MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011959	GCG	2	6	605593	605598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632632
13502	NC_011959	CGG	2	6	605624	605629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632632
13503	NC_011959	GGA	2	6	605653	605658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632632
13504	NC_011959	CTG	2	6	605660	605665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632632
13505	NC_011959	AGCG	2	8	605671	605678	25 %	0 %	50 %	25 %	221632632
13506	NC_011959	AGC	2	6	605730	605735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632632
13507	NC_011959	CGA	2	6	605848	605853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632632
13508	NC_011959	TGC	2	6	605884	605889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632632
13509	NC_011959	GGTCG	2	10	605912	605921	0 %	20 %	60 %	20 %	221632632
13510	NC_011959	GC	3	6	605989	605994	0 %	0 %	50 %	50 %	221632632
13511	NC_011959	TCGACG	2	12	606040	606051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632632
13512	NC_011959	CTG	2	6	606059	606064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632632
13513	NC_011959	CGGC	2	8	606080	606087	0 %	0 %	50 %	50 %	221632632
13514	NC_011959	TGGC	2	8	606099	606106	0 %	25 %	50 %	25 %	221632632
13515	NC_011959	GGA	2	6	606148	606153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632632
13516	NC_011959	GCGG	2	8	606215	606222	0 %	0 %	75 %	25 %	221632632
13517	NC_011959	CGG	2	6	606240	606245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632632
13518	NC_011959	CAT	2	6	606250	606255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632632
13519	NC_011959	GCGGA	2	10	606302	606311	20 %	0 %	60 %	20 %	221632632
13520	NC_011959	GGAC	2	8	606407	606414	25 %	0 %	50 %	25 %	221632632
13521	NC_011959	TGG	2	6	606493	606498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632632
13522	NC_011959	CCG	2	6	606530	606535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632632
13523	NC_011959	GAGC	2	8	606601	606608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13524	NC_011959	GCA	2	6	606623	606628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13525	NC_011959	TCG	2	6	606640	606645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13526	NC_011959	ACC	2	6	606684	606689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632633
13527	NC_011959	GCCG	2	8	606695	606702	0 %	0 %	50 %	50 %	221632633
13528	NC_011959	CG	3	6	606707	606712	0 %	0 %	50 %	50 %	221632633
13529	NC_011959	GGA	2	6	606800	606805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632633
13530	NC_011959	GAG	2	6	606852	606857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632633
13531	NC_011959	TCG	2	6	606895	606900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13532	NC_011959	GGTGCG	2	12	606905	606916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221632633
13533	NC_011959	TCG	2	6	606941	606946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13534	NC_011959	CGG	2	6	606982	606987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632633
13535	NC_011959	GCT	2	6	606996	607001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13536	NC_011959	GTC	2	6	607077	607082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13537	NC_011959	CAC	2	6	607127	607132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632633
13538	NC_011959	ATC	2	6	607227	607232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632633
13539	NC_011959	CGA	2	6	607243	607248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13540	NC_011959	GCT	2	6	607256	607261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
13541	NC_011959	TTCC	2	8	607283	607290	0 %	50 %	0 %	50 %	221632633
13542	NC_011959	CTT	2	6	607439	607444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632634
13543	NC_011959	TGC	2	6	607468	607473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632634
13544	NC_011959	GGCCGC	2	12	607481	607492	0 %	0 %	50 %	50 %	221632634
13545	NC_011959	GAG	2	6	607506	607511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632634
13546	NC_011959	GCC	2	6	607517	607522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632634
13547	NC_011959	GAC	2	6	607635	607640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632634
13548	NC_011959	TGG	2	6	607689	607694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632634
13549	NC_011959	CG	3	6	607723	607728	0 %	0 %	50 %	50 %	221632634
13550	NC_011959	GT	3	6	607824	607829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_011959	ACGA	2	8	607844	607851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13552	NC_011959	CG	3	6	608008	608013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13553	NC_011959	CG	3	6	608040	608045	0 %	0 %	50 %	50 %	221632635
13554	NC_011959	CGT	2	6	608088	608093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13555	NC_011959	GCAG	2	8	608109	608116	25 %	0 %	50 %	25 %	221632635
13556	NC_011959	AGA	2	6	608133	608138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632635
13557	NC_011959	CCG	2	6	608193	608198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632635
13558	NC_011959	CT	3	6	608219	608224	0 %	50 %	0 %	50 %	221632635
13559	NC_011959	CAG	2	6	608257	608262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13560	NC_011959	CGA	2	6	608331	608336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13561	NC_011959	AGG	2	6	608384	608389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632635
13562	NC_011959	CGG	2	6	608431	608436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632635
13563	NC_011959	ACT	2	6	608480	608485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632635
13564	NC_011959	GAG	2	6	608530	608535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632635
13565	NC_011959	CGG	2	6	608561	608566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632635
13566	NC_011959	GC	3	6	608601	608606	0 %	0 %	50 %	50 %	221632635
13567	NC_011959	GCC	2	6	608733	608738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632635
13568	NC_011959	TGGCG	2	10	608795	608804	0 %	20 %	60 %	20 %	221632635
13569	NC_011959	ACG	2	6	608813	608818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13570	NC_011959	ACGAT	2	10	608919	608928	40 %	20 %	20 %	20 %	221632635
13571	NC_011959	CAT	2	6	608946	608951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632635
13572	NC_011959	GCA	2	6	608956	608961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13573	NC_011959	GTG	2	6	608983	608988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632635
13574	NC_011959	CGT	2	6	608991	608996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13575	NC_011959	CGG	2	6	609024	609029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632635
13576	NC_011959	CGG	2	6	609144	609149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632635
13577	NC_011959	GTCG	2	8	609160	609167	0 %	25 %	50 %	25 %	221632635
13578	NC_011959	CTG	2	6	609178	609183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13579	NC_011959	AAGG	2	8	609184	609191	50 %	0 %	50 %	0 %	221632635
13580	NC_011959	GGT	2	6	609238	609243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632635
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13582	NC_011959	ACG	2	6	609284	609289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13583	NC_011959	ACA	2	6	609317	609322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632635
13584	NC_011959	CGG	2	6	609366	609371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632635
13585	NC_011959	GACCGG	3	18	609407	609424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632635
13586	NC_011959	ACC	2	6	609434	609439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632635
13587	NC_011959	AGC	3	9	609584	609592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632635
13588	NC_011959	CG	3	6	609624	609629	0 %	0 %	50 %	50 %	221632635
13589	NC_011959	CGGC	2	8	609745	609752	0 %	0 %	50 %	50 %	221632635
13590	NC_011959	CGAG	2	8	609793	609800	25 %	0 %	50 %	25 %	221632636
13591	NC_011959	CGA	2	6	609808	609813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13592	NC_011959	TGC	2	6	609814	609819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13593	NC_011959	CTCG	2	8	609836	609843	0 %	25 %	25 %	50 %	221632636
13594	NC_011959	AGC	2	6	609863	609868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13595	NC_011959	GTC	2	6	609882	609887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632636
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13598	NC_011959	GCT	2	6	609990	609995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13599	NC_011959	GGT	2	6	610013	610018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632636
13600	NC_011959	TGC	2	6	610046	610051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13601	NC_011959	CGC	2	6	610067	610072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632636
13602	NC_011959	GCG	2	6	610190	610195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632636
13603	NC_011959	CGTCT	2	10	610209	610218	0 %	40 %	20 %	40 %	221632636
13604	NC_011959	GCT	2	6	610247	610252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13605	NC_011959	CG	3	6	610377	610382	0 %	0 %	50 %	50 %	221632636
13606	NC_011959	TCG	2	6	610393	610398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13607	NC_011959	CGG	2	6	610442	610447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632636
13608	NC_011959	TGG	2	6	610494	610499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632636
13609	NC_011959	CCG	2	6	610518	610523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632636
13610	NC_011959	CCAG	2	8	610558	610565	25 %	0 %	25 %	50 %	221632636
13611	NC_011959	TGG	2	6	610585	610590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632636
13612	NC_011959	CGA	2	6	610623	610628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632636
13613	NC_011959	GGC	2	6	610639	610644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632636
13614	NC_011959	CGCTG	2	10	610728	610737	0 %	20 %	40 %	40 %	221632637
13615	NC_011959	GAT	2	6	610745	610750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632637
13616	NC_011959	GGA	2	6	610795	610800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632637
13617	NC_011959	TTCG	2	8	610805	610812	0 %	50 %	25 %	25 %	221632637
13618	NC_011959	CGG	2	6	610826	610831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632637
13619	NC_011959	TCGCG	2	10	610857	610866	0 %	20 %	40 %	40 %	221632637
13620	NC_011959	GC	3	6	610890	610895	0 %	0 %	50 %	50 %	221632637
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13623	NC_011959	TCT	2	6	611111	611116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632638
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13742	NC_011959	GCTC	2	8	616763	616770	0 %	25 %	25 %	50 %	221632642
13743	NC_011959	GCGGCT	2	12	616771	616782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632642
13744	NC_011959	ACC	3	9	616799	616807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632642
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13854	NC_011959	TGA	2	6	622032	622037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13857	NC_011959	CG	3	6	622167	622172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13858	NC_011959	CG	3	6	622217	622222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13859	NC_011959	CAA	2	6	622401	622406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632650
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13865	NC_011959	TCG	2	6	622666	622671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13983	NC_011959	GTA	2	6	627917	627922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632656
13984	NC_011959	CGATC	2	10	627955	627964	20 %	20 %	20 %	40 %	221632656
13985	NC_011959	GGC	2	6	627980	627985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632656
13986	NC_011959	TCG	2	6	628002	628007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632656
13987	NC_011959	TGC	2	6	628011	628016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632656
13988	NC_011959	GTG	2	6	628018	628023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632656
13989	NC_011959	CGA	2	6	628045	628050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632656
13990	NC_011959	CGG	2	6	628053	628058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632656
13991	NC_011959	CGT	2	6	628072	628077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632656
13992	NC_011959	CGG	2	6	628079	628084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632656
13993	NC_011959	GCA	2	6	628231	628236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632656
13994	NC_011959	TCC	2	6	628260	628265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632656
13995	NC_011959	CGA	2	6	628324	628329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632656
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13997	NC_011959	CG	3	6	628402	628407	0 %	0 %	50 %	50 %	221632656
13998	NC_011959	CAG	2	6	628504	628509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632656
13999	NC_011959	CAG	2	6	628553	628558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632656
14000	NC_011959	GTA	2	6	628676	628681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632656

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