MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_011959	CTT	2	6	1292440	1292445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633280
28503	NC_011959	ACC	2	6	1292474	1292479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633280
28504	NC_011959	TGA	2	6	1292592	1292597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633280
28505	NC_011959	GCC	2	6	1292657	1292662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633280
28506	NC_011959	TAG	2	6	1292667	1292672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633280
28507	NC_011959	CCT	2	6	1292703	1292708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633280
28508	NC_011959	TGG	2	6	1292742	1292747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633280
28509	NC_011959	AGC	2	6	1292768	1292773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633280
28510	NC_011959	CAG	2	6	1292787	1292792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633280
28511	NC_011959	CGT	3	9	1292842	1292850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633280
28512	NC_011959	TCGT	2	8	1292867	1292874	0 %	50 %	25 %	25 %	221633280
28513	NC_011959	CGC	2	6	1292881	1292886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633280
28514	NC_011959	TCC	2	6	1292924	1292929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633280
28515	NC_011959	CTT	2	6	1292986	1292991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633280
28516	NC_011959	CTT	2	6	1293060	1293065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633280
28517	NC_011959	CGT	2	6	1293145	1293150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28518	NC_011959	TCG	2	6	1293269	1293274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633281
28519	NC_011959	CGT	2	6	1293306	1293311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633281
28520	NC_011959	ACC	2	6	1293338	1293343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633281
28521	NC_011959	CAGG	2	8	1293375	1293382	25 %	0 %	50 %	25 %	221633281
28522	NC_011959	CTT	2	6	1293402	1293407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633281
28523	NC_011959	CACGA	2	10	1293427	1293436	40 %	0 %	20 %	40 %	221633281
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28528	NC_011959	TGC	2	6	1293686	1293691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633282
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28531	NC_011959	GA	3	6	1293869	1293874	50 %	0 %	50 %	0 %	221633282
28532	NC_011959	ATC	2	6	1293970	1293975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633282
28533	NC_011959	G	6	6	1293984	1293989	0 %	0 %	100 %	0 %	221633282
28534	NC_011959	GGTC	2	8	1294023	1294030	0 %	25 %	50 %	25 %	221633282
28535	NC_011959	GAC	2	6	1294036	1294041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633282
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28551	NC_011959	CGA	3	9	1294943	1294951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633283
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28554	NC_011959	CGCGA	2	10	1295091	1295100	20 %	0 %	40 %	40 %	221633283
28555	NC_011959	GCCG	2	8	1295104	1295111	0 %	0 %	50 %	50 %	221633283
28556	NC_011959	CGT	2	6	1295217	1295222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633283
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28562	NC_011959	GCCC	2	8	1295470	1295477	0 %	0 %	25 %	75 %	221633283
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28616	NC_011959	CGG	2	6	1298045	1298050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633287
28617	NC_011959	TTC	2	6	1298154	1298159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633287
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28732	NC_011959	CGA	2	6	1303523	1303528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633293
28733	NC_011959	CGC	2	6	1303572	1303577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633293
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28773	NC_011959	GTCG	2	8	1305118	1305125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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28965	NC_011959	CGA	2	6	1313901	1313906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633302
28966	NC_011959	TC	3	6	1313916	1313921	0 %	50 %	0 %	50 %	221633302
28967	NC_011959	GCT	2	6	1313952	1313957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633302
28968	NC_011959	CGT	2	6	1313964	1313969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633302
28969	NC_011959	CGA	2	6	1313985	1313990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633302
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28971	NC_011959	CTT	2	6	1314028	1314033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633302
28972	NC_011959	CGA	2	6	1314066	1314071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633302
28973	NC_011959	CCCCGT	2	12	1314154	1314165	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221633302
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28976	NC_011959	CGAG	2	8	1314331	1314338	25 %	0 %	50 %	25 %	221633303
28977	NC_011959	CGCA	2	8	1314543	1314550	25 %	0 %	25 %	50 %	221633303
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28983	NC_011959	CGC	2	6	1314893	1314898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633303
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28988	NC_011959	GCC	2	6	1315082	1315087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633303
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28992	NC_011959	TGA	2	6	1315276	1315281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633303
28993	NC_011959	GTC	2	6	1315360	1315365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633303
28994	NC_011959	AGC	2	6	1315462	1315467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633303
28995	NC_011959	CAG	2	6	1315485	1315490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633303
28996	NC_011959	CTG	2	6	1315638	1315643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633303
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28999	NC_011959	TCGA	2	8	1315715	1315722	25 %	25 %	25 %	25 %	221633304
29000	NC_011959	ACC	2	6	1315827	1315832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633304

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