MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011959	GAAG	2	8	628780	628787	50 %	0 %	50 %	0 %	221632656
14002	NC_011959	CGC	2	6	628875	628880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632656
14003	NC_011959	G	7	7	628893	628899	0 %	0 %	100 %	0 %	221632656
14004	NC_011959	GGT	2	6	628935	628940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632656
14005	NC_011959	CGG	2	6	628964	628969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632657
14006	NC_011959	TCC	2	6	629030	629035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632657
14007	NC_011959	CTT	2	6	629086	629091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632657
14008	NC_011959	CTG	2	6	629154	629159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14009	NC_011959	CGG	2	6	629184	629189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632657
14010	NC_011959	TCG	2	6	629201	629206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14011	NC_011959	ACG	2	6	629207	629212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14012	NC_011959	ACG	2	6	629312	629317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14013	NC_011959	CCGG	2	8	629416	629423	0 %	0 %	50 %	50 %	221632657
14014	NC_011959	GC	3	6	629445	629450	0 %	0 %	50 %	50 %	221632657
14015	NC_011959	GTG	2	6	629550	629555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632657
14016	NC_011959	GGTA	2	8	629621	629628	25 %	25 %	50 %	0 %	221632657
14017	NC_011959	CCGG	2	8	629733	629740	0 %	0 %	50 %	50 %	221632657
14018	NC_011959	GAA	2	6	629782	629787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632657
14019	NC_011959	ATC	2	6	629842	629847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632657
14020	NC_011959	CGA	2	6	629886	629891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14021	NC_011959	GCC	2	6	629999	630004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632657
14022	NC_011959	CGA	2	6	630009	630014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14023	NC_011959	GAG	2	6	630157	630162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632657
14024	NC_011959	CGA	2	6	630234	630239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14025	NC_011959	CG	3	6	630277	630282	0 %	0 %	50 %	50 %	221632657
14026	NC_011959	GCG	2	6	630287	630292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632657
14027	NC_011959	AGCG	2	8	630327	630334	25 %	0 %	50 %	25 %	221632657
14028	NC_011959	CG	3	6	630362	630367	0 %	0 %	50 %	50 %	221632657
14029	NC_011959	GTC	2	6	630419	630424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14030	NC_011959	TCG	2	6	630425	630430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14031	NC_011959	GCCC	2	8	630447	630454	0 %	0 %	25 %	75 %	221632657
14032	NC_011959	GAC	2	6	630519	630524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14033	NC_011959	CCGGG	2	10	630554	630563	0 %	0 %	60 %	40 %	221632657
14034	NC_011959	CGC	2	6	630566	630571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632657
14035	NC_011959	GCC	2	6	630583	630588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632657
14036	NC_011959	CCA	2	6	630657	630662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632657
14037	NC_011959	GTT	2	6	630664	630669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632657
14038	NC_011959	CGG	2	6	630698	630703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632657
14039	NC_011959	CCA	2	6	630709	630714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632657
14040	NC_011959	CGA	2	6	630753	630758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632657
14041	NC_011959	TCGC	2	8	630773	630780	0 %	25 %	25 %	50 %	221632657
14042	NC_011959	GGGTC	2	10	630795	630804	0 %	20 %	60 %	20 %	221632657
14043	NC_011959	CTC	2	6	631006	631011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632657
14044	NC_011959	AC	3	6	631036	631041	50 %	0 %	0 %	50 %	221632657
14045	NC_011959	TTCC	2	8	631044	631051	0 %	50 %	0 %	50 %	221632657
14046	NC_011959	TGG	2	6	631068	631073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632657
14047	NC_011959	CAC	2	6	631183	631188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632657
14048	NC_011959	TCT	2	6	631257	631262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632657
14049	NC_011959	TCGA	2	8	631307	631314	25 %	25 %	25 %	25 %	221632657
14050	NC_011959	CGGT	2	8	631367	631374	0 %	25 %	50 %	25 %	221632657
14051	NC_011959	TGG	2	6	631413	631418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632657
14052	NC_011959	TC	3	6	631539	631544	0 %	50 %	0 %	50 %	221632658
14053	NC_011959	CGA	2	6	631721	631726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632658
14054	NC_011959	A	6	6	631732	631737	100 %	0 %	0 %	0 %	221632658
14055	NC_011959	CGT	2	6	631756	631761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632658
14056	NC_011959	TGG	2	6	631852	631857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632658
14057	NC_011959	GCGTC	2	10	631871	631880	0 %	20 %	40 %	40 %	221632658
14058	NC_011959	AAC	2	6	631898	631903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632658
14059	NC_011959	CAC	2	6	631911	631916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632658
14060	NC_011959	ACC	2	6	632104	632109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632658
14061	NC_011959	ATCG	2	8	632208	632215	25 %	25 %	25 %	25 %	221632658
14062	NC_011959	CCG	2	6	632219	632224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632658
14063	NC_011959	GCGG	2	8	632229	632236	0 %	0 %	75 %	25 %	221632658
14064	NC_011959	CTCGCG	2	12	632256	632267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221632658
14065	NC_011959	GGC	2	6	632277	632282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632658
14066	NC_011959	GAT	2	6	632319	632324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632658
14067	NC_011959	GTT	2	6	632330	632335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632658
14068	NC_011959	TGG	2	6	632337	632342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632658
14069	NC_011959	CGATC	2	10	632474	632483	20 %	20 %	20 %	40 %	221632658
14070	NC_011959	CCT	2	6	632498	632503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632658
14071	NC_011959	GTC	2	6	632512	632517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632658
14072	NC_011959	GC	3	6	632536	632541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14073	NC_011959	GAAA	2	8	632629	632636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_011959	AGG	2	6	632647	632652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_011959	GAC	2	6	632669	632674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632659
14076	NC_011959	GCA	2	6	632679	632684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632659
14077	NC_011959	AGC	2	6	632768	632773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632659
14078	NC_011959	GCG	2	6	632855	632860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632659
14079	NC_011959	CG	3	6	632859	632864	0 %	0 %	50 %	50 %	221632659
14080	NC_011959	CGAT	2	8	632929	632936	25 %	25 %	25 %	25 %	221632659
14081	NC_011959	TCGC	2	8	633006	633013	0 %	25 %	25 %	50 %	221632659
14082	NC_011959	GCT	2	6	633030	633035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632659
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14084	NC_011959	CGG	2	6	633116	633121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632659
14085	NC_011959	GCGA	2	8	633210	633217	25 %	0 %	50 %	25 %	221632659
14086	NC_011959	GTG	2	6	633253	633258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632659
14087	NC_011959	TGA	2	6	633275	633280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632659
14088	NC_011959	GGC	2	6	633282	633287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632659
14089	NC_011959	CGAT	2	8	633340	633347	25 %	25 %	25 %	25 %	221632659
14090	NC_011959	GGT	2	6	633374	633379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632659
14091	NC_011959	TCGA	2	8	633513	633520	25 %	25 %	25 %	25 %	221632659
14092	NC_011959	GGA	2	6	633533	633538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632659
14093	NC_011959	TCG	2	6	633592	633597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632659
14094	NC_011959	CCG	2	6	633775	633780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632659
14095	NC_011959	CAAC	2	8	633869	633876	50 %	0 %	0 %	50 %	221632659
14096	NC_011959	TGC	2	6	633877	633882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632659
14097	NC_011959	GAG	3	9	633888	633896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632659
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14099	NC_011959	GCTG	2	8	633918	633925	0 %	25 %	50 %	25 %	221632659
14100	NC_011959	GGCT	2	8	633938	633945	0 %	25 %	50 %	25 %	221632659
14101	NC_011959	GAT	3	9	633991	633999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_011959	TGA	3	9	634070	634078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_011959	CG	3	6	634084	634089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14104	NC_011959	CGA	2	6	634158	634163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14105	NC_011959	CCGG	2	8	634171	634178	0 %	0 %	50 %	50 %	221632660
14106	NC_011959	TCC	2	6	634184	634189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632660
14107	NC_011959	TCG	2	6	634218	634223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14108	NC_011959	CGA	2	6	634290	634295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14109	NC_011959	TTC	2	6	634313	634318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632660
14110	NC_011959	TCG	2	6	634361	634366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14111	NC_011959	GAC	2	6	634387	634392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14112	NC_011959	AC	3	6	634448	634453	50 %	0 %	0 %	50 %	221632660
14113	NC_011959	GCA	2	6	634562	634567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14114	NC_011959	GAG	2	6	634633	634638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632660
14115	NC_011959	TTC	2	6	634660	634665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632660
14116	NC_011959	GCC	2	6	634669	634674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632660
14117	NC_011959	GAA	2	6	634678	634683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632660
14118	NC_011959	CGG	2	6	634713	634718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632660
14119	NC_011959	CGAG	2	8	634754	634761	25 %	0 %	50 %	25 %	221632660
14120	NC_011959	CGA	2	6	634791	634796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14121	NC_011959	GAG	2	6	634837	634842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632660
14122	NC_011959	GCC	2	6	634879	634884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632660
14123	NC_011959	GAA	2	6	634936	634941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632660
14124	NC_011959	CGT	2	6	634956	634961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14125	NC_011959	CGA	2	6	634992	634997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14126	NC_011959	TCG	2	6	635018	635023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632660
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14128	NC_011959	CGT	2	6	635100	635105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632660
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14132	NC_011959	TCG	2	6	635235	635240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632660
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14136	NC_011959	GC	4	8	635395	635402	0 %	0 %	50 %	50 %	221632660
14137	NC_011959	GAA	2	6	635434	635439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632660
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14140	NC_011959	GAC	2	6	635680	635685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632660
14141	NC_011959	CGG	2	6	635698	635703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632660
14142	NC_011959	CAT	2	6	635765	635770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14143	NC_011959	GAG	2	6	635843	635848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_011959	CACG	2	8	635877	635884	25 %	0 %	25 %	50 %	221632661
14145	NC_011959	GATC	2	8	635886	635893	25 %	25 %	25 %	25 %	221632661
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14155	NC_011959	TGG	2	6	636432	636437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632661
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14157	NC_011959	GTC	2	6	636571	636576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632661
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14159	NC_011959	CG	3	6	636593	636598	0 %	0 %	50 %	50 %	221632661
14160	NC_011959	CGGG	2	8	636650	636657	0 %	0 %	75 %	25 %	221632661
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14182	NC_011959	CCTG	2	8	637516	637523	0 %	25 %	25 %	50 %	221632661
14183	NC_011959	GTG	2	6	637544	637549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14184	NC_011959	TTC	2	6	637646	637651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632662
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14196	NC_011959	CGT	2	6	638257	638262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632662
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14230	NC_011959	GCTC	2	8	639701	639708	0 %	25 %	25 %	50 %	221632664
14231	NC_011959	CGA	2	6	639714	639719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632664
14232	NC_011959	CTT	2	6	639741	639746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632664
14233	NC_011959	TCG	2	6	639794	639799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632664
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14237	NC_011959	GGC	2	6	639928	639933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632664
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14239	NC_011959	GAT	2	6	639973	639978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632664
14240	NC_011959	GAT	2	6	640054	640059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632664
14241	NC_011959	GGT	2	6	640062	640067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632664
14242	NC_011959	CTT	2	6	640168	640173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632664
14243	NC_011959	GAT	2	6	640210	640215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632664
14244	NC_011959	AGC	2	6	640285	640290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632664
14245	NC_011959	ACG	3	9	640316	640324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632664
14246	NC_011959	ACC	2	6	640475	640480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632664
14247	NC_011959	GTC	2	6	640507	640512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632664
14248	NC_011959	CCGGC	2	10	640553	640562	0 %	0 %	40 %	60 %	221632664
14249	NC_011959	T	6	6	640663	640668	0 %	100 %	0 %	0 %	221632664
14250	NC_011959	ACG	2	6	640682	640687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632664
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14253	NC_011959	TGG	2	6	640857	640862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632665
14254	NC_011959	CGA	2	6	640908	640913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632665
14255	NC_011959	TCC	2	6	640949	640954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632665
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14258	NC_011959	CCT	2	6	641145	641150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632665
14259	NC_011959	AGATG	2	10	641202	641211	40 %	20 %	40 %	0 %	221632665
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14262	NC_011959	GAT	2	6	641254	641259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632665
14263	NC_011959	GGA	3	9	641328	641336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632665
14264	NC_011959	GCT	2	6	641345	641350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632665
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14269	NC_011959	AGAT	2	8	641651	641658	50 %	25 %	25 %	0 %	221632665
14270	NC_011959	GC	3	6	641693	641698	0 %	0 %	50 %	50 %	221632665
14271	NC_011959	GCG	2	6	641761	641766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632665
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14276	NC_011959	GAT	2	6	642166	642171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632665
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14278	NC_011959	AGCG	2	8	642232	642239	25 %	0 %	50 %	25 %	221632666
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14292	NC_011959	ATG	2	6	643071	643076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632666
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14305	NC_011959	GAC	2	6	643739	643744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632667
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14326	NC_011959	CGC	2	6	644644	644649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14344	NC_011959	GAG	2	6	645364	645369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14345	NC_011959	CGGA	2	8	645370	645377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14346	NC_011959	GCC	2	6	645424	645429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14347	NC_011959	CGG	2	6	645438	645443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14348	NC_011959	TCC	2	6	645475	645480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14349	NC_011959	TGGC	2	8	645499	645506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14350	NC_011959	GTG	2	6	645521	645526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14351	NC_011959	CGCT	2	8	645531	645538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14352	NC_011959	CTC	2	6	645578	645583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14353	NC_011959	GCTG	2	8	645586	645593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14354	NC_011959	TCGCC	2	10	645618	645627	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14355	NC_011959	CGT	2	6	645706	645711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14356	NC_011959	CTC	2	6	645725	645730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14357	NC_011959	CTG	2	6	645744	645749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14359	NC_011959	CGG	2	6	645807	645812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14360	NC_011959	TCG	2	6	645819	645824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14362	NC_011959	CGA	2	6	645921	645926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14479	NC_011959	GCG	2	6	651775	651780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632673
14480	NC_011959	CCG	2	6	651861	651866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14481	NC_011959	CGCT	2	8	651921	651928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14482	NC_011959	AGG	2	6	652024	652029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632674
14483	NC_011959	GCA	2	6	652066	652071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14484	NC_011959	GATC	2	8	652087	652094	25 %	25 %	25 %	25 %	221632674
14485	NC_011959	AGC	2	6	652147	652152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14486	NC_011959	GTC	2	6	652203	652208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14487	NC_011959	GAC	2	6	652288	652293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14488	NC_011959	GGTG	2	8	652309	652316	0 %	25 %	75 %	0 %	221632674
14489	NC_011959	CTG	2	6	652349	652354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14490	NC_011959	GCA	2	6	652417	652422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14491	NC_011959	GGAT	2	8	652557	652564	25 %	25 %	50 %	0 %	221632674
14492	NC_011959	CGA	2	6	652591	652596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14493	NC_011959	TCG	2	6	652607	652612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14494	NC_011959	GGC	2	6	652616	652621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
14495	NC_011959	GCTC	2	8	652658	652665	0 %	25 %	25 %	50 %	221632674
14496	NC_011959	CGA	2	6	652675	652680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
14497	NC_011959	GGCA	2	8	652705	652712	25 %	0 %	50 %	25 %	221632674
14498	NC_011959	A	6	6	652743	652748	100 %	0 %	0 %	0 %	221632674
14499	NC_011959	CGGAC	2	10	652776	652785	20 %	0 %	40 %	40 %	221632674
14500	NC_011959	AGC	2	6	652803	652808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674

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