MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011959	CGA	2	6	674673	674678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632695
15002	NC_011959	CCA	2	6	674706	674711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632695
15003	NC_011959	GGA	2	6	674716	674721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632695
15004	NC_011959	CGTGA	2	10	674734	674743	20 %	20 %	40 %	20 %	221632695
15005	NC_011959	CGA	2	6	674756	674761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_011959	GGAC	2	8	674822	674829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15007	NC_011959	GAG	2	6	674890	674895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_011959	GAG	2	6	674932	674937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632696
15009	NC_011959	TCG	3	9	675018	675026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
15010	NC_011959	CAG	2	6	675037	675042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632696
15011	NC_011959	GTC	2	6	675055	675060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
15012	NC_011959	GCT	2	6	675082	675087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
15013	NC_011959	TCA	2	6	675107	675112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632696
15014	NC_011959	CCT	2	6	675117	675122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632696
15015	NC_011959	GCG	3	9	675166	675174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632696
15016	NC_011959	CG	3	6	675192	675197	0 %	0 %	50 %	50 %	221632696
15017	NC_011959	CTC	2	6	675229	675234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632696
15018	NC_011959	GTC	2	6	675239	675244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
15019	NC_011959	TGC	2	6	675252	675257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
15020	NC_011959	GCC	2	6	675282	675287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632696
15021	NC_011959	GAG	2	6	675292	675297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632696
15022	NC_011959	GGT	2	6	675309	675314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632696
15023	NC_011959	TCT	2	6	675375	675380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632696
15024	NC_011959	GAG	2	6	675418	675423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632696
15025	NC_011959	GGA	2	6	675468	675473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_011959	ATC	2	6	675511	675516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632697
15027	NC_011959	CCG	2	6	675590	675595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632697
15028	NC_011959	TGC	2	6	675630	675635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632697
15029	NC_011959	GCG	3	9	675643	675651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632697
15030	NC_011959	GAAGA	2	10	675661	675670	60 %	0 %	40 %	0 %	221632697
15031	NC_011959	CAA	2	6	675705	675710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632697
15032	NC_011959	GTG	2	6	675727	675732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632697
15033	NC_011959	AAG	2	6	675758	675763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632697
15034	NC_011959	AGC	2	6	675780	675785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632697
15035	NC_011959	CGA	2	6	675880	675885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_011959	GACT	2	8	676017	676024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15037	NC_011959	GTG	2	6	676064	676069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632698
15038	NC_011959	TCCGA	2	10	676087	676096	20 %	20 %	20 %	40 %	221632698
15039	NC_011959	GAC	2	6	676109	676114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632698
15040	NC_011959	ATC	2	6	676121	676126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632698
15041	NC_011959	CTCG	2	8	676153	676160	0 %	25 %	25 %	50 %	221632698
15042	NC_011959	ATG	2	6	676164	676169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632698
15043	NC_011959	AGCG	2	8	676334	676341	25 %	0 %	50 %	25 %	221632698
15044	NC_011959	AGG	2	6	676449	676454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632698
15045	NC_011959	TGAG	2	8	676554	676561	25 %	25 %	50 %	0 %	221632698
15046	NC_011959	CTTG	2	8	676636	676643	0 %	50 %	25 %	25 %	221632698
15047	NC_011959	AGC	2	6	676658	676663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632698
15048	NC_011959	TTC	2	6	676692	676697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_011959	TC	3	6	676742	676747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15050	NC_011959	GTTG	2	8	676779	676786	0 %	50 %	50 %	0 %	221632699
15051	NC_011959	CAC	2	6	676808	676813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632699
15052	NC_011959	G	6	6	676816	676821	0 %	0 %	100 %	0 %	221632699
15053	NC_011959	CGA	2	6	676903	676908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632699
15054	NC_011959	GCT	2	6	676933	676938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632699
15055	NC_011959	CACT	2	8	676957	676964	25 %	25 %	0 %	50 %	221632699
15056	NC_011959	GGT	2	6	676997	677002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632699
15057	NC_011959	CG	3	6	677010	677015	0 %	0 %	50 %	50 %	221632699
15058	NC_011959	CAC	2	6	677018	677023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632699
15059	NC_011959	GAAG	2	8	677115	677122	50 %	0 %	50 %	0 %	221632699
15060	NC_011959	ATCG	2	8	677180	677187	25 %	25 %	25 %	25 %	221632699
15061	NC_011959	GAC	2	6	677240	677245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632699
15062	NC_011959	GGA	2	6	677268	677273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632699
15063	NC_011959	CGA	2	6	677311	677316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632699
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15065	NC_011959	GAC	2	6	677366	677371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632699
15066	NC_011959	TCCG	2	8	677457	677464	0 %	25 %	25 %	50 %	221632699
15067	NC_011959	GGAGC	2	10	677476	677485	20 %	0 %	60 %	20 %	221632699
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15070	NC_011959	GAC	2	6	677840	677845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632699
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15073	NC_011959	AGCG	2	8	677957	677964	25 %	0 %	50 %	25 %	221632699
15074	NC_011959	GCGA	2	8	677969	677976	25 %	0 %	50 %	25 %	221632699
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15076	NC_011959	CGGT	2	8	678056	678063	0 %	25 %	50 %	25 %	221632700
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15091	NC_011959	GTT	2	6	678440	678445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632700
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15094	NC_011959	GCG	2	6	678654	678659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632700
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15099	NC_011959	GC	3	6	678950	678955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15100	NC_011959	CG	3	6	679057	679062	0 %	0 %	50 %	50 %	221632701
15101	NC_011959	TCG	2	6	679166	679171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632701
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15104	NC_011959	GCG	2	6	679262	679267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632701
15105	NC_011959	CGT	2	6	679294	679299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632701
15106	NC_011959	GCG	2	6	679313	679318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632701
15107	NC_011959	GTCG	2	8	679332	679339	0 %	25 %	50 %	25 %	221632701
15108	NC_011959	GC	4	8	679362	679369	0 %	0 %	50 %	50 %	221632701
15109	NC_011959	CTC	2	6	679398	679403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632701
15110	NC_011959	CGGC	2	8	679457	679464	0 %	0 %	50 %	50 %	221632701
15111	NC_011959	TGA	2	6	679479	679484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632701
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15113	NC_011959	GAA	2	6	679533	679538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632701
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15121	NC_011959	GATC	2	8	679947	679954	25 %	25 %	25 %	25 %	221632701
15122	NC_011959	CTG	2	6	679973	679978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632701
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15124	NC_011959	TCG	2	6	680009	680014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632701
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15150	NC_011959	TCG	2	6	680948	680953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632702
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15236	NC_011959	GC	3	6	684524	684529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15237	NC_011959	TCG	2	6	684573	684578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15481	NC_011959	TGG	2	6	696053	696058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632716
15482	NC_011959	GGCTG	2	10	696084	696093	0 %	20 %	60 %	20 %	221632716
15483	NC_011959	TCG	2	6	696263	696268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
15484	NC_011959	GCT	2	6	696277	696282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
15485	NC_011959	TCC	2	6	696314	696319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632716
15486	NC_011959	AGCG	2	8	696320	696327	25 %	0 %	50 %	25 %	221632716
15487	NC_011959	GCTC	2	8	696338	696345	0 %	25 %	25 %	50 %	221632716
15488	NC_011959	TCG	2	6	696425	696430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
15489	NC_011959	CG	3	6	696480	696485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15490	NC_011959	ATC	2	6	696505	696510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632717
15491	NC_011959	CGA	2	6	696544	696549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
15492	NC_011959	GAC	2	6	696554	696559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
15493	NC_011959	ATC	2	6	696564	696569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632717
15494	NC_011959	CGG	2	6	696586	696591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632717
15495	NC_011959	GCC	2	6	696630	696635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
15496	NC_011959	CCG	2	6	696657	696662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
15497	NC_011959	CTT	2	6	696683	696688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632717
15498	NC_011959	GTC	2	6	696714	696719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
15499	NC_011959	CGA	2	6	696730	696735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
15500	NC_011959	CCG	2	6	696768	696773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717

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