MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011959	AGCG	2	8	652815	652822	25 %	0 %	50 %	25 %	221632674
14502	NC_011959	TGG	2	6	652842	652847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632674
14503	NC_011959	CGT	2	6	652861	652866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14504	NC_011959	CTG	2	6	652868	652873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14505	NC_011959	CGG	2	6	652875	652880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
14506	NC_011959	AGC	2	6	652951	652956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14507	NC_011959	GCG	2	6	652996	653001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
14508	NC_011959	GAC	2	6	653006	653011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14509	NC_011959	GGC	2	6	653069	653074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
14510	NC_011959	TGA	2	6	653095	653100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632674
14511	NC_011959	CGA	2	6	653220	653225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632675
14512	NC_011959	CG	4	8	653228	653235	0 %	0 %	50 %	50 %	221632675
14513	NC_011959	AGA	2	6	653298	653303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632675
14514	NC_011959	CGT	2	6	653341	653346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632675
14515	NC_011959	TCC	2	6	653456	653461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632675
14516	NC_011959	AGCC	2	8	653534	653541	25 %	0 %	25 %	50 %	221632675
14517	NC_011959	GAGC	2	8	653579	653586	25 %	0 %	50 %	25 %	221632675
14518	NC_011959	CAG	2	6	653688	653693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632675
14519	NC_011959	GAA	2	6	653716	653721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632675
14520	NC_011959	TCG	2	6	653726	653731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632675
14521	NC_011959	TCG	2	6	653759	653764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632675
14522	NC_011959	GGCA	2	8	653932	653939	25 %	0 %	50 %	25 %	221632675
14523	NC_011959	AGGCG	2	10	654009	654018	20 %	0 %	60 %	20 %	221632675
14524	NC_011959	CGG	2	6	654075	654080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632675
14525	NC_011959	GACC	2	8	654087	654094	25 %	0 %	25 %	50 %	221632675
14526	NC_011959	CAG	2	6	654220	654225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632675
14527	NC_011959	GAG	2	6	654252	654257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632676
14528	NC_011959	GCT	2	6	654265	654270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14529	NC_011959	TCG	2	6	654280	654285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14530	NC_011959	CAT	2	6	654297	654302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632676
14531	NC_011959	CGC	2	6	654338	654343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632676
14532	NC_011959	GAC	2	6	654369	654374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14533	NC_011959	TCGGG	2	10	654412	654421	0 %	20 %	60 %	20 %	221632676
14534	NC_011959	ACGGCG	2	12	654454	654465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632676
14535	NC_011959	GCT	2	6	654502	654507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14536	NC_011959	CAA	2	6	654513	654518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632676
14537	NC_011959	GAG	2	6	654560	654565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632676
14538	NC_011959	GCT	2	6	654567	654572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14539	NC_011959	GAG	2	6	654594	654599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632676
14540	NC_011959	AGC	2	6	654625	654630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14541	NC_011959	CCG	2	6	654680	654685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632676
14542	NC_011959	GGC	3	9	654696	654704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632676
14543	NC_011959	ACG	2	6	654721	654726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14544	NC_011959	GCG	2	6	654778	654783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632676
14545	NC_011959	TCG	2	6	654838	654843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14546	NC_011959	CGC	2	6	654891	654896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632676
14547	NC_011959	GAT	2	6	654950	654955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632676
14548	NC_011959	CCA	2	6	655005	655010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632676
14549	NC_011959	ATC	2	6	655014	655019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632676
14550	NC_011959	GAC	2	6	655026	655031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14551	NC_011959	CGT	2	6	655048	655053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14552	NC_011959	ACG	2	6	655133	655138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14553	NC_011959	TCG	2	6	655150	655155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14554	NC_011959	CGA	2	6	655196	655201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
14555	NC_011959	GGT	2	6	655277	655282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632676
14556	NC_011959	CTGA	2	8	655451	655458	25 %	25 %	25 %	25 %	221632677
14557	NC_011959	TCG	2	6	655477	655482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14558	NC_011959	CGG	2	6	655526	655531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632677
14559	NC_011959	GAC	2	6	655538	655543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14560	NC_011959	AGC	2	6	655569	655574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14561	NC_011959	TCG	2	6	655579	655584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14562	NC_011959	CGGT	2	8	655600	655607	0 %	25 %	50 %	25 %	221632677
14563	NC_011959	GCA	2	6	655617	655622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14564	NC_011959	GGCC	2	8	655630	655637	0 %	0 %	50 %	50 %	221632677
14565	NC_011959	GCC	2	6	655680	655685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632677
14566	NC_011959	CAGTC	2	10	655708	655717	20 %	20 %	20 %	40 %	221632677
14567	NC_011959	CGTCG	2	10	655754	655763	0 %	20 %	40 %	40 %	221632677
14568	NC_011959	CGA	2	6	655780	655785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14569	NC_011959	TGC	2	6	655795	655800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14570	NC_011959	GGC	2	6	655845	655850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632677
14571	NC_011959	CCG	2	6	655890	655895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632677
14572	NC_011959	GGAT	2	8	655896	655903	25 %	25 %	50 %	0 %	221632677
14573	NC_011959	TGC	2	6	656012	656017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14574	NC_011959	GCCA	2	8	656089	656096	25 %	0 %	25 %	50 %	221632677
14575	NC_011959	AGC	2	6	656136	656141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
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14578	NC_011959	AGC	2	6	656291	656296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
14579	NC_011959	ATCG	2	8	656315	656322	25 %	25 %	25 %	25 %	221632677
14580	NC_011959	CGT	2	6	656336	656341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
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14583	NC_011959	GAC	2	6	656399	656404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
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14585	NC_011959	GCG	2	6	656481	656486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632678
14586	NC_011959	GAA	2	6	656618	656623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632678
14587	NC_011959	GAG	2	6	656654	656659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632678
14588	NC_011959	GAT	2	6	656690	656695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632678
14589	NC_011959	CGA	2	6	656734	656739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632678
14590	NC_011959	GAT	2	6	656801	656806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632678
14591	NC_011959	GAC	2	6	656928	656933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632679
14592	NC_011959	ATC	2	6	656951	656956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632679
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14594	NC_011959	ATC	2	6	657019	657024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632679
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14597	NC_011959	CGATA	2	10	657138	657147	40 %	20 %	20 %	20 %	221632679
14598	NC_011959	CG	3	6	657239	657244	0 %	0 %	50 %	50 %	221632679
14599	NC_011959	AACC	2	8	657257	657264	50 %	0 %	0 %	50 %	221632679
14600	NC_011959	CGC	2	6	657269	657274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632679
14601	NC_011959	GTC	2	6	657284	657289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632679
14602	NC_011959	CGT	2	6	657373	657378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632679
14603	NC_011959	CGA	2	6	657396	657401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632679
14604	NC_011959	TCGA	2	8	657403	657410	25 %	25 %	25 %	25 %	221632679
14605	NC_011959	GAT	2	6	657526	657531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632679
14606	NC_011959	CCG	2	6	657573	657578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632679
14607	NC_011959	GATG	2	8	657663	657670	25 %	25 %	50 %	0 %	221632679
14608	NC_011959	GT	3	6	657675	657680	0 %	50 %	50 %	0 %	221632679
14609	NC_011959	TCT	2	6	657681	657686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632679
14610	NC_011959	AGCG	2	8	657716	657723	25 %	0 %	50 %	25 %	221632679
14611	NC_011959	GCGA	2	8	657763	657770	25 %	0 %	50 %	25 %	221632679
14612	NC_011959	TTC	2	6	657838	657843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632679
14613	NC_011959	GAG	2	6	657853	657858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632679
14614	NC_011959	ATG	2	6	657872	657877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632679
14615	NC_011959	TCGC	2	8	657922	657929	0 %	25 %	25 %	50 %	221632679
14616	NC_011959	GAT	2	6	657985	657990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632679
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14618	NC_011959	TGG	2	6	658077	658082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632679
14619	NC_011959	GAC	2	6	658096	658101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632679
14620	NC_011959	GGC	2	6	658114	658119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632679
14621	NC_011959	TCG	2	6	658148	658153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632679
14622	NC_011959	GCC	2	6	658162	658167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632679
14623	NC_011959	CTC	2	6	658197	658202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14624	NC_011959	TGC	2	6	658226	658231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_011959	GC	3	6	658264	658269	0 %	0 %	50 %	50 %	221632680
14626	NC_011959	AGG	2	6	658360	658365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632680
14627	NC_011959	GGTC	2	8	658462	658469	0 %	25 %	50 %	25 %	221632680
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14629	NC_011959	CACCTC	2	12	658518	658529	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	221632680
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14632	NC_011959	GATGCG	2	12	658641	658652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632680
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14637	NC_011959	GTC	2	6	658906	658911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632680
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14642	NC_011959	GTCG	2	8	659025	659032	0 %	25 %	50 %	25 %	221632680
14643	NC_011959	GAA	2	6	659117	659122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632680
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14647	NC_011959	CG	3	6	659243	659248	0 %	0 %	50 %	50 %	221632680
14648	NC_011959	GTA	2	6	659265	659270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632680
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14654	NC_011959	TCG	2	6	659725	659730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632681
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14657	NC_011959	GAT	2	6	659789	659794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632681
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14664	NC_011959	CGAT	2	8	660123	660130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14665	NC_011959	GAT	2	6	660136	660141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14666	NC_011959	GCC	2	6	660161	660166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14694	NC_011959	ATCG	2	8	661293	661300	25 %	25 %	25 %	25 %	221632683
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14726	NC_011959	TCGA	2	8	662480	662487	25 %	25 %	25 %	25 %	221632684
14727	NC_011959	GTGG	2	8	662488	662495	0 %	25 %	75 %	0 %	221632684
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14730	NC_011959	GC	3	6	662610	662615	0 %	0 %	50 %	50 %	221632685
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14733	NC_011959	GCC	3	9	662844	662852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632685
14734	NC_011959	ACGA	2	8	662878	662885	50 %	0 %	25 %	25 %	221632685
14735	NC_011959	CG	3	6	662977	662982	0 %	0 %	50 %	50 %	221632685
14736	NC_011959	CGA	2	6	663069	663074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632685
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14738	NC_011959	TCG	2	6	663217	663222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632685
14739	NC_011959	CAA	2	6	663245	663250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632685
14740	NC_011959	GCT	2	6	663341	663346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632685
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14743	NC_011959	TCG	2	6	663518	663523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632685
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14769	NC_011959	CTCG	2	8	664335	664342	0 %	25 %	25 %	50 %	221632685
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14851	NC_011959	CGA	2	6	668098	668103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632687
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14855	NC_011959	TTCG	2	8	668243	668250	0 %	50 %	25 %	25 %	221632687
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14979	NC_011959	GCG	2	6	673783	673788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632694
14980	NC_011959	GGC	2	6	673803	673808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632694
14981	NC_011959	GGTC	2	8	673827	673834	0 %	25 %	50 %	25 %	221632694
14982	NC_011959	GA	3	6	673856	673861	50 %	0 %	50 %	0 %	221632694
14983	NC_011959	ACGC	2	8	673889	673896	25 %	0 %	25 %	50 %	221632694
14984	NC_011959	GC	3	6	673933	673938	0 %	0 %	50 %	50 %	221632694
14985	NC_011959	GAG	2	6	673976	673981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14986	NC_011959	TCG	2	6	674058	674063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632695
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14991	NC_011959	ACGGG	2	10	674217	674226	20 %	0 %	60 %	20 %	221632695
14992	NC_011959	CG	3	6	674235	674240	0 %	0 %	50 %	50 %	221632695
14993	NC_011959	GGTG	2	8	674254	674261	0 %	25 %	75 %	0 %	221632695
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15000	NC_011959	CG	3	6	674614	674619	0 %	0 %	50 %	50 %	221632695

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