MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_011959	TCG	2	6	1271927	1271932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633262
28003	NC_011959	ATC	2	6	1271965	1271970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633262
28004	NC_011959	GAT	2	6	1272069	1272074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633262
28005	NC_011959	CTT	2	6	1272090	1272095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633262
28006	NC_011959	GTG	2	6	1272105	1272110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633262
28007	NC_011959	CCTGG	2	10	1272124	1272133	0 %	20 %	40 %	40 %	221633262
28008	NC_011959	GAG	3	9	1272224	1272232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28009	NC_011959	GAA	2	6	1272255	1272260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633263
28010	NC_011959	TCGC	2	8	1272261	1272268	0 %	25 %	25 %	50 %	221633263
28011	NC_011959	CTG	2	6	1272273	1272278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28012	NC_011959	GC	3	6	1272282	1272287	0 %	0 %	50 %	50 %	221633263
28013	NC_011959	TC	3	6	1272338	1272343	0 %	50 %	0 %	50 %	221633263
28014	NC_011959	CGA	2	6	1272349	1272354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28015	NC_011959	TTG	2	6	1272363	1272368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633263
28016	NC_011959	CTGC	2	8	1272370	1272377	0 %	25 %	25 %	50 %	221633263
28017	NC_011959	CGGGG	2	10	1272381	1272390	0 %	0 %	80 %	20 %	221633263
28018	NC_011959	CAG	2	6	1272412	1272417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28019	NC_011959	CCGG	2	8	1272445	1272452	0 %	0 %	50 %	50 %	221633263
28020	NC_011959	CGA	2	6	1272460	1272465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28021	NC_011959	TCG	2	6	1272475	1272480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28022	NC_011959	CTT	2	6	1272485	1272490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633263
28023	NC_011959	CCG	2	6	1272669	1272674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633263
28024	NC_011959	TCG	2	6	1272781	1272786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28025	NC_011959	GTC	2	6	1272810	1272815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28026	NC_011959	ACG	2	6	1272822	1272827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28027	NC_011959	AACCAC	2	12	1272847	1272858	50 %	0 %	0 %	50 %	221633263
28028	NC_011959	CGA	3	9	1272935	1272943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28029	NC_011959	TCG	2	6	1272973	1272978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28030	NC_011959	GCA	2	6	1273010	1273015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28031	NC_011959	CTT	2	6	1273064	1273069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633263
28032	NC_011959	ATC	2	6	1273077	1273082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633263
28033	NC_011959	GTC	2	6	1273089	1273094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28034	NC_011959	CCT	2	6	1273169	1273174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633263
28035	NC_011959	TCG	2	6	1273204	1273209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28036	NC_011959	ACGAC	2	10	1273213	1273222	40 %	0 %	20 %	40 %	221633263
28037	NC_011959	AAG	2	6	1273303	1273308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633263
28038	NC_011959	GACT	2	8	1273403	1273410	25 %	25 %	25 %	25 %	221633263
28039	NC_011959	AAGG	2	8	1273449	1273456	50 %	0 %	50 %	0 %	221633263
28040	NC_011959	GCG	2	6	1273483	1273488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633263
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28042	NC_011959	GCA	2	6	1273575	1273580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633263
28043	NC_011959	CGC	2	6	1273606	1273611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633263
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28045	NC_011959	GCG	2	6	1273779	1273784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633263
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28047	NC_011959	TGC	2	6	1273885	1273890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633263
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28049	NC_011959	CGC	2	6	1274086	1274091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633264
28050	NC_011959	TCG	3	9	1274242	1274250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633264
28051	NC_011959	GGA	2	6	1274255	1274260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633264
28052	NC_011959	CGG	2	6	1274311	1274316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633264
28053	NC_011959	TCC	2	6	1274323	1274328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633264
28054	NC_011959	TGC	2	6	1274380	1274385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633264
28055	NC_011959	TCG	2	6	1274404	1274409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633264
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28057	NC_011959	CGA	2	6	1274459	1274464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633264
28058	NC_011959	TCG	2	6	1274476	1274481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633264
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28065	NC_011959	GA	3	6	1274854	1274859	50 %	0 %	50 %	0 %	221633264
28066	NC_011959	CGG	2	6	1274876	1274881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633264
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28068	NC_011959	GCC	2	6	1274946	1274951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633265
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28070	NC_011959	CTTC	2	8	1275117	1275124	0 %	50 %	0 %	50 %	221633265
28071	NC_011959	GCC	2	6	1275133	1275138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633265
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28074	NC_011959	GCTC	2	8	1275222	1275229	0 %	25 %	25 %	50 %	221633265
28075	NC_011959	GCT	2	6	1275238	1275243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633265
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28077	NC_011959	TCG	2	6	1275258	1275263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633265
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28084	NC_011959	TCCA	2	8	1275497	1275504	25 %	25 %	0 %	50 %	221633265
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28087	NC_011959	TTC	2	6	1275647	1275652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633265
28088	NC_011959	GCT	2	6	1275696	1275701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633265
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28096	NC_011959	TC	3	6	1276019	1276024	0 %	50 %	0 %	50 %	221633266
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28101	NC_011959	GCA	2	6	1276244	1276249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633266
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28103	NC_011959	TCGTC	2	10	1276289	1276298	0 %	40 %	20 %	40 %	221633266
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28108	NC_011959	CG	4	8	1276433	1276440	0 %	0 %	50 %	50 %	221633266
28109	NC_011959	CT	3	6	1276455	1276460	0 %	50 %	0 %	50 %	221633266
28110	NC_011959	GC	3	6	1276493	1276498	0 %	0 %	50 %	50 %	221633266
28111	NC_011959	CGA	3	9	1276598	1276606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633266
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28114	NC_011959	GAC	2	6	1276746	1276751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633266
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28116	NC_011959	CGT	2	6	1276805	1276810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633266
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28224	NC_011959	TGCT	2	8	1280870	1280877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28225	NC_011959	CAG	2	6	1280912	1280917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28226	NC_011959	TGC	2	6	1280949	1280954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28227	NC_011959	CGT	2	6	1280955	1280960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28228	NC_011959	GCA	2	6	1280997	1281002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28229	NC_011959	AGCG	2	8	1281011	1281018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28230	NC_011959	CGA	2	6	1281019	1281024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28231	NC_011959	CCA	2	6	1281026	1281031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28232	NC_011959	CGT	2	6	1281033	1281038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28233	NC_011959	CGA	2	6	1281046	1281051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28234	NC_011959	GAAACG	2	12	1281203	1281214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28235	NC_011959	CGA	2	6	1281292	1281297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28236	NC_011959	GCG	2	6	1281305	1281310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28237	NC_011959	CGAC	2	8	1281316	1281323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28238	NC_011959	GAA	2	6	1281334	1281339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28239	NC_011959	CGT	2	6	1281374	1281379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28240	NC_011959	CGTG	2	8	1281404	1281411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28241	NC_011959	CGA	2	6	1281418	1281423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28242	NC_011959	A	6	6	1281423	1281428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28243	NC_011959	CCAG	2	8	1281481	1281488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28244	NC_011959	CGA	2	6	1281523	1281528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28245	NC_011959	TGA	2	6	1281592	1281597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28246	NC_011959	CCGTC	2	10	1281640	1281649	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28247	NC_011959	CGA	3	9	1281664	1281672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28248	NC_011959	TCG	2	6	1281678	1281683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28249	NC_011959	GAC	2	6	1281755	1281760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633270
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28252	NC_011959	TC	3	6	1281846	1281851	0 %	50 %	0 %	50 %	221633270
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28256	NC_011959	GACC	2	8	1281932	1281939	25 %	0 %	25 %	50 %	221633270
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28316	NC_011959	AGCG	2	8	1284438	1284445	25 %	0 %	50 %	25 %	221633272
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28329	NC_011959	AC	3	6	1284979	1284984	50 %	0 %	0 %	50 %	221633272
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28333	NC_011959	AGC	2	6	1285254	1285259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633274
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28336	NC_011959	GC	4	8	1285399	1285406	0 %	0 %	50 %	50 %	221633274
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28338	NC_011959	ACA	2	6	1285450	1285455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633274
28339	NC_011959	CGA	2	6	1285468	1285473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633274
28340	NC_011959	CACATC	2	12	1285544	1285555	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	221633274
28341	NC_011959	GTC	2	6	1285584	1285589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633274
28342	NC_011959	CGCT	2	8	1285634	1285641	0 %	25 %	25 %	50 %	221633274
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28350	NC_011959	AGCG	2	8	1285865	1285872	25 %	0 %	50 %	25 %	221633275
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28352	NC_011959	GCG	2	6	1285942	1285947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633275
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28469	NC_011959	CGA	2	6	1291046	1291051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633279
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