MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011959	TC	3	6	860219	860224	0 %	50 %	0 %	50 %	221632879
19002	NC_011959	ACGC	2	8	860231	860238	25 %	0 %	25 %	50 %	221632879
19003	NC_011959	GAG	2	6	860255	860260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632879
19004	NC_011959	ACCA	2	8	860262	860269	50 %	0 %	0 %	50 %	221632879
19005	NC_011959	CG	3	6	860373	860378	0 %	0 %	50 %	50 %	221632879
19006	NC_011959	ATT	2	6	860385	860390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221632879
19007	NC_011959	GCT	2	6	860614	860619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632879
19008	NC_011959	CA	3	6	860676	860681	50 %	0 %	0 %	50 %	221632879
19009	NC_011959	ACG	2	6	860759	860764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632879
19010	NC_011959	GCA	2	6	860809	860814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632879
19011	NC_011959	GGCT	2	8	860844	860851	0 %	25 %	50 %	25 %	221632879
19012	NC_011959	GAA	2	6	860856	860861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632879
19013	NC_011959	CG	3	6	860987	860992	0 %	0 %	50 %	50 %	221632879
19014	NC_011959	CGA	2	6	861086	861091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632879
19015	NC_011959	ACC	2	6	861105	861110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632879
19016	NC_011959	GTC	2	6	861243	861248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632879
19017	NC_011959	GTGA	2	8	861280	861287	25 %	25 %	50 %	0 %	221632879
19018	NC_011959	GCC	2	6	861289	861294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632879
19019	NC_011959	TCCG	2	8	861305	861312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19020	NC_011959	GTA	2	6	861357	861362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632880
19021	NC_011959	GCCA	2	8	861414	861421	25 %	0 %	25 %	50 %	221632880
19022	NC_011959	CGAC	2	8	861449	861456	25 %	0 %	25 %	50 %	221632880
19023	NC_011959	CGA	3	9	861572	861580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632880
19024	NC_011959	GAA	2	6	861683	861688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632880
19025	NC_011959	TCG	2	6	861724	861729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632880
19026	NC_011959	ACC	2	6	861786	861791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632880
19027	NC_011959	GCA	2	6	861814	861819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632880
19028	NC_011959	GCTC	2	8	861842	861849	0 %	25 %	25 %	50 %	221632880
19029	NC_011959	TG	3	6	861868	861873	0 %	50 %	50 %	0 %	221632880
19030	NC_011959	CGCA	2	8	861933	861940	25 %	0 %	25 %	50 %	221632880
19031	NC_011959	CCG	2	6	862010	862015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632880
19032	NC_011959	GAT	2	6	862053	862058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632880
19033	NC_011959	GC	3	6	862059	862064	0 %	0 %	50 %	50 %	221632880
19034	NC_011959	GCGCCT	2	12	862184	862195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221632880
19035	NC_011959	CG	3	6	862196	862201	0 %	0 %	50 %	50 %	221632880
19036	NC_011959	GTTCG	2	10	862274	862283	0 %	40 %	40 %	20 %	221632880
19037	NC_011959	CG	3	6	862282	862287	0 %	0 %	50 %	50 %	221632880
19038	NC_011959	CAG	2	6	862418	862423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632880
19039	NC_011959	CG	3	6	862424	862429	0 %	0 %	50 %	50 %	221632880
19040	NC_011959	GAC	2	6	862536	862541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632880
19041	NC_011959	CCT	2	6	862575	862580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19042	NC_011959	GTC	2	6	862587	862592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19043	NC_011959	AGG	2	6	862598	862603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632881
19044	NC_011959	GAG	2	6	862627	862632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632881
19045	NC_011959	GCT	2	6	862677	862682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19046	NC_011959	CAC	2	6	862779	862784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632881
19047	NC_011959	GGCA	2	8	862840	862847	25 %	0 %	50 %	25 %	221632881
19048	NC_011959	GCT	2	6	862980	862985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19049	NC_011959	CG	3	6	862995	863000	0 %	0 %	50 %	50 %	221632881
19050	NC_011959	CTT	2	6	863064	863069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632881
19051	NC_011959	GTG	2	6	863093	863098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632881
19052	NC_011959	CG	3	6	863216	863221	0 %	0 %	50 %	50 %	221632881
19053	NC_011959	GCT	3	9	863232	863240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19054	NC_011959	CCG	2	6	863243	863248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632881
19055	NC_011959	GCT	2	6	863268	863273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19056	NC_011959	CT	3	6	863305	863310	0 %	50 %	0 %	50 %	221632881
19057	NC_011959	GGT	2	6	863438	863443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632881
19058	NC_011959	CAT	2	6	863509	863514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632881
19059	NC_011959	CGT	2	6	863518	863523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19060	NC_011959	ACG	2	6	863603	863608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632881
19061	NC_011959	CGT	2	6	863733	863738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19062	NC_011959	CCA	2	6	863944	863949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632882
19063	NC_011959	GAAAG	2	10	863966	863975	60 %	0 %	40 %	0 %	221632882
19064	NC_011959	TCG	2	6	864007	864012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632882
19065	NC_011959	GCTCA	2	10	864014	864023	20 %	20 %	20 %	40 %	221632882
19066	NC_011959	CCA	2	6	864037	864042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632882
19067	NC_011959	CGA	2	6	864124	864129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632882
19068	NC_011959	CGA	2	6	864145	864150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632882
19069	NC_011959	GCG	2	6	864171	864176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632882
19070	NC_011959	CGGTG	2	10	864251	864260	0 %	20 %	60 %	20 %	221632882
19071	NC_011959	GCT	2	6	864318	864323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632882
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19074	NC_011959	GAT	2	6	864419	864424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632882
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19086	NC_011959	CGA	2	6	864964	864969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632882
19087	NC_011959	CGG	2	6	865021	865026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632882
19088	NC_011959	ACG	2	6	865035	865040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632882
19089	NC_011959	CG	3	6	865039	865044	0 %	0 %	50 %	50 %	221632882
19090	NC_011959	ATG	2	6	865083	865088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632882
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19092	NC_011959	GTC	2	6	865125	865130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632882
19093	NC_011959	AT	3	6	865147	865152	50 %	50 %	0 %	0 %	221632882
19094	NC_011959	GGT	2	6	865190	865195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632882
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19097	NC_011959	TTC	2	6	865430	865435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632882
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19099	NC_011959	CAT	2	6	865618	865623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632883
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19101	NC_011959	ACTC	2	8	865678	865685	25 %	25 %	0 %	50 %	221632883
19102	NC_011959	TCCT	2	8	865785	865792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19103	NC_011959	GGA	2	6	865809	865814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_011959	CG	3	6	865863	865868	0 %	0 %	50 %	50 %	221632884
19105	NC_011959	CT	3	6	865888	865893	0 %	50 %	0 %	50 %	221632884
19106	NC_011959	AAC	2	6	865906	865911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632884
19107	NC_011959	CAT	2	6	865935	865940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632884
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19109	NC_011959	CTC	2	6	866113	866118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632884
19110	NC_011959	GCT	2	6	866139	866144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632884
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19112	NC_011959	TCG	2	6	866159	866164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632884
19113	NC_011959	CT	3	6	866175	866180	0 %	50 %	0 %	50 %	221632884
19114	NC_011959	TCA	2	6	866259	866264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632884
19115	NC_011959	ATCG	2	8	866275	866282	25 %	25 %	25 %	25 %	221632884
19116	NC_011959	CG	3	6	866281	866286	0 %	0 %	50 %	50 %	221632884
19117	NC_011959	GCTC	2	8	866313	866320	0 %	25 %	25 %	50 %	221632884
19118	NC_011959	GA	3	6	866333	866338	50 %	0 %	50 %	0 %	221632884
19119	NC_011959	CCA	2	6	866407	866412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632884
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19121	NC_011959	CGC	2	6	866436	866441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632884
19122	NC_011959	GAA	2	6	866635	866640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632884
19123	NC_011959	CCA	2	6	866646	866651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632884
19124	NC_011959	GCA	2	6	866737	866742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632884
19125	NC_011959	GC	3	6	866765	866770	0 %	0 %	50 %	50 %	221632884
19126	NC_011959	TCG	2	6	866792	866797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632884
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19152	NC_011959	TGA	2	6	868019	868024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632885
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19159	NC_011959	CT	3	6	868375	868380	0 %	50 %	0 %	50 %	221632886
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19227	NC_011959	CTG	2	6	871230	871235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19238	NC_011959	TCA	2	6	871675	871680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632889
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19359	NC_011959	CAGC	2	8	876585	876592	25 %	0 %	25 %	50 %	221632894
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19483	NC_011959	AG	3	6	882954	882959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19484	NC_011959	CCA	2	6	882988	882993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19485	NC_011959	GAG	2	6	883026	883031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19486	NC_011959	GAG	2	6	883038	883043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632901
19487	NC_011959	GAT	2	6	883062	883067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632901
19488	NC_011959	CGT	2	6	883072	883077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632901
19489	NC_011959	TTC	2	6	883081	883086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632901
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