MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_011959	CCA	2	6	1251017	1251022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633247
27502	NC_011959	CCT	2	6	1251097	1251102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633247
27503	NC_011959	GAG	2	6	1251113	1251118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633247
27504	NC_011959	ACC	2	6	1251156	1251161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633247
27505	NC_011959	CCT	2	6	1251208	1251213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633247
27506	NC_011959	GAG	2	6	1251350	1251355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633247
27507	NC_011959	CGA	2	6	1251367	1251372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633247
27508	NC_011959	TCGC	2	8	1251394	1251401	0 %	25 %	25 %	50 %	221633247
27509	NC_011959	TCGC	2	8	1251417	1251424	0 %	25 %	25 %	50 %	221633247
27510	NC_011959	ACCG	2	8	1251435	1251442	25 %	0 %	25 %	50 %	221633247
27511	NC_011959	CGCCGG	2	12	1251456	1251467	0 %	0 %	50 %	50 %	221633247
27512	NC_011959	TCGC	2	8	1251479	1251486	0 %	25 %	25 %	50 %	221633247
27513	NC_011959	TCC	2	6	1251505	1251510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27514	NC_011959	GTC	2	6	1251572	1251577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27515	NC_011959	AGGGG	2	10	1251584	1251593	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27516	NC_011959	CCT	2	6	1251674	1251679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27517	NC_011959	TA	3	6	1251693	1251698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27518	NC_011959	CG	3	6	1251715	1251720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27519	NC_011959	ATC	2	6	1251725	1251730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27520	NC_011959	GCCT	2	8	1251813	1251820	0 %	25 %	25 %	50 %	221633248
27521	NC_011959	CTC	2	6	1251852	1251857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633248
27522	NC_011959	AAG	2	6	1252005	1252010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633248
27523	NC_011959	GCT	2	6	1252016	1252021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27524	NC_011959	ATCG	2	8	1252095	1252102	25 %	25 %	25 %	25 %	221633248
27525	NC_011959	TCC	2	6	1252147	1252152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633248
27526	NC_011959	GAAA	2	8	1252196	1252203	75 %	0 %	25 %	0 %	221633248
27527	NC_011959	GCTCGA	2	12	1252217	1252228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27528	NC_011959	TCGC	2	8	1252252	1252259	0 %	25 %	25 %	50 %	221633248
27529	NC_011959	ACG	2	6	1252279	1252284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27530	NC_011959	CGC	2	6	1252310	1252315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633248
27531	NC_011959	GCAG	2	8	1252325	1252332	25 %	0 %	50 %	25 %	221633248
27532	NC_011959	AGCG	2	8	1252390	1252397	25 %	0 %	50 %	25 %	221633248
27533	NC_011959	AGC	2	6	1252417	1252422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27534	NC_011959	CACGC	2	10	1252489	1252498	20 %	0 %	20 %	60 %	221633248
27535	NC_011959	GA	3	6	1252508	1252513	50 %	0 %	50 %	0 %	221633248
27536	NC_011959	GAA	2	6	1252530	1252535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633248
27537	NC_011959	AAC	2	6	1252549	1252554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633248
27538	NC_011959	GCA	2	6	1252565	1252570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27539	NC_011959	CG	3	6	1252584	1252589	0 %	0 %	50 %	50 %	221633248
27540	NC_011959	CGA	2	6	1252640	1252645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27541	NC_011959	CGC	2	6	1252658	1252663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633248
27542	NC_011959	CAG	2	6	1252680	1252685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27543	NC_011959	CTC	2	6	1252689	1252694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633248
27544	NC_011959	AAGC	2	8	1252715	1252722	50 %	0 %	25 %	25 %	221633248
27545	NC_011959	GCAA	2	8	1252741	1252748	50 %	0 %	25 %	25 %	221633248
27546	NC_011959	GCTC	2	8	1252784	1252791	0 %	25 %	25 %	50 %	221633248
27547	NC_011959	CGA	2	6	1252826	1252831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27548	NC_011959	GCGCG	2	10	1252902	1252911	0 %	0 %	60 %	40 %	221633248
27549	NC_011959	CAG	2	6	1252944	1252949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27550	NC_011959	CAG	2	6	1252974	1252979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27551	NC_011959	GT	3	6	1253007	1253012	0 %	50 %	50 %	0 %	221633248
27552	NC_011959	GGA	2	6	1253030	1253035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633248
27553	NC_011959	AGG	2	6	1253047	1253052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633248
27554	NC_011959	GAG	2	6	1253068	1253073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633248
27555	NC_011959	CAG	2	6	1253145	1253150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27556	NC_011959	CGT	2	6	1253151	1253156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27557	NC_011959	GAG	2	6	1253177	1253182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633248
27558	NC_011959	AG	3	6	1253181	1253186	50 %	0 %	50 %	0 %	221633248
27559	NC_011959	GGC	2	6	1253205	1253210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633248
27560	NC_011959	CTCG	2	8	1253235	1253242	0 %	25 %	25 %	50 %	221633248
27561	NC_011959	GCG	2	6	1253267	1253272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633248
27562	NC_011959	AGC	2	6	1253281	1253286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27563	NC_011959	GGA	2	6	1253297	1253302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633248
27564	NC_011959	GCA	2	6	1253351	1253356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27565	NC_011959	ACT	2	6	1253438	1253443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633248
27566	NC_011959	CG	3	6	1253456	1253461	0 %	0 %	50 %	50 %	221633248
27567	NC_011959	GCA	2	6	1253471	1253476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27568	NC_011959	AAC	2	6	1253608	1253613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633248
27569	NC_011959	AGC	2	6	1253617	1253622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27570	NC_011959	GAA	3	9	1253634	1253642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633248
27571	NC_011959	GC	3	6	1253751	1253756	0 %	0 %	50 %	50 %	221633248
27572	NC_011959	CGA	2	6	1253966	1253971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27573	NC_011959	GTG	2	6	1254001	1254006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633248
27574	NC_011959	TCG	2	6	1254058	1254063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633248
27575	NC_011959	AGCG	2	8	1254064	1254071	25 %	0 %	50 %	25 %	221633248
27576	NC_011959	GCC	2	6	1254073	1254078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633248
27577	NC_011959	CA	3	6	1254113	1254118	50 %	0 %	0 %	50 %	221633248
27578	NC_011959	TCA	2	6	1254190	1254195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633248
27579	NC_011959	CA	3	6	1254194	1254199	50 %	0 %	0 %	50 %	221633248
27580	NC_011959	GGA	2	6	1254203	1254208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633248
27581	NC_011959	CGGG	2	8	1254253	1254260	0 %	0 %	75 %	25 %	221633248
27582	NC_011959	CCGA	2	8	1254306	1254313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27583	NC_011959	AGC	2	6	1254353	1254358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27584	NC_011959	TCG	2	6	1254437	1254442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27585	NC_011959	CTC	2	6	1254451	1254456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633249
27586	NC_011959	GCG	2	6	1254464	1254469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633249
27587	NC_011959	CAG	2	6	1254470	1254475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27588	NC_011959	CG	3	6	1254482	1254487	0 %	0 %	50 %	50 %	221633249
27589	NC_011959	TCG	2	6	1254494	1254499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27590	NC_011959	GGT	2	6	1254522	1254527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633249
27591	NC_011959	GCC	2	6	1254559	1254564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633249
27592	NC_011959	CGT	2	6	1254582	1254587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27593	NC_011959	ATC	2	6	1254634	1254639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633249
27594	NC_011959	TCC	2	6	1254647	1254652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633249
27595	NC_011959	AGTCC	2	10	1254655	1254664	20 %	20 %	20 %	40 %	221633249
27596	NC_011959	TCA	2	6	1254719	1254724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633249
27597	NC_011959	CGC	2	6	1254729	1254734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633249
27598	NC_011959	CGC	2	6	1254741	1254746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633249
27599	NC_011959	CGA	2	6	1254758	1254763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27600	NC_011959	CCAGT	2	10	1254776	1254785	20 %	20 %	20 %	40 %	221633249
27601	NC_011959	GAC	2	6	1254820	1254825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27602	NC_011959	GTC	2	6	1254841	1254846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27603	NC_011959	GCG	2	6	1254882	1254887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633249
27604	NC_011959	CGT	2	6	1254966	1254971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27605	NC_011959	CT	3	6	1254998	1255003	0 %	50 %	0 %	50 %	221633249
27606	NC_011959	CG	3	6	1255061	1255066	0 %	0 %	50 %	50 %	221633249
27607	NC_011959	TTC	2	6	1255108	1255113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633249
27608	NC_011959	CTT	2	6	1255173	1255178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633249
27609	NC_011959	GCA	2	6	1255196	1255201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27610	NC_011959	CCTG	2	8	1255203	1255210	0 %	25 %	25 %	50 %	221633249
27611	NC_011959	TCCTGC	2	12	1255226	1255237	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221633249
27612	NC_011959	TGC	2	6	1255283	1255288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633249
27613	NC_011959	GATC	2	8	1255317	1255324	25 %	25 %	25 %	25 %	221633249
27614	NC_011959	CGG	2	6	1255356	1255361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633249
27615	NC_011959	CTCC	2	8	1255383	1255390	0 %	25 %	0 %	75 %	221633249
27616	NC_011959	CG	3	6	1255430	1255435	0 %	0 %	50 %	50 %	221633249
27617	NC_011959	CGA	2	6	1255457	1255462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633249
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27649	NC_011959	GCTC	2	8	1256575	1256582	0 %	25 %	25 %	50 %	221633250
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27679	NC_011959	TTCC	2	8	1257597	1257604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27731	NC_011959	TTGG	2	8	1259920	1259927	0 %	50 %	50 %	0 %	221633253
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27733	NC_011959	GAG	2	6	1259987	1259992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633253
27734	NC_011959	TCG	3	9	1260057	1260065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633253
27735	NC_011959	CTC	2	6	1260068	1260073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633253
27736	NC_011959	GAC	2	6	1260121	1260126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633253
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27739	NC_011959	TCG	2	6	1260198	1260203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633253
27740	NC_011959	ATC	2	6	1260215	1260220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633253
27741	NC_011959	TCGA	2	8	1260231	1260238	25 %	25 %	25 %	25 %	221633253
27742	NC_011959	CAG	2	6	1260261	1260266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633253
27743	NC_011959	CG	3	6	1260345	1260350	0 %	0 %	50 %	50 %	221633253
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27745	NC_011959	CGT	2	6	1260382	1260387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633253
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27755	NC_011959	GCA	2	6	1260956	1260961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633253
27756	NC_011959	CCA	2	6	1260962	1260967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633253
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27761	NC_011959	CGCT	2	8	1261139	1261146	0 %	25 %	25 %	50 %	221633254
27762	NC_011959	GTC	2	6	1261178	1261183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633254
27763	NC_011959	TCG	2	6	1261184	1261189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633254
27764	NC_011959	CGG	2	6	1261191	1261196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633254
27765	NC_011959	CTG	2	6	1261208	1261213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633254
27766	NC_011959	GGC	2	6	1261242	1261247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633254
27767	NC_011959	CT	3	6	1261249	1261254	0 %	50 %	0 %	50 %	221633254
27768	NC_011959	TTCT	2	8	1261255	1261262	0 %	75 %	0 %	25 %	221633254
27769	NC_011959	TCG	3	9	1261406	1261414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633254
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27774	NC_011959	TCGCA	2	10	1261606	1261615	20 %	20 %	20 %	40 %	221633254
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27781	NC_011959	CG	3	6	1261996	1262001	0 %	0 %	50 %	50 %	221633254
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27790	NC_011959	GCT	2	6	1262238	1262243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633254
27791	NC_011959	CGCGA	2	10	1262266	1262275	20 %	0 %	40 %	40 %	221633254
27792	NC_011959	CGG	2	6	1262368	1262373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633254
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27802	NC_011959	TCG	3	9	1262847	1262855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633255
27803	NC_011959	GAC	2	6	1262858	1262863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633255
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27806	NC_011959	TCG	2	6	1263093	1263098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633255
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27812	NC_011959	GCAC	2	8	1263245	1263252	25 %	0 %	25 %	50 %	221633255
27813	NC_011959	GAT	2	6	1263263	1263268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633255
27814	NC_011959	ATC	2	6	1263335	1263340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633255
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27817	NC_011959	CG	3	6	1263534	1263539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27818	NC_011959	GAG	2	6	1263548	1263553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27819	NC_011959	TCG	2	6	1263637	1263642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633256
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27830	NC_011959	TCC	2	6	1264096	1264101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633256
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27832	NC_011959	TCG	2	6	1264147	1264152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633256
27833	NC_011959	CTCG	2	8	1264154	1264161	0 %	25 %	25 %	50 %	221633256
27834	NC_011959	CGAT	2	8	1264182	1264189	25 %	25 %	25 %	25 %	221633256
27835	NC_011959	CG	3	6	1264202	1264207	0 %	0 %	50 %	50 %	221633256
27836	NC_011959	CGA	2	6	1264274	1264279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633256
27837	NC_011959	GAC	2	6	1264316	1264321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633256
27838	NC_011959	GCG	2	6	1264325	1264330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633256
27839	NC_011959	CCT	2	6	1264352	1264357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633256
27840	NC_011959	CGC	2	6	1264384	1264389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633256
27841	NC_011959	GGGA	2	8	1264423	1264430	25 %	0 %	75 %	0 %	221633256
27842	NC_011959	GAG	2	6	1264455	1264460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633256
27843	NC_011959	CGAG	2	8	1264477	1264484	25 %	0 %	50 %	25 %	221633256
27844	NC_011959	GC	3	6	1264497	1264502	0 %	0 %	50 %	50 %	221633256
27845	NC_011959	CTC	2	6	1264503	1264508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633256
27846	NC_011959	GGC	2	6	1264577	1264582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633256
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27965	NC_011959	GGCA	2	8	1270207	1270214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27966	NC_011959	GAT	2	6	1270295	1270300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633261
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27968	NC_011959	CTT	2	6	1270325	1270330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633261
27969	NC_011959	TGC	2	6	1270342	1270347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633261
27970	NC_011959	TCA	2	6	1270360	1270365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633261
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27973	NC_011959	CAG	2	6	1270432	1270437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633261
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28000	NC_011959	CGT	2	6	1271817	1271822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633262

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