MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_011959	GTC	2	6	836422	836427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18502	NC_011959	CT	3	6	836456	836461	0 %	50 %	0 %	50 %	221632859
18503	NC_011959	CGA	2	6	836553	836558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18504	NC_011959	TCT	3	9	836616	836624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632859
18505	NC_011959	GGT	2	6	836634	836639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632859
18506	NC_011959	GAG	2	6	836662	836667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632859
18507	NC_011959	TCG	2	6	836675	836680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18508	NC_011959	GTT	2	6	836734	836739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632859
18509	NC_011959	TGG	2	6	836810	836815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632859
18510	NC_011959	TCGC	2	8	836840	836847	0 %	25 %	25 %	50 %	221632859
18511	NC_011959	TCG	2	6	836918	836923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18512	NC_011959	GAG	2	6	837028	837033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632859
18513	NC_011959	CTTCG	2	10	837067	837076	0 %	40 %	20 %	40 %	221632859
18514	NC_011959	TCG	2	6	837097	837102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18515	NC_011959	TGGC	2	8	837259	837266	0 %	25 %	50 %	25 %	221632859
18516	NC_011959	TGCCGA	2	12	837390	837401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18517	NC_011959	GATC	2	8	837495	837502	25 %	25 %	25 %	25 %	221632859
18518	NC_011959	GAA	2	6	837526	837531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632859
18519	NC_011959	CAT	2	6	837550	837555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632859
18520	NC_011959	TCG	2	6	837635	837640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18521	NC_011959	CGC	2	6	837682	837687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632859
18522	NC_011959	GTC	2	6	837955	837960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632859
18523	NC_011959	GTG	2	6	838051	838056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_011959	AGC	2	6	838057	838062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18525	NC_011959	TCA	2	6	838075	838080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632860
18526	NC_011959	TCC	2	6	838115	838120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632860
18527	NC_011959	CTC	2	6	838141	838146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632860
18528	NC_011959	CAGG	2	8	838155	838162	25 %	0 %	50 %	25 %	221632860
18529	NC_011959	GTCC	2	8	838188	838195	0 %	25 %	25 %	50 %	221632860
18530	NC_011959	ACC	2	6	838196	838201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632860
18531	NC_011959	AC	3	6	838485	838490	50 %	0 %	0 %	50 %	221632860
18532	NC_011959	GAA	2	6	838522	838527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632860
18533	NC_011959	GA	3	6	838665	838670	50 %	0 %	50 %	0 %	221632860
18534	NC_011959	GCG	2	6	838671	838676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632860
18535	NC_011959	TCG	2	6	838698	838703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632860
18536	NC_011959	GCC	2	6	838730	838735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632860
18537	NC_011959	TTC	2	6	838756	838761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632860
18538	NC_011959	GGTA	2	8	838830	838837	25 %	25 %	50 %	0 %	221632860
18539	NC_011959	TCA	2	6	838842	838847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632860
18540	NC_011959	GCTGCG	2	12	838892	838903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632860
18541	NC_011959	CGAT	2	8	838946	838953	25 %	25 %	25 %	25 %	221632860
18542	NC_011959	CTC	2	6	838974	838979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18543	NC_011959	CAC	2	6	839048	839053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18544	NC_011959	CCA	2	6	839294	839299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18545	NC_011959	CGA	2	6	839315	839320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18546	NC_011959	CGAA	2	8	839322	839329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18547	NC_011959	ATCG	3	12	839394	839405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18548	NC_011959	ATG	2	6	839437	839442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_011959	AGG	2	6	839491	839496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_011959	GGT	2	6	839504	839509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_011959	TCA	2	6	839515	839520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18552	NC_011959	TCG	2	6	839531	839536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18553	NC_011959	AGT	2	6	839595	839600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632861
18554	NC_011959	GAT	2	6	839603	839608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632861
18555	NC_011959	CGA	2	6	839634	839639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632861
18556	NC_011959	AGCG	2	8	839647	839654	25 %	0 %	50 %	25 %	221632861
18557	NC_011959	TCGG	2	8	839727	839734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18558	NC_011959	CGA	2	6	839796	839801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18559	NC_011959	TGC	2	6	839841	839846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18560	NC_011959	GGC	2	6	839850	839855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_011959	CGG	2	6	840099	840104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18562	NC_011959	CTC	2	6	840185	840190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18563	NC_011959	CTT	2	6	840210	840215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18564	NC_011959	ATC	2	6	840231	840236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18565	NC_011959	GC	4	8	840260	840267	0 %	0 %	50 %	50 %	221632862
18566	NC_011959	TCGC	2	8	840288	840295	0 %	25 %	25 %	50 %	221632862
18567	NC_011959	TCT	2	6	840312	840317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632862
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18569	NC_011959	CCA	2	6	840370	840375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632862
18570	NC_011959	CG	3	6	840444	840449	0 %	0 %	50 %	50 %	221632862
18571	NC_011959	CAC	2	6	840472	840477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632862
18572	NC_011959	TTCG	2	8	840522	840529	0 %	50 %	25 %	25 %	221632862
18573	NC_011959	TCT	2	6	840533	840538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632862
18574	NC_011959	CGA	2	6	840539	840544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632862
18575	NC_011959	TCG	2	6	840596	840601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632862
18576	NC_011959	ATCGT	2	10	840637	840646	20 %	40 %	20 %	20 %	221632862
18577	NC_011959	GTT	2	6	840672	840677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632862
18578	NC_011959	TCG	2	6	840681	840686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632862
18579	NC_011959	AAG	2	6	840707	840712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632862
18580	NC_011959	GCGTTC	2	12	840715	840726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632862
18581	NC_011959	CGTTT	2	10	840770	840779	0 %	60 %	20 %	20 %	221632862
18582	NC_011959	CG	3	6	840941	840946	0 %	0 %	50 %	50 %	221632862
18583	NC_011959	CTG	2	6	840981	840986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632862
18584	NC_011959	CGCT	2	8	841067	841074	0 %	25 %	25 %	50 %	221632862
18585	NC_011959	CT	3	6	841073	841078	0 %	50 %	0 %	50 %	221632862
18586	NC_011959	CGC	2	6	841093	841098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632862
18587	NC_011959	CTC	2	6	841102	841107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632862
18588	NC_011959	GTC	2	6	841283	841288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18589	NC_011959	GACGA	2	10	841415	841424	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18590	NC_011959	CGAG	2	8	841430	841437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18591	NC_011959	CCTC	2	8	841546	841553	0 %	25 %	0 %	75 %	221632863
18592	NC_011959	GAA	2	6	841554	841559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632863
18593	NC_011959	CG	3	6	841571	841576	0 %	0 %	50 %	50 %	221632863
18594	NC_011959	CATCCA	2	12	841623	841634	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	221632863
18595	NC_011959	GAT	2	6	841713	841718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632863
18596	NC_011959	GCACG	2	10	841806	841815	20 %	0 %	40 %	40 %	221632863
18597	NC_011959	AC	3	6	841893	841898	50 %	0 %	0 %	50 %	221632863
18598	NC_011959	CGGT	2	8	841912	841919	0 %	25 %	50 %	25 %	221632863
18599	NC_011959	GGTC	2	8	841922	841929	0 %	25 %	50 %	25 %	221632863
18600	NC_011959	GATC	2	8	841958	841965	25 %	25 %	25 %	25 %	221632863
18601	NC_011959	GCC	2	6	841966	841971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632863
18602	NC_011959	ACG	2	6	841997	842002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632863
18603	NC_011959	CG	4	8	842028	842035	0 %	0 %	50 %	50 %	221632863
18604	NC_011959	CGG	2	6	842049	842054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632863
18605	NC_011959	TAG	2	6	842263	842268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632863
18606	NC_011959	GGA	2	6	842288	842293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632863
18607	NC_011959	TCC	2	6	842314	842319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632863
18608	NC_011959	TCAC	2	8	842332	842339	25 %	25 %	0 %	50 %	221632863
18609	NC_011959	AGC	2	6	842345	842350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632863
18610	NC_011959	GCT	3	9	842358	842366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632863
18611	NC_011959	TTC	2	6	842377	842382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632863
18612	NC_011959	CCA	2	6	842407	842412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632863
18613	NC_011959	GATC	2	8	842429	842436	25 %	25 %	25 %	25 %	221632863
18614	NC_011959	CCA	2	6	842488	842493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632863
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18616	NC_011959	CG	3	6	842581	842586	0 %	0 %	50 %	50 %	221632863
18617	NC_011959	AGC	2	6	842614	842619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632863
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18620	NC_011959	CTCC	2	8	842708	842715	0 %	25 %	0 %	75 %	221632863
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18622	NC_011959	GAG	2	6	842843	842848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18743	NC_011959	CT	3	6	848547	848552	0 %	50 %	0 %	50 %	221632870
18744	NC_011959	CTC	2	6	848592	848597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632870
18745	NC_011959	TGA	2	6	848627	848632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632870
18746	NC_011959	ACC	3	9	848665	848673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632870
18747	NC_011959	CGCA	2	8	848703	848710	25 %	0 %	25 %	50 %	221632870
18748	NC_011959	GCG	2	6	848722	848727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632870
18749	NC_011959	TTCG	2	8	848729	848736	0 %	50 %	25 %	25 %	221632870
18750	NC_011959	GC	4	8	848775	848782	0 %	0 %	50 %	50 %	221632870
18751	NC_011959	CGT	2	6	848807	848812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632870
18752	NC_011959	AC	3	6	848816	848821	50 %	0 %	0 %	50 %	221632870
18753	NC_011959	CTG	2	6	848879	848884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632870
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18757	NC_011959	CGAC	2	8	849198	849205	25 %	0 %	25 %	50 %	221632871
18758	NC_011959	GCT	2	6	849277	849282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632871
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18763	NC_011959	CGC	2	6	849621	849626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632871
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18779	NC_011959	CGGCGT	2	12	850119	850130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632872
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18982	NC_011959	AGT	2	6	859604	859609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632878
18983	NC_011959	TCC	2	6	859635	859640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18984	NC_011959	CA	3	6	859663	859668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18985	NC_011959	AGC	2	6	859701	859706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632879
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18989	NC_011959	CG	3	6	859793	859798	0 %	0 %	50 %	50 %	221632879
18990	NC_011959	CCAC	2	8	859811	859818	25 %	0 %	0 %	75 %	221632879
18991	NC_011959	CCA	2	6	859825	859830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632879
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