MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011959	TCCC	2	8	813213	813220	0 %	25 %	0 %	75 %	221632838
18002	NC_011959	CAC	2	6	813230	813235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632838
18003	NC_011959	CGC	2	6	813271	813276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632838
18004	NC_011959	TGC	2	6	813303	813308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18005	NC_011959	CCA	2	6	813331	813336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632838
18006	NC_011959	GT	3	6	813366	813371	0 %	50 %	50 %	0 %	221632838
18007	NC_011959	CCGT	2	8	813385	813392	0 %	25 %	25 %	50 %	221632838
18008	NC_011959	CTTC	2	8	813464	813471	0 %	50 %	0 %	50 %	221632838
18009	NC_011959	CCTC	2	8	813505	813512	0 %	25 %	0 %	75 %	221632838
18010	NC_011959	TCG	2	6	813544	813549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18011	NC_011959	CGAG	2	8	813626	813633	25 %	0 %	50 %	25 %	221632838
18012	NC_011959	GGA	2	6	813653	813658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632838
18013	NC_011959	TCG	2	6	813679	813684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18014	NC_011959	CGT	2	6	813687	813692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18015	NC_011959	CTC	2	6	813725	813730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632838
18016	NC_011959	TGG	2	6	813742	813747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632838
18017	NC_011959	CGC	2	6	813763	813768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632838
18018	NC_011959	GAC	2	6	813801	813806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18019	NC_011959	ACC	2	6	813828	813833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632838
18020	NC_011959	ACC	4	12	813846	813857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632838
18021	NC_011959	TCC	2	6	813864	813869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632838
18022	NC_011959	GTC	2	6	813880	813885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18023	NC_011959	ATG	2	6	813886	813891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632838
18024	NC_011959	TGGA	2	8	813918	813925	25 %	25 %	50 %	0 %	221632838
18025	NC_011959	CGATC	2	10	813992	814001	20 %	20 %	20 %	40 %	221632838
18026	NC_011959	TCG	2	6	814021	814026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18027	NC_011959	TGT	2	6	814031	814036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632838
18028	NC_011959	CGA	2	6	814037	814042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18029	NC_011959	AGATG	2	10	814049	814058	40 %	20 %	40 %	0 %	221632838
18030	NC_011959	GCG	2	6	814101	814106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632838
18031	NC_011959	GTC	2	6	814159	814164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18032	NC_011959	TCG	2	6	814175	814180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632838
18033	NC_011959	CCG	2	6	814309	814314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632839
18034	NC_011959	GAC	2	6	814361	814366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632839
18035	NC_011959	CGC	2	6	814373	814378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632839
18036	NC_011959	GAA	2	6	814481	814486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632839
18037	NC_011959	A	6	6	814498	814503	100 %	0 %	0 %	0 %	221632839
18038	NC_011959	GCG	2	6	814614	814619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632839
18039	NC_011959	TCG	2	6	814688	814693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632839
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18041	NC_011959	ACC	2	6	814776	814781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632839
18042	NC_011959	GAA	2	6	814807	814812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632839
18043	NC_011959	TGT	2	6	814837	814842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632839
18044	NC_011959	CCA	2	6	814858	814863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632839
18045	NC_011959	GAC	2	6	814889	814894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632839
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18048	NC_011959	ACGG	2	8	815056	815063	25 %	0 %	50 %	25 %	221632839
18049	NC_011959	GAGC	2	8	815126	815133	25 %	0 %	50 %	25 %	221632839
18050	NC_011959	CTC	2	6	815154	815159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632839
18051	NC_011959	AGT	2	6	815209	815214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632840
18052	NC_011959	GGT	2	6	815316	815321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632840
18053	NC_011959	GTC	2	6	815337	815342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632840
18054	NC_011959	C	6	6	815393	815398	0 %	0 %	0 %	100 %	221632840
18055	NC_011959	CGG	2	6	815406	815411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632840
18056	NC_011959	GCC	2	6	815416	815421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632840
18057	NC_011959	TCG	2	6	815462	815467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632840
18058	NC_011959	CTC	2	6	815471	815476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632840
18059	NC_011959	AGGC	2	8	815477	815484	25 %	0 %	50 %	25 %	221632840
18060	NC_011959	ACG	2	6	815529	815534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632840
18061	NC_011959	TCCCG	2	10	815604	815613	0 %	20 %	20 %	60 %	221632841
18062	NC_011959	CCG	2	6	815615	815620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632841
18063	NC_011959	CCA	2	6	815668	815673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632841
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18065	NC_011959	ACG	3	9	815692	815700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632841
18066	NC_011959	GTGCG	2	10	815739	815748	0 %	20 %	60 %	20 %	221632841
18067	NC_011959	GC	3	6	815802	815807	0 %	0 %	50 %	50 %	221632841
18068	NC_011959	CGAC	2	8	815828	815835	25 %	0 %	25 %	50 %	221632841
18069	NC_011959	CG	3	6	815894	815899	0 %	0 %	50 %	50 %	221632841
18070	NC_011959	TCC	2	6	816160	816165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632841
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18073	NC_011959	AGC	2	6	816357	816362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632841
18074	NC_011959	GTAC	2	8	816395	816402	25 %	25 %	25 %	25 %	221632841
18075	NC_011959	CGTC	2	8	816436	816443	0 %	25 %	25 %	50 %	221632841
18076	NC_011959	CTG	2	6	816488	816493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632841
18077	NC_011959	CAAGC	2	10	816692	816701	40 %	0 %	20 %	40 %	221632841
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18083	NC_011959	GCGA	2	8	817071	817078	25 %	0 %	50 %	25 %	221632841
18084	NC_011959	CGA	2	6	817124	817129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632841
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18086	NC_011959	TGC	3	9	817212	817220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632841
18087	NC_011959	GAC	2	6	817224	817229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632841
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18090	NC_011959	AGGGT	2	10	817331	817340	20 %	20 %	60 %	0 %	221632842
18091	NC_011959	AGC	2	6	817357	817362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632842
18092	NC_011959	AAT	2	6	817380	817385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632842
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18095	NC_011959	CGA	2	6	817499	817504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632842
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18101	NC_011959	TGC	2	6	817797	817802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632842
18102	NC_011959	ACG	2	6	817864	817869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632842
18103	NC_011959	ACG	2	6	817894	817899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632842
18104	NC_011959	GTC	2	6	817974	817979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632842
18105	NC_011959	GCTG	2	8	818282	818289	0 %	25 %	50 %	25 %	221632842
18106	NC_011959	CGA	2	6	818318	818323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632842
18107	NC_011959	GGA	2	6	818327	818332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632842
18108	NC_011959	TGA	2	6	818393	818398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632842
18109	NC_011959	CG	3	6	818449	818454	0 %	0 %	50 %	50 %	221632842
18110	NC_011959	CAG	2	6	818466	818471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632842
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18115	NC_011959	GGTC	2	8	818621	818628	0 %	25 %	50 %	25 %	221632843
18116	NC_011959	GCT	2	6	818716	818721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632843
18117	NC_011959	TTC	3	9	818769	818777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632843
18118	NC_011959	CA	3	6	818785	818790	50 %	0 %	0 %	50 %	221632843
18119	NC_011959	AGC	2	6	818812	818817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632843
18120	NC_011959	GAT	2	6	818874	818879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632843
18121	NC_011959	GC	3	6	818914	818919	0 %	0 %	50 %	50 %	221632843
18122	NC_011959	GCCG	2	8	818976	818983	0 %	0 %	50 %	50 %	221632843
18123	NC_011959	GCT	2	6	818989	818994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632843
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18238	NC_011959	TAT	2	6	823730	823735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221632847
18239	NC_011959	GAC	2	6	823879	823884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632847
18240	NC_011959	GA	3	6	824048	824053	50 %	0 %	50 %	0 %	221632848
18241	NC_011959	GCC	2	6	824075	824080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632848
18242	NC_011959	GTT	2	6	824089	824094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632848
18243	NC_011959	TCG	2	6	824132	824137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
18244	NC_011959	CGC	2	6	824226	824231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632848
18245	NC_011959	CTA	2	6	824232	824237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632848
18246	NC_011959	GCTC	2	8	824277	824284	0 %	25 %	25 %	50 %	221632848
18247	NC_011959	C	6	6	824291	824296	0 %	0 %	0 %	100 %	221632848
18248	NC_011959	GCTGT	2	10	824408	824417	0 %	40 %	40 %	20 %	221632848
18249	NC_011959	TC	3	6	824423	824428	0 %	50 %	0 %	50 %	221632848
18250	NC_011959	TCG	2	6	824447	824452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
18251	NC_011959	CTC	2	6	824503	824508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632848
18252	NC_011959	GA	3	6	824525	824530	50 %	0 %	50 %	0 %	221632848
18253	NC_011959	ATC	2	6	824551	824556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632848
18254	NC_011959	GGT	2	6	824603	824608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632848
18255	NC_011959	GTC	2	6	824638	824643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
18256	NC_011959	ATCGC	2	10	824653	824662	20 %	20 %	20 %	40 %	221632848
18257	NC_011959	ATCG	2	8	824680	824687	25 %	25 %	25 %	25 %	221632848
18258	NC_011959	AGC	2	6	824739	824744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632848
18259	NC_011959	GC	4	8	824761	824768	0 %	0 %	50 %	50 %	221632848
18260	NC_011959	CTG	2	6	824824	824829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
18261	NC_011959	TCT	2	6	824886	824891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632848
18262	NC_011959	CTC	2	6	824935	824940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632848
18263	NC_011959	ACT	2	6	825003	825008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632848
18264	NC_011959	CG	3	6	825085	825090	0 %	0 %	50 %	50 %	221632849
18265	NC_011959	TCC	2	6	825153	825158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632849
18266	NC_011959	TCT	2	6	825174	825179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632849
18267	NC_011959	GTC	2	6	825288	825293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18268	NC_011959	TCC	2	6	825361	825366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632849
18269	NC_011959	TCGTT	2	10	825394	825403	0 %	60 %	20 %	20 %	221632849
18270	NC_011959	TGC	2	6	825427	825432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18271	NC_011959	TCA	2	6	825448	825453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632849
18272	NC_011959	ACA	2	6	825470	825475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632849
18273	NC_011959	TCT	2	6	825479	825484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632849
18274	NC_011959	CACC	2	8	825555	825562	25 %	0 %	0 %	75 %	221632849
18275	NC_011959	ACA	2	6	825563	825568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632849
18276	NC_011959	AG	3	6	825600	825605	50 %	0 %	50 %	0 %	221632849
18277	NC_011959	CGGT	2	8	825619	825626	0 %	25 %	50 %	25 %	221632849
18278	NC_011959	CGC	2	6	825677	825682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632849
18279	NC_011959	TCG	2	6	825712	825717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18280	NC_011959	CTGG	2	8	825724	825731	0 %	25 %	50 %	25 %	221632849
18281	NC_011959	GC	3	6	825749	825754	0 %	0 %	50 %	50 %	221632849
18282	NC_011959	CAG	2	6	825768	825773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632849
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18284	NC_011959	GCT	2	6	825819	825824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18285	NC_011959	TGC	2	6	825833	825838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18286	NC_011959	GCG	2	6	825904	825909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632849
18287	NC_011959	CGAC	2	8	825922	825929	25 %	0 %	25 %	50 %	221632849
18288	NC_011959	GCA	2	6	825960	825965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18289	NC_011959	GCG	2	6	825979	825984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632849
18290	NC_011959	CCT	2	6	826016	826021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632849
18291	NC_011959	ACG	2	6	826029	826034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18292	NC_011959	GCA	2	6	826049	826054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18293	NC_011959	CAA	2	6	826065	826070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632849
18294	NC_011959	AGC	2	6	826102	826107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632849
18295	NC_011959	AGGC	2	8	826178	826185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18296	NC_011959	GACCAT	2	12	826212	826223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221632850
18297	NC_011959	GCT	2	6	826245	826250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632850
18298	NC_011959	GCT	2	6	826309	826314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632850
18299	NC_011959	CGC	2	6	826428	826433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632850
18300	NC_011959	TCG	2	6	826538	826543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632850
18301	NC_011959	ACC	2	6	826594	826599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632850
18302	NC_011959	TCC	2	6	826616	826621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632850
18303	NC_011959	TCC	2	6	826628	826633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632850
18304	NC_011959	CAC	2	6	826653	826658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632850
18305	NC_011959	GCCA	2	8	826683	826690	25 %	0 %	25 %	50 %	221632850
18306	NC_011959	CCAG	2	8	826729	826736	25 %	0 %	25 %	50 %	221632850
18307	NC_011959	TTCGC	2	10	826820	826829	0 %	40 %	20 %	40 %	221632850
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18310	NC_011959	GCT	2	6	826912	826917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632850
18311	NC_011959	CT	3	6	826965	826970	0 %	50 %	0 %	50 %	221632850
18312	NC_011959	CGA	2	6	826971	826976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632850
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18321	NC_011959	CGG	2	6	827298	827303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632850
18322	NC_011959	CTT	2	6	827310	827315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632850
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18326	NC_011959	CGA	2	6	827551	827556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632850
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18328	NC_011959	GCT	2	6	827703	827708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632850
18329	NC_011959	TCG	2	6	827774	827779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632850
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18331	NC_011959	TGC	2	6	827923	827928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632851
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18335	NC_011959	GCGA	2	8	828351	828358	25 %	0 %	50 %	25 %	221632851
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18338	NC_011959	TCG	2	6	828570	828575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632851
18339	NC_011959	GCT	2	6	828617	828622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632851
18340	NC_011959	CAG	2	6	828633	828638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632851
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18342	NC_011959	GCG	2	6	828803	828808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632851
18343	NC_011959	GCGA	2	8	828838	828845	25 %	0 %	50 %	25 %	221632851
18344	NC_011959	GTGG	2	8	828878	828885	0 %	25 %	75 %	0 %	221632851
18345	NC_011959	GAT	2	6	828906	828911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632851
18346	NC_011959	CAT	2	6	828912	828917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632851
18347	NC_011959	CAA	2	6	828921	828926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632851
18348	NC_011959	GC	3	6	828976	828981	0 %	0 %	50 %	50 %	221632852
18349	NC_011959	ACCA	2	8	829204	829211	50 %	0 %	0 %	50 %	221632852
18350	NC_011959	GAG	2	6	829267	829272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632852
18351	NC_011959	ATCG	2	8	829345	829352	25 %	25 %	25 %	25 %	221632852
18352	NC_011959	GCG	2	6	829400	829405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632852
18353	NC_011959	CCA	2	6	829433	829438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632852
18354	NC_011959	GC	3	6	829546	829551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18355	NC_011959	GGC	2	6	829612	829617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18356	NC_011959	CTCG	2	8	829646	829653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18357	NC_011959	CGA	2	6	829670	829675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18358	NC_011959	CGA	2	6	829828	829833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632853
18359	NC_011959	GGC	2	6	829838	829843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632853
18360	NC_011959	TTTC	2	8	829859	829866	0 %	75 %	0 %	25 %	221632853
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18385	NC_011959	CTTCC	2	10	831196	831205	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18386	NC_011959	CGA	2	6	831218	831223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18387	NC_011959	GAT	2	6	831252	831257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18391	NC_011959	TCG	2	6	831341	831346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632856
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18423	NC_011959	CAT	2	6	832950	832955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632857
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18478	NC_011959	AGG	2	6	835605	835610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632858
18479	NC_011959	GAC	2	6	835616	835621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632858
18480	NC_011959	GAA	2	6	835631	835636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632858
18481	NC_011959	GAG	2	6	835689	835694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632858
18482	NC_011959	TGT	2	6	835711	835716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632858
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