MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011959	AGC	2	6	883811	883816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19502	NC_011959	TTG	2	6	883835	883840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632901
19503	NC_011959	TCG	2	6	883853	883858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19504	NC_011959	TCG	2	6	883862	883867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19505	NC_011959	GGTC	2	8	883896	883903	0 %	25 %	50 %	25 %	221632901
19506	NC_011959	TCG	2	6	883943	883948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19507	NC_011959	CTA	2	6	883968	883973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632901
19508	NC_011959	GAA	2	6	884119	884124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632901
19509	NC_011959	AGC	2	6	884141	884146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19510	NC_011959	CAG	2	6	884158	884163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19511	NC_011959	GGA	2	6	884236	884241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19512	NC_011959	GAGCCC	2	12	884242	884253	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19513	NC_011959	CTC	2	6	884267	884272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19514	NC_011959	CGT	2	6	884323	884328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19515	NC_011959	ACCGAA	2	12	884358	884369	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19516	NC_011959	CGA	2	6	884378	884383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19517	NC_011959	AGCG	2	8	884432	884439	25 %	0 %	50 %	25 %	221632902
19518	NC_011959	CG	3	6	884438	884443	0 %	0 %	50 %	50 %	221632902
19519	NC_011959	CGA	2	6	884508	884513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632902
19520	NC_011959	TCGCGC	2	12	884516	884527	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221632902
19521	NC_011959	GGTC	2	8	884541	884548	0 %	25 %	50 %	25 %	221632902
19522	NC_011959	CGAG	2	8	884589	884596	25 %	0 %	50 %	25 %	221632902
19523	NC_011959	GCG	2	6	884740	884745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632902
19524	NC_011959	AACG	2	8	884746	884753	50 %	0 %	25 %	25 %	221632902
19525	NC_011959	AAGC	2	8	884781	884788	50 %	0 %	25 %	25 %	221632902
19526	NC_011959	CAG	2	6	884809	884814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632902
19527	NC_011959	CAT	2	6	884904	884909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632902
19528	NC_011959	TGA	2	6	884952	884957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632902
19529	NC_011959	CGT	2	6	884967	884972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632902
19530	NC_011959	TCCC	2	8	885027	885034	0 %	25 %	0 %	75 %	221632902
19531	NC_011959	CGCT	2	8	885062	885069	0 %	25 %	25 %	50 %	221632902
19532	NC_011959	CT	3	6	885230	885235	0 %	50 %	0 %	50 %	221632902
19533	NC_011959	CTG	2	6	885247	885252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632902
19534	NC_011959	GAG	3	9	885268	885276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632902
19535	NC_011959	CAT	2	6	885282	885287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632902
19536	NC_011959	GAGG	2	8	885317	885324	25 %	0 %	75 %	0 %	221632902
19537	NC_011959	GTG	2	6	885334	885339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632903
19538	NC_011959	TGG	2	6	885352	885357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632903
19539	NC_011959	CGC	2	6	885368	885373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632903
19540	NC_011959	GC	3	6	885386	885391	0 %	0 %	50 %	50 %	221632903
19541	NC_011959	AGCA	2	8	885532	885539	50 %	0 %	25 %	25 %	221632903
19542	NC_011959	CCGA	2	8	885681	885688	25 %	0 %	25 %	50 %	221632903
19543	NC_011959	TCTCC	2	10	885740	885749	0 %	40 %	0 %	60 %	221632903
19544	NC_011959	GCC	2	6	885788	885793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632903
19545	NC_011959	TAC	2	6	885801	885806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632903
19546	NC_011959	TCG	2	6	885853	885858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632903
19547	NC_011959	ACT	2	6	885928	885933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632903
19548	NC_011959	CAC	2	6	886024	886029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632903
19549	NC_011959	CGTG	2	8	886034	886041	0 %	25 %	50 %	25 %	221632903
19550	NC_011959	GAC	2	6	886083	886088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632904
19551	NC_011959	TCG	2	6	886115	886120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632904
19552	NC_011959	AGC	2	6	886398	886403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632904
19553	NC_011959	TTCG	2	8	886477	886484	0 %	50 %	25 %	25 %	221632904
19554	NC_011959	GTC	3	9	886531	886539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632904
19555	NC_011959	GC	3	6	886546	886551	0 %	0 %	50 %	50 %	221632904
19556	NC_011959	CAT	2	6	886566	886571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632904
19557	NC_011959	GAC	2	6	886582	886587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632904
19558	NC_011959	CGT	2	6	886593	886598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632904
19559	NC_011959	CG	3	6	886681	886686	0 %	0 %	50 %	50 %	221632904
19560	NC_011959	GGTCA	2	10	886739	886748	20 %	20 %	40 %	20 %	221632904
19561	NC_011959	TGG	2	6	886765	886770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_011959	GAC	2	6	886784	886789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632905
19563	NC_011959	GGA	2	6	886864	886869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632905
19564	NC_011959	TTC	2	6	886880	886885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632905
19565	NC_011959	GAGC	2	8	886909	886916	25 %	0 %	50 %	25 %	221632905
19566	NC_011959	GAC	2	6	886949	886954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632905
19567	NC_011959	CAC	2	6	886961	886966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632905
19568	NC_011959	CTG	2	6	886980	886985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632905
19569	NC_011959	GAGT	2	8	887019	887026	25 %	25 %	50 %	0 %	221632905
19570	NC_011959	GCGTC	2	10	887044	887053	0 %	20 %	40 %	40 %	221632905
19571	NC_011959	GGAT	2	8	887084	887091	25 %	25 %	50 %	0 %	221632905
19572	NC_011959	GAAAC	2	10	887192	887201	60 %	0 %	20 %	20 %	221632905
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19575	NC_011959	CAT	2	6	887344	887349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632905
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19578	NC_011959	CAT	2	6	887450	887455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632905
19579	NC_011959	CCGCG	2	10	887491	887500	0 %	0 %	40 %	60 %	221632905
19580	NC_011959	CAG	2	6	887558	887563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632905
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19582	NC_011959	ACCT	2	8	887779	887786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19583	NC_011959	TCC	2	6	887810	887815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19584	NC_011959	CAG	2	6	887835	887840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19585	NC_011959	TCC	2	6	887912	887917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19586	NC_011959	ATC	2	6	887930	887935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19587	NC_011959	TCGA	2	8	887951	887958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19588	NC_011959	CAT	3	9	888000	888008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19589	NC_011959	ACGCG	2	10	888064	888073	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19590	NC_011959	CTC	2	6	888094	888099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19591	NC_011959	CAC	2	6	888129	888134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19592	NC_011959	GGC	2	6	888185	888190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19593	NC_011959	TC	3	6	888206	888211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19594	NC_011959	CCCA	2	8	888246	888253	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19595	NC_011959	GCA	2	6	888258	888263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19599	NC_011959	CA	3	6	888422	888427	50 %	0 %	0 %	50 %	221632906
19600	NC_011959	GC	3	6	888478	888483	0 %	0 %	50 %	50 %	221632906
19601	NC_011959	GC	3	6	888605	888610	0 %	0 %	50 %	50 %	221632906
19602	NC_011959	TCG	2	6	888635	888640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632906
19603	NC_011959	TTC	2	6	888671	888676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632906
19604	NC_011959	TCC	2	6	888767	888772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632906
19605	NC_011959	ACG	2	6	888817	888822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632906
19606	NC_011959	CAT	2	6	888867	888872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632906
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19608	NC_011959	GTC	2	6	888943	888948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632906
19609	NC_011959	CGG	2	6	888970	888975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632906
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19611	NC_011959	CAGG	2	8	889119	889126	25 %	0 %	50 %	25 %	221632906
19612	NC_011959	GAG	2	6	889132	889137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632906
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19616	NC_011959	CGAC	2	8	889247	889254	25 %	0 %	25 %	50 %	221632906
19617	NC_011959	GC	4	8	889262	889269	0 %	0 %	50 %	50 %	221632906
19618	NC_011959	TCG	2	6	889307	889312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632906
19619	NC_011959	CG	3	6	889416	889421	0 %	0 %	50 %	50 %	221632906
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19984	NC_011959	GCCAG	2	10	905315	905324	20 %	0 %	40 %	40 %	221632921
19985	NC_011959	CGG	2	6	905383	905388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632921
19986	NC_011959	CCCGAG	2	12	905433	905444	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221632921
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19988	NC_011959	CGCT	2	8	905480	905487	0 %	25 %	25 %	50 %	221632921
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19991	NC_011959	GA	3	6	905601	905606	50 %	0 %	50 %	0 %	221632921
19992	NC_011959	GAG	2	6	905631	905636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632921
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