MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011959	CG	3	6	44811	44816	0 %	0 %	50 %	50 %	221632074
1002	NC_011959	CCA	2	6	44888	44893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632074
1003	NC_011959	AGC	2	6	44962	44967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632075
1004	NC_011959	TCG	2	6	44989	44994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632075
1005	NC_011959	CGG	2	6	45001	45006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632075
1006	NC_011959	GTC	2	6	45021	45026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632075
1007	NC_011959	GTCGAG	2	12	45032	45043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632075
1008	NC_011959	CGT	2	6	45056	45061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632075
1009	NC_011959	GCG	2	6	45067	45072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632075
1010	NC_011959	CGA	2	6	45134	45139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632075
1011	NC_011959	GGT	2	6	45149	45154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632075
1012	NC_011959	GC	3	6	45199	45204	0 %	0 %	50 %	50 %	221632075
1013	NC_011959	CGC	2	6	45209	45214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632075
1014	NC_011959	GGC	2	6	45281	45286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632075
1015	NC_011959	CGG	2	6	45319	45324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632075
1016	NC_011959	CGGTCG	2	12	45328	45339	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632075
1017	NC_011959	ACC	2	6	45369	45374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632075
1018	NC_011959	GAA	2	6	45375	45380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632075
1019	NC_011959	GAG	2	6	45426	45431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632075
1020	NC_011959	CGT	2	6	45435	45440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632075
1021	NC_011959	GCGT	2	8	45468	45475	0 %	25 %	50 %	25 %	221632076
1022	NC_011959	GGA	2	6	45589	45594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632076
1023	NC_011959	GTC	3	9	45605	45613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632076
1024	NC_011959	CG	3	6	45632	45637	0 %	0 %	50 %	50 %	221632076
1025	NC_011959	AGG	2	6	45781	45786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632076
1026	NC_011959	AGCG	2	8	45827	45834	25 %	0 %	50 %	25 %	221632076
1027	NC_011959	CCA	2	6	45872	45877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632076
1028	NC_011959	CG	3	6	45903	45908	0 %	0 %	50 %	50 %	221632076
1029	NC_011959	TCC	2	6	45913	45918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632076
1030	NC_011959	CG	4	8	45925	45932	0 %	0 %	50 %	50 %	221632076
1031	NC_011959	CTC	2	6	46016	46021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632076
1032	NC_011959	GAGC	2	8	46022	46029	25 %	0 %	50 %	25 %	221632076
1033	NC_011959	GGC	2	6	46087	46092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632076
1034	NC_011959	CAC	2	6	46165	46170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632076
1035	NC_011959	CGT	2	6	46211	46216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632076
1036	NC_011959	CGT	2	6	46240	46245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011959	TGG	2	6	46251	46256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011959	GGA	2	6	46260	46265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011959	CG	3	6	46475	46480	0 %	0 %	50 %	50 %	221632077
1040	NC_011959	CGAGGG	2	12	46513	46524	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221632077
1041	NC_011959	CGC	2	6	46561	46566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632077
1042	NC_011959	GCGAG	2	10	46573	46582	20 %	0 %	60 %	20 %	221632077
1043	NC_011959	AGG	2	6	46755	46760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632077
1044	NC_011959	GC	3	6	46782	46787	0 %	0 %	50 %	50 %	221632077
1045	NC_011959	CAT	2	6	46828	46833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632077
1046	NC_011959	CGC	2	6	46841	46846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632077
1047	NC_011959	GCTGG	2	10	46914	46923	0 %	20 %	60 %	20 %	221632077
1048	NC_011959	AGCC	2	8	46928	46935	25 %	0 %	25 %	50 %	221632077
1049	NC_011959	GGC	2	6	46945	46950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632077
1050	NC_011959	CGA	2	6	46978	46983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632077
1051	NC_011959	GC	3	6	47015	47020	0 %	0 %	50 %	50 %	221632077
1052	NC_011959	CGAT	2	8	47048	47055	25 %	25 %	25 %	25 %	221632078
1053	NC_011959	GGA	2	6	47060	47065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632078
1054	NC_011959	CTG	2	6	47069	47074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1055	NC_011959	GTC	3	9	47075	47083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1056	NC_011959	CG	3	6	47101	47106	0 %	0 %	50 %	50 %	221632078
1057	NC_011959	GCG	2	6	47132	47137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632078
1058	NC_011959	AGCGC	2	10	47147	47156	20 %	0 %	40 %	40 %	221632078
1059	NC_011959	CGGTC	2	10	47158	47167	0 %	20 %	40 %	40 %	221632078
1060	NC_011959	TCG	2	6	47175	47180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1061	NC_011959	CGCC	2	8	47215	47222	0 %	0 %	25 %	75 %	221632078
1062	NC_011959	TCGC	2	8	47229	47236	0 %	25 %	25 %	50 %	221632078
1063	NC_011959	CGC	2	6	47380	47385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632078
1064	NC_011959	CGT	2	6	47390	47395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1065	NC_011959	TCG	2	6	47415	47420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1066	NC_011959	TCG	2	6	47445	47450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1067	NC_011959	CAC	2	6	47482	47487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632078
1068	NC_011959	GCGG	2	8	47491	47498	0 %	0 %	75 %	25 %	221632078
1069	NC_011959	GC	3	6	47506	47511	0 %	0 %	50 %	50 %	221632078
1070	NC_011959	AGGCG	2	10	47557	47566	20 %	0 %	60 %	20 %	221632078
1071	NC_011959	CGA	2	6	47571	47576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1072	NC_011959	GGA	2	6	47599	47604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632078
1073	NC_011959	TGG	2	6	47634	47639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632078
1074	NC_011959	GTG	2	6	47678	47683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632078
1075	NC_011959	GTC	2	6	47684	47689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1076	NC_011959	CGG	2	6	47704	47709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632078
1077	NC_011959	CTC	2	6	47747	47752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632078
1078	NC_011959	TCA	2	6	47922	47927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632078
1079	NC_011959	ACG	2	6	48025	48030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632078
1080	NC_011959	CGC	3	9	48096	48104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632079
1081	NC_011959	CGCT	2	8	48110	48117	0 %	25 %	25 %	50 %	221632079
1082	NC_011959	GCG	2	6	48149	48154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632079
1083	NC_011959	CCGA	2	8	48202	48209	25 %	0 %	25 %	50 %	221632079
1084	NC_011959	TCG	2	6	48257	48262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1085	NC_011959	AGC	2	6	48263	48268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1086	NC_011959	CGA	2	6	48285	48290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1087	NC_011959	GCCA	2	8	48329	48336	25 %	0 %	25 %	50 %	221632079
1088	NC_011959	CAG	2	6	48388	48393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1089	NC_011959	GGA	2	6	48450	48455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632079
1090	NC_011959	GTGC	2	8	48472	48479	0 %	25 %	50 %	25 %	221632079
1091	NC_011959	CTC	2	6	48538	48543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632079
1092	NC_011959	CTGGC	2	10	48554	48563	0 %	20 %	40 %	40 %	221632079
1093	NC_011959	GAG	2	6	48580	48585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632079
1094	NC_011959	TCG	2	6	48593	48598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1095	NC_011959	GCT	2	6	48606	48611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1096	NC_011959	GGA	2	6	48624	48629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632079
1097	NC_011959	CCG	2	6	48636	48641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632079
1098	NC_011959	GCC	2	6	48651	48656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632079
1099	NC_011959	CGGGA	2	10	48750	48759	20 %	0 %	60 %	20 %	221632079
1100	NC_011959	CTG	2	6	48763	48768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1101	NC_011959	AGC	2	6	48821	48826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1102	NC_011959	TCG	2	6	48863	48868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632079
1103	NC_011959	GGT	2	6	48895	48900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632079
1104	NC_011959	ACGG	2	8	48925	48932	25 %	0 %	50 %	25 %	221632079
1105	NC_011959	CGGC	2	8	48953	48960	0 %	0 %	50 %	50 %	221632079
1106	NC_011959	GGGA	2	8	48980	48987	25 %	0 %	75 %	0 %	221632079
1107	NC_011959	GAT	2	6	48999	49004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632079
1108	NC_011959	GCC	2	6	49018	49023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632079
1109	NC_011959	TTC	2	6	49147	49152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632079
1110	NC_011959	CCT	2	6	49167	49172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632079
1111	NC_011959	CGG	2	6	49184	49189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632079
1112	NC_011959	GA	3	6	49253	49258	50 %	0 %	50 %	0 %	221632079
1113	NC_011959	TCC	2	6	49259	49264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632079
1114	NC_011959	GGGA	2	8	49273	49280	25 %	0 %	75 %	0 %	221632079
1115	NC_011959	TTG	2	6	49297	49302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632079
1116	NC_011959	GTC	2	6	49376	49381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011959	TCG	2	6	49384	49389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011959	TGC	2	6	49434	49439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632080
1119	NC_011959	GCG	2	6	49484	49489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632080
1120	NC_011959	GTG	2	6	49499	49504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632080
1121	NC_011959	AGC	2	6	49597	49602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632080
1122	NC_011959	TCG	2	6	49629	49634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632080
1123	NC_011959	CGC	2	6	49680	49685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632080
1124	NC_011959	TGCTCG	2	12	49740	49751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632080
1125	NC_011959	CTG	2	6	49781	49786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632080
1126	NC_011959	GC	3	6	49826	49831	0 %	0 %	50 %	50 %	221632080
1127	NC_011959	GCTG	2	8	49861	49868	0 %	25 %	50 %	25 %	221632080
1128	NC_011959	CTC	2	6	49874	49879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632080
1129	NC_011959	GAA	2	6	49928	49933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632080
1130	NC_011959	CCG	2	6	49948	49953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632080
1131	NC_011959	GCC	2	6	49996	50001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632080
1132	NC_011959	AGCC	2	8	50049	50056	25 %	0 %	25 %	50 %	221632080
1133	NC_011959	CGG	2	6	50061	50066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632080
1134	NC_011959	TGC	2	6	50089	50094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632080
1135	NC_011959	GCG	2	6	50099	50104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632080
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1137	NC_011959	TCT	2	6	50244	50249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632080
1138	NC_011959	GCT	2	6	50300	50305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_011959	AGCG	2	8	50335	50342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_011959	TCCC	2	8	50365	50372	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1141	NC_011959	GAA	2	6	50490	50495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_011959	GCGA	2	8	50551	50558	25 %	0 %	50 %	25 %	221632081
1143	NC_011959	CGG	2	6	50568	50573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632081
1144	NC_011959	CTC	2	6	50585	50590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632081
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1146	NC_011959	GTCT	2	8	50651	50658	0 %	50 %	25 %	25 %	221632081
1147	NC_011959	GCGG	2	8	50661	50668	0 %	0 %	75 %	25 %	221632081
1148	NC_011959	GTA	2	6	50747	50752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632082
1149	NC_011959	GCG	2	6	50868	50873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632082
1150	NC_011959	GGC	2	6	50941	50946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632082
1151	NC_011959	CAC	2	6	50960	50965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632082
1152	NC_011959	CGA	2	6	50971	50976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632082
1153	NC_011959	GCCAGA	2	12	51016	51027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632082
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1155	NC_011959	CTC	2	6	51190	51195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1156	NC_011959	C	6	6	51195	51200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1157	NC_011959	CCA	2	6	51205	51210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1158	NC_011959	AGC	2	6	51397	51402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1162	NC_011959	CTG	2	6	51490	51495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1163	NC_011959	GA	3	6	51504	51509	50 %	0 %	50 %	0 %	221632083
1164	NC_011959	CGC	2	6	51529	51534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632083
1165	NC_011959	AGC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1167	NC_011959	TCG	2	6	51627	51632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1168	NC_011959	GC	3	6	51660	51665	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1169	NC_011959	GCG	2	6	51684	51689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
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1183	NC_011959	CGA	2	6	52297	52302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1185	NC_011959	GCA	2	6	52357	52362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1201	NC_011959	CTG	2	6	53033	53038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1208	NC_011959	TCCG	2	8	53270	53277	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1209	NC_011959	CGGA	2	8	53288	53295	25 %	0 %	50 %	25 %	221632083
1210	NC_011959	GCCAGA	2	12	53302	53313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1218	NC_011959	CCAGAT	2	12	53714	53725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221632083
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1221	NC_011959	GAG	2	6	53952	53957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1222	NC_011959	CGA	2	6	53992	53997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1223	NC_011959	TGCTTC	2	12	54011	54022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	221632083
1224	NC_011959	GAG	2	6	54062	54067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1225	NC_011959	CGTC	2	8	54141	54148	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1226	NC_011959	GAAT	2	8	54154	54161	50 %	25 %	25 %	0 %	221632083
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1231	NC_011959	GGA	2	6	54376	54381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1232	NC_011959	GCT	2	6	54510	54515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1236	NC_011959	CGT	2	6	54611	54616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1237	NC_011959	GGC	2	6	54620	54625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1238	NC_011959	TCG	2	6	54642	54647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1239	NC_011959	GTC	2	6	54675	54680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1240	NC_011959	CTC	2	6	54683	54688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1241	NC_011959	GCT	2	6	54802	54807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1242	NC_011959	GCT	2	6	54844	54849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1243	NC_011959	GAG	2	6	54851	54856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1244	NC_011959	ATCG	2	8	54875	54882	25 %	25 %	25 %	25 %	221632083
1245	NC_011959	GCC	2	6	54908	54913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632083
1246	NC_011959	TCCT	2	8	54932	54939	0 %	50 %	0 %	50 %	221632083
1247	NC_011959	GCT	2	6	54991	54996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1248	NC_011959	ACC	2	6	55012	55017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632083
1249	NC_011959	GCTC	2	8	55081	55088	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1250	NC_011959	CGA	2	6	55117	55122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1251	NC_011959	GAG	2	6	55223	55228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1252	NC_011959	GCC	2	6	55257	55262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632083
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1254	NC_011959	CG	3	6	55404	55409	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1255	NC_011959	GCTC	2	8	55410	55417	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
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1263	NC_011959	TCG	2	6	55830	55835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
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1292	NC_011959	CGG	2	6	57236	57241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NC_011959	AAG	2	6	57288	57293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1298	NC_011959	GAGCG	2	10	57515	57524	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1372	NC_011959	GGAAA	2	10	60319	60328	60 %	0 %	40 %	0 %	221632086
1373	NC_011959	GCAC	2	8	60345	60352	25 %	0 %	25 %	50 %	221632086
1374	NC_011959	GGC	2	6	60497	60502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_011959	CCT	2	6	60529	60534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1377	NC_011959	CGCT	2	8	60671	60678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1499	NC_011959	GCTC	2	8	65567	65574	0 %	25 %	25 %	50 %	221632093
1500	NC_011959	GC	3	6	65576	65581	0 %	0 %	50 %	50 %	221632093

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