MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011959	GCT	2	6	719919	719924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
16002	NC_011959	GAGC	2	8	719958	719965	25 %	0 %	50 %	25 %	221632736
16003	NC_011959	GTC	2	6	719988	719993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
16004	NC_011959	GC	3	6	719995	720000	0 %	0 %	50 %	50 %	221632736
16005	NC_011959	CTCG	2	8	720014	720021	0 %	25 %	25 %	50 %	221632736
16006	NC_011959	CGA	2	6	720030	720035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632736
16007	NC_011959	GCGAT	2	10	720052	720061	20 %	20 %	40 %	20 %	221632736
16008	NC_011959	GTC	2	6	720072	720077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
16009	NC_011959	GAT	2	6	720107	720112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632736
16010	NC_011959	G	6	6	720145	720150	0 %	0 %	100 %	0 %	221632736
16011	NC_011959	GTC	2	6	720165	720170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
16012	NC_011959	CGA	2	6	720254	720259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632736
16013	NC_011959	GGC	3	9	720266	720274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632736
16014	NC_011959	CTG	2	6	720319	720324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632737
16015	NC_011959	GGTC	2	8	720332	720339	0 %	25 %	50 %	25 %	221632737
16016	NC_011959	CGC	2	6	720343	720348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632737
16017	NC_011959	GAG	2	6	720372	720377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632737
16018	NC_011959	GTG	2	6	720383	720388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632737
16019	NC_011959	CGAC	2	8	720392	720399	25 %	0 %	25 %	50 %	221632737
16020	NC_011959	CGAT	2	8	720400	720407	25 %	25 %	25 %	25 %	221632737
16021	NC_011959	CG	3	6	720408	720413	0 %	0 %	50 %	50 %	221632737
16022	NC_011959	CTG	2	6	720425	720430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_011959	CGAG	2	8	720465	720472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16024	NC_011959	GTT	2	6	720560	720565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_011959	CCGG	2	8	720605	720612	0 %	0 %	50 %	50 %	221632738
16026	NC_011959	GTA	2	6	720614	720619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632738
16027	NC_011959	GGC	2	6	720656	720661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632738
16028	NC_011959	TCG	2	6	720699	720704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16029	NC_011959	CAC	2	6	720718	720723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632738
16030	NC_011959	GCA	2	6	720737	720742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16031	NC_011959	GCG	2	6	720752	720757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632738
16032	NC_011959	GAGCG	2	10	720879	720888	20 %	0 %	60 %	20 %	221632738
16033	NC_011959	CG	3	6	720887	720892	0 %	0 %	50 %	50 %	221632738
16034	NC_011959	A	7	7	720903	720909	100 %	0 %	0 %	0 %	221632738
16035	NC_011959	GTTCG	2	10	720938	720947	0 %	40 %	40 %	20 %	221632738
16036	NC_011959	CGT	2	6	720954	720959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16037	NC_011959	GGA	2	6	721027	721032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632738
16038	NC_011959	CTG	2	6	721044	721049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16039	NC_011959	GACG	2	8	721085	721092	25 %	0 %	50 %	25 %	221632738
16040	NC_011959	TGC	2	6	721126	721131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16041	NC_011959	GGA	2	6	721228	721233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632738
16042	NC_011959	AGC	2	6	721254	721259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16043	NC_011959	TCAC	2	8	721268	721275	25 %	25 %	0 %	50 %	221632738
16044	NC_011959	GA	3	6	721317	721322	50 %	0 %	50 %	0 %	221632738
16045	NC_011959	TGG	2	6	721326	721331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632738
16046	NC_011959	TGA	2	6	721384	721389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632738
16047	NC_011959	ACGGGA	2	12	721403	721414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221632738
16048	NC_011959	CG	3	6	721429	721434	0 %	0 %	50 %	50 %	221632738
16049	NC_011959	CGG	2	6	721446	721451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632738
16050	NC_011959	AGC	2	6	721462	721467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16051	NC_011959	AGG	2	6	721470	721475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632738
16052	NC_011959	AGC	2	6	721477	721482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16053	NC_011959	GCA	2	6	721586	721591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16054	NC_011959	GCG	2	6	721636	721641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632738
16055	NC_011959	AGC	2	6	721645	721650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632738
16056	NC_011959	GTGG	2	8	721700	721707	0 %	25 %	75 %	0 %	221632738
16057	NC_011959	TGG	2	6	721733	721738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632738
16058	NC_011959	GGT	3	9	721774	721782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632738
16059	NC_011959	GAGT	2	8	721783	721790	25 %	25 %	50 %	0 %	221632738
16060	NC_011959	GAA	2	6	721791	721796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632738
16061	NC_011959	G	6	6	721827	721832	0 %	0 %	100 %	0 %	221632739
16062	NC_011959	CGG	2	6	721833	721838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632739
16063	NC_011959	CGA	2	6	721856	721861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632739
16064	NC_011959	GAT	2	6	721868	721873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632739
16065	NC_011959	TGG	2	6	721924	721929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632739
16066	NC_011959	TCG	3	9	721960	721968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632739
16067	NC_011959	CGC	2	6	722027	722032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632739
16068	NC_011959	CGAC	2	8	722051	722058	25 %	0 %	25 %	50 %	221632739
16069	NC_011959	TGAC	2	8	722110	722117	25 %	25 %	25 %	25 %	221632739
16070	NC_011959	GTCG	2	8	722124	722131	0 %	25 %	50 %	25 %	221632739
16071	NC_011959	GCC	3	9	722163	722171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632739
16072	NC_011959	CTC	2	6	722252	722257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632739
16073	NC_011959	GAGG	2	8	722269	722276	25 %	0 %	75 %	0 %	221632739
16074	NC_011959	TCG	2	6	722283	722288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632740
16075	NC_011959	CGC	2	6	722334	722339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632740
16076	NC_011959	CGG	2	6	722364	722369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632740
16077	NC_011959	GTG	2	6	722407	722412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632740
16078	NC_011959	TCG	2	6	722435	722440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632740
16079	NC_011959	TGG	2	6	722487	722492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632740
16080	NC_011959	CTT	2	6	722493	722498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632740
16081	NC_011959	CGT	2	6	722500	722505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632740
16082	NC_011959	ACG	2	6	722540	722545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632740
16083	NC_011959	TGC	2	6	722625	722630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632740
16084	NC_011959	ACTG	2	8	722682	722689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16085	NC_011959	GCG	2	6	722735	722740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632741
16086	NC_011959	CGA	2	6	722818	722823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632741
16087	NC_011959	AGT	2	6	722901	722906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632741
16088	NC_011959	GAT	2	6	722936	722941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632741
16089	NC_011959	GCGCC	2	10	722958	722967	0 %	0 %	40 %	60 %	221632741
16090	NC_011959	CTTT	2	8	723065	723072	0 %	75 %	0 %	25 %	221632741
16091	NC_011959	GAGC	2	8	723085	723092	25 %	0 %	50 %	25 %	221632741
16092	NC_011959	CCT	2	6	723128	723133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16093	NC_011959	GCT	2	6	723153	723158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_011959	GGA	2	6	723217	723222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_011959	GCG	2	6	723246	723251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_011959	TCG	2	6	723292	723297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632742
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16099	NC_011959	GCC	2	6	723450	723455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632743
16100	NC_011959	CGA	2	6	723605	723610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632743
16101	NC_011959	CGAC	2	8	723712	723719	25 %	0 %	25 %	50 %	221632743
16102	NC_011959	GAC	2	6	723738	723743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632743
16103	NC_011959	GGA	3	9	723779	723787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632743
16104	NC_011959	TCC	2	6	723792	723797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632743
16105	NC_011959	TGG	2	6	723878	723883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632743
16106	NC_011959	GCGA	2	8	723898	723905	25 %	0 %	50 %	25 %	221632743
16107	NC_011959	GAG	2	6	723981	723986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632743
16108	NC_011959	GTG	2	6	724051	724056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632743
16109	NC_011959	TTGC	2	8	724059	724066	0 %	50 %	25 %	25 %	221632743
16110	NC_011959	CG	3	6	724071	724076	0 %	0 %	50 %	50 %	221632743
16111	NC_011959	AGC	2	6	724108	724113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632743
16112	NC_011959	GGGT	2	8	724121	724128	0 %	25 %	75 %	0 %	221632743
16113	NC_011959	CGA	2	6	724187	724192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632743
16114	NC_011959	GAG	2	6	724325	724330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632744
16115	NC_011959	GGA	2	6	724342	724347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632744
16116	NC_011959	CG	3	6	724367	724372	0 %	0 %	50 %	50 %	221632744
16117	NC_011959	GA	4	8	724378	724385	50 %	0 %	50 %	0 %	221632744
16118	NC_011959	GC	4	8	724398	724405	0 %	0 %	50 %	50 %	221632744
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16120	NC_011959	TGC	2	6	724448	724453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632744
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