102	NC_011959	GCG	2	6	1319690	1319695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633309
29103	NC_011959	ATC	2	6	1319735	1319740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633309
29104	NC_011959	TCC	2	6	1319771	1319776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633309
29105	NC_011959	ACT	2	6	1319822	1319827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633309
29106	NC_011959	CGA	2	6	1319877	1319882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29107	NC_011959	CGA	2	6	1319898	1319903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633309
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29109	NC_011959	GC	3	6	1320020	1320025	0 %	0 %	50 %	50 %	221633309
29110	NC_011959	CGG	2	6	1320031	1320036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633309
29111	NC_011959	CAT	2	6	1320054	1320059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633309
29112	NC_011959	GTC	2	6	1320076	1320081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29113	NC_011959	AGC	2	6	1320086	1320091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633309
29114	NC_011959	CG	4	8	1320161	1320168	0 %	0 %	50 %	50 %	221633309
29115	NC_011959	GCCA	2	8	1320193	1320200	25 %	0 %	25 %	50 %	221633309
29116	NC_011959	CGGT	2	8	1320217	1320224	0 %	25 %	50 %	25 %	221633309
29117	NC_011959	GGT	2	6	1320333	1320338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633309
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29119	NC_011959	GTC	2	6	1320505	1320510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633309
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29145	NC_011959	GC	3	6	1321589	1321594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29146	NC_011959	TG	3	6	1321637	1321642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29147	NC_011959	ACC	2	6	1321667	1321672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29150	NC_011959	GACC	2	8	1321755	1321762	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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29155	NC_011959	GAAC	2	8	1321927	1321934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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29202	NC_011959	CTT	2	6	1324136	1324141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633312
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29220	NC_011959	CTT	2	6	1324784	1324789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633313
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29227	NC_011959	TC	3	6	1325094	1325099	0 %	50 %	0 %	50 %	221633314
29228	NC_011959	GCGA	2	8	1325101	1325108	25 %	0 %	50 %	25 %	221633314
29229	NC_011959	AAG	2	6	1325184	1325189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633314
29230	NC_011959	CGA	2	6	1325193	1325198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633314
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29233	NC_011959	CGA	2	6	1325227	1325232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633314
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29350	NC_011959	CAG	2	6	1330411	1330416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633319
29351	NC_011959	GAC	2	6	1330420	1330425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633319
29352	NC_011959	CGG	2	6	1330460	1330465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633319
29353	NC_011959	GGC	2	6	1330468	1330473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633319
29354	NC_011959	GCA	2	6	1330484	1330489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633319
29355	NC_011959	CGT	2	6	1330528	1330533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633319
29356	NC_011959	TTCCGC	2	12	1330543	1330554	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221633319
29357	NC_011959	GCCA	2	8	1330566	1330573	25 %	0 %	25 %	50 %	221633319
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29361	NC_011959	TCG	2	6	1330644	1330649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633319
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29372	NC_011959	CGA	2	6	1330977	1330982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633319
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29385	NC_011959	CTC	2	6	1331512	1331517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29386	NC_011959	GCA	2	6	1331521	1331526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29406	NC_011959	AGCGCG	2	12	1332652	1332663	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221633320
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29413	NC_011959	CGACT	2	10	1332951	1332960	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29414	NC_011959	AGG	2	6	1332972	1332977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29415	NC_011959	GGC	2	6	1332979	1332984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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29437	NC_011959	AGG	2	6	1333655	1333660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633322
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29442	NC_011959	GA	3	6	1333997	1334002	50 %	0 %	50 %	0 %	221633322
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29451	NC_011959	TCC	2	6	1334555	1334560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633322
29452	NC_011959	ATC	2	6	1334647	1334652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633322
29453	NC_011959	CTC	2	6	1334656	1334661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633322
29454	NC_011959	CTG	2	6	1334691	1334696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633323
29455	NC_011959	GGA	2	6	1334746	1334751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633323
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29457	NC_011959	GTG	2	6	1334806	1334811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633323
29458	NC_011959	TCGAGA	2	12	1334862	1334873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221633323
29459	NC_011959	CGA	2	6	1334875	1334880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633323
29460	NC_011959	GCG	2	6	1334958	1334963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633323
29461	NC_011959	CGT	2	6	1335031	1335036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633323
29462	NC_011959	ATG	2	6	1335038	1335043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633323
29463	NC_011959	GGT	2	6	1335119	1335124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633323
29464	NC_011959	CGAG	2	8	1335181	1335188	25 %	0 %	50 %	25 %	221633323
29465	NC_011959	CG	3	6	1335199	1335204	0 %	0 %	50 %	50 %	221633323
29466	NC_011959	TCG	2	6	1335210	1335215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633323
29467	NC_011959	CGC	2	6	1335313	1335318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633323
29468	NC_011959	GAG	2	6	1335425	1335430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633323
29469	NC_011959	GC	3	6	1335469	1335474	0 %	0 %	50 %	50 %	221633323
29470	NC_011959	GGC	2	6	1335497	1335502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633323
29471	NC_011959	TTCC	2	8	1335527	1335534	0 %	50 %	0 %	50 %	221633323
29472	NC_011959	CTC	2	6	1335683	1335688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633323
29473	NC_011959	GAAC	2	8	1335739	1335746	50 %	0 %	25 %	25 %	221633323
29474	NC_011959	TTC	3	9	1335755	1335763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633323
29475	NC_011959	CAT	2	6	1335790	1335795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633323
29476	NC_011959	GAG	3	9	1335848	1335856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633323
29477	NC_011959	GAA	2	6	1335872	1335877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633323
29478	NC_011959	CGT	2	6	1335881	1335886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29479	NC_011959	CTCG	2	8	1336005	1336012	0 %	25 %	25 %	50 %	221633324
29480	NC_011959	AGG	2	6	1336030	1336035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633324
29481	NC_011959	CGAG	2	8	1336050	1336057	25 %	0 %	50 %	25 %	221633324
29482	NC_011959	AGA	2	6	1336072	1336077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633324
29483	NC_011959	GCC	2	6	1336115	1336120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633324
29484	NC_011959	GGA	2	6	1336122	1336127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633324
29485	NC_011959	CTC	2	6	1336244	1336249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633324
29486	NC_011959	CCG	2	6	1336268	1336273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633324
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29488	NC_011959	CGCT	2	8	1336296	1336303	0 %	25 %	25 %	50 %	221633324
29489	NC_011959	TCG	3	9	1336347	1336355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29490	NC_011959	CTC	2	6	1336385	1336390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633324
29491	NC_011959	CGG	2	6	1336408	1336413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633324
29492	NC_011959	GC	3	6	1336419	1336424	0 %	0 %	50 %	50 %	221633324
29493	NC_011959	TCC	2	6	1336488	1336493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633324
29494	NC_011959	TCG	2	6	1336506	1336511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29495	NC_011959	CGT	2	6	1336546	1336551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29496	NC_011959	GTCC	2	8	1336552	1336559	0 %	25 %	25 %	50 %	221633324
29497	NC_011959	TCG	2	6	1336608	1336613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29498	NC_011959	GGCT	2	8	1336649	1336656	0 %	25 %	50 %	25 %	221633324
29499	NC_011959	ACG	2	6	1336703	1336708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633324
29500	NC_011959	GTC	2	6	1336712	1336717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633324

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